cluster # 8279

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Schistosoma mansoni
cluster # 8279 cluster # 8279 Sequences # 6 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_8279#0 length = 2273 sequences # 6
consensusID : consensus_8279#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 2273
fasta sequence
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[+] EMBL SMATPASE             [TTACTAATGATTGTCAGTCCGTGTTGTCGGATTATCAGAACTTGCTGTGTGAGCAACCGAGGGACGTTTCATTCTCGCTTGGCCGCCTTGTACCCTTCATATATCAAAATACCTAACAACCACGCTCGGATATTTGTTACAAAGTCTAGAAAAATCAACCGTCCTTCTAGTTCATTTATTATTGACACGAAAGAAGCTAGGCAACGTAATTCAGATTCATCAACAGTGAGTTCAGATCTGGATGAAATTTTAAAGGATCAAACACCATCAGCACAGCTTCGACTAGTAGATGCCTATCGTAGAGGTTTTCAGTCGTCAACTGACAGTGGGAAGTCGTCAAATAAAATGCAGATGTGGAGGACAATTATTATAAAGACTATTCTTTTTGGGGTGGTCTCTTGCTTCACCATAGTGTTTTTAAAAAAGACACTGGTTGGTACGTTCCCGAAATTCTTGGACCAGAATATAGGGTCGTTTGCTGAAAACACTGACGTTAGCTTTAGTGACGTCCAAGGATGTGATGAGGTCAAAAAGGAACTCGTGGATGTCGTTGAATTTCTTAGAAACCCTGAAAAGTTCAATCAGATTGGAGCTAAACTCCCTAAAGGTGTCCTCCTTGTGGGTCCTCCTGGAGTTGGAAAAACCCTACTCGCTAAAGCCGTGTCTGGAGAAGCCCAAGTCCCTTTCTTATATGCTTCTGGGAGTAGTTTCGACGAAGTCCTCGTTGGACTAGGAGCTTCTCGTATTCGACAACTTTTCACCACTGCCAAACAGAATTCACCATGTTTGGTATTTATTGATGAAATAGATTCTGTCGGGGGAAATCGAACATTTTCTCCTCATCATCCCTTTGCGAATCAGACAATTAACCAGCTTCTCGCAGAAATGGATGGGTTCCAGTCGAAAGAAGGAATTATTGTTTTAG GTGCAACAAATCAAGCAGAAGTCTTAGACAAGGCTTTATTGAGACCTGGTCGTTTTGATGTCCAAATTCATGTATCACCACCAACTTATGAAGGCAGAATAGCTCTTCTAAATCTTTACTTAAAAAAAGTAAAAACAGGCTCAAATATTGATATAGAAAAGTTGGCCCATGGAACAGTTGGATACACTGGTGCGGATATACAGAATTTGGTTAATCAAGCTGCTATCGCTGCTGCACTACGTAATGATCCTTTTGTTGAAATGCATCATTTATGGGATGCTCGTGATCGATTAATAATGGGACCAGCTAAACGTCGTCCATTGGATGATCAAACTAATCGAGTGTCAGCATTTCATGAGGCTGGTCATGCTTTAGTAGCATTGCTGACTGCGGATAGTATACCATTACACAAAGTTACAATTATTCCTCGAGGTGAGGCAGGCGGTCTTACTAGTTTTCTACAAGAGAAAGATATAAGTTTTATGACTCGTGCACAATTATTAGCTCAATTAGATGTATTGATGGGTGGTCGAGTTGGTGAAGAATTAGTTTTTGGTGCAGACAAAGTTACCAATGGTGCAGCAGATGATTTTCGAAAAGCAACAATTTTAGCTCAAAATATGGTGAAACGCTTCGGTTTTTCAAGTAAAATTGGACCAAGAGTTATACCAGATACTCAGGATGAACAACTTGGTGAAGCCACACGTGACCTAATCGATAAAGAAGTTGACCAATTACTCAATGATTCTTTAACTCGTGTACGTACTTTACTATCTAGTCAAAGTAAACAACATAAACTTCTAGCTGAAGCATTACTACATTTTGAAACATTAACCAAAGATGAAGTATTAGCAGTATTAGCTGGTAAAATGAAACCTCCAAAAACTCAATCAGTAACATCAAAATCAACAACTCTTCTACCACAATTAGGTCCTTCAACATCAACTGAAATTCCACGTATGATTGTTTCATTAATCATTGTACATGTTGTTGATTTTATTTCGTTTTTTTGTCCATTCAAGGATACTTTACACACATATACACACACACACAAACTGTTATTTTCTTGAAACTTGTTAACTCATTACAAAAAGTTCCAATTGTTCAGTTCTCTTTTTTCTTTTTATTTTAATCGATGTATTTAGTTATTCTTCTATCATTTTCTAAATTTAATTTACTCCGTTATACTTTCACCCTTTAACTCCTTTCACTTTCCAGAGATAGAGCGAGAGAAAAAGAATACTCTAACTGTACCCAATGAAAGTTATATGTGCGTATATGTAATTATATTACGTTTTATGCTTTATAAATGGAACAAAAAAATGATATTTAACTGAAATGTAAATGT]
