These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8413#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 884 fasta sequence [GTGCTGGCTCATTGTGGCATGAATTTACAGCTGACTTTCCAGTTTCACGCCTCTTGAGCTTATCATCACCAAACACTTTGGAATACATTGCTGAATCAGAGTCCCAAGCTTATCATATCTTACAGTCAACAATAAATAGCTTGTTATTGAATCGTTTACGTACTATACATCCAAATTTATGGCCTCATGATATCAAACTTGCAGCTAGTTGTAACGATGGTGATAATCAAAACTTAACGTGGACTGACTTATATTTACCGCTTAATTCATCAACAGAAAATATTTATTCAGATAAAATACGGTTTAATACGTGTATTGAGCTTTATTTACCTGCAGGTGTTATTCGTCGTTGTCTGTCAAGACAAGAATTACTCGGTCGGTTAAAAAGTTTATCCTTATCTGTTGGAAAGTACAGCTTATCAGATTTAAGCGATCACCACTTAAAAACTCATGAATATATCATTGAGTTGATTTCAAGTCTTGCAAATGTTCGTGCAACTGCACCTATTTACCTCACAACATTTTCTTCTATTATTTTAGAGGATTATCGAACATGGTTAGCTAATTTAACTGCTTCTGCTACGGAGAATAAAAGTGTATGTTTACAGTCACCAGTAGTCTTTAATATATGTCTTTCAACAATGAGTTACCTTGAGTATTTATTATTGTTGTGGCAGCCTTGGCAATGGTGCGCCATAGAATCCGAAAAATCTCCAATATCTGTTAGACTGGGTCTCGTTCAGTTAAGTATGAGAATACGTCAGTTAAGACCTTCTTTATCTGTTGAACAATGGGATTTTGTTCTTTGTTTAACTTTGAGTTGGGTCTGTTCAGTTGTTCATTATTTTTGTGGCTCATCTAATCCTGGTGTCGAAAAAACTTTA] [+] EMBL CD069434 [GTGCTGGCTCATTGTGGCATGAATTTACAGCTGACTTTCCAGTTTCACGCCTCTTGAGCTTATCATCACCAAACACTTTGGAATACATTGCTGAATCAGAGTCCCAAGCTTATCATATCTTACAGTCAACAATAAATAGCTTGTTATTGAATCGTTTACGTACTATACATCCAAATTTATGGCCTCATGATATCAAACTTGCAGCTAGTTGTAACGATGGTGATAATCAAAACTTAACGTGGACTGACTTATATTTACCGCTTAATTCATCAACAGAAAATATTTATTCAGATAAAATACGGTTTAATACGTGTATTGAGCTTTATTTACCTGCAGGTGTTATTCGTCGTTGTCTGTCAAGACAAGAATTACTCGGTCGGTTAAAAAGTTTATCCTTATCTGTTGGAAAGTACAGCTTA ] [-] EMBL CD165980 [ TCCCAAGCTTACCATATCTTACAGTCAACAATAAATAGCTTGTTATTGAATCGTTTACGTGCTATACATCCAAATTTATGGCCTCATGATATCAAACTTGCAGCTAGTTGTAGCGATGGTGATAATCAAAACTTAACGTGGACTGACTTATATTTACCGCTTAATTCATCAACAGAAAATATTTATTCAGATAAAATACGGTTTAATACGTGTATTGAGCTTTATTTACCTGCAGGTGTTATTCGTCGTTGTCTGTCAAGACAAG ] [+] EMBL BF937030 [ CCAAATTTATGGCCTCATGATATCAAACTTGCAGCTAGTTGTAACGATGGTGATAATCAAAACTTAACGTGGACTGACTTATATTTACCGCTTAATTCATCAACAGAAAATATTTATTCAGATAAAATACGGTTTAATACGTGTATTGAGCTTTATTTACCTGCAGGTGTTATTCGTCGTTGTCTGTCAAGACAAGAATTACTCGGTCGGTTAAAAAGTTTATCCTTATCTGTTGGAAAGTACAGCTTATCAGATTTAAGCGATCACCACTTAAAAACTCATGAATATATCATTGAGTTGATTTCAAGTCTTGCAAATGTTCGTGCAACTGCACCTATTTACCTCACAACATTTTCTTCTATTATTTTAGAGGATTATCGAACATGGTTAGCTAATTTAACTGCTTCTGCTACGGAGAATAAAAGTGTATGTTTACAGTCACCAGTAGTCTTTAATATATGTCTTTCAACAATGAGT ] [+] EMBL CD152541 [ ACCGCTTAATTCATGGGCACAAAATATTTATTCAGATAAAATACGGTTTAATACTTGTATTGAGCTTTATTTACCTGCAAGTGTTATTCGTCGTTGTCTGTCAAGACAAGAATTACTCGGTCGGTTAAAAAGTTTATCCTTATCTGGTGGAAAGTACAGCTTATCATATTTAAGCGATCACCACTTAAAAACTCATGAATATATCATTGAGTTGATTTCAAGTCTTGCAAATGTTCGCGCAACTGCg ] [+] EMBL CD152497 [ ACCGCTTAATTCATCAACAGAAAATATTTATTCAGATAAAATACGGTTTAATACGTGTATTGAGCTTTATTTACCTGCAGGTGTTATTCGTCGTTGTCTGTCAAGACAAGAATTACTCGGTCGGTTAAAAAGTT ] [-] EMBL CD154950 [ ATTTCAAGTCTTGCAAATGTTCGTGCAACTGCACCTGTTTACCTCACAACATTTTCTTCTATTATTTTAGAGGATTATCGAACATGGTTAGCTAATTTAACTGCTTCTGCTACGGAGAATAAAAGTGTATGTTTACAGTCACCAGTAGTCTTTAATATATGTCTTTCAACAATGAGTTACCTTGAGTATTTATTATTGTTGTGGCAGCCTTGGCAATGGTGCGCCATAGAATCCGAAAAATCTCCAATATCTGTTAGACTGGGTCTCGTTCAGTTAAGTATGAGAATACGTCAGTTAAGACCTTCTTTATCTGTTGAACAATGGGATTTTGTTCTTTGTTTAACTTTGAGTTGGGTCTGTTCAGTTGTTCATTATTTTTGTGGCTCATCTAATCCTGGTGTCGAAAAAACTTTA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||