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Schistosoma mansoni
cluster # 8332 cluster # 8332       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8332#0 length = 451 sequences # 6  

consensusID : consensus_8332#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 451
fasta sequence
                              [GTCGACCTGGCATACCATCAAATCCTGGGAATCCTCGAACTCCTTGATTACCAAGTACTCCCGGCGAACCTCTTACACCTTTAGGACCAGGTTGACCATCACGACCTGGCATACCATCCTTTCCAGGATCTCCAGTTGGACCTGTTGGTCCAACTGGACCTTGTTGTCCTTCAGGTCCTGGATCGCCTATAGGACCCGGTGGTCCAGTGTTCCCGAGACTACCAGGTTGTCCTGCTGGTCCACGTTCACCTGGTTCTCCACGTGGCCCAGGAAATCCAACAGGTCCTTCTCTTCCAGTTGAACCTGGTGGTCCTATTGGTCCAGGAGGTCCGACGGGGCCTTGAAGACCTTGTTCACCAATCGGTCCGACAGATCCAACTGGGCCAACTGGACCAGCATCTCCTTTCATTCCCGGTGGGCCGAATCTTCCTGGTGGACCTCGTGGCCCAGG]

[+] EMBL CD143176             [GTCGACCTGGCATACCATCAAATCCTGGGAATCCTCGAACTCCTTGATTACCAAGTACTCCCGGCGAACCTCTTACACCTTTAGGACCAGGTTGACCATCACGACCTGGCATACCATCCTTTCCAGGATCTCCAGTTGGACCTGTTGGTCCAACTGAACCTTGTTGTCCTTCAGGTCCTGGATCGCCTATAGGACCCGGTGGTCCAGTGTTCCCGAGACTACCAGGTTGTCCTGCTGGTCCACGTTCACCTGGTTCTCCACGTGGCCCAGGAAATCCAACAGGTCCT                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD143111             [GTCGACCTGGCATACCATCAAATCCTGGGAATCCTCGAACTCCTTGATTACCAAGTACTCCCGGCGAACCTCTTACACCTTTAGGACCAGGTTGACCATCACGACCTGGCATACCATCCTTTCCAGGATCTCCAGTTGGACCTGTTGGTCCAA  GTCCCTTGgtt                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD137552             [                     ATCCTGGGAATCCTCGAACTCCTTGATTACCAAGTACTCCCGGCGAACCTTTTACACCTTTAGGACCAGGTTGACCATCACGACCTGGCATACCATCCTTTCCAGGATCTCCAGTTGGACCTGTTGGTCCAACTGGACCTTGTTGTCCTTCAGGTCCTGGATCGCCTATAGGACCCGGTGGTCCAATGTTCCCGAGACTACCAGGTTGTCCTGCTGGTCCACGTTCACCTGGTTCTCCACGTGGCCCAGGAAATCCAACAGGTCCTTCTCTTCCAGTTGAACCTGGTGGTCCTATTGGTCCAGGAGGTCCGACGGGGCCTTGAAGACCTTGTTCACCAATCGGTCCGACAGATCCAACTGGGCCAACTGGACCAGCATCTCCTTTCATTCCCGGTGGGCCGAATCTTCCTGGTGGACCTCGTGGCCCAGG]
[-] EMBL CD143210             [                                                              GGCGAACCTCTTACACCTTTAGGACCAGGTTGACCATCACGACCTGGCATACCATCCTTTCCAGGATCTNCAGTTGGACCTGTTGGTCCAACTGGACCTTGTTGTCCTTCAGGTCCTGGATCGCCTATAGGACCCGGTGGTCCAGTGTTCCCGAGACTACCAGGTTGTCCTGCTGGTCCACGTTCACCTGGTTCTCCACGTGGCCCAGGAAATCCAACAGGTCCTTCTCTTCCAGTTGAACCTGGTGGTCCTATTGGTCCAGGAGGTCCGACGGGGCCTTGAAGACCTTGTTCACCAATCGGTCCGACAGATCCAACTGGGCCAACTGGACCAGCATCTCCTTTCATTCCCGGTGGGC                               ]
[-] EMBL CD143014             [                                                                                            TGACCATCACGACCTGGCATACCATCCTTTCCAGGATCTNCAGTTGGACCTGTTGGTCCAACTGGACCTTGTTGTCCTTCAGGTCCTGGATCGCCTATAGGACCCGGTGGTCCAGTGTTCCCGAGACTACCAGGTTGTCCTGCTGGTCCACGTTCACCTGGTTCTCCACGTGGCCCAGGAAATCCAACAGGTCCTTCTCTTCCAGTTGAACCTGGTGGTCCTATTGGTCCAGGAGGTCCGACGGGGCCTTGAAGACCTTGTTCACCAATCGGTCCGACAGATCCAACTGGGCCAACTGGACCAGCATCTCCTTTCATTCCCGGTGGGC                               ]
[-] EMBL CD140051             [                                                                                                   CACGACCTGGCATACCATCCTTTCCAGGATCTCCAGTTGGACCTGTTGGTCCAACTGGACCTTGTTGTCCTTCAGGTCCTGGATCGCCTATAGGACCCGGTGGTCCAGTGTTCCCGAGACTACCAGGTTGTCCTGCTGGTCCACGTTCACCTGGTTCTCCACGTGGCCCAGGAAATCCAACAGGTCCTTCTCTTCCAGTTGAACCTGGTGGTCCTATTGGTCCAGGAGGTCCGACGGGGCCTTGAAGACCTTGTTCACCAATCGGTCCGACAGATCCAACTGGGCCAACTGGACCAGCATCTCCTTTCATTCCCGGTGGGCCGAATCTTCCTGGTGGACC            ]


>consensus_8332#0 GTCGACCTGGCATACCATCAAATCCTGGGAATCCTCGAACTCCTTGATTACCAAGTACTC CCGGCGAACCTCTTACACCTTTAGGACCAGGTTGACCATCACGACCTGGCATACCATCCT TTCCAGGATCTCCAGTTGGACCTGTTGGTCCAACTGGACCTTGTTGTCCTTCAGGTCCTG GATCGCCTATAGGACCCGGTGGTCCAGTGTTCCCGAGACTACCAGGTTGTCCTGCTGGTC CACGTTCACCTGGTTCTCCACGTGGCCCAGGAAATCCAACAGGTCCTTCTCTTCCAGTTG AACCTGGTGGTCCTATTGGTCCAGGAGGTCCGACGGGGCCTTGAAGACCTTGTTCACCAA TCGGTCCGACAGATCCAACTGGGCCAACTGGACCAGCATCTCCTTTCATTCCCGGTGGGC CGAATCTTCCTGGTGGACCTCGTGGCCCAGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)