[+] EMBL AI976161             [                                TATCAGAAGTTGCTGTGTGAGCAACCGAGGGACGTTTCATTCTCGCTTGGCCGCCTTGTACCCTTCATATATCAAAATACCTAACAACCACGCTCGGATATTTGTTACAAAGTCTAGAAAAATCAACCGTCCTTCTAGTTCATTTATTATTGACACGAAAGAAGCTAGGCAACGTAATTCAGATTCATCAACAGTGAGTTCAGATCTGGATGAAATTTTAAAGGATCAAACACCATCAGCACAGCTTCGACTAGTAGATGCCTATCGTAGAGGTTTTCAGTCGTCAACTGACAGTGGGAAGTCGTCAAATAAAATGCAGATGTGGAGGACAATTATTATAAAGACTATTCTTTTTGGGGTGGTCTCTTGCTTCACCATAGTGTTTTTAAAAAAGACACTTGGTGGTACGTTCCCGAAATTCTTGGACCAGAATATAGGGTCGTTTGCTGAAAACACTGACGTTAGCTTTAGTGACGTCCAAGGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD060250             [                                                                                                                                                                                                                                                  TGAAA TTTAAAGGATCAAACACCATCAGCACAGCTTCGACTAGTAGATGCCTATCGTAGAGGTTTTCAGTCGTCTACTGACAGTGGGAAGTCATCAAATAAAATGCAGATGTGGAGGACAATTATTATAAAGACTATTCTTTTTGGGGTGGTCTCTTGCTTCACCATAGTGTTTTTAAAAAAGACACTTGGTGGTACGTTCCCGAAATTCTTGGACCAGAATATAGGGTCGTGTGCTGAAAACACTGACGTTAGCTTTAGTGACGTCCAAGGATGTGATGAGGTCAAAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD137248             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACTTGGTGGTACGTTCCCGAAATTCTTGGACCAGAATATAGGGTCGTTTGCTGAAAACGCTGACGTTAGCTTTAGTGACGTCCAAGGATGTGATGAGGTCAAAAAGGAACTCGTGGATGTCGTTGAATTTCTTAGAAACCCTGAAAAGTTCAATCAGATTGGAGCTAAACTCCCTAAAGGTGTCCTCCTTGTGGGTCCTCCTGGAGTTGGAAAAACCCTACTCGCTAAAGCCGTGTCTGGAGAAGCCCAAGTCCCTTTCTTATATGCTTCTGGGAGTAGTTTCGACGAAGTCCTCGTTGGACTAGGAGCTTCTCGTATTCGACAACTTTTCACCACTGCCAAACAGAATTCACCATGTTTGGTATTTATTGATGAAATAGATTCTGTCGGGGGAAATCGAACATTTTCTCCTCATCATCCCTTTGCGAATCAGACAATTAACCAGCTTCTCGCAGAAATGGATGGGTTCCAGTCGAAAGAAGGAATTATTGTTTTAGTGTGCAACAAATCAAGCAGAAGTCTTAGACAAGGCTTTATTGAGACCTGGTCGTTTTGATGTCCAAATTCATGTATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD137034             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTGGAGAAGCCCAAGTCCCTTTCTTATATGCTTCTGGGAGTAGTTTCGACGAAGTCCTCGTTGGACTAGGAGCTTCTCGTATTCGACAACTTTTCACCACTGCCAAACAGAATTCACCATGTTTGGTATTTATTGATGAAATAGATTCTGTCGGGGGAAATCGAACATTTTCTCCTCATCATCCCTTTGCGAATCAGACAATTAACCAGCTTCTCGCAGAAATGGATGGGTTCCAGTCGAAAGAAGGAATTATTGTTTTAG GTGCAACAAATCAAGCAGAAGTCTTAGACAAGGCTTTATTGAGACCTGGTCGTTTTGATGTCCAAATTCATGTATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD170472             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAATCAAGCTGCTATCGCTGCTGCACTACGTAATGATCCTTTTGTTGAAATGCATCATTTATGGGATGCTCGTGATCGATTAATAATGGGACCAGCTAAACGTCGTCCATTGGATGATCAAACTAATCGAGTGTCAGCATTTCATGAGGCTGGTCATGCTTTAGTAGCATTGCTGACTGCGGATAGTATACCATTACACAAAGTTACAATTATTCCTCGAGGTGAGGCAGGCGGTCTTACTAGTTTTCTACAAGAGAAAGATATAAGTTTTATGACTCGTGCACAATTATTAGCTCAATTAGATGTATTGATGGGTGGTCGAGTTGGTGAAGAATTAGTTTTTGGTGCAGACAAAGTTACCAATGGTGCAGCAGATGATTTTCGAAAAGCAACAATTTTAGCTCAAAATATGGTGAAACGCTTCGGTTTTTCAAGTAAAATTGGACCAAGAGTTATACCAGATACTCAGGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]




