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Schistosoma mansoni
cluster # 8199 cluster # 8199       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8199#0 length = 722 sequences # 6  

consensusID : consensus_8199#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 722
fasta sequence
                              [TAGCCAANAATTTTGCACGAGGGTATATGGAATTAGTCTGTTTATTTTTCTCGTATTTTCTATCATCTTGATGATCTACAATTTCAATGTAATGATGTTACGTCTCTTCCCCATTCTACTTTTAGTGATTTTTACGTCAACAGGTTTAGGCCATCGTTGTTATGTGTGTAGTAAGTGTCAAGACCCATTCAGAGTTAAGGATACTGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAATAAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGTTGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTATTCTTCAATAATAAAATATTTATTATTAGAAGGCTATTTTTTGCTATGATTTAGTAATGATAGCCTACCATATATTGATTTATATTA-TAAACTGTCTCTGGTCGACGAATAATCTAATTTTGAT-ATATACCT]

[+] EMBL CD080793             [TAGCCAANAATTTTGCACGAGGGTATATGGAATTAGTCTGTTTATTTTTCTCGTATTTTCTATCATCTTGATGATCTACAATTTCAATGTAATGATGTTACGTCTCTTCCCCATTCTACTTTTAGTGATTTTTACGTCAACAGGTTTAGGCCATCGTTGTTATGTGTGTAGTAAGTGTCAAGACCCATTCAGAGTTAAGGATACTGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAATAAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGTTGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTATGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTATTCTTCAATAATAAAAT                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD078569             [                   ctaGTATATGGAATTAGTCTGTTTATTTTTCTCGTATTTTCTATCATCTTGATGATCTACAATTTCAATGTAATGATGTTACGTCTCTTCCCCATTCTACTTTTAATGATTTTTACGTCAACAGGTTTAGGCCATCGTTGTTATGTGTGTAGTAAGTGTCAAGACCCATTCAGAGTTAAGGATACTGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAATAAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGTTGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTATTCTTCNATAATANAATATTTATTATTAGAAGGCTATTTTTTGCTATGATTTAGTAATGATAGCCTACCATATATTGATTTATATTA TAAACTGTCTCTGGTCGACGAATAATCTAATTTTGAT ATATACC ]
[-] EMBL CD073036             [                                                                                                                                  TTTACGTCAACAGGTTTAGGCCATCGTTGTTATGTGTGTAGTAAGTGTCAAGACCCATTCAGAGTTAAGGATACTGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAATAAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGTTGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTATTCTTCAATAATAAAATATTTATTATTAGAAGGCTATTTTTTGTTATGATTTAGTAATGATAGCTTAACATATATTGA TTATATTATTAAACTGTCTCTGGTCGACGATAAATCTAATTTTGATAATATACgt]
[+] EMBL CD194905             [                                                                                                                                                                                                            TGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAATAAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGTTGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCCCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTC                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AA791338             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGAC TTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTC TGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATTTATACTTTATTTATTATGAC TAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTA TCTTCAATAATAAAATATT                                                                                                                  ]
[+] EMBL SM3591               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTCAAGACGATTTGTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTCCATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCATTTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGT                                                                                                                                                                                                                     ]


>consensus_8199#0 TAGCCAANAATTTTGCACGAGGGTATATGGAATTAGTCTGTTTATTTTTCTCGTATTTTC TATCATCTTGATGATCTACAATTTCAATGTAATGATGTTACGTCTCTTCCCCATTCTACT TTTAGTGATTTTTACGTCAACAGGTTTAGGCCATCGTTGTTATGTGTGTAGTAAGTGTCA AGACCCATTCAGAGTTAAGGATACTGAAATACAAAATGGTTGTACCTTCTGTTCAACAAT AAGAACATATGTTCAAGATAAACTACAAGTGACTAGTCGTAGTTGTGTTCCGGTTTGCGT TGAAGCTGATGCTAGGAGATCCGGGTCAGGAATTGTTACATCGTGTTGTCAAGACGATTT GTGCAATTCTGGTACACAAACACAAATATCCATGACTTTAATCCTATCTTCATTGTTTTC CATACTACCATTGTTATCACGTTACTTTTAATAAAAAATAAACTGATATTTCTCGCCCAT TTCTCTTGGCACGAAAAGTTTGATTATTGGTATATATTGGTTCTAAATGATGATAGAATT TATACTTTATTTATTATGACTTAATTATGCTTCGTTCACACCATCATTTATTCTTCAATA ATAAAATATTTATTATTAGAAGGCTATTTTTTGCTATGATTTAGTAATGATAGCCTACCA TATATTGATTTATATTATAAACTGTCTCTGGTCGACGAATAATCTAATTTTGATATATAC CT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)