cluster # 8253

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8253 cluster # 8253 Sequences # 6 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8253#0 length = 1447 sequences # 6
consensusID : consensus_8253#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1447
fasta sequence
                              [AACAAGAAAACAAGGAGAAGAAAGGAACAACGAATATCANACAAGAAAAGGAGAAAAACCCATGAATATATTCTAAACGTATTATGCATTGATATGTTCAGTAATGAAAATGAAAGAAAGCATATTCGAAGCTTATTGTTTAAAATGAATGAATGTCAAGTTAAGTCAATTTAATTATGTTGATTTGAATAGAATAAATGAGCTGATATATTATTCGTCATATTAATATTTGTATTATTTAAAAGAGGATGTTGTAATTGTGATTGAATTCGTCGTTGAGATTGCTGCTGCTGTTGTTGTTGATGATGAAGATGCTGAAGTTGATGATGTTGAAGTTGTTGTTTATTTGATAAAATGGATTGTGGAAATGGATAATGAATTGGTTGAATAACTGGTATAGTTACTGTAACTGGTATTGGTGGTACATTATTATTATTACTATTATTATTAGTAGTAGCAGAAGTATTGCTCGAATCAAATTGTTGATTACTAGATGATGATGATGAAGAACATGTCACATTAATTGA-TTATCTATACTACTTAAATGTATTCTTCTATGTGCATATAAATAACTTTTACTAGTAAAACTTTTTTCACATCCTGAATAATCACATACATATGGACGTTCACCTAAATGTACATTCATATGTTCAGTTAAACTACGTGAATATAAAAATGTTTTACCACAACCATCATGTATACAATGATATTGACGACGTTGATTTTTATCTAAATGTACACGTTTATGTGCAAATAAATTACAACGTCTAGCAAAACGATGTGTACATCCTGGATAATCACATAGAAATGGTCTTTCACCAGTATGTATACGTATATGTTCTATAAGACATTCACGTGTAACAAATACTTTATTACATCCTGGTAATGTACATGAATAACGTTCACGT-AATTGTTTTGGTTCATGTAATTGTATGTGTGTTTTTAATAATGTTTCATTAGAAAATGTTAAATTACAATTA-GGATATGTACATATATAGGGTTTATCAATTGCATGACTTTGTTTATGATAAATAAGACTTGTTCGACTAAAAAATACTTTACCACAACCACGATAAGTACATGGATGACGTTTTAAATAATCTACTGTAGCTATACGTGATAAATTAGATTGTGATGAATGATTTTGTTGGTATGGATATTGATCATTGATTGAATTACTTATAAAGTTATTAGCATTTTGTGTAGAATAGTCATTCTTATTATCATTATTGTTAGTAGTATCTGTACGATCAATGCTTAACTCTAATGGATATCCCATTTCTGATTCTTCTTTAATCTTCATTATTTCTGAAAGAGTATTACAATTTTCTGAAGAATTTGTAAATAAAGAAATTGTTGATGATATAGAAGGAGAAGAAGATGAAACAGTTATAGTACTAGGATGAGGAGGGATGAAGTGGAGAGGTAAATATATTCTTGATTATTC]

[-] EMBL CD140949             [AACAAGAAAACAAGGAGAAGAAAGGAACAACGAATATCANACAAGAAAAGGAGAAAAACCCATGAATATATTCTAAACGTATTATGCATTGATATGTTCAGTAATGAAAATGAAAGAAAGCATATTCGAAGCTTATTGTTTAAAATGAATGAATGTCAAGTTAAGTCAATTTAATTATGTTGATTTGAATAGAATAAATGAGCTGATATATTATTCGTCATATTAATATTTGTATTATTTAAAAGAGGATGTTGTAATTGTGATTGAATTCGTCGTTGAGATTGCTGCTGCTGTTGTTGTTGATGATGAAGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL AI977194             [                                                                  TATATTCTAAACGTATTATGCATTGATATGTTCAGTAATGAAAATGAAAGAAAGCATATTCGAAGCTTATTGTTTAAAATGAATGAATGTCAAGCTAAGTCAATTTAATTATGTTGATTTGAATAGAATAAATGAGCTGATATATTATTCGTCATATTAATATTTGTATTATTTAAAAGAGGATGTTGTAATTGTGATTGAATTCGTTGTTGAGATTGCTGCTGCTGTTGTTGTTGATGATGAAGATGCTGAAGTTGATGATGTTGAAGTTGTTGTTTATTTGATAAAATGGATTGTGGAAATGGATAATGAATTGGTTGAATAACTGGTATAGTTACTGTAACTGGTATTGGTGGTACATTATTATTATTACTATTATTATTAGTAGTAGCAGAAGTATTGCTCGAATCAAATTGTTGATTACTAGATGATGATGATGAAGAACATGTCACATTAATTGATTTATCTATACTACTTGAATGTATTCTTCTATGTGCATATAAATAACTTTTACTAGTAAAACTTTTTTCACATCCTGAATAATCACATACATATGGACGTTCACCTAAATGTACATTCATATGTTCAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD191236             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATGAAGAACATGTCACATTAATTGA TTATCTATACTACTTAAATGTATTCTTCTATGTGCATATAAATAACTTTTACTAGTAAAACTTTTTTCACATCCTGAATAATCACATACATATGGACGTTCACCTAAATGTACATTCATATGTTCAGTTAAACTACGTGAATATAAAAATGTTTTACCACAACCATCATGTATACAATGATATTGACGACGTTGATTTTTATCTAAATGTACACGTTTATGTGCAAATAAATTACAACGTCTAGCAAAACGATGTGTACATCCTGGATAATCACATAGAAATGGTCTTTCACCAGTATGTATACGTATATGTTCTATAAGACATTCACGTGTAACAAATACTTTATTACATCCTGGTAATGTACATGAATAACGTTCACGT AATTGTTTTGGTTCATGTAATTGTATGTGTGTTTTTAATAATGTTTCATTAGAAAATGTTAAATTACAATTA GGATATGTACATATATAGGGTTTATCAATTGCATGACTTTGTTTATGATAAATAAGACTTGTTCGACTAAAAAATACTTTACCACAACCACGATAAGTACATGGATGACGTTTTAAATAATCTACTGTAGCTATACGTGATAAATTAGATTGTGATGAATGATTTTGTTGGTATGGATATTGATCATTGATTGAATTACTTATAA                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD191312             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATGAAGAATATCTCACATTAATTGA TTATCTATACTACTTAAATGTATTCTTCTATGTGCATATAAATAACTTTTACTAGTAAAACTTTTTTCACATCCTGAATAATCACATACATATGGACGTTCACCTAAATGTACATTCATATGTTCAGTTAAACTACGTGAATATAAAAATGTTTTACCACAACCATCATGTATACAATGATATTGACGACGTTGATTTTTATCTAAATGTACACGTTTATGTGCAAATAAATTACAACGTCTAGCAAAACGATGTGTACATCCTGGATAATCACATAGAAATGGTCTTTCACCAGTATGTATACGTATATGTTCTATAAGACATTCACGTGTAACAAATACTTTATTACATCCTGGTAATGTACATGAATAACGTTCACGT AATTGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL BF936946             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCACGTAAATTG TTTGGTTCATGTAATTGTATATGTGTTTTTAATAATGTTTCATTAGAAAATGTTAAATTACAATTAGGGATATGTACATATATAGGGTTTATCAATTGCATGACTTTGTTTATGATAAATAAGACTTGTTCGACTAAAGAATACTTTACCACAACCACGATAAGTACATGGATGACGTTTTAAATAATCTACTGTAGCTATACGTGATAAATTAGATTGTGATGAATGATTTTGTTGGTATGGATATTGATCATTGATTGAATTACTTATAAAGTTATTAGCATTTTGTGTAGAATAGTCATTCTTATTATCATTATTGTTAGTAGTATCTGTACGATCAATGCTTAACTCTAATGGATATCCCATTTCTGATTCTTCTTTAATCTTCATTATTTCTGAAAGAGTATTACAATTTTCTGAAGAATTTGTAAATAAAGAAATTGTTGATGATATAGAAGGAGAAGAAGATGAAACAGTTATAGTACTAGGATGAGGAGGGATGAAGTGGAGAGGTAAATATATTCTTGATTATTC]
[+] EMBL CD166534             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tcggtaccAAAATACTTTACCACAA CACGATAAGTACATGGATGACGTTTTAAATAATCTACTGTAGCTATACGTGATAAATTAGATTGTGATGAATGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]




>consensus_8253#0
AACAAGAAAACAAGGAGAAGAAAGGAACAACGAATATCANACAAGAAAAGGAGAAAAACC
CATGAATATATTCTAAACGTATTATGCATTGATATGTTCAGTAATGAAAATGAAAGAAAG
CATATTCGAAGCTTATTGTTTAAAATGAATGAATGTCAAGTTAAGTCAATTTAATTATGT
TGATTTGAATAGAATAAATGAGCTGATATATTATTCGTCATATTAATATTTGTATTATTT
AAAAGAGGATGTTGTAATTGTGATTGAATTCGTCGTTGAGATTGCTGCTGCTGTTGTTGT
TGATGATGAAGATGCTGAAGTTGATGATGTTGAAGTTGTTGTTTATTTGATAAAATGGAT
TGTGGAAATGGATAATGAATTGGTTGAATAACTGGTATAGTTACTGTAACTGGTATTGGT
GGTACATTATTATTATTACTATTATTATTAGTAGTAGCAGAAGTATTGCTCGAATCAAAT
TGTTGATTACTAGATGATGATGATGAAGAACATGTCACATTAATTGATTATCTATACTAC
TTAAATGTATTCTTCTATGTGCATATAAATAACTTTTACTAGTAAAACTTTTTTCACATC
CTGAATAATCACATACATATGGACGTTCACCTAAATGTACATTCATATGTTCAGTTAAAC
TACGTGAATATAAAAATGTTTTACCACAACCATCATGTATACAATGATATTGACGACGTT
GATTTTTATCTAAATGTACACGTTTATGTGCAAATAAATTACAACGTCTAGCAAAACGAT
GTGTACATCCTGGATAATCACATAGAAATGGTCTTTCACCAGTATGTATACGTATATGTT
CTATAAGACATTCACGTGTAACAAATACTTTATTACATCCTGGTAATGTACATGAATAAC
GTTCACGTAATTGTTTTGGTTCATGTAATTGTATGTGTGTTTTTAATAATGTTTCATTAG
AAAATGTTAAATTACAATTAGGATATGTACATATATAGGGTTTATCAATTGCATGACTTT
GTTTATGATAAATAAGACTTGTTCGACTAAAAAATACTTTACCACAACCACGATAAGTAC
ATGGATGACGTTTTAAATAATCTACTGTAGCTATACGTGATAAATTAGATTGTGATGAAT
GATTTTGTTGGTATGGATATTGATCATTGATTGAATTACTTATAAAGTTATTAGCATTTT
GTGTAGAATAGTCATTCTTATTATCATTATTGTTAGTAGTATCTGTACGATCAATGCTTA
ACTCTAATGGATATCCCATTTCTGATTCTTCTTTAATCTTCATTATTTCTGAAAGAGTAT
TACAATTTTCTGAAGAATTTGTAAATAAAGAAATTGTTGATGATATAGAAGGAGAAGAAG
ATGAAACAGTTATAGTACTAGGATGAGGAGGGATGAAGTGGAGAGGTAAATATATTCTTG
ATTATTC
clustalw multiple alignements is not computed in this case