>consensus_8279#0
TTACTAATGATTGTCAGTCCGTGTTGTCGGATTATCAGAACTTGCTGTGTGAGCAACCGA
GGGACGTTTCATTCTCGCTTGGCCGCCTTGTACCCTTCATATATCAAAATACCTAACAAC
CACGCTCGGATATTTGTTACAAAGTCTAGAAAAATCAACCGTCCTTCTAGTTCATTTATT
ATTGACACGAAAGAAGCTAGGCAACGTAATTCAGATTCATCAACAGTGAGTTCAGATCTG
GATGAAATTTTAAAGGATCAAACACCATCAGCACAGCTTCGACTAGTAGATGCCTATCGT
AGAGGTTTTCAGTCGTCAACTGACAGTGGGAAGTCGTCAAATAAAATGCAGATGTGGAGG
ACAATTATTATAAAGACTATTCTTTTTGGGGTGGTCTCTTGCTTCACCATAGTGTTTTTA
AAAAAGACACTTGGTGGTACGTTCCCGAAATTCTTGGACCAGAATATAGGGTCGTTTGCT
GAAAACACTGACGTTAGCTTTAGTGACGTCCAAGGATGTGATGAGGTCAAAAAGGAACTC
GTGGATGTCGTTGAATTTCTTAGAAACCCTGAAAAGTTCAATCAGATTGGAGCTAAACTC
CCTAAAGGTGTCCTCCTTGTGGGTCCTCCTGGAGTTGGAAAAACCCTACTCGCTAAAGCC
GTGTCTGGAGAAGCCCAAGTCCCTTTCTTATATGCTTCTGGGAGTAGTTTCGACGAAGTC
CTCGTTGGACTAGGAGCTTCTCGTATTCGACAACTTTTCACCACTGCCAAACAGAATTCA
CCATGTTTGGTATTTATTGATGAAATAGATTCTGTCGGGGGAAATCGAACATTTTCTCCT
CATCATCCCTTTGCGAATCAGACAATTAACCAGCTTCTCGCAGAAATGGATGGGTTCCAG
TCGAAAGAAGGAATTATTGTTTTAGGTGCAACAAATCAAGCAGAAGTCTTAGACAAGGCT
TTATTGAGACCTGGTCGTTTTGATGTCCAAATTCATGTATCACCACCAACTTATGAAGGC
AGAATAGCTCTTCTAAATCTTTACTTAAAAAAAGTAAAAACAGGCTCAAATATTGATATA
GAAAAGTTGGCCCATGGAACAGTTGGATACACTGGTGCGGATATACAGAATTTGGTTAAT
CAAGCTGCTATCGCTGCTGCACTACGTAATGATCCTTTTGTTGAAATGCATCATTTATGG
GATGCTCGTGATCGATTAATAATGGGACCAGCTAAACGTCGTCCATTGGATGATCAAACT
AATCGAGTGTCAGCATTTCATGAGGCTGGTCATGCTTTAGTAGCATTGCTGACTGCGGAT
AGTATACCATTACACAAAGTTACAATTATTCCTCGAGGTGAGGCAGGCGGTCTTACTAGT
TTTCTACAAGAGAAAGATATAAGTTTTATGACTCGTGCACAATTATTAGCTCAATTAGAT
GTATTGATGGGTGGTCGAGTTGGTGAAGAATTAGTTTTTGGTGCAGACAAAGTTACCAAT
GGTGCAGCAGATGATTTTCGAAAAGCAACAATTTTAGCTCAAAATATGGTGAAACGCTTC
GGTTTTTCAAGTAAAATTGGACCAAGAGTTATACCAGATACTCAGGATGAACAACTTGGT
GAAGCCACACGTGACCTAATCGATAAAGAAGTTGACCAATTACTCAATGATTCTTTAACT
CGTGTACGTACTTTACTATCTAGTCAAAGTAAACAACATAAACTTCTAGCTGAAGCATTA
CTACATTTTGAAACATTAACCAAAGATGAAGTATTAGCAGTATTAGCTGGTAAAATGAAA
CCTCCAAAAACTCAATCAGTAACATCAAAATCAACAACTCTTCTACCACAATTAGGTCCT
TCAACATCAACTGAAATTCCACGTATGATTGTTTCATTAATCATTGTACATGTTGTTGAT
TTTATTTCGTTTTTTTGTCCATTCAAGGATACTTTACACACATATACACACACACACAAA
CTGTTATTTTCTTGAAACTTGTTAACTCATTACAAAAAGTTCCAATTGTTCAGTTCTCTT
TTTTCTTTTTATTTTAATCGATGTATTTAGTTATTCTTCTATCATTTTCTAAATTTAATT
TACTCCGTTATACTTTCACCCTTTAACTCCTTTCACTTTCCAGAGATAGAGCGAGAGAAA
AAGAATACTCTAACTGTACCCAATGAAAGTTATATGTGCGTATATGTAATTATATTACGT
TTTATGCTTTATAAATGGAACAAAAAAATGATATTTAACTGAAATGTAAATGT
clustalw multiple alignements is not computed in this case