cluster # 8313

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Schistosoma mansoni
cluster # 8313 cluster # 8313 Sequences # 6 consensus # 2

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consensus_8313#0 length = 1288 sequences # 5

consensus_8313#1 length = 595 sequences # 1

consensusID : consensus_8313#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1288
fasta sequence

                              [TTTTATTCACAGTCTAACAATAATAAACGAATTAATCGTTTTTCATACAGTTCTCCTTCATATTATACAACTAACTCTACATCTTCAAACAGTCCAATTGTCCATACAGATGAATTTGATCAATCTAAGTCAAATTTAATTAATTCCAAACAACAATCACCAAGTACATCAAGTACTAAGGAATGTTTTATAACTGCTGTTGTTGAAGATGTACCATCAGAGACAGGTAATAGTTCTACACTATCTGAATCTATCAATATACTTAATTCAGATCAGTCTACAATTATTCATTCTACAAATTCTGCATCTAATAGTTTCAGTCTACATGGTACAACATTGAATTAGCATTTTCTCATTAATTTCAATTACATAATTTTATTATATTTAAAGTTGTTTTTTTTTTCAATAAATACATTTAATGTATACATATATCAGTGAATTCGTATTATATTTTGTCATTTATTGGTTTGATTATTTTGGAATACAATAAAGAAATTAAACTCTCGTATTTTTATTTGCTTCATTTACTTCGGATTAATTTCTTGTATACAAGCTATCAATATAGTTAAATAATATTTAAAATAATTNTGCTCCTTATTATTACTATTATTGNTGNTATTTAACCGTTATTAAGCATTCAATATGCACTATTTACTTGTTGATAAATTGTATATTTTTCAGTTTACGTTTCCCCATAAACTTTATGTTGGTTATTTTACAATGACTGGTCATGCCCAATTACCTTCTACCAATATATTTGTTAGATTTCATTGAATCAAACCACTACGCCCTTTGTATCATTCCCTAACGTATTTGAATTCATAGAAACCTGAAGTTTATGGTGTTGTCTGTTGAGGATGTGCAATGTTC-CGTGTGTG-ATCTCATTTAGGCATATATATATATATATATATATATATATATATCGGAACCTAATAAAACACCTTTTCTTTGATTCTTTTTTAACTTTCCGTGTCAAAAATAAGTTGATAACTAAATACTGGGAAATTATCTGTTATATTACTGTTGTTGTGAATTCCTCTAATCGTTCGCTATTTGTTTCTCTGTATTTTTTGAGACAGAACGATAATTCATCGGCTCATCTATTTAAAAAAAACCTTCAGGTCAGATAACAATTCTTCCCAATAAGCTTTTCATTATAACTGTATGTTTATTGTAGCATGGTCGGTTCTTCTTTACATTGTTTTCCTAAACAGTTTTTGACTCTTCATTTGTGCTGTCCTAACTTTTGTATCTAGTATTTTTTAGTTGCGTTTAATAAATACATTGT]

