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Schistosoma mansoni
cluster # 8315 cluster # 8315       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8315#0 length = 1008 sequences # 6  
consensusID : consensus_8315#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1008
fasta sequence 
                              [AATATTAATTTCCATTAAAAATTACAAATACAACAAAAAAATGGTGCATATTTATGTTATATATCTGTGAATATCCAAAAAGCAACAACAAAATGTATAAAAAATAACAATATGGACATCAATGACAAACCAGTCAAAGTAATTGCACACTTCAACCTCTTTTATCACTTAAGAGTAGTATGTACAAATAATTAAAACAAATTAGAAATATCGGACATGAAGGAAAAAAAAGTGAATAGAAGAGAAACACCACACATATTTAAGTAAAACCTATACTCAGACACACATGCACACAAACGTATAAAGTTTATCGTTGGTTTGGAAGGTGAAACTAATTGGTTGTATGAGACACCAGGAATAGATTGTTTAGTTCATTGGAAGGAATATTAAGTATAACGATTAGTTATTTAATAAAACCTTCCTTTAAAGTACAAAAATAAGAAAACTCGTATAACAAAAGAAAAAAAAAGTTTTATATCACAAGTACTTATCTGTTCTCATATGTGGCAGGTAATTCAGTTCCAGCGATTGAAATTATATCTTGTCGTCGTTGTATAGTGAATTGTTTTTTAGAAGGACGAATTTTTTTAGGTTGGTTAGGTCGACGACGTCGATGTCTACTATCAACAGTACTATCATTACAAACACCAACATTGGGATCCACTTCATTAGGATATATCGTCTCATATTTTAATTCTTGATCATATTCATGTTTTACTGAGACTTCAATTGATTTATTCATTATATCTGACGGTTTACATGGTTCGAAAGAACAGGGGTGGACAATGTCACCACGTTTCCATCTACTATTCATATCTAACTTCCTTGATTTATTTGCATTTCGGCTAAACTGAAAATGTGGTTTTGTTGAATTGTTCTCTTGAGTTGAAATTTCATTTATCTCATTATTATCAGTACTAGAGATATTCCNAATAGGCCACCATGGNACATTTGCTTCTTGATTATAACCATACATTGCACGAATAGNGTCTGGGTATGACCATATAT]

[+] EMBL BF936152             [AATATTAATTTCCATTAAAAATTACAAATACAACAAAAAAATGGTGCATATTTATGTTATATATCTGTGAATATCCAAAAAGCAACAACAAAATGTATAAAAAATAACAATATGGACATCAATGACAAACCAGTCAAAGTAATTGCACACTTCAACCTCTTTTATCACTTAAGAGTAGTATGTACAAATAATTAAAACAAATTAGAAATATCGGACATGAAGGAAAAAAAAGTGAATAGAAGAGAAACACCACACATATTTAAGTAAAACCTATACTCAGACACACATGCACACAAACGTATAAAGTTTATCGTTGGTTTGGAAGGTGAAACTAATTGGTTGTATGAGACACCAGGAATAGATTGTTTAGTTCATTGGAAGGAATATTAAGTATAACGATTAGTTATTTAATAAAACCTTCCTTTAAAGTACAAAAATAAGAAAACTCGTATAACAAAAG AAAAAAAAGTTTTATATCACAAGTACTTATCTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD116189             [                                                                                                                                                                                                                                   AAAAGTGAATAGAAGAGAAACACCACACATATTTAAGTAAAACCTATACTCAGACACACATGCACACAAACGTATAAAGTTTATCGTTGGTTTGGAAGGTGAAACTAATTGGTTGTATGAGACACCAGGAATAGATTGTTTAGTTCATTGGAAGGAATATTAAGTATAACGATTAGTTATTTAATAAAACCTTCCTTTAAAGTGCAAAAATAAGAAAACTCGTATAACAAAAGAAAAAAAAAGTTTTATATCACAAGTACTTATCTGTTCTCATATGTGGCAGGTAATTCAGTTCCAGCGATTGAAATTATATCTTGTCGTCGTTGTATAGTGAATTGTTTTTTAGAAGGACGAATTTTTTTAGGTTGGTTAGGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD116204             [                                                                                                                                                                                                                                   