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Schistosoma mansoni
cluster # 8220 cluster # 8220       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8220#0 length = 751 sequences # 6  

consensusID : consensus_8220#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 751
fasta sequence
                              [ATAGAGAAAAAGACAAGCAAGTGAGCAATCGAAACTGTTAATTACGACTAGAATATACATTTACAATAACTAATCATTCCAAAATGAATTAATCAGTGAAAGAAAAGAGAATTCACTCTGTATTAATCATGGATCGATTTGATTTAATCAGCCTTATTTCAGATTATTTTAGCAATTAAGCTATTTGTACAGGGTCATTGTATTCTTAACGGAGTGTTAAGAGGGTAAATATTTGGGGATTTTATATGATTGTTTTGATATTATTATTGATATTGTGAAGATGATGGTAGCAGTGTGGTTGTTGTTGGTGGTGGTAAACGATGATTACCGTCATCGACTGAATTACGAACACGTCTGAAGTGAACAGGTGGCTTGCTATTCGTTCCATTATTGATATTTCTAAATTCTTGATTTATTGAAGGATGCATAGTTCCACTAGACGAAGGAGGATGAGAGGTAGTTGGTGCAGAATTGGGAGGTTCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTTTGGATGTGTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAACGATAAAGGAAGAAAAGTTTTGCCAC-AACTGTTCCTCTAATAATAGTAAGTTATTTTCACGTACAAGATAAATTTCATGGCATAAATTCAAAATACGATCCACATGAGGTAATTCTTCAAGACGAATCACATAAGAAATATTACTGTACGCAGTACGTAGCAGCCGACTAGCTAA]

[-] EMBL CD059567             [ATAGAGAAAAAGACAAGCAAGTGAGCAATCGAAACTGTTAATTACGACTAGAATATACATTTACAATAACTAATCATTCCAAAATGAATTAATCAGTGAAAGAAAAGAGAATTCACTCTGTATTAATCATGGATCGATTTGATTTAATCAGCCTTATTTCAGATTATTTTAGCAATTAAGCTATTTGTACAGGGTCATTGTATTCTTAACGGAGTGTTAAGAGGGTAAATATTTGGGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD194458             [                                AACTGTTAATTACGACTAGACTATACATTTACAATAACTAATCATTCCAAAATGAATTAATCAGTGAAAGAAAAGAAAATTCACTCTGTATTAATCATGGATCGATTTGATTTAATCAGTCTTATTTCAGATTATTTTAACAATTAAGCTATTTGTACAGGGCCATTGTATTCTTAACGGAGTGTTAAGAGGGTAAATATTTGGGGATTTTATATGATTGTTTTGATATTATTATTGATATTGTGAAGATGATGGTAGCAGTGTGGTTGTTGTTGGTGGTGGTAAACGATGATTACCGTCATCGACTGAATTACGAACACGTCTGAAGTGAACAGGTGGCTTGCTATTCGTTCCATTATTGATATTTCTAAATTCTTGATTTATTGAAGGATGCATAGTTCCACTAGACGAAGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD144761             [                                                                                                                                                                                                               cACGGAGTGTTAAGAGGGTAAATATTTGGGGATTTTATATGATTGTTTTGTTATTATTATTGATATTGTGAAGATGATGGTAGCAGTGTGGTTGTTGTTGGTGGTGGTAAACGATGATTACCGTCATCGACTGAATTACGAACACGTCTGAAGTGAACAGGTGGCTTGCTATTCGTTCCATTATTGATATTTCTAAATTCTTGATTTATTGAAGGATGCATAGTTCCACTAGACGAAGGAGGATGAGAGGTAGTTGGTGCAGAATTGGGAGGTTCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTTTGGATGTGTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAGCGATAAAGGAAGAAAAGTTTTGCCAC ctccgtgg                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD144611             [                                                                                                                                                                                                                               GGTAAATATTTGGGGATTTTATATGATTGTTTTGATATTATTATTGATATTGTGAAGATGATGGTAGCAGTGTGGTTGTTGTTGGTGGTGGTAAACGATGATTACCGTCATCGACTGAATTACGAACACGTCTGAAGTGAACAGGTGGCTTGCTATTCGTTCCATTATTGATATTTCTAAATTCTTGATTTATTGAAGGATGCATAGTTCCACTANACGAAGGAGGATGAGAGGTAGTTGGTGCATAATTGGGAGGTTCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTCTGGATGTCTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAACGATAAAGGAAGAAAA                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD193356             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GGATGAGAGGTAGTTGGTGCAGAATTGGGAGGTTCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTTTGGATGTGTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAACGATAAAGGAAGAAAAGTTTTGCCACTAACTGTTCCTCTAATAATAGTAAGTTATTTTCACGTACAAGATAAATTTCATGGCATAAATTCAAAATACGATCCACATGAGGTAATTCTTCAAGACGAATCACATAAGAAATATTACTGTACGCAGTACGTAGCAGCCGACTAGCTAA]
[-] EMBL CD112452             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTTCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTTTGGATGTCTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAACGATAAAGGAAGAAAAGTTTTGCCACTAACTGTTCCTCTAATAATAGTAAGTTATTTTCACGTACAAGATAAATTTCATGGCATAAATTCAA                                                                                    ]


>consensus_8220#0 ATAGAGAAAAAGACAAGCAAGTGAGCAATCGAAACTGTTAATTACGACTAGAATATACAT TTACAATAACTAATCATTCCAAAATGAATTAATCAGTGAAAGAAAAGAGAATTCACTCTG TATTAATCATGGATCGATTTGATTTAATCAGCCTTATTTCAGATTATTTTAGCAATTAAG CTATTTGTACAGGGTCATTGTATTCTTAACGGAGTGTTAAGAGGGTAAATATTTGGGGAT TTTATATGATTGTTTTGATATTATTATTGATATTGTGAAGATGATGGTAGCAGTGTGGTT GTTGTTGGTGGTGGTAAACGATGATTACCGTCATCGACTGAATTACGAACACGTCTGAAG TGAACAGGTGGCTTGCTATTCGTTCCATTATTGATATTTCTAAATTCTTGATTTATTGAA GGATGCATAGTTCCACTAGACGAAGGAGGATGAGAGGTAGTTGGTGCAGAATTGGGAGGT TCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTTT GGATGTGTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAACGATAAAGGAAGAAAAGTTTTGCC ACAACTGTTCCTCTAATAATAGTAAGTTATTTTCACGTACAAGATAAATTTCATGGCATA AATTCAAAATACGATCCACATGAGGTAATTCTTCAAGACGAATCACATAAGAAATATTAC TGTACGCAGTACGTAGCAGCCGACTAGCTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)