[+] EMBL CD190027             [TTTTATTCACAGTCTAACAATAATAAACGAATTAATCGTTTTTCATACAGTTCTCCTTCATATTATACAACTAACTCTACATCTTCAAACAGTCCAATTGTCCATACAGATGAATTTGATCAATCTAAGTCAAATTTAATTAATTCCAAACAACAATCACCAAGTACATCAAGTACTAAGGAATGTTTTATAACTGCTGTTGTTGAAGATGTACCATCAGAGACAGGTAATAGTTCTACACTATCTGAATCTATCAATATACTTAATTCAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD078679             [                                    CGTTTTTCATACAGTTCTCCTTCATATTATACAACTAACTCTACATCTTCAAACAGTCCAATTGTCTATACAGATGAATTTGATCAATCTAAGTCAAATTTAATTAATTCCAAACAACAATCACCAAGTACATCAAGTACTAAGGAATGTTTTATAACTGCTGTTGTTGAAGATGTACCATCAGAGACAGGTAATAGTTCTACACTATCTGAATCTATCAATATACTTAATTCAGATCAGTCTACAATTATTCATTCTACAAATTCTGCATCTAATAGTTTCAGTCTACATGGTACAACATTGAATTAGCATTTTCTCATTAATTTCAATTACATAATTTTATTATATTTAAAGTTGTTTTTTTTTTCAATAAATACATTTAATGTATACATATATCAGTGAATTCGTATTATATTTTGTCATTTATTGGTTTGATTATTTTGGAATACAATAAAGAAATTAAACTCTCGTATTTTTATTTGCTTCATTTACTTCGGATTAATTTCTTGTATACAAGCTATCAATATAGTTAAATAATATTTAAAATAATTNTGCTCCTTATTATTACTATTATTGNTGNTATTTAACCGTTATTAAGCATTCAATATGCACTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD082853             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTCAAT AATACATTTAATGTATACATATATCAGTGAATTCGTATTATATTTTGTCATTTATTGGTTTGATTATTTTGGAATACAATAAAGAAATTAAACTCTCGTATTTTTATTTGCTTCATTTACTTCGGATTAATTTCTTGTATACAAGCTATCAATATAGTTAAATAATATTTAAAATAATTTTGCTCCTTATTATTACTATTATTGTTGTTATTTAACCGTTATTAAGCATTCAATATGCACTATTTACTTGTTGATAAATTGTATATTTTTCAGTTTACGTTTCCCCATAAACTTTATGTTGGTTATTTTACAATGACTGGTCATGCCCAATTACCTTCTACCAATATATTTGTTAGATTTCATTGAATCAAACCACTACGCCCTTTGTATCATTCCCTAACGTATTTGAATTCATAGAAACCTGAAGTTTATGGTGTTGTCTGTTGAGGATGTGCAATGTTC CGTGTGTG ATCTCATTTAGGCATATATATATATATATATATATATATATATATCGGAACCTAATAAAACACCTTTTCTTTGATTCTTTTTTAACTNTCCGTGTCAAANATAAGTTGATAACTAAATACTGGGAAATTATCTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD076439             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTACGTTTCCCCATAAACTTTATGTTGGTTATTTTACAATGACTGGTCATGCCCAATTACCTTCTACCAATATATTTGTTAGATTTCATTGAATCAAACCACTACGCCCTTTGTATCATTCCCTAACGTATTTGAATTCATAGAAACCTGAAGTTTATGGTGTTGTCTGTTGAGGATGTGCAATGTTC CGTGTGTG ATCTCATTTAGGCATATATATATATATATATATATATATATATATCGGAACCTAATAAAACACCTTTTCTTTGATTCTTTTTTAACTTTCCGTGTCAAAAATAAGTTGATAACTAAATACTGGGAAATTATCTGTTATATTACTGTTGTTGTGAATTCCTCTAATCGTTCGCTATTTGTTTCTCTGTATTTTTTGAGACAGAACGATAATTCATCGGCTCATCTATTTAAAAAAAACCTTCAGGTCAGATAACAATTCTTCCCAATAAGCTTTTCATTATAACTGTATGTTTATTGTAGCATGGTCGGTTCTTCTTTACATTGTTTTCCTAAACAGTTTTTGACTCTTCATTTGTGCTGTCCTAACTTTTGTATCTAGTATTTTTTAGTTGCGTTTAATAAATACATTGT]
[-] EMBL AA999625             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGATCTCATTTGGGCATAT ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCGGACCCTAATAAAACACCTTTTCTTTGATTCTTTTTTAACTTTCCGTGTCAAAAATAAGTTGATAACTAAATACTGGGAAATTATCTGTTATATTACTGTTGTTGTGAATTCCTCTAATCGTTCGCTATTTGTTTCTCTGTATTTTTTGAGACAGAACGATAATTCATCGGCTCATCTATTTAAAAAAAACCTTCAGGTCAGATAACAATTCTTCCCAATAAGCTTTTCATTATAACTGTATGTTTATTGTAGCATGGTCGATTCTTCTTTACATTGTTTTCCTAAACAGTTTTTGACTCTTCATTTGTGCTGTCCTAACTTTTGTATCTAGTAACTCTTAGTTGCGTTT ATAAATACATTG ]




