These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8443#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1476 fasta sequence [TTACGATTATCTCCTAAATCATCAACTGTAACACTGAAATCTGATAAATTGTCAACTATTTCATTCTTCGCTTCTTCAATATGTTGAAGCCAGTTTTGAAATTCGTACATATCAGTTGTAAAGCATTTAGCTAATGGATACACCTCAGCAAATTTAATTTCTGTTTGATTTAATCGATTATCAAGTGTTATCATTTGTTTTGAAACACTAGACACAGCATCACTCAATTCATGATAAAATTTATCTGTTGTAAATGGTACGAAAGATTTGTTTGTTTTTATAGGCGATGATGATAATGATGATTTTATGGCACTATTCTGATTACCCGAACTTGTTGATAATGCAGATGATTGTATTATGTCATGAATTTGATCGCATAATTGAGTTAAATAAATTTGATGTTTTTTCCAGTTCCCTTGAAATTGTTCTATTCTTTCATGCAGTTTATCTAACATAACAGGCTGATATGGTAGAACAGCTAAATAAGGAAATTCAGTACCAAGCGAATGTATAGTTGGCATTTTTACCGATGATTCATTAATTGTAAAATGATTTTCATCAGAATAATTATCCCAATCTAATGATGGTGCAGCGGATATTTTTGGATCAAAACGTTTCAACGCTAAATCTAACCATTGC-ACCTTGATTTCTAATTTATGCATTAATTGTTTAGCTTTTTGACGATTACTACCAACAATTTTAGCTAAATCGGTAAGCTTTTCATTGAATTCATCATATCGTTTTAATTCATTATCTATTTGTTCTACATGTCCAAGTTTACCATCTGAATGATTAGGGAAATGTGTTGTTGTCAATGTCGAAGGATTAGTAAACAAATCAATAGGTTTACAAATTTGTTTTAATTGATTCCAAAAATTATGAACTTGTTGATATTGTGGTTCTAATCCATTGATCATTTCATATTCTAATTGATCTATCAATGACTTCTCTATTTGGGTTGAATAAACTTCTTTTGTATTGTTTTCTAGTAATCCATTAAGCCGGGATTCAACACTAAGCAAACGTGAACTGAGTGTATTCACAGAGGATGTTAAAGATTGAGCTACAGGCAAACTAGATTCTAAAATAAACAATTTTCGTTTTGTATCTGATTGCAGTTCTTCATAAATATCACTTAGATTTACTAAACGATTTTGTATAGAATCTTCATTTACAAAATATCTACCTGATTTACATAACTGTTCACCGCTTAATTTAATCTCATCAATAGTTGATTGATAATTTTCAATCTCTTCTGATAAACTTTTTAATTTTTTTAATTCTTCAGTTAAATCCATTAAAATTGTTGTATTACCTGGTGTTGTTTTAGTTACTTGTATTGGTTCATTTAAACACAATTGTTTTTGTTTTAACCAATTTAATATTTGATGAATTCGTTCATTACCTAATTTTTCACTTTCATTACATAAACGAAATTTATTCAAATTCAATTGTATCTCTTTACGTACACAATCA] [+] EMBL CD064492 [TTACGATTATCTCCTAAATCATCAACTGTAACACTGAAATCTGATAAATTGTCAACTATTTCATTCTTCGCTTCTTCAATATGTTGAAGCCAGTTTTGAAATTCGTACATATCAGTTGTAAAGCATTTAGCTAATGGATACACCTCAGCAAATTTAATTTCTGTTTGATTTAATCGATTATCAAGTGTTATCATTTGTTTTGAAACACTAGACACAGCATCACTCAATTCATGATAAAATTTATCTGTTGTAAATGGTACGAAAGATTTGTTTGTTTTTATAGGCGATGATGATAATGATGATTTTATGGCACTATTCTGATTACCCGAACTTGTTGATAATGCAGATGATTGTATTATGTCATGAATTTGATCGCATAATTGAGTTAAATAAATTTGATGTTTTTTCCAGTTCCCTTGAAATTGTTCTATTCTTTCATGCAGTTTATCTAACATAACAGGCTGATATGGTAGAACAGCTAAATAAGGAAATTCAGTACCAAGCGAATGTATAGTTGGCATTTTTACCGATGAT ] [+] EMBL CD133886 [ TTGAAATTGTTCTATTCTTTCATGTAGTTTATCTAACATAACAGGTTGATATGGTAGAACAGCTAAATAAGGAAATTCAGTACCAAGTGAATGTATAGTTGGCATTTTTACCGATGATTCATTAATTGTAAAATGATTTTCATCAGAATAATTATCCCAATCTAATGATGGTGCAGCGGATATTTTTGGATCAAAACGTTTCAACGCTAAATCTAACCATTGC