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Schistosoma mansoni
cluster # 8233 cluster # 8233       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8233#0 length = 615 sequences # 6  

consensusID : consensus_8233#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 615
fasta sequence
                              [TGAATTAGGTGACTGTTG-GCTATTAGCTGCTATTGCT-TGTTTATCAA-TGGACAA-GAAATTA-TTTGAACAAGTTGTTGCTATAGATCAAAATTTTACTAAAGAATATTGTGGTTTATTTCGTTTTCATTTTTGGAATTATGGTGAATGGAAAGAAGTTGTCGTGGATGATCGTCTACCAACATATCAAAAATCATTAGTTTATATACATTCAACTG-AAAAAAATGAATTTTGGTCAGCATTATTAGAAAAAGCTTATGCAAAATTATGCGGCTCATATGAAGCACTTAAAGGCGGTACAACTAGTGAAGCATTAGAAGATTTTACTGGTGGAATTTCTGAAATGTTTGATTTGAAAAAAGATACACCATCAAATTTATTACAAGTTATGTTGAAAAGTCAAGAGTTAAGTTCATTGATGGCATGTTCTATTCAAGCTGATCCAAATACTTTTGAAGCTCGTTTACCAAATGGATTAATTATGGGACATGCATATTCAATTACGTCTGTTAAAATGTTAGATATATCAATTCCAAATAAAACTGGTAAAATACCATTAGTTCGTGTACGTAATCCATGGGGTGATGAATCGGAATGGAAAGGTGCATGGAGTGATAA]