>consensus_8313#0
TTTTATTCACAGTCTAACAATAATAAACGAATTAATCGTTTTTCATACAGTTCTCCTTCA
TATTATACAACTAACTCTACATCTTCAAACAGTCCAATTGTCCATACAGATGAATTTGAT
CAATCTAAGTCAAATTTAATTAATTCCAAACAACAATCACCAAGTACATCAAGTACTAAG
GAATGTTTTATAACTGCTGTTGTTGAAGATGTACCATCAGAGACAGGTAATAGTTCTACA
CTATCTGAATCTATCAATATACTTAATTCAGATCAGTCTACAATTATTCATTCTACAAAT
TCTGCATCTAATAGTTTCAGTCTACATGGTACAACATTGAATTAGCATTTTCTCATTAAT
TTCAATTACATAATTTTATTATATTTAAAGTTGTTTTTTTTTTCAATAAATACATTTAAT
GTATACATATATCAGTGAATTCGTATTATATTTTGTCATTTATTGGTTTGATTATTTTGG
AATACAATAAAGAAATTAAACTCTCGTATTTTTATTTGCTTCATTTACTTCGGATTAATT
TCTTGTATACAAGCTATCAATATAGTTAAATAATATTTAAAATAATTNTGCTCCTTATTA
TTACTATTATTGNTGNTATTTAACCGTTATTAAGCATTCAATATGCACTATTTACTTGTT
GATAAATTGTATATTTTTCAGTTTACGTTTCCCCATAAACTTTATGTTGGTTATTTTACA
ATGACTGGTCATGCCCAATTACCTTCTACCAATATATTTGTTAGATTTCATTGAATCAAA
CCACTACGCCCTTTGTATCATTCCCTAACGTATTTGAATTCATAGAAACCTGAAGTTTAT
GGTGTTGTCTGTTGAGGATGTGCAATGTTCCGTGTGTGATCTCATTTAGGCATATATATA
TATATATATATATATATATATATCGGAACCTAATAAAACACCTTTTCTTTGATTCTTTTT
TAACTTTCCGTGTCAAAAATAAGTTGATAACTAAATACTGGGAAATTATCTGTTATATTA
CTGTTGTTGTGAATTCCTCTAATCGTTCGCTATTTGTTTCTCTGTATTTTTTGAGACAGA
ACGATAATTCATCGGCTCATCTATTTAAAAAAAACCTTCAGGTCAGATAACAATTCTTCC
CAATAAGCTTTTCATTATAACTGTATGTTTATTGTAGCATGGTCGGTTCTTCTTTACATT
GTTTTCCTAAACAGTTTTTGACTCTTCATTTGTGCTGTCCTAACTTTTGTATCTAGTATT
TTTTAGTTGCGTTTAATAAATACATTGT

consensusID : consensus_8313#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 595
fasta sequence

                              [AGTTTACGTTTCCCCATAAACTTTATGTTGGTTATTTTACAATGACTGGTCATGCCCAATTACCTTCTACCAATATATTTGTTAGATTTCATTGAATCAAACCACTACGCCCTTTGTATCATTCCCTAACGTATTTGAATTCATAGAAACCTGAAGTTTATGGTGTTGTCTGTTGAGGATGTGCAATGTTCCGTGTGTGATCTCATTTAGGCATATATATATATATATCGGAACCTAATAAAACACCTTTTCTTTGATTCTTTTTTAACTTTCCGTGTCAAAAATAAGTTGATAACTAAATACTGGGAAATTATCTGTTATATTACTGTTGTTGTGAATTCCTCTAATCGTTCGCTATTTGTTTCTCTGTATTTTTTGAGACAGAACGATAATTCATCGGCTCATCTATTTAAAAAAAACCTTCAGGTCAGATAACAATTCTTCCCAATAAGCTTTTCATTATAACTGTATGTTTATTGTAGCATGGTCGGTTCTTCTTTACATTGTTTTCCTAAACAGTTTTTGACTCTTCATTTGTGCTGTCCTAACTTTTGTATCTAGTATTTTTTAGTTGCGTTTAATAAATACATTGTAG]

