Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8413 cluster # 8413       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8413#0 length = 884 sequences # 6  

consensusID : consensus_8413#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 884
fasta sequence
                              [GTGCTGGCTCATTGTGGCATGAATTTACAGCTGACTTTCCAGTTTCACGCCTCTTGAGCTTATCATCACCAAACACTTTGGAATACATTGCTGAATCAGAGTCCCAAGCTTATCATATCTTACAGTCAACAATAAATAGCTTGTTATTGAATCGTTTACGTACTATACATCCAAATTTATGGCCTCATGATATCAAACTTGCAGCTAGTTGTAACGATGGTGATAATCAAAACTTAACGTGGACTGACTTATATTTACCGCTTAATTCATCAACAGAAAATATTTATTCAGATAAAATACGGTTTAATACGTGTATTGAGCTTTATTTACCTGCAGGTGTTATTCGTCGTTGTCTGTCAAGACAAGAATTACTCGGTCGGTTAAAAAGTTTATCCTTATCTGTTGGAAAGTACAGCTTATCAGATTTAAGCGATCACCACTTAAAAACTCATGAATATATCATTGAGTTGATTTCAAGTCTTGCAAATGTTCGTGCAACTGCACCTATTTACCTCACAACATTTTCTTCTATTATTTTAGAGGATTATCGAACATGGTTAGCTAATTTAACTGCTTCTGCTACGGAGAATAAAAGTGTATGTTTACAGTCACCAGTAGTCTTTAATATATGTCTTTCAACAATGAGTTACCTTGAGTATTTATTATTGTTGTGGCAGCCTTGGCAATGGTGCGCCATAGAATCCGAAAAATCTCCAATATCTGTTAGACTGGGTCTCGTTCAGTTAAGTATGAGAATACGTCAGTTAAGACCTTCTTTATCTGTTGAACAATGGGATTTTGTTCTTTGTTTAACTTTGAGTTGGGTCTGTTCAGTTGTTCATTATTTTTGTGGCTCATCTAATCCTGGTGTCGAAAAAACTTTA]

