cluster # 8239

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Schistosoma mansoni
cluster # 8239 cluster # 8239 Sequences # 6 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_8239#0 length = 382 sequences # 6

consensusID : consensus_8239#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 382
fasta sequence

                              [GGGAGTTTGACTCTTTATTTATGGAGTTATGGGCGTTATTTATAGAGTTAAAATCGTTATTTATAGAGTTTGATTCGCTATTTACGAAGTTGTCTATCTGTTCCCCCAGCCAACTGTCCAACTCATTGTCTATGTGCTGTATTACAAATTCTTGATCGTCTGTTTCAAACGAAGCTGCTGTTTCATCTGAAAAAATGATATCGCGCCGTTGCGTTGTTAATGTTAAAATCGTCCGCTCCGGATTTAGTTGCTGAATAAACTCAGGTTGCTTCCACTCGCGTTCTTTCCATATTGATTCAATATCATTCAGTCCAGATCCCGCCCGCTTACACAAACCGATTAAAATAAACATTTTAAATAAATTCGGGTTGCGTAAATTGCT]

[+] EMBL CD121885             [GGGAGTTTGACTCTTTATTTATGGAGTTATGGGCGTTATTTATAGAGTTAAAATCGTTATTTATAGAGTTTGATTCGCTATTTACGAAGTTGTCTATCTGTTCCCCCAGCCAACTGTCCAACTCATTGTCTATGTGCTGTATTACAAATTCTTGATCGTCTGTTTCAAACGAAGCTGCTGTTTCATCTGAAAAAATGATATCGCGCCGTTGCGTTGTTAATGTTAAAATCGTCCGCTCCGGATTTAGTTGCTGAATAAACTCAGGTTGCTTCCACTCGCGTTCTTTCCATATTGATTCAATATCATTCAGTCCAGATCCCGCCCGCTTACACAAACCGATTAAAATAAACATTTTAAATACATTCGGGTTGCGTAAATTGCT]
[+] EMBL CD122003             [    GTTTGACTCTTTATTTATGGAGTTATGGGCGTTATTTATAGAGTTAAAATCGTTATTTATAGAGTTTGATTCGCTATTTACGAAGTTGTCTATCCGTTCCCCCAGCCAACTGTCCAACTCATTGTCTATGTGCTGTATTACAAATTCTTGATCGTCTGTTTCAAACGAAGCTGCTGTTTCATCTGAAAAAATGATATCGCGCCGTTGCGTTGTTAATGTTAAAATCGTCCGCTCCGGATTTAGTTGCTGAATAAACTCAGGTTGCTTCCACTCGCGTTCTTTCCATATTGATTCAATATCATTCAGTCCAGATCCCGCCCGCTTACACAAACCGATTAAAATAAACATTTTAAATAAATTCGGGTTGCGTAAATGGCT]
[+] EMBL CD122054             [    GTTTGACTCTTTATTTATGGAGTTATGGGCGTTATTTATAGAGTTAAAATCGTTATTTATAGAGTTTGATTCGCTATTTACGAAGTTGTCTATCTGTTCCCCCAGCCAACTGTCCAACTCATTGTCTATGTGCTGTATTACAAATTCTTGATCGTCTGTTTCAAACGAAGCTGCTGTTTCATCTGAAAAAATGATATCGCGCCGTTGCGTTGTTAATGTTAAAATCGTCCGCTCCGGATTTAGTTGCTGAATAAACTCAGGTTGCTTCCACTCGCGTTCTTTCCATATTGATTCAATACCATTCAGTCCAGATCCCGCCCGCTTACACAAACCGATTAAAATAAACATTTTAAATAAATTCGGGTTGCGTA       ]
[+] EMBL CD122015             [    GTTTGACTCTTTATTTATGGAGTTATGGGCGTTATTTATAGAGTTAAAATCGTTATTTATAGAGTTTGATTCGCTATTTACGAAGTTGTCTATCTGTTCCCCCAGCCAACTGTCCAACTCATTGTCTATGTGCTGTATTACAAATTCTTGATCGTCTGTTTCAAACGAAGCTGCTGTTTCATCTGAAAATATGATATCGCGCCGTTGCGTTGTTAATGTTAAAATCGTCCGCTCCGGATTTAGTTGCTGAATAAACTCAGGTTGCTTCCACTCGCGTTATTTCCATATTGATTCAATATCATTCAGTCCAGATCCCGCCCGCTTACACAAACCGATTAAAATAAACATTTTAAAT                       ]
[+] EMBL CD121895             [    GTTTGACTCTTTATTTATGGAGTTATGGGCGTTATTTATAGAGTTAAAATCGTTATTTATAGAGTTTGATTCGCTACTTACGAAGTTGCCTATCTGTTCCCCCAGCCAACTGTCCAACTCATTGTCTATGTGCTGTATTACAAATTCTTGATCGTCTGTTTCAAACGAAGCTGCTGTTTCATCTGAAAAAATGATATCGCGCCGTTGCGTTGTTAATGTTAAAATCGTCCGCTCCGGATTTAGTTGCTGAATAAACTCAGGTTGCTTCCACTCGCGTTCTTTCCATATTGATTCAATATCATTCAGTCCAGATCCCGCCCGCTTACACAAACCGATTAAAATAAACATTTTAAAT                       ]
[+] EMBL CD121872             [    GTTTGACTCTTTATTTATGGAGTTATGGGCGTTATTTATAGAGTTAAAATCGTTATTTATAGAGTTTGATTCGCTATTTACGAAGTTGCCTATCTGTTCCCCCAGCCAACTGTCCAACTCATTGTCTATGTGCTGTATTACAAATTCTTGATCGTCTGTTTCAAACGAAGCTGCTGTTTCATCTGAAAAAATGATATCGCGCCGTTGCGTTGTTAATGTTAAAATCGTCCGCTCCGGATTTAGTTGCTGAATAAACTCAGGTTGCTTCCACTCGCGTTCTTTCCATATTGATTCAATATCATTCAGTCCAGATCCCGCCCGCTTACACAAACCGATTAAAATAAACATTTTAAAT                       ]




>consensus_8239#0
GGGAGTTTGACTCTTTATTTATGGAGTTATGGGCGTTATTTATAGAGTTAAAATCGTTAT
TTATAGAGTTTGATTCGCTATTTACGAAGTTGTCTATCTGTTCCCCCAGCCAACTGTCCA
ACTCATTGTCTATGTGCTGTATTACAAATTCTTGATCGTCTGTTTCAAACGAAGCTGCTG
TTTCATCTGAAAAAATGATATCGCGCCGTTGCGTTGTTAATGTTAAAATCGTCCGCTCCG
GATTTAGTTGCTGAATAAACTCAGGTTGCTTCCACTCGCGTTCTTTCCATATTGATTCAA
TATCATTCAGTCCAGATCCCGCCCGCTTACACAAACCGATTAAAATAAACATTTTAAATA
AATTCGGGTTGCGTAAATTGCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case