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Schistosoma mansoni
cluster # 8352 cluster # 8352       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8352#0 length = 576 sequences # 6  

consensusID : consensus_8352#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 576
fasta sequence
                              [AGGAATTCACACGGTTGGCTCTTGGAGATGGAGCATCTGGTTATCGATATGGATTGGAATGCTTGTTTCGATTTTACTCGTATGGTTTGGAACGTCGTTTCAAATGGTCTCTTTATAAGGACTTCCAGGAACAAGCCTTGAGAGACTACAAAAACGGACATCTATATGGGTTGGAAAAATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTAATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTGATCTAATGCGACTCACTATCAGGACACTTGAAATTT]

[+] EMBL CD129903             [AGGAATTCACACGGTTGGCTCTTGGAGATGGAGCATCTGGTTATCGATATGGATTGGAATGCTTGTTTCGATTTTACTCGTATGGTTTGGAACGTCGTTTCAAATGGTCTCTTTATAAGGACTTCCAGGAACAAGCCTTGAGAGACTACAAAAACGGACATCTATATGGGTTGGAAAAATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTAATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTGATCTAATGCGACTCACTATCAGGACACTTGAAATTT]
[+] EMBL CD165055             [                                                                                                                                         TTGAGAGACTACAAAAACGGACATCTATATGGGTTGGAAAAATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTA                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD189032             [                                                                                                                                                                           gGGAAAAATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGAGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTAATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTGATCTAATG                            ]
[+] EMBL CD189347             [                                                                                                                                                                                AAATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGATCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGCTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTA                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD188653             [                                                                                                                                                                                 AATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTAATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTGATCTAATGC                           ]
[+] EMBL CD183527             [                                                                                                                                                                                 AATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGCTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTAATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTGATCTAATG                            ]


>consensus_8352#0 AGGAATTCACACGGTTGGCTCTTGGAGATGGAGCATCTGGTTATCGATATGGATTGGAAT GCTTGTTTCGATTTTACTCGTATGGTTTGGAACGTCGTTTCAAATGGTCTCTTTATAAGG ACTTCCAGGAACAAGCCTTGAGAGACTACAAAAACGGACATCTATATGGGTTGGAAAAAT TCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGT TACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGAT TTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCT CCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACT TCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTA ATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTG ATCTAATGCGACTCACTATCAGGACACTTGAAATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)