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Schistosoma mansoni
cluster # 8279 cluster # 8279       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8279#0 length = 2273 sequences # 6  

consensusID : consensus_8279#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 2273
fasta sequence
                              [TTACTAATGATTGTCAGTCCGTGTTGTCGGATTATCAGAACTTGCTGTGTGAGCAACCGAGGGACGTTTCATTCTCGCTTGGCCGCCTTGTACCCTTCATATATCAAAATACCTAACAACCACGCTCGGATATTTGTTACAAAGTCTAGAAAAATCAACCGTCCTTCTAGTTCATTTATTATTGACACGAAAGAAGCTAGGCAACGTAATTCAGATTCATCAACAGTGAGTTCAGATCTGGATGAAATTTTAAAGGATCAAACACCATCAGCACAGCTTCGACTAGTAGATGCCTATCGTAGAGGTTTTCAGTCGTCAACTGACAGTGGGAAGTCGTCAAATAAAATGCAGATGTGGAGGACAATTATTATAAAGACTATTCTTTTTGGGGTGGTCTCTTGCTTCACCATAGTGTTTTTAAAAAAGACACTTGGTGGTACGTTCCCGAAATTCTTGGACCAGAATATAGGGTCGTTTGCTGAAAACACTGACGTTAGCTTTAGTGACGTCCAAGGATGTGATGAGGTCAAAAAGGAACTCGTGGATGTCGTTGAATTTCTTAGAAACCCTGAAAAGTTCAATCAGATTGGAGCTAAACTCCCTAAAGGTGTCCTCCTTGTGGGTCCTCCTGGAGTTGGAAAAACCCTACTCGCTAAAGCCGTGTCTGGAGAAGCCCAAGTCCCTTTCTTATATGCTTCTGGGAGTAGTTTCGACGAAGTCCTCGTTGGACTAGGAGCTTCTCGTATTCGACAACTTTTCACCACTGCCAAACAGAATTCACCATGTTTGGTATTTATTGATGAAATAGATTCTGTCGGGGGAAATCGAACATTTTCTCCTCATCATCCCTTTGCGAATCAGACAATTAACCAGCTTCTCGCAGAAATGGATGGGTTCCAGTCGAAAGAAGGAATTATTGTTTTAG-GTGCAACAAATCAAGCAGAAGTCTTAGACAAGGCTTTATTGAGACCTGGTCGTTTTGATGTCCAAATTCATGTATCACCACCAACTTATGAAGGCAGAATAGCTCTTCTAAATCTTTACTTAAAAAAAGTAAAAACAGGCTCAAATATTGATATAGAAAAGTTGGCCCATGGAACAGTTGGATACACTGGTGCGGATATACAGAATTTGGTTAATCAAGCTGCTATCGCTGCTGCACTACGTAATGATCCTTTTGTTGAAATGCATCATTTATGGGATGCTCGTGATCGATTAATAATGGGACCAGCTAAACGTCGTCCATTGGATGATCAAACTAATCGAGTGTCAGCATTTCATGAGGCTGGTCATGCTTTAGTAGCATTGCTGACTGCGGATAGTATACCATTACACAAAGTTACAATTATTCCTCGAGGTGAGGCAGGCGGTCTTACTAGTTTTCTACAAGAGAAAGATATAAGTTTTATGACTCGTGCACAATTATTAGCTCAATTAGATGTATTGATGGGTGGTCGAGTTGGTGAAGAATTAGTTTTTGGTGCAGACAAAGTTACCAATGGTGCAGCAGATGATTTTCGAAAAGCAACAATTTTAGCTCAAAATATGGTGAAACGCTTCGGTTTTTCAAGTAAAATTGGACCAAGAGTTATACCAGATACTCAGGATGAACAACTTGGTGAAGCCACACGTGACCTAATCGATAAAGAAGTTGACCAATTACTCAATGATTCTTTAACTCGTGTACGTACTTTACTATCTAGTCAAAGTAAACAACATAAACTTCTAGCTGAAGCATTACTACATTTTGAAACATTAACCAAAGATGAAGTATTAGCAGTATTAGCTGGTAAAATGAAACCTCCAAAAACTCAATCAGTAACATCAAAATCAACAACTCTTCTACCACAATTAGGTCCTTCAACATCAACTGAAATTCCACGTATGATTGTTTCATTAATCATTGTACATGTTGTTGATTTTATTTCGTTTTTTTGTCCATTCAAGGATACTTTACACACATATACACACACACACAAACTGTTATTTTCTTGAAACTTGTTAACTCATTACAAAAAGTTCCAATTGTTCAGTTCTCTTTTTTCTTTTTATTTTAATCGATGTATTTAGTTATTCTTCTATCATTTTCTAAATTTAATTTACTCCGTTATACTTTCACCCTTTAACTCCTTTCACTTTCCAGAGATAGAGCGAGAGAAAAAGAATACTCTAACTGTACCCAATGAAAGTTATATGTGCGTATATGTAATTATATTACGTTTTATGCTTTATAAATGGAACAAAAAAATGATATTTAACTGAAATGTAAATGT]

[+] EMBL SMATPASE             [TTACTAATGATTGTCAGTCCGTGTTGTCGGATTATCAGAACTTGCTGTGTGAGCAACCGAGGGACGTTTCATTCTCGCTTGGCCGCCTTGTACCCTTCATATATCAAAATACCTAACAACCACGCTCGGATATTTGTTACAAAGTCTAGAAAAATCAACCGTCCTTCTAGTTCATTTATTATTGACACGAAAGAAGCTAGGCAACGTAATTCAGATTCATCAACAGTGAGTTCAGATCTGGATGAAATTTTAAAGGATCAAACACCATCAGCACAGCTTCGACTAGTAGATGCCTATCGTAGAGGTTTTCAGTCGTCAACTGACAGTGGGAAGTCGTCAAATAAAATGCAGATGTGGAGGACAATTATTATAAAGACTATTCTTTTTGGGGTGGTCTCTTGCTTCACCATAGTGTTTTTAAAAAAGACACTGGTTGGTACGTTCCCGAAATTCTTGGACCAGAATATAGGGTCGTTTGCTGAAAACACTGACGTTAGCTTTAGTGACGTCCAAGGATGTGATGAGGTCAAAAAGGAACTCGTGGATGTCGTTGAATTTCTTAGAAACCCTGAAAAGTTCAATCAGATTGGAGCTAAACTCCCTAAAGGTGTCCTCCTTGTGGGTCCTCCTGGAGTTGGAAAAACCCTACTCGCTAAAGCCGTGTCTGGAGAAGCCCAAGTCCCTTTCTTATATGCTTCTGGGAGTAGTTTCGACGAAGTCCTCGTTGGACTAGGAGCTTCTCGTATTCGACAACTTTTCACCACTGCCAAACAGAATTCACCATGTTTGGTATTTATTGATGAAATAGATTCTGTCGGGGGAAATCGAACATTTTCTCCTCATCATCCCTTTGCGAATCAGACAATTAACCAGCTTCTCGCAGAAATGGATGGGTTCCAGTCGAAAGAAGGAATTATTGTTTTAG GTGCAACAAATCAAGCAGAAGTCTTAGACAAGGCTTTATTGAGACCTGGTCGTTTTGATGTCCAAATTCATGTATCACCACCAACTTATGAAGGCAGAATAGCTCTTCTAAATCTTTACTTAAAAAAAGTAAAAACAGGCTCAAATATTGATATAGAAAAGTTGGCCCATGGAACAGTTGGATACACTGGTGCGGATATACAGAATTTGGTTAATCAAGCTGCTATCGCTGCTGCACTACGTAATGATCCTTTTGTTGAAATGCATCATTTATGGGATGCTCGTGATCGATTAATAATGGGACCAGCTAAACGTCGTCCATTGGATGATCAAACTAATCGAGTGTCAGCATTTCATGAGGCTGGTCATGCTTTAGTAGCATTGCTGACTGCGGATAGTATACCATTACACAAAGTTACAATTATTCCTCGAGGTGAGGCAGGCGGTCTTACTAGTTTTCTACAAGAGAAAGATATAAGTTTTATGACTCGTGCACAATTATTAGCTCAATTAGATGTATTGATGGGTGGTCGAGTTGGTGAAGAATTAGTTTTTGGTGCAGACAAAGTTACCAATGGTGCAGCAGATGATTTTCGAAAAGCAACAATTTTAGCTCAAAATATGGTGAAACGCTTCGGTTTTTCAAGTAAAATTGGACCAAGAGTTATACCAGATACTCAGGATGAACAACTTGGTGAAGCCACACGTGACCTAATCGATAAAGAAGTTGACCAATTACTCAATGATTCTTTAACTCGTGTACGTACTTTACTATCTAGTCAAAGTAAACAACATAAACTTCTAGCTGAAGCATTACTACATTTTGAAACATTAACCAAAGATGAAGTATTAGCAGTATTAGCTGGTAAAATGAAACCTCCAAAAACTCAATCAGTAACATCAAAATCAACAACTCTTCTACCACAATTAGGTCCTTCAACATCAACTGAAATTCCACGTATGATTGTTTCATTAATCATTGTACATGTTGTTGATTTTATTTCGTTTTTTTGTCCATTCAAGGATACTTTACACACATATACACACACACACAAACTGTTATTTTCTTGAAACTTGTTAACTCATTACAAAAAGTTCCAATTGTTCAGTTCTCTTTTTTCTTTTTATTTTAATCGATGTATTTAGTTATTCTTCTATCATTTTCTAAATTTAATTTACTCCGTTATACTTTCACCCTTTAACTCCTTTCACTTTCCAGAGATAGAGCGAGAGAAAAAGAATACTCTAACTGTACCCAATGAAAGTTATATGTGCGTATATGTAATTATATTACGTTTTATGCTTTATAAATGGAACAAAAAAATGATATTTAACTGAAATGTAAATGT]
[+] EMBL AI976161             [                                TATCAGAAGTTGCTGTGTGAGCAACCGAGGGACGTTTCATTCTCGCTTGGCCGCCTTGTACCCTTCATATATCAAAATACCTAACAACCACGCTCGGATATTTGTTACAAAGTCTAGAAAAATCAACCGTCCTTCTAGTTCATTTATTATTGACACGAAAGAAGCTAGGCAACGTAATTCAGATTCATCAACAGTGAGTTCAGATCTGGATGAAATTTTAAAGGATCAAACACCATCAGCACAGCTTCGACTAGTAGATGCCTATCGTAGAGGTTTTCAGTCGTCAACTGACAGTGGGAAGTCGTCAAATAAAATGCAGATGTGGAGGACAATTATTATAAAGACTATTCTTTTTGGGGTGGTCTCTTGCTTCACCATAGTGTTTTTAAAAAAGACACTTGGTGGTACGTTCCCGAAATTCTTGGACCAGAATATAGGGTCGTTTGCTGAAAACACTGACGTTAGCTTTAGTGACGTCCAAGGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD060250             [                                                                                                                                                                                                                                                  TGAAA TTTAAAGGATCAAACACCATCAGCACAGCTTCGACTAGTAGATGCCTATCGTAGAGGTTTTCAGTCGTCTACTGACAGTGGGAAGTCATCAAATAAAATGCAGATGTGGAGGACAATTATTATAAAGACTATTCTTTTTGGGGTGGTCTCTTGCTTCACCATAGTGTTTTTAAAAAAGACACTTGGTGGTACGTTCCCGAAATTCTTGGACCAGAATATAGGGTCGTGTGCTGAAAACACTGACGTTAGCTTTAGTGACGTCCAAGGATGTGATGAGGTCAAAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD137248             