[-] EMBL CD073142             [AGTTTACGTTTCCCCATAAACTTTATGTTGGTTATTTTACAATGACTGGTCATGCCCAATTACCTTCTACCAATATATTTGTTAGATTTCATTGAATCAAACCACTACGCCCTTTGTATCATTCCCTAACGTATTTGAATTCATAGAAACCTGAAGTTTATGGTGTTGTCTGTTGAGGATGTGCAATGTTCCGTGTGTGATCTCATTTAGGCATATATATATATATATCGGAACCTAATAAAACACCTTTTCTTTGATTCTTTTTTAACTTTCCGTGTCAAAAATAAGTTGATAACTAAATACTGGGAAATTATCTGTTATATTACTGTTGTTGTGAATTCCTCTAATCGTTCGCTATTTGTTTCTCTGTATTTTTTGAGACAGAACGATAATTCATCGGCTCATCTATTTAAAAAAAACCTTCAGGTCAGATAACAATTCTTCCCAATAAGCTTTTCATTATAACTGTATGTTTATTGTAGCATGGTCGGTTCTTCTTTACATTGTTTTCCTAAACAGTTTTTGACTCTTCATTTGTGCTGTCCTAACTTTTGTATCTAGTATTTTTTAGTTGCGTTTAATAAATACATTGTAG]




>consensus_8313#1
AGTTTACGTTTCCCCATAAACTTTATGTTGGTTATTTTACAATGACTGGTCATGCCCAAT
TACCTTCTACCAATATATTTGTTAGATTTCATTGAATCAAACCACTACGCCCTTTGTATC
ATTCCCTAACGTATTTGAATTCATAGAAACCTGAAGTTTATGGTGTTGTCTGTTGAGGAT
GTGCAATGTTCCGTGTGTGATCTCATTTAGGCATATATATATATATATCGGAACCTAATA
AAACACCTTTTCTTTGATTCTTTTTTAACTTTCCGTGTCAAAAATAAGTTGATAACTAAA
TACTGGGAAATTATCTGTTATATTACTGTTGTTGTGAATTCCTCTAATCGTTCGCTATTT
GTTTCTCTGTATTTTTTGAGACAGAACGATAATTCATCGGCTCATCTATTTAAAAAAAAC
CTTCAGGTCAGATAACAATTCTTCCCAATAAGCTTTTCATTATAACTGTATGTTTATTGT
AGCATGGTCGGTTCTTCTTTACATTGTTTTCCTAAACAGTTTTTGACTCTTCATTTGTGC
TGTCCTAACTTTTGTATCTAGTATTTTTTAGTTGCGTTTAATAAATACATTGTAG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8313#0      TTTTATTCACAGTCTAACAATAATAAACGAATTAATCGTTTTTCATACAGTTCTCCTTCA 60
consensus_8313#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8313#0      TATTATACAACTAACTCTACATCTTCAAACAGTCCAATTGTCCATACAGATGAATTTGAT 120
consensus_8313#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8313#0      CAATCTAAGTCAAATTTAATTAATTCCAAACAACAATCACCAAGTACATCAAGTACTAAG 180
consensus_8313#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8313#0      GAATGTTTTATAACTGCTGTTGTTGAAGATGTACCATCAGAGACAGGTAATAGTTCTACA 240
consensus_8313#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8313#0      CTATCTGAATCTATCAATATACTTAATTCAGATCAGTCTACAATTATTCATTCTACAAAT 300
consensus_8313#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8313#0      TCTGCATCTAATAGTTTCAGTCTACATGGTACAACATTGAATTAGCATTTTCTCATTAAT 360
consensus_8313#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8313#0      TTCAATTACATAATTTTATTATATTTAAAGTTGTTTTTTTTTTCAATAAATACATTTAAT 420
consensus_8313#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8313#0      GTATACATATATCAGTGAATTCGTATTATATTTTGTCATTTATTGGTTTGATTATTTTGG 480
consensus_8313#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8313#0      AATACAATAAAGAAATTAAACTCTCGTATTTTTATTTGCTTCATTTACTTCGGATTAATT 540
consensus_8313#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8313#0      TCTTGTATACAAGCTATCAATATAGTTAAATAATATTTAAAATAATTNTGCTCCTTATTA 600
consensus_8313#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8313#0      TTACTATTATTGNTGNTATTTAACCGTTATTAAGCATTCAATATGCACTATTTACTTGTT 660
consensus_8313#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8313#0      GATAAATTGTATATTTTTCAGTTTACGTTTCCCCATAAACTTTATGTTGGTTATTTTACA 720
consensus_8313#1      -------------------AGTTTACGTTTCCCCATAAACTTTATGTTGGTTATTTTACA 41
                                         *****************************************

