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Schistosoma mansoni
cluster # 8322 cluster # 8322       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8322#0 length = 1309 sequences # 6  

consensusID : consensus_8322#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1309
fasta sequence
                              [TCTCTTTAATAATACTAATGAGAAAATAATCAGTCATAATATTGAAACAAAAATAAAGGAATATGACTGGCGATAAGTTTGAAAGTAAACTATATAAATCAAATCTCATTCAACTTTTCTACGCTTTCGACGAAAATCGAAATCAAGACGATCATCACCATCATTATTTGTCTGTTGTGATCCTGGCTTAGGACCAACTCTACGCTTATTTCCTCTACCTCTGGATGAACCACCAGAAGTTAGATCAGTCCGTACGCCTCGTCCGCGCCCACTTCGATTAGTTTTTGGTAATGCATCATTCGGTGGACTGACTGGATTTCTTCCTATATAATTTTGCTTGGCAAATTTACCTTCATTTAGTGAAGAACTTGTGTCGTCGTCGGTGGAAACATCTTCAACCATGTCCGCTAGTGTTGTCGCCTCGTCCTTGTCAGAATCAAATCCAAAATCATCTTTTGTTTGTAGTATAAGTTGACAGCTTGGCACTGACTTTTTATTGAATGATTGTTTTGTTTGTAACGTTGCTTTACCACTGACTTTGTTTACTCGGACCTTTTCTGGGGTTAAATTATT-GTGTATTGGTACTTGTTCAGCTTCTTCTTCCTCGAGACTCCACTCTAATTCCTGTAATCTCGTTGGTTTAGTATTTGCACAAGTTTCGACTTTTGGATTACTGTATGGCTTTATTGGGCTATACTTATCTTCGTTTTCTTCTTTATCACTGTCCTCATTTTGTGTAGAATTAGTGCTTCGAGTATAGCAAAATGACAAAATATCAGTGACAATACGTTCTTCTGGAGCTTTACGCATTCTAAGATGTCGAATGGCTTTGTTCAAAATAGATGATGAGATGTGATTTATAGCATCGGAAATACCCCGATCTACATATCGTCTGAGTCCACGTTCAAGTTCACTTGTAGTGAATAAGCTCAACCCACAGGTTAACTCTTCTGATGGTTTTTGTCCTTTACTCTCAACCTTTTGTAGTAGATAATGACGTACAAGCTCTTCAACTTCAGCAGAATTTAATCCAACTTTTTTACTTTCAACTTCCATTTCATCTGGATCACTGCAAATCGTACTGTTCTGTAGACCAGATTNTAAAGCGCGATTTGCTTGCGCAGCAGCCAATTTTTCACGATTTCGATTAAAAACAATTAAATCTTTANGGTGGGCCACACGACCAACAAATTTTTGACCAAATCTAAGTCCACTGAATGATTCGAATCCACCGCTTAAGTCTACGCGNTATCGTATAAGTGGTTCAACTGGNGGGAAGTAATCGNTGAGTTGATGTGATTTTGATATT]

[+] EMBL AI975343             [TCTCTTTAATAATACTAATGAGAAAATAATCAGTCATAATATTGAAACAAAAATAAAGGAATATGACTGGCGATAAGTTTGAAAGTAAACTATATAAATCAAATCTCATTCAACTTTTCTACGCTTTCGACGAAAATCGAAATCAAGACGATCATCACCATCATTATTTGTCTGTTGTGATCCTGGCTTAGGACCAACTCTACGCTTATTTCCTCTACCTCTGGATGAACCACCAGAAGTTAGATCAGTCCGTACGCCTCGTCCGCGCCCACTTCGATTAGTTTTTGGTAATGCATCATTCGGTGGACTGACTGGATTTCTTCCTATATAATTTTGCTTGGCAAATTTACCTTCATTTAGTGAAGAACTTGTGTCGTCGTCGGTGGAAACATCTTCAACCATGTCCGCTAGTGTTGTCGCCTCGTCCTTGTCAGAATCAAATCCAAAATCATCTTTTGTTTGTAGTATAAGTTGACAGCTTGGCACTGACTTTTTATTGAATGATTGTTTTGTTTGTAACGTTGCTTTACCACTGACTTTGTTTACTCGGACCTTTTCTGGGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD073596             [ CTCTTTAATAATACTAAGGAGAAAATAATCAGTCATAATATTGAAACAAAAATAAAGGAATATGACGGGCGATAAGTTGGAAAGTAAACTATATAAATCAAATCTCATTCAACTTTTCTACGCTTTCGACGAAAATCGAAATCAAGACGATCATCACCATCATTATTTGTCTGTGGGGATCCTGGCTTAGGACCAACTCTACGCTTATTTCCTCTACCTCGGGATGAACCACCAGAAGTTAGATCAGTCCGTACGCCTCGTCCGCGCCCACTTCGATTAGTTTTGGGTAATGCATCATTCGGGGGACTGACTGGATTTCTTCCTATATAATTTGGCTGGGCAAATTTACCTTCATTTAGTGAAAAACTTGGGTCGTCGTCGGGGGAAACATCTTCAACCATGTCCGCTAGGGTTGCCGCCTCGTCCTTGTCAGAATCAAATCCAAAATCATCTTTGGTTTGTAGTATAAGTTGACAGCTGGGCACTGACTTTTTATTGAATGATGGTTTTGTTTGAAACGTTGCTTTACCACTGACTTTGTTTACTCGGACCTTTTCTGGGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD128811             [                                                                                                                                                           CACCATCATTATTTGTTTGTTGTGATCCTGGCTTAGGACCAACTCTACGCTTATTTCCTCTACCTCTGGATGAACCACCAGAAGTTAGATCAGTCCGTACGCCTCGTCCGCGCCCACTTCGATTAGTTTTTGGTAATGCATCATTCGGTGGACTGACTGGATTTCTTCCTATATAATTTTGCTTGGCAAATTTACCTTCATTTACTGAAGAACTTGTGTCGTCGTCGGTGGAAACATCTTCAACCATGTCCGCTAGTGTTGTCGCCTCGTCCTTGTCAGAATCAAATCCAAAATCATCTTTTGTTTGTAGTATAAGTTGACAGCTTGGCACTGACTTTTTATTGAATGATTGTTTTGTTTGTAACGTTGCTTTACCACTGACTTTGTTTACTCGGACCTTTTCTGGGGTTAAATTATT GTGTATTGGTACTTGTTCAGCTTCTTCTTCCTCGAGACTCCACTCTAATTCCTGTAATCTCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD128829             [                                                                                                                                                                        TGTCTGTTGTGATCCTGGCTTAGGACCAACTCTACGCTTATTTCCTCTACCTCTGGATGAACCACCAGAAGTTAGATCAGTCCGTACGCCTCGTCCGCGCCCACTTCGATTAGTTTTTGGTAATGCATCATTCGGTGGACTGACTGGATTTCTTCCTATATAATTTTGCTTGGCAAATTTACCTTCATTTAGTGAAGAACTTGTGTCGTCGTCGGTGGAAACATCTTCAACCATGTCCGCTAGTGTTGTCGCCTCGTCCTTGTCAGAATCAAATCCAAAATCATCTTTTGTTTGTAGTATAAGTTGACAGCTTGGCACTGACTTTTTATTGAATGATTGTTTCGCTTGGAAAGTTGCTTTACCACTGACTTTGCCTACTAGGACCTTTTCTGGGGGTAAATTATTGGTG ATTGGCACTTGGTCAGCTTCTTCTTTCTCGAGACTCCACTCTAATTTCTGTAATCTTGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD183487             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATT GTGTATTGGTACTTGTTCAGCTTCTTCTTCCTCGAGACTCCACTCTAATCCCTGTAATCTCGTTGGTTTAGTATTTGCACAAGTTTCGACTTTTGGATTACTGTATGGCTTTATTGGGCTATACTTATCTTCGTTTTCTTCTTTATCACTGTCCTCATTTTGTGTAGAATTAGTGCTTCGAGTATAGCAAAATGACAAAATATCAGTGACAATACGTTCTTCTGGAGCTTTACGCATTCTAAGATGTCGAATGGCTTTGTTCAAAATAGATGATGAGATGTGATTTATAGCATCGGAAATACCCCGATCTACATATCGTCTGAGTCCACGTTCAAGTTCACTTGTAGTGAATAAGCTCAACCCACAGGTTAACTCTTCTGATGGTTTTTGTCCTTTACTCTCAACCTTTTGTAGTAGATAATGACGTACAAGCTCTTCAACTTCAGCAGAATTTAATCCAACTTTTTTACTTTCAACTTCCATTTCATCTGGATCACTGCAAATCGTACTGTTCTGTAGACCAGATTNTAAAGCGCGATTTGCTTGCGCAGCAGCCAATTTTTCACGATTTCGATTAAAAACAATTAAATCTTTANGGTGGGCCACACGACCAACAAATTTTTGACCAAATCTAAGTCCACTGAATGATTCGAATCCACCGCTTAAGTCTACGCGNTATCGTATAAGTGGTTCAACTGGNGGGAAGTAATCGNTGAGTTGATGTGATTTTGATATT]
