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Schistosoma mansoni
cluster # 8410 cluster # 8410       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8410#0 length = 1110 sequences # 6  

consensusID : consensus_8410#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1110
fasta sequence
                              [AAGAATTTATTTTATAAGAATGAACCAAATGGAATTTAAACATGAGATTTCTGGTTAATGATCAAAATTACAAGGAATACACAAAATAGATTGTAAACATGGTATAGTGAAAGTATTAAACATTGAATGAATCTTATCCAAATGAAATCACGAAAAACCAAGTTAATAATGAAGATTACATTTAAATATGTGGTATCAATGTACATCATATATTTTGATTATACAATAACTAAGATTAGTTCCATCATTATAAATTTTCATACACAGAAACTACTGATATATGAAATAAGTAATAAAAAAATTATGCAAGAATATTTTGGACGATGACAATGATAATTAGAATTACCAAAGATGTTAAATTCCACAGATATAATAGTATATACTGAAATCTTTATA-AATGATGATCTTTTGAATGATGTAGTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAGAAAAATAAACAGACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACCTGGTGTGACAAAATCAAAGCTATTTATTTATCTGTCTATCTAGTACAAAGTAACTTTGCCATCATTCTTTCCTGATAATAATGTGTATGTGTGTGTATGGGTGTACGATGGTTTTCAAATTATAGTTCAATTATTCACTACGTGATCCATGGGCATGGAGATTATTACGATTCGGATGGTTGATAGTATGAGGACGACTTGATGACATGGCCAAATTTAATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTAATATAATAAGTCCTGTGAATGCCCCAAACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGAAAATTTGAAATAGACGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATGTGATACCACGAAGGATAGAACTACCCATTTCACTAAGAGATTCCTTAGCTCGTTCCACTCGAGTTGGTAATACACTGATTGTAAATGAACGAACTATATGTGCACAAGACTCAACAGATATACCTAAAGCCACAACTAAATTGACTAAAGATAATGCATTCGAGGTGATAGACCATAGAGCCATAACGGCTGATACACTAATCACAATAT]

