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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8199#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 722 fasta sequence
[TAGCCAANAATTTTGCACGAGGGTATATGGAATTAGTCTGTTTATTTTTCTCGTATTTTCTATCATCTTGATGATCTACAATTTCAATGTAATGATGTTACGTCTCTTCCCCATTCTACTTTTAGTGATTTTTACGTCAACAGGTTTAGGCCATCGTTGTTATGTGTGTAGTAAGTGTCAAGACCCATTCAGAGTTAAGGATACTGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAATAAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGTTGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTATTCTTCAATAATAAAATATTTATTATTAGAAGGCTATTTTTTGCTATGATTTAGTAATGATAGCCTACCATATATTGATTTATATTA-TAAACTGTCTCTGGTCGACGAATAATCTAATTTTGAT-ATATACCT]
[+] EMBL CD080793 [TAGCCAANAATTTTGCACGAGGGTATATGGAATTAGTCTGTTTATTTTTCTCGTATTTTCTATCATCTTGATGATCTACAATTTCAATGTAATGATGTTACGTCTCTTCCCCATTCTACTTTTAGTGATTTTTACGTCAACAGGTTTAGGCCATCGTTGTTATGTGTGTAGTAAGTGTCAAGACCCATTCAGAGTTAAGGATACTGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAATAAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGTTGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTATGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTATTCTTCAATAATAAAAT ]
[+] EMBL CD078569 [ ctaGTATATGGAATTAGTCTGTTTATTTTTCTCGTATTTTCTATCATCTTGATGATCTACAATTTCAATGTAATGATGTTACGTCTCTTCCCCATTCTACTTTTAATGATTTTTACGTCAACAGGTTTAGGCCATCGTTGTTATGTGTGTAGTAAGTGTCAAGACCCATTCAGAGTTAAGGATACTGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAATAAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGTTGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTATTCTTCNATAATANAATATTTATTATTAGAAGGCTATTTTTTGCTATGATTTAGTAATGATAGCCTACCATATATTGATTTATATTA TAAACTGTCTCTGGTCGACGAATAATCTAATTTTGAT ATATACC ]
[-] EMBL CD073036 [ TTTACGTCAACAGGTTTAGGCCATCGTTGTTATGTGTGTAGTAAGTGTCAAGACCCATTCAGAGTTAAGGATACTGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAATAAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGTTGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTATTCTTCAATAATAAAATATTTATTATTAGAAGGCTATTTTTTGTTATGATTTAGTAATGATAGCTTAACATATATTGA TTATATTATTAAACTGTCTCTGGTCGACGATAAATCTAATTTTGATAATATACgt]
[+] EMBL CD194905 [ TGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAATAAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGTTGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCCCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTC ]
[+] EMBL AA791338 [ TCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGAC TTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTC TGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGAC TAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTA TCTTCAATAATAAAATATT ]
[+] EMBL SM3591 [ GTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||