Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8287 cluster # 8287       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8287#0 length = 643 sequences # 6  
consensusID : consensus_8287#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 643
fasta sequence 
                              [ATTTACTGGGAGTTTAACAACTTCAAGTGAAGTATTGGTTTGTTTATCATTTCTAAATGTTGATGACGGTTTGATTGGTCCGATAGAATATAAAATTTCAGCTAACAATTGACCAGTAGGTTCGAAGCCTAAACCTCCAGCACCAGGATATGAAATAGAGCCTAAAGTTAATCGCACAATTGATTCAACTGGATCCATGAAACCAAAATTGTAACTATCTGAAGAATCGCATAAATTTGCAATTTTTTGAAGATAATTTATCCACGTTAAACAATTCAATGATCGATCTAAAATGAGCTTACGATACGTTTCATCTTCCTCATTAATTTTTTTGCATTTTGACAATAAATATGCATGAATAAATGGCATATATACCCATTCCTTTGAAATTAATCGGTCACATACAGATCTTGGTTTAGAAATAACATGATTCAATTGAAAAATAGATTGATATTTCAATGAATGATCTGGATTTACTTCAAGCATATCTTCAAGAATTGGTGATAAGCTTAATCGACTGTCTTCGTTATCATTAATATTATCTGTGACACCATCATTCCGTGCAATGGAAGTTGATGTTGTTCCAAGTACTAGTTCATGGGTATACAGTTCTCTAATTTCATGTAGACGTCGTAAAACGTAT]

[+] EMBL CD067358             [ATTTACTGGGAGTTTAACAACTTCAAGCGAAGTATTGGTTTGTTTATCATTTCTAAACGTTGATGACGGATTGATTGGTCCGATAGAATATAAAATTTCAGCTAACAATTGACCACCATGTTCGAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD067359             [ATTTACTGGGAGTTTAACAACTTCAAGTGAAGTATTGGTTTGTTTATCATTTCTAAATGTTGATGACGGGTTGATTGGTCCGATAGAATATAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD067237             [   TACTGGGAGTTTAACAACTTCAAGTGAAGTATTGGTTTGTTTATCATTTCTAAATGTTGATGACGGTTTGATTGGTCCGATAGAATATAAAATTTCAGCTAACAATTGACCAGTAGGTTCGAAGCCTAAACCTCCAGCACCAGGATATGAAATAGAGCCTAAAGTTAATCGCACAATTGATTCAACTGGATCCATGAAACCAAAATTGTAACTATCTGAAGAATCGCATAAATTTGCAATTTTTTGAAGATAATTTATCCACGTTAAACAATTCAATGATCGATCTAAAATGAGCTTACGATACGTTTCATCTTCCTCATTAATTTTTTTGCATTTTGACAATAAATATGCATGAATAAATGGCATATATACCCATTCCTTTGAAATTAATCGGTCACATACAGATCTTGGTTTAGAAATAACATGATTCAATTGAAAAATAGATTGATATTTCAATGAATGATCTGGATTTACTTCAAGCATATCTTCAAGAATTGGTGATAAGCTTAATCG                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD066738             [   TACTGGGAGTTTAACAACTTCAAGTGAAGTATTGGTTTGTTTATCATTTCTAAACGTTGATGACGGTTTGATTGGTCCGATAGAATATAAAATTTCAGCCAACAATTGACCAGTAGGTTCGAAGCCTAAACCTCCAGCACCAGGATATGAAATAGAGCCTAAAGTTAATCGCACAATTGATTCAACTGGATCCATGAAACCAAAATTGTAACTATCTGAAGAATCGCATAAATTTGCAATTTTTTGAAGATAATTTATCCACGTTAAACAATTCAATGATCGATCTAAAATGAGCTTACGATACGTTTCATCTTCCTCATTAATTTTTTTGCATTTTGACAATAAATATGCATGAATAAATGGCATATATACCCATTCCTTTGAAATTAATCGGTCACATACAGATCTTGGTTTAGAAATAACATGATTCAATTGAAAAATAGATTGATATTTCAATGAATGATCTGGAT                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD067272             [   TACTGGGAGTTTAACAACTTCAAGTGAAGTATTGGTTTGTTTATCATTTCTAAATGTTGATGACGGTTTGATTGGTCCGATAGAATATAAAATTTCAGCTAACAATTGACCAGTAGGTTCGAAGCCTAAACCTCCAGCACCAGGATATGAAATAGAGCCTAAAGTTAATCGCACAATTGATTCAACTGGATCCATGAAACCAAAATTGTAACTATCTGAAGAATCGCATAAATTTGCAATTTTTTGAAGATAATTTATCCACGTTAAACAATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD178271             [          AGTTTAACAAATTCAAGTGAAGTATTGGTTTGTTTATCATTTCTAAATGTTGATGACGGTTTGATTGGTCCGATAGAATATAAAATTTCAGCTAACAATTGACCAGTAGGTTCGAAGCCTAAACCTCCAGCACCAGGATATGAAATAGAGCCTAAAGTTAATCGCACAATTGATTCAATTGGATCCATGAAACCAAAATTGTAACTATCTGAAGAATCGCATAAATTTGCAATTTTTTGAAGATAATTTATCCACGTTAAACAATTCAATGATCGATCTAAAATGAGCTTACGATACGTTTCATCTTCCTCATTAATTTTTTTGCATTTTGACAATAAATATGCATGAATAAATGGCATATATACCCATTCCTTTGAAATTAATCGGTCACATACAGATCTTGATTTAGAAATAACATGATTCAATTGAAAAATAGATTGATATATCAATGAATGATCTGGATTTACTTCAGGCATATCTTCAAGAATTGGTGATAAGCTTAATCGACTGTCTTCGTTATCATTAATATTATCTGTGACACCATCATTCCGTGCAATGGAAGTTGATGTTGTTCCAAGTACTAGTTCATGGGTATACAGTTCTCTAATTTCATGTAGACGTCGTAAAACGTAT]




>consensus_8287#0
ATTTACTGGGAGTTTAACAACTTCAAGTGAAGTATTGGTTTGTTTATCATTTCTAAATGT
TGATGACGGTTTGATTGGTCCGATAGAATATAAAATTTCAGCTAACAATTGACCAGTAGG
TTCGAAGCCTAAACCTCCAGCACCAGGATATGAAATAGAGCCTAAAGTTAATCGCACAAT
TGATTCAACTGGATCCATGAAACCAAAATTGTAACTATCTGAAGAATCGCATAAATTTGC
AATTTTTTGAAGATAATTTATCCACGTTAAACAATTCAATGATCGATCTAAAATGAGCTT
ACGATACGTTTCATCTTCCTCATTAATTTTTTTGCATTTTGACAATAAATATGCATGAAT
AAATGGCATATATACCCATTCCTTTGAAATTAATCGGTCACATACAGATCTTGGTTTAGA
AATAACATGATTCAATTGAAAAATAGATTGATATTTCAATGAATGATCTGGATTTACTTC
AAGCATATCTTCAAGAATTGGTGATAAGCTTAATCGACTGTCTTCGTTATCATTAATATT
ATCTGTGACACCATCATTCCGTGCAATGGAAGTTGATGTTGTTCCAAGTACTAGTTCATG
GGTATACAGTTCTCTAATTTCATGTAGACGTCGTAAAACGTAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)