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Schistosoma mansoni
cluster # 8242 cluster # 8242       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8242#0 length = 817 sequences # 6  

consensusID : consensus_8242#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 817
fasta sequence
                              [GAATTTTGAAGTGATAGAGCTGTCAATGCTGAAAAAGCATATGTTTTTTCCTCTTTCTGGTTTGGGGAATTTTACTGCCCAGACTCTATTATATCCATTTGTTTTGCTTCGTACGAGACTCCAACTTCAAGAAGGTGCCCAGGTTTATCGTGGTCTTGTACATGCAATTTCTTCTGTTGTCAAGGAAGAGGGTTTTCGAGGATTGTATAGTGGCTACTTGGTTCGATCATTTCACATATTCTCAGGTACCATTTACGTTTCCACATATGAAGTAGCCAGACAAGCATGTACAGTCTTTCCAACACTAAGTCCTATTCACCGATCTTTTGTTGGTGGTGCAGTGGCTTCATGTGTTGCTCAAGGTTTTTTTGTTCCTATTGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTGAATTGTAATCGTATTCATACAAATATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCGTCCATTAACTCCGGTTCATTTAACAGAAAATGAAATGAATTCCAATTGGGGTCGTCTTTGTGGCGTAATTCGTTATATCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCTGATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATTTTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTAAGGAACATGTTCAAGACTCGGTATTGTTGCCATCAAACGATGATTCTGCTCCAGTTCCTAGATTATTGATTCAGTTGATTTCGGCTCCTCTAGCTGGCATTTCATCTGCTATCATTGTT]

[+] EMBL CD148756             [GAATTTTGAAGTGATAGAGCTGTCAATGCTGAAAAAGCATATGTTTTTTCCTCTTTCTGGTTTGGGGAATTTTACTGCCCAGACTCTATTATATCCATTTGTTTTGCTTCGTACGAGACTCCAACTTCAAGAAGGTGCCCAGGTTTATCGTGGTCTTGTACATGCAATTTCTTCTGTTGTCAAGGAAGAGGGTTTTCGAGGATTGTATAGTGGCTACTTGGTTCGATCATTTCACATATTCTCAGGTACCATTTACGTTTCCACATATGAAGTAGCCAGACAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD193967             [                                                                                     CTATTATATCCATTTGTTTTGCTTCGTACGAGACTCCAACTTCAAGAAGGTGCCCAGGTTTATCGTGGTCTTGTACATGCAATTTCTTCTGTTGTCAAGGAAGAGGGTTTTCGAGGATTGTATAGTGGCTACTTGGTTCGATCATTTCACATATTCTCAGGTACCATTTACGTTTCCACATATGAAGTAGCCAGACAAGCATGTACAGTCTTTCCAACACTAAGTCCTATTCACCGATCTTTTGTTGGTGGTGCAGTGGCTTCATGTGTTGCTCAAGGTTTTTTTGTTCCTATTGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD148681             [                                                                                                                                                                                                                                                           TTTACGTTTCCACATATGAAGTAGCCAGACAAGCATGTACAGTCTTTCCAACACTAAGTCCTATTCACCGATCTTTTGTTGGTGGTGCAGTGGCTTCATGTGTTGCTCAAGGTTTTTTTGTTCCTATTGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTGAATTGTAATCGTATTCATACAAATATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCGTCCATTAACTCCGGTTCATTTAACAGAAAATGAAATGAATTCCAATTGGGGTCGTCTTTGTGGCGTAATTCGTTATATCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCTGATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATTTTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTAAGGAACATGTTCAAGACTCGGTATTGTTGCCATCAAACGATGATTC                                                                         ]
[+] EMBL CD119009             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTGTTGGTGGTGCAGTGGCTTCATGTGTTGCTCAAGGTTTTTTTGTTCCTATTGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTGAATTGTAATCGTATTCATACAAATATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCGTCCATTAACTCCGGTTCATTTAACGGAAAATGAAATGAATTCCAATTGGGGTCGTCTTTGTGGCGTAATTCGTTATATCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCTGATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATTTTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTCAGGAACATGTTCAAGACTCGGTATTGTTGCCATCAAACGATGATTCTGC                                                                      ]
[-] EMBL CD119205             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          nGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTGAATTGTAATCGTATTCATACAAATATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCGTCCATTAACTCCGGTTCATTTAACAGAAAATGAAATGAATTCCAATTGGGGTCGTCTTTGTGGCGTAATTCGTTATACCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCTGATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATTTTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTAAGGAACATGTTCAAGACTCGGTATTGTTGCCATCAAACGATGATTCTGCTCCAGTTCCTAGATTATTGATTCAGTTGATTTCGGCTCCTCTAGCTGGCATTTCATCTGCTATCATTGTT]
[-] EMBL CD119239             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCGTCCATTAACTCCGGTTCATTTAACAGAAAATGAAATGAATTCCAATCGGGGTCGTCTTTGTGGCGTAATTCGTTATATCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCTGATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATTTTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTAAGGAACATGTTCAAGACTCGGTATTGTTGCCATCAAACGATGATTCTGCTCCAGTTCCTAGATTATTGATTCAGTTGATTTCGGCTCCTCTAGCTGGCATTTCATCTGCTATCATTGTT]


>consensus_8242#0 GAATTTTGAAGTGATAGAGCTGTCAATGCTGAAAAAGCATATGTTTTTTCCTCTTTCTGG TTTGGGGAATTTTACTGCCCAGACTCTATTATATCCATTTGTTTTGCTTCGTACGAGACT CCAACTTCAAGAAGGTGCCCAGGTTTATCGTGGTCTTGTACATGCAATTTCTTCTGTTGT CAAGGAAGAGGGTTTTCGAGGATTGTATAGTGGCTACTTGGTTCGATCATTTCACATATT CTCAGGTACCATTTACGTTTCCACATATGAAGTAGCCAGACAAGCATGTACAGTCTTTCC AACACTAAGTCCTATTCACCGATCTTTTGTTGGTGGTGCAGTGGCTTCATGTGTTGCTCA AGGTTTTTTTGTTCCTATTGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTGAATTGTAATCG TATTCATACAAATATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCG TCCATTAACTCCGGTTCATTTAACAGAAAATGAAATGAATTCCAATTGGGGTCGTCTTTG TGGCGTAATTCGTTATATCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCT GATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATT TTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTAAGGAACATGTTCAAGACTCGGT ATTGTTGCCATCAAACGATGATTCTGCTCCAGTTCCTAGATTATTGATTCAGTTGATTTC GGCTCCTCTAGCTGGCATTTCATCTGCTATCATTGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)