consensus_8313#0      ATGACTGGTCATGCCCAATTACCTTCTACCAATATATTTGTTAGATTTCATTGAATCAAA 780
consensus_8313#1      ATGACTGGTCATGCCCAATTACCTTCTACCAATATATTTGTTAGATTTCATTGAATCAAA 101
                      ************************************************************

consensus_8313#0      CCACTACGCCCTTTGTATCATTCCCTAACGTATTTGAATTCATAGAAACCTGAAGTTTAT 840
consensus_8313#1      CCACTACGCCCTTTGTATCATTCCCTAACGTATTTGAATTCATAGAAACCTGAAGTTTAT 161
                      ************************************************************

consensus_8313#0      GGTGTTGTCTGTTGAGGATGTGCAATGTTCCGTGTGTGATCTCATTTAGGCATATATATA 900
consensus_8313#1      GGTGTTGTCTGTTGAGGATGTGCAATGTTCCGTGTGTGATCTCATTTAGGCATATATATA 221
                      ************************************************************

consensus_8313#0      TATATATATATATATATATATATCGGAACCTAATAAAACACCTTTTCTTTGATTCTTTTT 960
consensus_8313#1      TATATAT----------------CGGAACCTAATAAAACACCTTTTCTTTGATTCTTTTT 265
                      *******                *************************************

consensus_8313#0      TAACTTTCCGTGTCAAAAATAAGTTGATAACTAAATACTGGGAAATTATCTGTTATATTA 1020
consensus_8313#1      TAACTTTCCGTGTCAAAAATAAGTTGATAACTAAATACTGGGAAATTATCTGTTATATTA 325
                      ************************************************************

consensus_8313#0      CTGTTGTTGTGAATTCCTCTAATCGTTCGCTATTTGTTTCTCTGTATTTTTTGAGACAGA 1080
consensus_8313#1      CTGTTGTTGTGAATTCCTCTAATCGTTCGCTATTTGTTTCTCTGTATTTTTTGAGACAGA 385
                      ************************************************************

consensus_8313#0      ACGATAATTCATCGGCTCATCTATTTAAAAAAAACCTTCAGGTCAGATAACAATTCTTCC 1140
consensus_8313#1      ACGATAATTCATCGGCTCATCTATTTAAAAAAAACCTTCAGGTCAGATAACAATTCTTCC 445
                      ************************************************************

consensus_8313#0      CAATAAGCTTTTCATTATAACTGTATGTTTATTGTAGCATGGTCGGTTCTTCTTTACATT 1200
consensus_8313#1      CAATAAGCTTTTCATTATAACTGTATGTTTATTGTAGCATGGTCGGTTCTTCTTTACATT 505
                      ************************************************************

consensus_8313#0      GTTTTCCTAAACAGTTTTTGACTCTTCATTTGTGCTGTCCTAACTTTTGTATCTAGTATT 1260
consensus_8313#1      GTTTTCCTAAACAGTTTTTGACTCTTCATTTGTGCTGTCCTAACTTTTGTATCTAGTATT 565
                      ************************************************************

consensus_8313#0      TTTTAGTTGCGTTTAATAAATACATTGT-- 1288
consensus_8313#1      TTTTAGTTGCGTTTAATAAATACATTGTAG 595
                      ****************************