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACTTGGTGGTACGTTCCCGAAATTCTTGGACCAGAATATAGGGTCGTTTGCTGAAAACGCTGACGTTAGCTTTAGTGACGTCCAAGGATGTGATGAGGTCAAAAAGGAACTCGTGGATGTCGTTGAATTTCTTAGAAACCCTGAAAAGTTCAATCAGATTGGAGCTAAACTCCCTAAAGGTGTCCTCCTTGTGGGTCCTCCTGGAGTTGGAAAAACCCTACTCGCTAAAGCCGTGTCTGGAGAAGCCCAAGTCCCTTTCTTATATGCTTCTGGGAGTAGTTTCGACGAAGTCCTCGTTGGACTAGGAGCTTCTCGTATTCGACAACTTTTCACCACTGCCAAACAGAATTCACCATGTTTGGTATTTATTGATGAAATAGATTCTGTCGGGGGAAATCGAACATTTTCTCCTCATCATCCCTTTGCGAATCAGACAATTAACCAGCTTCTCGCAGAAATGGATGGGTTCCAGTCGAAAGAAGGAATTATTGTTTTAGTGTGCAACAAATCAAGCAGAAGTCTTAGACAAGGCTTTATTGAGACCTGGTCGTTTTGATGTCCAAATTCATGTATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD137034             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTGGAGAAGCCCAAGTCCCTTTCTTATATGCTTCTGGGAGTAGTTTCGACGAAGTCCTCGTTGGACTAGGAGCTTCTCGTATTCGACAACTTTTCACCACTGCCAAACAGAATTCACCATGTTTGGTATTTATTGATGAAATAGATTCTGTCGGGGGAAATCGAACATTTTCTCCTCATCATCCCTTTGCGAATCAGACAATTAACCAGCTTCTCGCAGAAATGGATGGGTTCCAGTCGAAAGAAGGAATTATTGTTTTAG GTGCAACAAATCAAGCAGAAGTCTTAGACAAGGCTTTATTGAGACCTGGTCGTTTTGATGTCCAAATTCATGTATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD170472             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAATCAAGCTGCTATCGCTGCTGCACTACGTAATGATCCTTTTGTTGAAATGCATCATTTATGGGATGCTCGTGATCGATTAATAATGGGACCAGCTAAACGTCGTCCATTGGATGATCAAACTAATCGAGTGTCAGCATTTCATGAGGCTGGTCATGCTTTAGTAGCATTGCTGACTGCGGATAGTATACCATTACACAAAGTTACAATTATTCCTCGAGGTGAGGCAGGCGGTCTTACTAGTTTTCTACAAGAGAAAGATATAAGTTTTATGACTCGTGCACAATTATTAGCTCAATTAGATGTATTGATGGGTGGTCGAGTTGGTGAAGAATTAGTTTTTGGTGCAGACAAAGTTACCAATGGTGCAGCAGATGATTTTCGAAAAGCAACAATTTTAGCTCAAAATATGGTGAAACGCTTCGGTTTTTCAAGTAAAATTGGACCAAGAGTTATACCAGATACTCAGGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]


>consensus_8279#0 TTACTAATGATTGTCAGTCCGTGTTGTCGGATTATCAGAACTTGCTGTGTGAGCAACCGA GGGACGTTTCATTCTCGCTTGGCCGCCTTGTACCCTTCATATATCAAAATACCTAACAAC CACGCTCGGATATTTGTTACAAAGTCTAGAAAAATCAACCGTCCTTCTAGTTCATTTATT ATTGACACGAAAGAAGCTAGGCAACGTAATTCAGATTCATCAACAGTGAGTTCAGATCTG GATGAAATTTTAAAGGATCAAACACCATCAGCACAGCTTCGACTAGTAGATGCCTATCGT