[+] EMBL CD066227             [TGAATTAGGTGACTGTTG GCTATTAGCTGCTATTGCT TGTTTATCAA TGGACAA GAAATTA TTTGAACAAGTTGTTGCTATAGATCAAAATTTTACTAAAGAATATTGTGGTTTATTTCGTTTTCA TTTTGGAATTATGGTGAATGGAAAGAAGTTGTCGTGGATGATCGTCTACCAACATATCAAAAATCATTAGTTTATATACATTCAACTGAAAAAAAATGAATTTTGGTCAGCATTATTAGAAAAAGCTTATGCAAAATTATGCGGCTCATATGAAGCACTTAAAGGCGGTACAACTAGTGAAGCATTAGAAGATTTTACTGGTGGAATTTCTGAAATGTTTGATTTGAAAAAAGATACACCATCAAATTTATTACAAGTTATGTTGAAAAGTCAAGAGTTAAGTTCATTGATGGCATGTTCTATTCAAGCTGATCCAAATACTTTTGAAGCTCGTTTACCAAATGGATTAATTATGGGACATGCATATTCAATTACGTCTGTTAAAATGTTAGATATATCAATTCCAAATAAAACTGGTAAAATACCATTAGTTCGTGTACG                                                ]
[+] EMBL CD068300             [             TGTTGCGCTATTAGCTGCTATTGCTATGTTTATCAA TGGACAA GAAATTA TTTGAACAAGTTGTTGCTATAGATCAAAATTTTACTAAAGAATATTGTGGTTTATTTCGTTTTCATTTTTGGAATTATGGTGAATGGAAAGAAGTTGTCGTGGATGATCGTCTACCAACATATCAAAAATCATTAGTTTATATACATTCAACTG AAAAAAATGATTTTTGGTCAGCATTATTAGAAAAAGCTTATGCAAAATTATGCGGCTCATATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD066274             [                                  TGCT TGTTTATCAAGTGGACAANGAAATTACTTTGAACAAGTTGTTGCTATAGATCAAAATTTTACTAAAGAATATTGTGGTTTATTTCGTTTTCATTTTTGGAATTATGGTGAATGGAAAGAAGTTGTCGTGGATGATCGTCTACCAACATATCAAAAATCATTAGTTTATATACATTCAACTG AAAAAAATGAATTTTGGTCAGCATTATTAGAAAAAGCTTATGCAAAATTATGCGGCTCATACGAAGCACTTAAAGGCGGTACAACTAGTGAAGCATTAGAAGATTTTACTGGTGGAATTTCTGAAATGTTTGATTTGAAAAAAGATACACCATCAAATTTATTACAAGTTATGTTGAAAAGTCAAGAGTTAAGTTCATTGATGGCATGTTCTATTCAAGCTGATCCAAATACTTTTGAAGCTCGTTTACCAAATGGATTAATTATGGGACATGCATATTCAATTACGTCTGTTAAAATGTTAGATATATCAATTCCAAATAAAACTGGTAAAATACCATTAGTTCGTGTACG                                                ]
[-] EMBL CD066204             [                                                                                TGCTATAGATCAAAATTTTACTAAAGAATATTGTGGTTTATTTCGTTTTCATTTTTGGAATTATGGTGAATGGAAAGAAGTTGTCGTGGATGATCGTCTACCAACATATCAAAAATCATTAGTGTATATACATTCAACTG AAAAAAATGAATTTTGGTCAGCATTATTAGAAAAAGCTTATGCAAAATTATGCGGCTCATATGAAGCACTTAAAGGCGGTACAACTAGTGAAGCATTAGAAGATTTTACTGGTGGAATTTCTGAAATGTTTGATTTGAAAAAAGATACACCATCAAATTTATTACAAGTTATGTTGAAAAGTCAAGAGTTAAGTTCATTGATGGCATGTTCTATTCAAGCTGATCCAAATACTTTTGAAGCTCGTTTACCAAATGGATTAATTATGGGACATGCATATTCAATTACGTCTGTTAAAATGTTAGATATATCAATTCCAAATAAAACTGGTAAAATACCATTAGTTCGTGTACGT                                               ]
[-] EMBL CD197699             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAAAGCCGGTACAACTAGTGAAGCATTAGAAGATTTTACTGGTGGAATTTCTGAAATGTTTGATTTGAAAAAAGATACACCATCAAATTTATTACAAGTTATGTTGAAAAGTCAAGAGTTAAGTTCATTGATGGCATGTTCTATTCAAGCTGATCCAAATACTTTTGAAGCTCGTTTACCAAATGGATTAATTATGGGACATGCATATTCAATTACGTCTGTTAAAATGTTAGATATATCAATTCCAAACAAAACTGGTAAAATACCATTAGTTCGTGTACGTAATCCATGGGGTGATGAATCGGAATGGAAAGGTGCATGGAGTGATAA]
[-] EMBL CD197798             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAAAGGCGGTACAACTAGTGAAGCATTAGAAGATTTTACTGGTGGAATTTCTGAAATGTTTGATTTGAAAAAAGATACACCATCAAATTTATTACAAGTTATGTTGAAAAGTCAAGAGTTAAGTTCATTGATGGCATGTTCTATTCAAGCTGATCCAAATACTTTTGAAGCTCGTTTACCAAATGGATTAATTATGGGACATGCATATTCAATTACGTCTGTTAANATGTTAGATATATCAATTCCAAATAAAACTGGTAAAATACCATTAGTTCGTGTACGTAATCCATGGGGTGATGAATCGGAATGGAAAGGTGCATGGAGTGATAA]


>consensus_8233#0 TGAATTAGGTGACTGTTGGCTATTAGCTGCTATTGCTTGTTTATCAATGGACAAGAAATT ATTTGAACAAGTTGTTGCTATAGATCAAAATTTTACTAAAGAATATTGTGGTTTATTTCG TTTTCATTTTTGGAATTATGGTGAATGGAAAGAAGTTGTCGTGGATGATCGTCTACCAAC ATATCAAAAATCATTAGTTTATATACATTCAACTGAAAAAAATGAATTTTGGTCAGCATT ATTAGAAAAAGCTTATGCAAAATTATGCGGCTCATATGAAGCACTTAAAGGCGGTACAAC TAGTGAAGCATTAGAAGATTTTACTGGTGGAATTTCTGAAATGTTTGATTTGAAAAAAGA TACACCATCAAATTTATTACAAGTTATGTTGAAAAGTCAAGAGTTAAGTTCATTGATGGC ATGTTCTATTCAAGCTGATCCAAATACTTTTGAAGCTCGTTTACCAAATGGATTAATTAT GGGACATGCATATTCAATTACGTCTGTTAAAATGTTAGATATATCAATTCCAAATAAAAC TGGTAAAATACCATTAGTTCGTGTACGTAATCCATGGGGTGATGAATCGGAATGGAAAGG TGCATGGAGTGATAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)