[+] EMBL CD077113             [AAGAATTTATTTTATAAGAATGAACCAAATGGAATTTAAACATGAGATTTCTGGTTAATGATCAAAATTACAAGGAATACACAAAATAGATTGTAAACATGGTATAGTGAAAGTATTAAACATTGAATGAATCTTATCCAAATGAAATCACGAAAAACCAAGTTAATAATGAAGATTACATTTAAATATGTGGTATCAATGTACATCATATATTTTGATTATACAATAACTAAGATTAGTTCCATCATTATAAATTTTCATACACAGAAACTACTGATATATGAAATAAGTAATAAAAAAATTATGCAAGAATATTTTGGACGATGACAATGATAATTAGAATTACCAAAGATGTTAAATTCCACAGATATAATAGTATATACTGAAATCTTTATA AATGATGATCTTTTGAATGATGTAGTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAGAAAAATAAACAGACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACCTGGTGTGACAAAATCAAAGCTATTTATTTATCTGTCTATCTAGTACAAAGTAACTTTGCCATCATTCTTTCCTGATAATAATGTGTATGTGTGTGTATGGGTGTACGATGGTTTTCAAATTATAGTTCAATTATTCACTACGTGATCCATGGGCATGGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD073207             [AAGAATTTATTTTATAAGAATGAACCAAATGGAATTTAAACATGAGATTTCTGGTTAATGATCAAAATTACAAGGAATACACAAAATAGATTGTAAACATGGTATAGTGAAAGTATTAAACATTGAATGAATCTTATCCAAATGAAATCACGAAAAACCAAGTTAATAATGAAGATTACATTTAAATATGTGGTATCAATGTACATCATATATTTTGATTATACAATAACTAAGATTAGTTCCATCATTATAAATTTTCATACACAGAAACTACTGATATATGAAATAAGTAATAAAAAAATTATGCAAGAATATTTTGGACGATGACAATGATAATTAGAATTACCAAAGATGTTAAATTCCACAGATATAATAGTATATACTGAAATCTTTATA AATGATGATCTTTTGAATGATGTAGTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAAAAAAATAAACAGACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACGTGGTGTGACAAAATCAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD078747             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaTACCAAAGATG TAAATTCCNCAGATATAATAGTATATACTGAAATCTTTATA AATGATGATCTTNTGAATGATGTAGTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAAAAAAATAAACAGACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACGTGGTGTGACAAAATCAAAGCTATTTATTTATCTGTCTATCTAGTACAAAGTAACTTTGCCATCATTCTTTCCTGATAATAATGTGTATGTGTGTGTATGGGTGTACGATGGTTTTCAAGTTATAGTTCAATTATTCACTACGTGATCCATGGGCACGGAGATTATTACGATTCGGATGGTTGATAGTATGAGGACGACTTGATGACATGGCCAAATTTAATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTAATATAATAAGTCCTGTGAATGCCCCAAACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGAAAATTTGAAATAGACGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATGTGATACCACGAAGGATAGAACTACCCATTTCACTAAGAGATTCCTTAGCTCGTTCC                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD079249             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAAATTCCACAGATATAATAGTATATACTGAAATC TTACAGAATGATGATCTTNTGAATGATGTAGTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAGAAAAATAAACAGACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACCTGGTGTGACAAAATCAAAGCTATTTATTTATCTGTCTATCTAGTACAAAGTAACTTTGCCATCATTCTTTCCTGATAATAATGTGTATGTGTGTGTATGGGTGTACGATGGTTTTCAAATTATAGTTCAATTATTCACTACGTGATCCATGGGCATGGAGATTATTACGATTCGGATGGTTGATATTATGAGGACGACATGATGACATGGCCAAATTTAATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTAATATAATAAGTCCTGTGAATGCCCCAAACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGAAAATTTGAAATAAACGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATGTGATACCACGAAGGATAGAACTACCCATTTCACTAAGAGATTCCT                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL AI110991             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGGGCACGGAGATTATTANGATTCGGATNGTNGATAGTATGAGGANGACTTGATGACATGGCCAAATTTAATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTNATATAATAAGTCCTGTGAATGCCCCANACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGNAAATTTGAAATAGANGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATGTGATACCACGAAGGATAGAACT                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD168893             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTAATATAATAAGTCCTGTGAATGCCCCAAACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGAAAATTTGAAATAAACGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATGTGATACCACGAAGGATAGAACTACCCATTTCACTAAGAGATTCCTTAGCTCGTTCCACTCGAGTTGGTAATACACTGATTGTAAATGAACGAACTATATGTGCACAAGACTCAACAGATATACCTAAAGCCACAACTAAATTGACTAAAGATAATGCATTCGAGGTGATAGACCATAGAGCCATAACGGCTGATACACTAATCACAATAT]


>consensus_8410#0 AAGAATTTATTTTATAAGAATGAACCAAATGGAATTTAAACATGAGATTTCTGGTTAATG ATCAAAATTACAAGGAATACACAAAATAGATTGTAAACATGGTATAGTGAAAGTATTAAA CATTGAATGAATCTTATCCAAATGAAATCACGAAAAACCAAGTTAATAATGAAGATTACA TTTAAATATGTGGTATCAATGTACATCATATATTTTGATTATACAATAACTAAGATTAGT TCCATCATTATAAATTTTCATACACAGAAACTACTGATATATGAAATAAGTAATAAAAAA ATTATGCAAGAATATTTTGGACGATGACAATGATAATTAGAATTACCAAAGATGTTAAAT TCCACAGATATAATAGTATATACTGAAATCTTTATAAATGATGATCTTTTGAATGATGTA GTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAGAAAAATAAACAG ACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACCTGGTGTGACAAAATC AAAGCTATTTATTTATCTGTCTATCTAGTACAAAGTAACTTTGCCATCATTCTTTCCTGA TAATAATGTGTATGTGTGTGTATGGGTGTACGATGGTTTTCAAATTATAGTTCAATTATT CACTACGTGATCCATGGGCATGGAGATTATTACGATTCGGATGGTTGATAGTATGAGGAC GACTTGATGACATGGCCAAATTTAATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTAATA TAATAAGTCCTGTGAATGCCCCAAACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGAAAA TTTGAAATAGACGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATG TGATACCACGAAGGATAGAACTACCCATTTCACTAAGAGATTCCTTAGCTCGTTCCACTC GAGTTGGTAATACACTGATTGTAAATGAACGAACTATATGTGCACAAGACTCAACAGATA TACCTAAAGCCACAACTAAATTGACTAAAGATAATGCATTCGAGGTGATAGACCATAGAG CCATAACGGCTGATACACTAATCACAATAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)