[-] EMBL CD079318             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGTNTAGTATNTGCACAAGTTTCGACTTTTGGATTACTGTATGGCTTTATTGGGCTATACTTATCTTCGTTTTCTTCTTTATCACTGTCCTCATTTTGTGTAGAATTAGTGCTTCGAGTATAGCAAAATGACAAAATATCAGTGACAATACGTTCTTCTGGAGCTTTACGCATTCTAAGATGTCGAATGGCTTTGTTCAAAATAGATGATGAGATGTGATTTATAGCATCGGAAATACCCCGATCTACATATCGTCTGAGTCCACGTTCAAGTTCACTTGTAGTGAATAAGCTCAACCCACAGGTTAACTCTTCTGATGGTTTTTGTCCTTTACTCTCAACCATTTGTAGTAGATAATGACGTACAAGCTCTTCAACTTCAGCAGAATTTAATCCAACTTTTTTACTTTCAACTTCCATTTCATCTGGATCACTGCAAATCGTACTGTTCTGTAGACCAGATTTTAAAGCGCGATTTGCTTGCGCAGCAGCCAATTTTTCACGATTTCGATTAAAAACAATTAAATCTTTAGGGTTGGCCACACGACCAACAAATTTTTGACCAAATCTAAGTCCACTGAATGATTCGAATCCACCGCTTAAGTCTACGCGTAATCGTATAAGTGGTTCAACTGG GGGAAGTAgttcgc                      ]


>consensus_8322#0 TCTCTTTAATAATACTAATGAGAAAATAATCAGTCATAATATTGAAACAAAAATAAAGGA ATATGACTGGCGATAAGTTTGAAAGTAAACTATATAAATCAAATCTCATTCAACTTTTCT ACGCTTTCGACGAAAATCGAAATCAAGACGATCATCACCATCATTATTTGTCTGTTGTGA TCCTGGCTTAGGACCAACTCTACGCTTATTTCCTCTACCTCTGGATGAACCACCAGAAGT TAGATCAGTCCGTACGCCTCGTCCGCGCCCACTTCGATTAGTTTTTGGTAATGCATCATT CGGTGGACTGACTGGATTTCTTCCTATATAATTTTGCTTGGCAAATTTACCTTCATTTAG TGAAGAACTTGTGTCGTCGTCGGTGGAAACATCTTCAACCATGTCCGCTAGTGTTGTCGC CTCGTCCTTGTCAGAATCAAATCCAAAATCATCTTTTGTTTGTAGTATAAGTTGACAGCT TGGCACTGACTTTTTATTGAATGATTGTTTTGTTTGTAACGTTGCTTTACCACTGACTTT GTTTACTCGGACCTTTTCTGGGGTTAAATTATTGTGTATTGGTACTTGTTCAGCTTCTTC TTCCTCGAGACTCCACTCTAATTCCTGTAATCTCGTTGGTTTAGTATTTGCACAAGTTTC GACTTTTGGATTACTGTATGGCTTTATTGGGCTATACTTATCTTCGTTTTCTTCTTTATC ACTGTCCTCATTTTGTGTAGAATTAGTGCTTCGAGTATAGCAAAATGACAAAATATCAGT GACAATACGTTCTTCTGGAGCTTTACGCATTCTAAGATGTCGAATGGCTTTGTTCAAAAT AGATGATGAGATGTGATTTATAGCATCGGAAATACCCCGATCTACATATCGTCTGAGTCC ACGTTCAAGTTCACTTGTAGTGAATAAGCTCAACCCACAGGTTAACTCTTCTGATGGTTT TTGTCCTTTACTCTCAACCTTTTGTAGTAGATAATGACGTACAAGCTCTTCAACTTCAGC AGAATTTAATCCAACTTTTTTACTTTCAACTTCCATTTCATCTGGATCACTGCAAATCGT ACTGTTCTGTAGACCAGATTNTAAAGCGCGATTTGCTTGCGCAGCAGCCAATTTTTCACG ATTTCGATTAAAAACAATTAAATCTTTANGGTGGGCCACACGACCAACAAATTTTTGACC AAATCTAAGTCCACTGAATGATTCGAATCCACCGCTTAAGTCTACGCGNTATCGTATAAG TGGTTCAACTGGNGGGAAGTAATCGNTGAGTTGATGTGATTTTGATATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)