These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8336#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1019 fasta sequence [TAACTAAATCTGACATTTGGTCAATGAATAGTAAAATTGCTTCGAATCTCTTAGGTGCTATTTCACCATCATCTAGTTTATTATCGTCAATGATTGTTCAATCATCATTACCATTTTGTTCATCAATATTTATGGATTCGTCACCAGGAGGAGGAATTGTAGCAGGAAGTTCTGGTACTGGCACTACCAACACTACTACATCTGTCACTACTACAAGCATAAGTGATAATAATACCTTGATGAATAGTAGTAGTATCTTATCTACTCAGAAAAACATTTGTGCCGTAATCAACAGTAGTAGTATTCACAGTAGTAGTACATTAGCTAATGAATTATGTACAAGTACATTTGGCGGTAATTATGGTACACTTTTAACTTCAACTACCCCTCCTACTACTACGTCTGATTGTAGTAGCACTAGTGTTAAAACTACAACCACAACTGAAACATCTTTCACAACGTCCACATCAACTATTACTTATGTTCAATGGCGTATGTTATCCTCGGATGGACATGTTTACTTTTTACATCAAGATGATTTTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATAATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGAATAGTGATAGTAGTAATAACTGTGTTGGCTTTGGTGGTATTCCGTCGTCACCTTCTCCAACTAGGAATCTTAATCGCCAGCATCAAAATAATGGCAGCATTAAAAATTCTGTGATTTGTGAATCCTCTCCTTTTGTTTTATCAGATACAGATGTTAATAAAGAGTAAGTTTGTAAGTGACATATATGTGATTGACGGTGATGGAGAGAAGGGGCGTCCCAGTCCGTTTAACCTTTGTCC] [+] EMBL CD195576 [TAACTAAATCTGACATTTGGTCAATGAATAGTAAAATTGCTTCGAATCTCTTAGGTGCTATTTCACCATCATCTAGTTTATTATCGTCAATGATTGTTCAATCATCATTACCATTTTGTTCATCAATATTTATGGATTCGTCACCAGGAGGAGGAATTGTAGCAGGAAGTTCTGGTACTGGCACTACCAACACTACTACATCTGTCACTACTACAAGCATAAGTGATAATAATACCTTGATGAATAGTAGTAGTATCTTATCTACTCAGAAAAACATTTGTGCCGTAATCAACAGTAGTAGTATTCACAGTAGTAGTACATTAGCTAATGAATTATGTACAAGTACATTTGGCGGTAATTATGGTACACTTTTAACTTCAACTACCCCTCC ] [+] EMBL CD095625 [ GCAGGAAGTTCTGGTACTGGCACTACCAACACTACTACATCTGTCACTACTACAAGCATAAGTGATAATAATACCTTGATGAATAGTAGTAGTATCTTATCTACTCAGAAAAACATTTGTGCTGTAATCAACAGTAGTAGTATTCACAGTAATAGTACATTAGCTAATGAATTATGTACAAGTACATTTGGCGGTAATTATGGTACACTTTTAACTTCAACTACCCCTCCTACTACTACGTCTGATTGTAGTAGCACTAGTGTTAAAACTACAACCACAACTGAAACATCTTTCACAACGTCCACATCAACTATTACTTATGTTCAATGGCGTATGTTATCCTCGGATGGACATGTTTACTTTTTACATCAAGATGATTTTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAGTGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAA ] [-] EMBL CD156096 [ TCGGATGGACATGTTTACTTTTTACATCAAGATGATTTTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATAATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGAATAGTGATAGTAGTAATAACTGTGTTGGCTTTGGTGGTATTCCGTCGTCACCTTCTCCAACTAGGAATCTTAATCGCCAGCATCAAAATAATGGCAGCATTAAAAATTCTGTGATTTGTGAATCCTCTCCTTTTGTTTTATCAGATACAGATGTTAATAAAGAGTAAGTTTGTAAGTGACATATATGTGATTGACGGTGATGGAGAGAAGGGGCGTCCCAGTCCGTTTAACCTTTGTCC] [-] EMBL CD156144 [ TCGGATGGACATGTTTACTTTTTACATCAAGATGATTTTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATAATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGAATAGTGATAGTAGTAATAACTGTGTTGGCTTTGGTGGTATTCCGTCGTCACCTTCTCCAACTAGGAATCTTAATCGCCAGCATCAAAATAATGGCAGCATTAAAAATTCTGTGATTTGTGAATCCTCTCCTTTTGTTTTATCAGATACAGATGTTAATAAAGAGTAAGTTTGTAAGTGACATATATGTGATTGACGGTGATGGAGAGAAGGGGCGTCCCAGTCCGTTTAACCTTTGTCC] [-] EMBL CD132460 [ TTTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGCGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATAATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGA ] [-] EMBL CD187823 [ TAAGGCAGTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTGAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATAATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGAATAGTGGTAGTAagg ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||