ACCTTGATTTCTAATTTATGCATTAATTGTTTAGCTTTTTGACGATTACTACCAACAATTTTAGCTAAATCGGTAAGCTTTTCATTGAATTCATCATATCGTTTTAATTCATTATCTATTTGTTCTACATGTCCAAGTTTACCATCTGAATGATTAGGGAAATGTGTTGTTGTCAATGTCGAAGGATTAGTAAACAAGTCAATAGGTTTACAAATTTGTTTTAATTGATTCCAAAAATTATGAACTTGTTGATATTGTGGTTCTAATCCATTGATCATTTCATATTCTAATTGATCTATCAATGACTTCTCTATTTGGGTTGAATAAACTTCTTTTGTATTGGTTTCTAGTAATCCATTAAGCCGGGAT ] [-] EMBL CD201259 [ ATTTTTACCGATGATTCATTAATTGTAAAATGATTTTCATCAGAATAATTATCCCAATCTAATGATGGTGCAGCGGATATTTTTGGATCAAAACGTTTCAACGCTAAATCTAACCATTGC GCCTTGATTTCTAATTTATGCATTAATTGTTTAGCTTTTTGACGATTACTACCAACAATTTTAGCTAAATCGGTAAGCTTTTCATTGAATTCATCATATCGTTTTAATTCATTATCTATTTGTTCTACATGTCCAAGTTTACCATCTGAATGATTAGGGAAATGTGTTGTTGTCAATGTCGAAGGATTAGTAAACAAATCAATAGGTTTACAAATT ] [-] EMBL CD191736 [ ATNTAACCA TGCGCCCTTGATTTCTAATTTATGCATTAATGTTTTAGCTTTTTGACGATTACTACCTACAATTTTAGCTANATCGGTAAGCTTTTCATTGAACTCATCATATCGTTTTAATTCATTATCTATNTGTTCTACATGTCCAAGTTTACCATCTGAATGATTAGGGAAATGTGTTGTTGTCAATGTCGAAGGATTAGTAAACAAATCAATAGGTTTACAAATTTGTTTTAATTGATTCCAAAAATTATGAACTTGTTGATATTGCGGTTCTAATCCATTGATCATTTCATATTCTAATTGATCTATCAATGACTTCTCTATTTGGGTTGAATAAACTTCTTTTGTATTGTTTTCTAGTAATCCATTAAGCCGGGATTCAACACTAAGCAAACGTGAACTGAGTGTATTCACAGAGGATGTTAAAGATTGAGCTACAGGCAAACTAGATTCTAAAATAAACAATTTTCGTTTTGTATCTGATTGCAGTTCTTCATAAATATCACTTAGATTTACTAAACGATTTTGTATAGAATCTTCATTTACAAAATATCTACCTGATTTACATAACTGTTCACCGCTTAATTT ] [-] EMBL CD112905 [ TGACGATTACTACCAACAATTTTAGCTAAATCGGTAAGCTTTTCATTGAATTCATCATATCGTTTTAATTCATTATCTATTTGTTCTACATGTCCAAGTTTACCATCTGAATGATTAGGGAAATGTGTTGTTGTCAATGTCGAAGGATTAGTAAACAAATCAATAGGTTTACAAATTTGTTTTAATTGATTCCAAAAATTATGAACTTGTTGATATTGTGGTTCTAATCCATTGATCATTTCATATTCTAATTGATCTATCAATGACTTCTCTATTTGGGTTGAAT AACTTCTTTTGTATTGTTTTCTAGTAATCCATTAAGCCGGGATTCAACACAAAGCAAACGTGAACTGAGTGTATTCACAGAGGATGTTAAAGATTGAGCTACAGGCAAACTAGATTCTAAAATAAACAATTTTCGTTTTGTATCTGATTGCAGTTCTTCATAAATATCACTTAGATTTACTAAACGATTTTGTATAGAATCTTCATTTACAAAATATCTACCTGATTTACATAACTGTTCACCGCTTAATTTAATCTCATCAATAGTTGATTGATAATTTTCAAT ] [+] EMBL CD069288 [ TCTAATTGATCTATCAGTGACTTCTCTATTTGGGTTGAATAAACTTCTTTTGTATTGTTTTCTAGTAATCCATTAAGCCGGGATTCAACACTAAGCAAACGTGAACTGAGTGTATTCACAGAGGATGTTAAAGATTGAGCTACAGGCAAACTAGATTCTAAAATAAACAATTTTCGTTTTGTATCTGATTGCAGTTCTTCATAAATATCACTTAGATTTACTAAACGATTTTGTATAGAATCTTCATTTACAAAATATCTACCTGATTTACATAACTGTTCACCGCTTAATTTAATCTCATCAATAGTTGATTGATAATTTTCAATCTCTTCTGATAAACTTTTTAATTTTTTTAATTCTTCAGTTAAATCCATTAAAATTGTTGTATTACCTGGTGTTGTTTTAGTTACTTGTATTGGTTCATTTAAACACAATTGTTTTTGTTTTAACCAATTTAATATTTGATGAATTCGTTCATTACCTAATTTTTCACTTTCATTACATAAACGAAATTTATTCAAATTCAATTGTATCTCTTTACGTACACAATCA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||