cluster # 840

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Schistosoma mansoni
cluster # 840 cluster # 840 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_840#0 length = 556 sequences # 2

consensusID : consensus_840#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 556
fasta sequence

                              [AGTTTGCGTTACGCTGACACGGTATTTATTACAAAGTGCTTATATATCGTTAAACTCTAGTTTATTAATCAATAATAACATTCGGTTAACCCTTGAAGAAAAATGGTTCGACTGACACAAAAGCGAGCTCGAAAAAGTCCTAGTTCTTCAGATGTCAACTCTGGTCTTACCTATACCCCATGCTCTGCAACTCCTGATGCACCAGATAATAGTGGGAGTGGACTTATTCCACACATATTGCTGGGTGACTCTATGTCTAACTTAATAATGAGTTCTAACTCACGAACAGATGGTATCGATCTTATTAAGAGCGAATTAGCCGCTGTCTATAAGCAATTAAGTGATATGCGTTCTAAAGTGGAGTCACTTGCGGGCTCTTTATTAAAGCATGATGATCTTAAACTAGAACTAAAGACACTGTCACCCCTTCGACTGCTGTTGTCAAAGGATATAGTTCCTTCTGAACTCGAAGACAGGATCAAAGTAGAATCAGTTATTGACTCGATAGCTAGCGAAGTCACCAAGCGAATAATCTCACGAAATAACGTGATTATAT]

[+] EMBL AI976156             [AGTTTGCGTTACGCTGACACGGTATTTATTACAAAGTGCTTATATATCGTTAAACTCTAGTTTATTAATCAATAATAACATTCGGTTAACCCTTGAAGAAAAATGGTTCGACTGACACAAAAGCGAGCTCGAAAAAGTCCTAGTTCTTCAGATGTCAACTCTGGTCTTACCTATACCCCATGCTCTGCAACTCCTGATGCACCAGATAATAGTGGGAGTGGACTTATTCCACACATATTGCTGGGTGACTCTATGTCTAACTTAATAATGAGTTCTAACTCACGAACAGATGGTATCGATCTTATTAAGAGCGAATTAGCCGCTGTCTATAAGCAATTAAGTGATATGCGTTCTAAAGTGGAGTCACTTGCGGGCTCTTTATTAAAGCATGATGATCTTAAACTAGAACTAAAGACACTGTCACCCCTTCGACTGCTGTTGTCAAAGGATATAGTTCCTTCTGAACTCGAAGACAGGATCAAAGTAGAATCAGTTATTGACTCGATAGCTAGCGAAGTCACCAAGCGAATAATCTCACGAAATAACGTGATTATAT]
[+] EMBL AI976154             [AGTTTGCGTTACGCTGACACGGTATTTATTACAAAGTGCTTATATATCGTTAAACTCTAGTTTATTAATCAATAATAACATTCGGTTAACCCTTGAAGAAAAATGGTTCGACTGACACAAAAGCGAGCTCGAAAAAGTCCTAGTTCTTCAGATGTCAACTCTGGTCTTACCTATACCCCATGCTCTGCAACTCCTGATGCACCAGATAATAGTGGGAGTGGACTTATTCCACACATATTGCTGGGTGACTCTATGTCTAACTTAATAATGAGTTCTAACTCACGAACAGATGGTATCGATCTTATTAAGAGCGAATTAGCCGCTGTCTATAAGCAATTAAGTGATATGCGTTCTAAAGTGGAGTCACTTGCGGGCTCTTTATTAAAGCATGATGATCTTAAACTATAACTAAAGACACTGTCACCCCTTCGACTGCTGTTGTC                                                                                                                 ]




>consensus_840#0
AGTTTGCGTTACGCTGACACGGTATTTATTACAAAGTGCTTATATATCGTTAAACTCTAG
TTTATTAATCAATAATAACATTCGGTTAACCCTTGAAGAAAAATGGTTCGACTGACACAA
AAGCGAGCTCGAAAAAGTCCTAGTTCTTCAGATGTCAACTCTGGTCTTACCTATACCCCA
TGCTCTGCAACTCCTGATGCACCAGATAATAGTGGGAGTGGACTTATTCCACACATATTG
CTGGGTGACTCTATGTCTAACTTAATAATGAGTTCTAACTCACGAACAGATGGTATCGAT
CTTATTAAGAGCGAATTAGCCGCTGTCTATAAGCAATTAAGTGATATGCGTTCTAAAGTG
GAGTCACTTGCGGGCTCTTTATTAAAGCATGATGATCTTAAACTAGAACTAAAGACACTG
TCACCCCTTCGACTGCTGTTGTCAAAGGATATAGTTCCTTCTGAACTCGAAGACAGGATC
AAAGTAGAATCAGTTATTGACTCGATAGCTAGCGAAGTCACCAAGCGAATAATCTCACGA
AATAACGTGATTATAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case