cluster # 8346

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Schistosoma mansoni
cluster # 8346 cluster # 8346 Sequences # 6 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_8346#0 length = 446 sequences # 6

consensusID : consensus_8346#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 446
fasta sequence

                              [CTGGTCTTCCTGCTACACCCATGGATCCTTCTGGTCCTCTTTGACCTGGTTCTCCTCGAACACCTGGACGCCCATCATGACCGATTTCGCCCTGAATTCCACGTTCTTTGCTCAATCCTGGATGTCCTGGTGTTCCTGTAGGACCCTTTTCACCCTTTTCTCCTTTTGCACCAGTCAAACCACGATCCCCTTTTTGTCCAGCGGGTCCTGATGCCCCGGGTCTTCCAGGGTTACCTACTGGACCTTGCGGTCCCATCACACCCGCCCTTCCAGTAGGACCAGATTCACCTCTTGGACCTGAGGGTCCAGGTGGACCCATGGGACCTGGTGGGCCAACAGGTCCCGTTGGTCCTTGAGGTCCTTGTGGCCCCATAGGTCCTTGAGAACCTTTATGTCCATCAAATCCAGTATCACCTTTGTCTCCTGTTTGACCTTGATAACCTTGG]

[-] EMBL CD131300             [CTGGTCTTCCTGCTACACCCATGGATCCTTCTGGTCCTCTTTGACCTGGTTCTCCTCGAACACCTGGACGCCCATCATGACCGATTTCGCCCTGAATTCCACGTTCTTTGCTCAATCCTGGATGTCCTGGTGTTCCTGTAGGACCCTTTTCACCCTTTTCTCCTTTTGCACCAGTCAAACCACGATCCCCTTTTTGTCCAGCGGGTCCTGATGCCCCGGGTCTTCCAGGGTTAC                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD131557             [CTGGTCTTCCTGCTACACCCATGGATCCTTCTGGTCCTCTTTGACCTGGTTCTCCTCGAACACCTGGACGCCCATCATGACCGATTTCGCCCTGAATTCCACGTTCTTTGCTCAATCCTGGATGTCCTGGTGTTCCTGTAGGACCCTTTTCACCCTTTTCTCCTTTTGCACCAGTCAAACCACGATCCCCTTTTTGTCCAGCGGGTCCTGATGCCCCGGGTCTTCCAGGGTTAC                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD138498             [                                                                                             ggATTCCACGTTCTTTGCTCAATCCTGGATGTCCTGGTGTTCCTGTAGGACCCTTTTCACCCTTTTCTCCTTTTGCACCAGTCAAACCACGATCCCCTTTTTGTCCAGCGCGTCCTGATGCCCCGAGTCTTCCAGGGTTACCTACTGGACCTTGCGGTCCCATCACACCCGCCCTTCCAGTAGGACCAGATTCACCTCTT                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD180704             [                                                                                                                                 caagaCCAGGACGACCCTTTTCACCCTTTTCTCCTTTTGCACCAGTCAAACCACGATCCCCTTTTTGTCCAGCGGGTCCTGATGCCCCGGGTCTTCCAGGGTTACCTACTGGACCTTGCGGTCCCATCACACCCGCCCTTCCAGTAGGACCAGATTCACCTCTTGGACCTGAGGGTCCAGGTGGACCCATGGGACCTGGTGGGCCAACAGGTCCCGTTGGTCCTTGAGGTCCTTGTGGCCCCATAGGTCCTTGAGAACCTTTATGTCCATCAAATCCAGTATCACCTTTGTCTCCTGTTTGA               ]
[+] EMBL CD128834             [                                                                                                                                                                   TTTTGCACCAGTCAAACCACGATCCCCTTTTTGTCCAGCGGGTCCTGATGCCCCGGGTCTTCCAGGGTTACCTACTGGACCTTGCGGTCCCATCACACCCGCCCTTCCAGTAGacaaatatc                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD068799             [                                                                                                                                                                                      CGATCCCCTTTTTGTCCAGCGGGTCCTGATGCCCCGGGTCTTCCAGGGTTACCTACTGGACCTTGCGGTCCCATCACACCCGCCCTTCCAGTAGGACCAGATTCACCTCTTGGACCTGAGGGTCCAGGTGGACCCATGGGACCTGGTGGGCCAACAGGTCCCGTTGGTCCTTGAGGTCCTTGTGGCCCCATAGGTCCTTGAGAACCTTTATGTCCATCAAATCCAGTATCACCTTTGTCTCCTGTTTGACCTTGATAACCTTGG]




>consensus_8346#0
CTGGTCTTCCTGCTACACCCATGGATCCTTCTGGTCCTCTTTGACCTGGTTCTCCTCGAA
CACCTGGACGCCCATCATGACCGATTTCGCCCTGAATTCCACGTTCTTTGCTCAATCCTG
GATGTCCTGGTGTTCCTGTAGGACCCTTTTCACCCTTTTCTCCTTTTGCACCAGTCAAAC
CACGATCCCCTTTTTGTCCAGCGGGTCCTGATGCCCCGGGTCTTCCAGGGTTACCTACTG
GACCTTGCGGTCCCATCACACCCGCCCTTCCAGTAGGACCAGATTCACCTCTTGGACCTG
AGGGTCCAGGTGGACCCATGGGACCTGGTGGGCCAACAGGTCCCGTTGGTCCTTGAGGTC
CTTGTGGCCCCATAGGTCCTTGAGAACCTTTATGTCCATCAAATCCAGTATCACCTTTGT
CTCCTGTTTGACCTTGATAACCTTGG

clustalw multiple alignements is not computed in this case