[+] EMBL CD069434             [GTGCTGGCTCATTGTGGCATGAATTTACAGCTGACTTTCCAGTTTCACGCCTCTTGAGCTTATCATCACCAAACACTTTGGAATACATTGCTGAATCAGAGTCCCAAGCTTATCATATCTTACAGTCAACAATAAATAGCTTGTTATTGAATCGTTTACGTACTATACATCCAAATTTATGGCCTCATGATATCAAACTTGCAGCTAGTTGTAACGATGGTGATAATCAAAACTTAACGTGGACTGACTTATATTTACCGCTTAATTCATCAACAGAAAATATTTATTCAGATAAAATACGGTTTAATACGTGTATTGAGCTTTATTTACCTGCAGGTGTTATTCGTCGTTGTCTGTCAAGACAAGAATTACTCGGTCGGTTAAAAAGTTTATCCTTATCTGTTGGAAAGTACAGCTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD165980             [                                                                                                     TCCCAAGCTTACCATATCTTACAGTCAACAATAAATAGCTTGTTATTGAATCGTTTACGTGCTATACATCCAAATTTATGGCCTCATGATATCAAACTTGCAGCTAGTTGTAGCGATGGTGATAATCAAAACTTAACGTGGACTGACTTATATTTACCGCTTAATTCATCAACAGAAAATATTTATTCAGATAAAATACGGTTTAATACGTGTATTGAGCTTTATTTACCTGCAGGTGTTATTCGTCGTTGTCTGTCAAGACAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BF937030             [                                                                                                                                                                          CCAAATTTATGGCCTCATGATATCAAACTTGCAGCTAGTTGTAACGATGGTGATAATCAAAACTTAACGTGGACTGACTTATATTTACCGCTTAATTCATCAACAGAAAATATTTATTCAGATAAAATACGGTTTAATACGTGTATTGAGCTTTATTTACCTGCAGGTGTTATTCGTCGTTGTCTGTCAAGACAAGAATTACTCGGTCGGTTAAAAAGTTTATCCTTATCTGTTGGAAAGTACAGCTTATCAGATTTAAGCGATCACCACTTAAAAACTCATGAATATATCATTGAGTTGATTTCAAGTCTTGCAAATGTTCGTGCAACTGCACCTATTTACCTCACAACATTTTCTTCTATTATTTTAGAGGATTATCGAACATGGTTAGCTAATTTAACTGCTTCTGCTACGGAGAATAAAAGTGTATGTTTACAGTCACCAGTAGTCTTTAATATATGTCTTTCAACAATGAGT                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD152541             [                                                                                                                                                                                                                                                                ACCGCTTAATTCATGGGCACAAAATATTTATTCAGATAAAATACGGTTTAATACTTGTATTGAGCTTTATTTACCTGCAAGTGTTATTCGTCGTTGTCTGTCAAGACAAGAATTACTCGGTCGGTTAAAAAGTTTATCCTTATCTGGTGGAAAGTACAGCTTATCATATTTAAGCGATCACCACTTAAAAACTCATGAATATATCATTGAGTTGATTTCAAGTCTTGCAAATGTTCGCGCAACTGCg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD152497             [                                                                                                                                                                                                                                                                ACCGCTTAATTCATCAACAGAAAATATTTATTCAGATAAAATACGGTTTAATACGTGTATTGAGCTTTATTTACCTGCAGGTGTTATTCGTCGTTGTCTGTCAAGACAAGAATTACTCGGTCGGTTAAAAAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD154950             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTTCAAGTCTTGCAAATGTTCGTGCAACTGCACCTGTTTACCTCACAACATTTTCTTCTATTATTTTAGAGGATTATCGAACATGGTTAGCTAATTTAACTGCTTCTGCTACGGAGAATAAAAGTGTATGTTTACAGTCACCAGTAGTCTTTAATATATGTCTTTCAACAATGAGTTACCTTGAGTATTTATTATTGTTGTGGCAGCCTTGGCAATGGTGCGCCATAGAATCCGAAAAATCTCCAATATCTGTTAGACTGGGTCTCGTTCAGTTAAGTATGAGAATACGTCAGTTAAGACCTTCTTTATCTGTTGAACAATGGGATTTTGTTCTTTGTTTAACTTTGAGTTGGGTCTGTTCAGTTGTTCATTATTTTTGTGGCTCATCTAATCCTGGTGTCGAAAAAACTTTA]


>consensus_8413#0 GTGCTGGCTCATTGTGGCATGAATTTACAGCTGACTTTCCAGTTTCACGCCTCTTGAGCT TATCATCACCAAACACTTTGGAATACATTGCTGAATCAGAGTCCCAAGCTTATCATATCT TACAGTCAACAATAAATAGCTTGTTATTGAATCGTTTACGTACTATACATCCAAATTTAT GGCCTCATGATATCAAACTTGCAGCTAGTTGTAACGATGGTGATAATCAAAACTTAACGT GGACTGACTTATATTTACCGCTTAATTCATCAACAGAAAATATTTATTCAGATAAAATAC GGTTTAATACGTGTATTGAGCTTTATTTACCTGCAGGTGTTATTCGTCGTTGTCTGTCAA GACAAGAATTACTCGGTCGGTTAAAAAGTTTATCCTTATCTGTTGGAAAGTACAGCTTAT CAGATTTAAGCGATCACCACTTAAAAACTCATGAATATATCATTGAGTTGATTTCAAGTC TTGCAAATGTTCGTGCAACTGCACCTATTTACCTCACAACATTTTCTTCTATTATTTTAG AGGATTATCGAACATGGTTAGCTAATTTAACTGCTTCTGCTACGGAGAATAAAAGTGTAT GTTTACAGTCACCAGTAGTCTTTAATATATGTCTTTCAACAATGAGTTACCTTGAGTATT TATTATTGTTGTGGCAGCCTTGGCAATGGTGCGCCATAGAATCCGAAAAATCTCCAATAT CTGTTAGACTGGGTCTCGTTCAGTTAAGTATGAGAATACGTCAGTTAAGACCTTCTTTAT CTGTTGAACAATGGGATTTTGTTCTTTGTTTAACTTTGAGTTGGGTCTGTTCAGTTGTTC ATTATTTTTGTGGCTCATCTAATCCTGGTGTCGAAAAAACTTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)