AGAGGTTTTCAGTCGTCAACTGACAGTGGGAAGTCGTCAAATAAAATGCAGATGTGGAGG ACAATTATTATAAAGACTATTCTTTTTGGGGTGGTCTCTTGCTTCACCATAGTGTTTTTA AAAAAGACACTTGGTGGTACGTTCCCGAAATTCTTGGACCAGAATATAGGGTCGTTTGCT GAAAACACTGACGTTAGCTTTAGTGACGTCCAAGGATGTGATGAGGTCAAAAAGGAACTC GTGGATGTCGTTGAATTTCTTAGAAACCCTGAAAAGTTCAATCAGATTGGAGCTAAACTC CCTAAAGGTGTCCTCCTTGTGGGTCCTCCTGGAGTTGGAAAAACCCTACTCGCTAAAGCC GTGTCTGGAGAAGCCCAAGTCCCTTTCTTATATGCTTCTGGGAGTAGTTTCGACGAAGTC CTCGTTGGACTAGGAGCTTCTCGTATTCGACAACTTTTCACCACTGCCAAACAGAATTCA CCATGTTTGGTATTTATTGATGAAATAGATTCTGTCGGGGGAAATCGAACATTTTCTCCT CATCATCCCTTTGCGAATCAGACAATTAACCAGCTTCTCGCAGAAATGGATGGGTTCCAG TCGAAAGAAGGAATTATTGTTTTAGGTGCAACAAATCAAGCAGAAGTCTTAGACAAGGCT TTATTGAGACCTGGTCGTTTTGATGTCCAAATTCATGTATCACCACCAACTTATGAAGGC AGAATAGCTCTTCTAAATCTTTACTTAAAAAAAGTAAAAACAGGCTCAAATATTGATATA GAAAAGTTGGCCCATGGAACAGTTGGATACACTGGTGCGGATATACAGAATTTGGTTAAT CAAGCTGCTATCGCTGCTGCACTACGTAATGATCCTTTTGTTGAAATGCATCATTTATGG GATGCTCGTGATCGATTAATAATGGGACCAGCTAAACGTCGTCCATTGGATGATCAAACT AATCGAGTGTCAGCATTTCATGAGGCTGGTCATGCTTTAGTAGCATTGCTGACTGCGGAT AGTATACCATTACACAAAGTTACAATTATTCCTCGAGGTGAGGCAGGCGGTCTTACTAGT TTTCTACAAGAGAAAGATATAAGTTTTATGACTCGTGCACAATTATTAGCTCAATTAGAT GTATTGATGGGTGGTCGAGTTGGTGAAGAATTAGTTTTTGGTGCAGACAAAGTTACCAAT GGTGCAGCAGATGATTTTCGAAAAGCAACAATTTTAGCTCAAAATATGGTGAAACGCTTC GGTTTTTCAAGTAAAATTGGACCAAGAGTTATACCAGATACTCAGGATGAACAACTTGGT GAAGCCACACGTGACCTAATCGATAAAGAAGTTGACCAATTACTCAATGATTCTTTAACT CGTGTACGTACTTTACTATCTAGTCAAAGTAAACAACATAAACTTCTAGCTGAAGCATTA CTACATTTTGAAACATTAACCAAAGATGAAGTATTAGCAGTATTAGCTGGTAAAATGAAA CCTCCAAAAACTCAATCAGTAACATCAAAATCAACAACTCTTCTACCACAATTAGGTCCT TCAACATCAACTGAAATTCCACGTATGATTGTTTCATTAATCATTGTACATGTTGTTGAT TTTATTTCGTTTTTTTGTCCATTCAAGGATACTTTACACACATATACACACACACACAAA CTGTTATTTTCTTGAAACTTGTTAACTCATTACAAAAAGTTCCAATTGTTCAGTTCTCTT TTTTCTTTTTATTTTAATCGATGTATTTAGTTATTCTTCTATCATTTTCTAAATTTAATT TACTCCGTTATACTTTCACCCTTTAACTCCTTTCACTTTCCAGAGATAGAGCGAGAGAAA AAGAATACTCTAACTGTACCCAATGAAAGTTATATGTGCGTATATGTAATTATATTACGT TTTATGCTTTATAAATGGAACAAAAAAATGATATTTAACTGAAATGTAAATGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)