These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8242#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 817 fasta sequence [GAATTTTGAAGTGATAGAGCTGTCAATGCTGAAAAAGCATATGTTTTTTCCTCTTTCTGGTTTGGGGAATTTTACTGCCCAGACTCTATTATATCCATTTGTTTTGCTTCGTACGAGACTCCAACTTCAAGAAGGTGCCCAGGTTTATCGTGGTCTTGTACATGCAATTTCTTCTGTTGTCAAGGAAGAGGGTTTTCGAGGATTGTATAGTGGCTACTTGGTTCGATCATTTCACATATTCTCAGGTACCATTTACGTTTCCACATATGAAGTAGCCAGACAAGCATGTACAGTCTTTCCAACACTAAGTCCTATTCACCGATCTTTTGTTGGTGGTGCAGTGGCTTCATGTGTTGCTCAAGGTTTTTTTGTTCCTATTGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTGAATTGTAATCGTATTCATACAAATATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCGTCCATTAACTCCGGTTCATTTAACAGAAAATGAAATGAATTCCAATTGGGGTCGTCTTTGTGGCGTAATTCGTTATATCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCTGATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATTTTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTAAGGAACATGTTCAAGACTCGGTATTGTTGCCATCAAACGATGATTCTGCTCCAGTTCCTAGATTATTGATTCAGTTGATTTCGGCTCCTCTAGCTGGCATTTCATCTGCTATCATTGTT] [+] EMBL CD148756 [GAATTTTGAAGTGATAGAGCTGTCAATGCTGAAAAAGCATATGTTTTTTCCTCTTTCTGGTTTGGGGAATTTTACTGCCCAGACTCTATTATATCCATTTGTTTTGCTTCGTACGAGACTCCAACTTCAAGAAGGTGCCCAGGTTTATCGTGGTCTTGTACATGCAATTTCTTCTGTTGTCAAGGAAGAGGGTTTTCGAGGATTGTATAGTGGCTACTTGGTTCGATCATTTCACATATTCTCAGGTACCATTTACGTTTCCACATATGAAGTAGCCAGACAAGCA ] [-] EMBL CD193967 [ CTATTATATCCATTTGTTTTGCTTCGTACGAGACTCCAACTTCAAGAAGGTGCCCAGGTTTATCGTGGTCTTGTACATGCAATTTCTTCTGTTGTCAAGGAAGAGGGTTTTCGAGGATTGTATAGTGGCTACTTGGTTCGATCATTTCACATATTCTCAGGTACCATTTACGTTTCCACATATGAAGTAGCCAGACAAGCATGTACAGTCTTTCCAACACTAAGTCCTATTCACCGATCTTTTGTTGGTGGTGCAGTGGCTTCATGTGTTGCTCAAGGTTTTTTTGTTCCTATTGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTG ] [+] EMBL CD148681 [ TTTACGTTTCCACATATGAAGTAGCCAGACAAGCATGTACAGTCTTTCCAACACTAAGTCCTATTCACCGATCTTTTGTTGGTGGTGCAGTGGCTTCATGTGTTGCTCAAGGTTTTTTTGTTCCTATTGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTGAATTGTAATCGTATTCATACAAATATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCGTCCATTAACTCCGGTTCATTTAACAGAAAATGAAATGAATTCCAATTGGGGTCGTCTTTGTGGCGTAATTCGTTATATCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCTGATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATTTTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTAAGGAACATGTTCAAGACTCGGTATTGTTGCCATCAAACGATGATTC ] [+] EMBL CD119009 [ TTTGTTGGTGGTGCAGTGGCTTCATGTGTTGCTCAAGGTTTTTTTGTTCCTATTGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTGAATTGTAATCGTATTCATACAAATATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCGTCCATTAACTCCGGTTCATTTAACGGAAAATGAAATGAATTCCAATTGGGGTCGTCTTTGTGGCGTAATTCGTTATATCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCTGATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATTTTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTCAGGAACATGTTCAAGACTCGGTATTGTTGCCATCAAACGATGATTCTGC ] [-] EMBL CD119205 [ nGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTGAATTGTAATCGTATTCATACAAATATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCGTCCATTAACTCCGGTTCATTTAACAGAAAATGAAATGAATTCCAATTGGGGTCGTCTTTGTGGCGTAATTCGTTATACCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCTGATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATTTTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTAAGGAACATGTTCAAGACTCGGTATTGTTGCCATCAAACGATGATTCTGCTCCAGTTCCTAGATTATTGATTCAGTTGATTTCGGCTCCTCTAGCTGGCATTTCATCTGCTATCATTGTT] [-] EMBL CD119239 [ TATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCGTCCATTAACTCCGGTTCATTTAACAGAAAATGAAATGAATTCCAATCGGGGTCGTCTTTGTGGCGTAATTCGTTATATCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCTGATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATTTTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTAAGGAACATGTTCAAGACTCGGTATTGTTGCCATCAAACGATGATTCTGCTCCAGTTCCTAGATTATTGATTCAGTTGATTTCGGCTCCTCTAGCTGGCATTTCATCTGCTATCATTGTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||