AAAAGTGAATAGAAGAGAAACACCACACATATTTAAGTAAAACCTATACTCAGACACACATGCACACAAACGTATAAAGTTTATCGTTGGTTTGGAAGGTGAAACTAATTGGTTGTATGAGACACCAGGAATAGATTGTTTAGTTCATTGGAAGGAATATTAAGTATAACGATTAGTTATTTAATAAAACCTTCCTTTAAAGTGCAAAAATAAGAAAACTCGTATAACAAAAGAAAAAAAAAGTTTTATATCACAAGTACTTATCTGTTCTCATATGTGGCAGGTAATTCAGTTCCAGCGATTGAAATTATATCTTGTCGTCGTTGTATAGTGAATTGTTTTTTAGAAGGACGAATTTTTTTAGGTTGGTTAGGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD116286             [                                                                                                                                                                                                                                    AAAGTGAATAGAAGAGAAACACCACACATATTTAGGTAAAACCTATACTCAGACACACATGCACACAAACGTATAAAGTTTATCGTTGGTTTGGAAGGTGAAACTAATTGGTTGTATGAGACACCAGGAATAGATTGTTTAGTTCATTGGAAGGAATATTAAGTATAACGATTAGTTATTTAATAAAACCTTCCTTTAAAGTACAAAAATAAGAAAACTCGTATAACAAAAGAAAAAAAAAGTTTTATATCACAAGTACTTATCTGTTCTCATATGTGGCAGGTAATTCAGTTCCGGCGATTGAAATTATATCTTGTCGTCGTTGTATAGTGAATTGTTTTTTAGAAGGACGAATTTTTTTAGGTTGGTTAGGTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD179043             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTGGTTGTATGAGACACCAGGAATAGATTGTTTAGTTCATTGGAAGGAATATTAAGTATAACGATTAGTTATTTAATAAAACCTTCCTTTAAAGTACAAAAATAAGAAAACTCGTATAACAAAAGAAAAAAAAAGTTTTATATCACAAGTACTTATCTGTTCTCATATGTGGCAGGTAATTCAGTTCCAGCGATTGAAATTATATCTTGTCGTCGTTGTATAGTGAATTGTTTTTTAGAAGGACGAATTTTTTTAGGTTGGTTAGGTCGACGACGTCGATGTCTACTATCAACAGTACTATCATTACAAACACCAACATTGGGATCCACTTCATTAGGATATATCGTCTCATATTTTAATTCTTGATCATATTCATGTTTTACTGAGACTTCAATTGATTTATTCATTATATCTGACGGTTTACATGGTTCGAAAGAACAGGGGTGGACAATGTCACCACGTTTCCATCTACTATTCATATCTAACTTCCTTGATTTATTTGCATTTCGGCTAAACTGAAAATGTGGTTTTGTTGAATTGTTCTCTTGAGTTGAAATTTCATTTATCTCATTATTATCAGTACTAGAGATATTCCNAATAGGCCACCATGGNACATTTGCTTCTTGATTATAACCATACATTGCACGAATAGNGTCTGGGTATGACCATATAT]
[+] EMBL CD067013             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gTAGATCATTGGAAGGAATATTAAGTATAACGATTAGTTATTTAATAGAACCTTCCTTTAAAGTACAAAAATAAGAAAACTCGTATAACAAAAGAAAAAAAAAGATTTATATCACAAGTACTTATCTGACCTCATATGAGGCAGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]




>consensus_8315#0
AATATTAATTTCCATTAAAAATTACAAATACAACAAAAAAATGGTGCATATTTATGTTAT
ATATCTGTGAATATCCAAAAAGCAACAACAAAATGTATAAAAAATAACAATATGGACATC
AATGACAAACCAGTCAAAGTAATTGCACACTTCAACCTCTTTTATCACTTAAGAGTAGTA
TGTACAAATAATTAAAACAAATTAGAAATATCGGACATGAAGGAAAAAAAAGTGAATAGA
AGAGAAACACCACACATATTTAAGTAAAACCTATACTCAGACACACATGCACACAAACGT
ATAAAGTTTATCGTTGGTTTGGAAGGTGAAACTAATTGGTTGTATGAGACACCAGGAATA
GATTGTTTAGTTCATTGGAAGGAATATTAAGTATAACGATTAGTTATTTAATAAAACCTT
CCTTTAAAGTACAAAAATAAGAAAACTCGTATAACAAAAGAAAAAAAAAGTTTTATATCA
CAAGTACTTATCTGTTCTCATATGTGGCAGGTAATTCAGTTCCAGCGATTGAAATTATAT
CTTGTCGTCGTTGTATAGTGAATTGTTTTTTAGAAGGACGAATTTTTTTAGGTTGGTTAG
GTCGACGACGTCGATGTCTACTATCAACAGTACTATCATTACAAACACCAACATTGGGAT
CCACTTCATTAGGATATATCGTCTCATATTTTAATTCTTGATCATATTCATGTTTTACTG
AGACTTCAATTGATTTATTCATTATATCTGACGGTTTACATGGTTCGAAAGAACAGGGGT
GGACAATGTCACCACGTTTCCATCTACTATTCATATCTAACTTCCTTGATTTATTTGCAT
TTCGGCTAAACTGAAAATGTGGTTTTGTTGAATTGTTCTCTTGAGTTGAAATTTCATTTA
TCTCATTATTATCAGTACTAGAGATATTCCNAATAGGCCACCATGGNACATTTGCTTCTT
GATTATAACCATACATTGCACGAATAGNGTCTGGGTATGACCATATAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)