These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8199#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 722 fasta sequence [TAGCCAANAATTTTGCACGAGGGTATATGGAATTAGTCTGTTTATTTTTCTCGTATTTTCTATCATCTTGATGATCTACAATTTCAATGTAATGATGTTACGTCTCTTCCCCATTCTACTTTTAGTGATTTTTACGTCAACAGGTTTAGGCCATCGTTGTTATGTGTGTAGTAAGTGTCAAGACCCATTCAGAGTTAAGGATACTGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAATAAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGTTGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTATTCTTCAATAATAAAATATTTATTATTAGAAGGCTATTTTTTGCTATGATTTAGTAATGATAGCCTACCATATATTGATTTATATTA-TAAACTGTCTCTGGTCGACGAATAATCTAATTTTGAT-ATATACCT] [+] EMBL CD080793 [TAGCCAANAATTTTGCACGAGGGTATATGGAATTAGTCTGTTTATTTTTCTCGTATTTTCTATCATCTTGATGATCTACAATTTCAATGTAATGATGTTACGTCTCTTCCCCATTCTACTTTTAGTGATTTTTACGTCAACAGGTTTAGGCCATCGTTGTTATGTGTGTAGTAAGTGTCAAGACCCATTCAGAGTTAAGGATACTGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAATAAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGTTGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTATGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTATTCTTCAATAATAAAAT ] [+] EMBL CD078569 [ ctaGTATATGGAATTAGTCTGTTTATTTTTCTCGTATTTTCTATCATCTTGATGATCTACAATTTCAATGTAATGATGTTACGTCTCTTCCCCATTCTACTTTTAATGATTTTTACGTCAACAGGTTTAGGCCATCGTTGTTATGTGTGTAGTAAGTGTCAAGACCCATTCAGAGTTAAGGATACTGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAATAAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGTTGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTATTCTTCNATAATANAATATTTATTATTAGAAGGCTATTTTTTGCTATGATTTAGTAATGATAGCCTACCATATATTGATTTATATTA TAAACTGTCTCTGGTCGACGAATAATCTAATTTTGAT ATATACC ] [-] EMBL CD073036 [ TTTACGTCAACAGGTTTAGGCCATCGTTGTTATGTGTGTAGTAAGTGTCAAGACCCATTCAGAGTTAAGGATACTGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAATAAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGTTGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTATTCTTCAATAATAAAATATTTATTATTAGAAGGCTATTTTTTGTTATGATTTAGTAATGATAGCTTAACATATATTGA TTATATTATTAAACTGTCTCTGGTCGACGATAAATCTAATTTTGATAATATACgt] [+] EMBL CD194905 [ TGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAATAAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGTTGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCCCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTC ] [+] EMBL AA791338 [ TCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGAC TTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTC TGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGAC TAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTA TCTTCAATAATAAAATATT ] [+] EMBL SM3591 [ GTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||