These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8352#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 576 fasta sequence [AGGAATTCACACGGTTGGCTCTTGGAGATGGAGCATCTGGTTATCGATATGGATTGGAATGCTTGTTTCGATTTTACTCGTATGGTTTGGAACGTCGTTTCAAATGGTCTCTTTATAAGGACTTCCAGGAACAAGCCTTGAGAGACTACAAAAACGGACATCTATATGGGTTGGAAAAATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTAATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTGATCTAATGCGACTCACTATCAGGACACTTGAAATTT] [+] EMBL CD129903 [AGGAATTCACACGGTTGGCTCTTGGAGATGGAGCATCTGGTTATCGATATGGATTGGAATGCTTGTTTCGATTTTACTCGTATGGTTTGGAACGTCGTTTCAAATGGTCTCTTTATAAGGACTTCCAGGAACAAGCCTTGAGAGACTACAAAAACGGACATCTATATGGGTTGGAAAAATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTAATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTGATCTAATGCGACTCACTATCAGGACACTTGAAATTT] [+] EMBL CD165055 [ TTGAGAGACTACAAAAACGGACATCTATATGGGTTGGAAAAATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTA ] [+] EMBL CD189032 [ gGGAAAAATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGAGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTAATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTGATCTAATG ] [+] EMBL CD189347 [ AAATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGATCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGCTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTA ] [-] EMBL CD188653 [ AATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTAATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTGATCTAATGC ] [+] EMBL CD183527 [ AATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGCTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTAATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTGATCTAATG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||