These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8435#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 512 fasta sequence [TTCTCTTTGNTTACGAGATGGCAATGGAGCAGTTGGTTTTT-CTGTTGTGTTACTCGAAGTTGTTGTGGTAGTGGTTGTTGTTGAACCTGTTGATGATTGACTAACCTGAGAAAATAGATT-AATAGGTTCCGGATGTAAT-CCAAGTGTTTTAGGATAAGTAATACTGTTGTTAAGAATATCAAGTGAATCAGAATATACAGGATGACATTGACTAGAATGAGAAGCATTGATAACATTTGATGTGGAAATTTCATCCAATGGAATAGGATGCGAAGAACACTCTTTAGATGTAGAAATTATGGAATATAAATTAGCAGGACTACTATTTTGAGACCCAGCATAGTACT-GAAGAATTGGTTGAATGTCTGCGTCAACAGAAGACTGAGATTTTTCTAAATCAGATTGATTTGTAATTTCATAAGATTTGGTCAAATAACCAGGTGTTACGGT-ACCGAATTGATCATTTCATGTTTGACCTTCAAAATACCTAATAAAGCGCCTTTGAGATAACC] [+] EMBL CD162188 [TTCTCTTTGNTTACGAGATGGNAATGGAGCAGTTGGTTTTT TTGTTGTGTTACTTGAAGTTGTTGTGGTAGTGGTTGTTGTTGAACCTGTTGATGATTGACTAACCTGAGAAAATAGATT AATAGGTTCCGGATGTAATNCCAAGTGTTTTAGGATAAGTAATACTGTTGTTAAGAATATCAAGTGAATCAGAATATACTTGATGACATTCCCCACCCTGAGAAGCATTGATAACATTTGATGTGGAAATTTCATCCAATGGAATAGGATGCGAAGAACACTCTTTAGATGTAGAAATTATGGAATATAAATTAGCAGGACTACTATTTTGAGACCCAGCATAGTACT GAAGAATTGGTTGAATGTCTGCGTCAACAGAAGACTGAGATTTTTCTAAATCAGATTGATTTGTAATTTCATAAGATTTGGCCAAATAACCAGGTGTTACGGT ACCGAATTGATCATTTTATGTTTGACCTTCAAAATACCTAATAAAGCGCCTTTGAGATAAC ] [+] EMBL CD162141 [ GGCAATGGAGCAGTTGGTTTTT CTGTTGCGTTACTCGAAGTTGTTGTGGTAGTGGTTGTTGTTGAACCTGTTGATGATTGACTAACCTGAGAAAATAGATT AATAGGTTCCGGATGTAAT CCAAGTGTTTTAGGATAAGTAATACTGTTGTTAAGAATATCAAGTGAATCAGAATATACAGGATGACATTGACTAGAATGAGAAGCATTGATAACATTTGATGTGGAAATTTCATCCAATGGAATAGGATGCGAAGAACACTCTTTAGATGTAGAAATTATGGAATATAAATTAGCAGGACTACTATTTTGAGACCCAGCATAGTACTCGAAGAATTGGTTGAATGTCTGCGTCAACAGAAGACTGAGATTTTTCTAAATCAGATTGATTTGTAATTTCATAAGATTTGGTCAAATAACCAGGTGTTACGGTAACCGAATTGATCATTTCATGTTTGACCTTCAAAATACCTAATAAAGCGCCTTTGAGATAAC ] [+] EMBL CD162183 [ GGCAATGGAGCAGTTGGTTTTT CTGTTGTGTTACTCGAAGTTGTTGTGGTAGTGGTTGTTGTTGAACCTGTTGATGATTGACTAACCTGATAAAATAGATT AATAGGTTCCGGATGTAAT CCAAGTGTTTTAGGATAACTAATACTGTTGTTAATAATATCAAGTGAATCATAATATACATGATGACATTGACTAGAATGAGAAGCATTGATAACATTTGATGTGGAAATTTCATCCAATGGAATATGATGCTAAGAACACTCTTTAGATGTAGAAATTATGGAATATAAATTACCAGGACTACTATTTTGAGACCCACCATAGTACT GAAGAATTGGTTGAATGTCTGCGTCAACAAAAGACTGACATTTTTCTAAATCAAATTGATTTGTAATTTTATAAGATTTGGTCAAATATCCATGTGTTACGGT ACCGAATCGATCATTACATGTTTGACCTTCTGAATACCTAATAAAGCGCCTTTGACATCAC ] [+] EMBL CD162262 [ GGCAATGGAGCAGTTGGTTTTT CTGTTGTGTTACTCGAAGTTGTTGTGGTAGTGGTTGTTGTTGAACCTGTTGATGATTGACTAACCTGAGAAAATAGATT AATAGGTTCCGGATGTAAT CCAAGTGTTTTAGGATAAGTAATACTGTTGTTAAGAATATCAAGTGAATCAGAATATACAGGATGACATTGACTAGAATGAGAAGCATTGATAACATTTGATGTGGAAATTTCATCCAATGGAATAGGATGCGAAGAACACTCTTTAGATGTAGAAATTATGGAATATAAATTAGCAGGACTACTATTTTGAGACCCAGCATAGTACT GAAGAATTGGTTGAATGTCTGCGTCAACAGAAGACTGAGATTTTTCTAAATCAGATTGATTTGTAATTTCATAAGATTTGGTCAAATAACCAGGTGTTACGGT ACCGAATTGATCATTTCATGTTTGACCTTCAAAATACCTAATANAGCGCCTTTGAGATAAC ] [-] EMBL CD162142 [ GCAATGAAGCAG TGGTTTTTCCTGTTGTGTTACTCAAAGTTG TGTGGTAATGGGTGTTGTTAAACCTGTTTATGATTGATTACCTTAAGAAAATA ATTAAATAGGTTCCGGATGTAAT CCAAGTGTTTAAGAATAAGTAATACTGTTGTTAGGAATATCAAGTGACTCAGAATATACAGGATGACATTGACTAGAATAAGAAGCATTGATAACATTTGATGTGAAAATTTCATCCAATGGAATAGGATGCGAAGAACACTCTTTAGATGTAGAAATTATGGAATATAAATTAGCAGGACTACTATTTTGAGACCCAGCATAGTACT GAAGAATTGGTTGAATGTCTGCGTCAACAGAAGACTGAGATTTTTCTAAATCAGATTGATTTGTAATTTCATAAGATTTGGTCAAATAACCAGGTGTTACGGT ACCGAATTGATCATTTCATGTTTGACCTTCAAAATACCTAATACAGCGCCTTTGAGATAACC] [+] EMBL CD140291 [ GTTGTTGTGGTAGTGGTTGTTGTTGAACCTGTTGATGATTGACTAACCTGAGAAAATAGATT AATAGGTTCCGGATGTAAT CCAAGTGTTTTAGGATAAGTAATACTGTTGTTAAGAATATCAAGTGAATCAGAATATACAGGATGACATTGACTAGAATGAGAAGCATTGATAACATTTGATGTGGAAATTTCATCCAATGGAATAGGATGCGAAGAACACTCTTTAGATGTAGAAATTATGGAATATAAATTAGCAGGACTACTATTTTGAGACCCAGCATAGTACT GAAGAATTGGTTGAATGTCTGCGTCAACAGAAGACTGAGATTTTTCTAAATCAGATTGATTTGTAATTTCATAAGATTTGGTCAAATAACCAGGTGTTACGGT ACCGAATTGATCA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||