These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8236#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1164 fasta sequence [TTTTATAAAACAAGAATTTGATCGTAGTTTTATATTATCGGATCCAGGTATGGGCTCCGAATTGTTCGTTGATCCTGCACAAGAAGATCGTGAAATGATATGGCGTACTAATGAATATCCGACATTAGATCGTCTACATTTATCCAATTCATTCGGAAGTTCAAACCACCAACCTATCATTATGTGCACACGAGATCAACGTCGCAGGATAATTCAACAAAGTAATATTATGCCAGATTACATTTTATGCCGTCAGCAAACAATACCTATCTTGAGATTGCCTACTCCTGCACGTACAGTGGTATCTTTAGGACGACCACAGCAGCAGTCCTGACATGTTTTCTATATTAGTACCAATTTNNCGCCAGTTTTACTTAATGATCTCGTCTTTTCCTCTGTCTTGCTTAATACAATGAGTTCAAAGTAGGGATATAACATAACTACTTTTGCAACCACACAATTAGGCCTTAAACGCATGTCTTGTTAACTACTAGCAGTTTTCATGCGCATCTTGTATATTTACTGTTTCTATAACCTATTGAGTTGTCTCAGTTTATTTTGTCAAATAATTAGTTTCATTGTTCCTAAACTGCCCCCTCAGCATAAATTTGTACAAATCGAAATCGACCTATCTGGTCCCTTTTACAGAAATCTAAATGCTTGACACTAATATACTGGTTATTGCCGATTATTCTTTCCAAACACTTCATGGAACCTACTGGTCATTTCCTGCGCCTACATGTTTTTAATCTTTTAGTGTTTTCCCAGTGAGGTAAATCGTGTAGTGCCCGAAGGAAATCTTTTTTAGTCTTCTATGTACACAGTTGTTTTTCATGTACAGACTTCCAGATAATCTGTGATTTTTTCGAACTCAAGTTTAATGATGTATGGTTGTGGGGTCGATTCATATTTTTGACTCCTTGCAGTAATATTTATTGTACGACATAATATTTCATTCCTAAACAATAAGAATAATCAAACTATTTTACAACTTGTTTCCTCAGAACATACGTCATCAAAGTATATTTGCTCACCATTTTTTAACTGAATGTTTTGCAGTTACTTTAACATGATTCTGTATAGTGAAAAGTCCCTGCTGTATACCTTTATACCCGTCACTTATTACAATGTTTCGTATTTAACACTATGATGACCCCCCGTCAA] [+] EMBL CD149423 [TTTTATAAAACGGGAGTTTGATCGTAGTTTTATATTATCGGATCCAGGTATGGGCTCCGAATTGTTCGTTGATCCTGCACAAGAAGATCGTGAAATGATATGGCGTACTAATGAATATCCGACATTAGATCGTCTACATTTATCCAATTCATTCGGAAGTTCAAACCACCAACCTATCATTATGTGCACACGAGATCAACGTCGCAGGATAATTCAACAAAGTAATATTATGCCAGATTACATTTTATGCCGTCAGCAAACAATACCTATCTTGAGATTGCCTACTCCTGCACGTACAGTGGTATCTTTAGGACGACCACAGCAGCAGTCCTGACATGTTTTCTATATTACTACCAA ] [+] EMBL CD198806 [ AAAACAAGAATTTGATCGTAGTTTTATATTATCGGATCCAGGTATGGGCTCCGAATTGTTCGTTGATCCTGCACAAGAAGATCGTGAAATGATATGGCGTACTAATGAATATCCGACATTAGATCGTCTACATTTATCCAATTCATTCGGAAGTTCAAACCACCAACCTATCATTATGTGCACACGAGATCAACGTCGCAGGATAATTCAACAAAGTAATATTATGCCAGATTACATTTTATGCCGTCAGCAAACAATACCTATCTTGAGATTGCCTACTCCTGCACGTACAGTGGTATCTTTAGGACGACCACAGCAGCAGTCCTGACATGTTTTCTATATNAGTACCAATTTNNC ] [+] EMBL CD198710 [ AAAACAAGAATTTGATCGTAGTTTTATATTATCGGATCCAGGTGTGGGCTCCGAATTGTTCGTTGATCCTGCACAAGAAGATCGTGAAATGATATGGCGTACTAATGAATATCCGACATTAGATCGTCTACATTTATCCAATTCATTCGGAAGTTCAAACCACCAACCTATCATTATGTGCACACGAGATCAACGTCGCAGGATAATTCAACAAAGTAATATTATGCCAGATTACATTTTATGCCGTCAGCAAACAATACCTATCTTGAGATTGCCTACTCCTGCACGTACAGTGGTATCTTTAGGACGACCACAGCAGCAGTCCTGACATGTTTTCTATATTAGTACCAATT ] [+] EMBL CD082878 [ TCGTCTACATTTATCCAATTCATTCGGAAGTTCAAACCACCAACCTATCATTATGTGCACACGAGATCAACGTCGCAGGATAATTCAACAAAGTAATATTATGCCAGATTACATTTTATGCCGTCAGCAAACAATACCTATCTTGAGATTGCCTACTCCTGCACGTACAGTGGTATCTTTAGGACGACCACAGCAGCAGTCCTGACATGTTTTCTATATTAGTACCAATTTCCAGCCAGTTTTACTTAATGATCTCGTCTTTTCCTCTGTCTTGCTTAATACAATGAGTTCAAAGTAGGGATATAACATAACTACTTTTGCAACCACACAATTAGGCCTTAAACGCATGTCTTGTTAACTACTAGCAGTTTTCATGCGCATCTTGTATATTTACTGTTTCTATAACCTATTGAGTTGTCTCAGTTTATTTTGTCAAATAATTAGTTTCATTGTTCCTAAACTGCCCCCTCAGCATAAATTTGTACAAATCGAAATCGACCTATCTGGTCCCTTTTACAGAAATCTAAATGCTTGACACTAATATACTGGTTATTGCCG ] [-] EMBL CD076463 [ TTAAACGCATGTCTTGTTAACTACTAGCAGTTNTCATGCGCATCTTGTATATTTACTGTTTCTATAACCTATTGAGTTGTCTCAGTTTATTTTGTCAAATAATTAGTTTCATTGTTCCTAAACTGCCCCCTCAGCATAAATTTGTACAAATCGAAATCGACCTATCTGGTCCCTTTTACAGAAATCTAAATGCTTGACACTAATATACTGTTTATTGCCGATTATTCTTTCCAAACACTTCATGGAACCTACTGGTCATTTCCTGCGCCTACATGTTTTTAATCTTTTAGTGTTTTCCCAGTGAGGTAAATCGTGTAGTGCCCGAAGGAAATCTTTTTTAGTCTTCTATGTACACAGTTGTTTTTCATGTACAGACTTCCAGATAATCTGTGATTTTTTCGAACTCAAGTTTAATGATGTATGGTTGTGGGGTCGATTCATATTTTTGACTCCTTGCAGTAATATTTATTGTACGACATAATATTTCATTCCTAAACAATAAGAATAATCA ] [+] EMBL BG931061 [ GTCGATTCATATTTTTGACTCCTTGCAGTAATATTTATTGTACGACATAATATTTCATTCCTAAACAATAAGAATAATCAAACTATTTTACAACTTGTTTCCTCAGAACATACGTCATCAAAGTATATTTGCTCACCATTTTTTAACTGAATGTTTTGCAGTTACTTTAACATGATTCTGTATAGTGAAAAGTCCCTGCTGTATACCTTTATACCCGTCACTTATTACAATGTTTCGTATTTAACACTATGATGACCCCCCGTCAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||