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Schistosoma mansoni
cluster # 8336 cluster # 8336       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8336#0 length = 1019 sequences # 6  

consensusID : consensus_8336#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1019
fasta sequence
                              [TAACTAAATCTGACATTTGGTCAATGAATAGTAAAATTGCTTCGAATCTCTTAGGTGCTATTTCACCATCATCTAGTTTATTATCGTCAATGATTGTTCAATCATCATTACCATTTTGTTCATCAATATTTATGGATTCGTCACCAGGAGGAGGAATTGTAGCAGGAAGTTCTGGTACTGGCACTACCAACACTACTACATCTGTCACTACTACAAGCATAAGTGATAATAATACCTTGATGAATAGTAGTAGTATCTTATCTACTCAGAAAAACATTTGTGCCGTAATCAACAGTAGTAGTATTCACAGTAGTAGTACATTAGCTAATGAATTATGTACAAGTACATTTGGCGGTAATTATGGTACACTTTTAACTTCAACTACCCCTCCTACTACTACGTCTGATTGTAGTAGCACTAGTGTTAAAACTACAACCACAACTGAAACATCTTTCACAACGTCCACATCAACTATTACTTATGTTCAATGGCGTATGTTATCCTCGGATGGACATGTTTACTTTTTACATCAAGATGATTTTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATAATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGAATAGTGATAGTAGTAATAACTGTGTTGGCTTTGGTGGTATTCCGTCGTCACCTTCTCCAACTAGGAATCTTAATCGCCAGCATCAAAATAATGGCAGCATTAAAAATTCTGTGATTTGTGAATCCTCTCCTTTTGTTTTATCAGATACAGATGTTAATAAAGAGTAAGTTTGTAAGTGACATATATGTGATTGACGGTGATGGAGAGAAGGGGCGTCCCAGTCCGTTTAACCTTTGTCC]

[+] EMBL CD195576             [TAACTAAATCTGACATTTGGTCAATGAATAGTAAAATTGCTTCGAATCTCTTAGGTGCTATTTCACCATCATCTAGTTTATTATCGTCAATGATTGTTCAATCATCATTACCATTTTGTTCATCAATATTTATGGATTCGTCACCAGGAGGAGGAATTGTAGCAGGAAGTTCTGGTACTGGCACTACCAACACTACTACATCTGTCACTACTACAAGCATAAGTGATAATAATACCTTGATGAATAGTAGTAGTATCTTATCTACTCAGAAAAACATTTGTGCCGTAATCAACAGTAGTAGTATTCACAGTAGTAGTACATTAGCTAATGAATTATGTACAAGTACATTTGGCGGTAATTATGGTACACTTTTAACTTCAACTACCCCTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD095625             [                                                                                                                                                                 GCAGGAAGTTCTGGTACTGGCACTACCAACACTACTACATCTGTCACTACTACAAGCATAAGTGATAATAATACCTTGATGAATAGTAGTAGTATCTTATCTACTCAGAAAAACATTTGTGCTGTAATCAACAGTAGTAGTATTCACAGTAATAGTACATTAGCTAATGAATTATGTACAAGTACATTTGGCGGTAATTATGGTACACTTTTAACTTCAACTACCCCTCCTACTACTACGTCTGATTGTAGTAGCACTAGTGTTAAAACTACAACCACAACTGAAACATCTTTCACAACGTCCACATCAACTATTACTTATGTTCAATGGCGTATGTTATCCTCGGATGGACATGTTTACTTTTTACATCAAGATGATTTTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAGTGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD156096             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCGGATGGACATGTTTACTTTTTACATCAAGATGATTTTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATAATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGAATAGTGATAGTAGTAATAACTGTGTTGGCTTTGGTGGTATTCCGTCGTCACCTTCTCCAACTAGGAATCTTAATCGCCAGCATCAAAATAATGGCAGCATTAAAAATTCTGTGATTTGTGAATCCTCTCCTTTTGTTTTATCAGATACAGATGTTAATAAAGAGTAAGTTTGTAAGTGACATATATGTGATTGACGGTGATGGAGAGAAGGGGCGTCCCAGTCCGTTTAACCTTTGTCC]
[-] EMBL CD156144             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCGGATGGACATGTTTACTTTTTACATCAAGATGATTTTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATAATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGAATAGTGATAGTAGTAATAACTGTGTTGGCTTTGGTGGTATTCCGTCGTCACCTTCTCCAACTAGGAATCTTAATCGCCAGCATCAAAATAATGGCAGCATTAAAAATTCTGTGATTTGTGAATCCTCTCCTTTTGTTTTATCAGATACAGATGTTAATAAAGAGTAAGTTTGTAAGTGACATATATGTGATTGACGGTGATGGAGAGAAGGGGCGTCCCAGTCCGTTTAACCTTTGTCC]
[-] EMBL CD132460             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGCGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATAATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGA                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD187823             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAAGGCAGTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTGAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATAATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGAATAGTGGTAGTAagg                                                                                                                                                                                                                                ]


>consensus_8336#0 TAACTAAATCTGACATTTGGTCAATGAATAGTAAAATTGCTTCGAATCTCTTAGGTGCTA TTTCACCATCATCTAGTTTATTATCGTCAATGATTGTTCAATCATCATTACCATTTTGTT CATCAATATTTATGGATTCGTCACCAGGAGGAGGAATTGTAGCAGGAAGTTCTGGTACTG GCACTACCAACACTACTACATCTGTCACTACTACAAGCATAAGTGATAATAATACCTTGA TGAATAGTAGTAGTATCTTATCTACTCAGAAAAACATTTGTGCCGTAATCAACAGTAGTA GTATTCACAGTAGTAGTACATTAGCTAATGAATTATGTACAAGTACATTTGGCGGTAATT ATGGTACACTTTTAACTTCAACTACCCCTCCTACTACTACGTCTGATTGTAGTAGCACTA GTGTTAAAACTACAACCACAACTGAAACATCTTTCACAACGTCCACATCAACTATTACTT ATGTTCAATGGCGTATGTTATCCTCGGATGGACATGTTTACTTTTTACATCAAGATGATT TTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTAC AGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATA ATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATA ATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGA ATAGTGATAGTAGTAATAACTGTGTTGGCTTTGGTGGTATTCCGTCGTCACCTTCTCCAA CTAGGAATCTTAATCGCCAGCATCAAAATAATGGCAGCATTAAAAATTCTGTGATTTGTG AATCCTCTCCTTTTGTTTTATCAGATACAGATGTTAATAAAGAGTAAGTTTGTAAGTGAC ATATATGTGATTGACGGTGATGGAGAGAAGGGGCGTCCCAGTCCGTTTAACCTTTGTCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)