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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8461#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 629 fasta sequence
[GTAACCCTTGTTAGTGGACGATACCACAGAAGCGTTCCCGCAAACAGCTGAGTTATGGATGATGAGTACGACGTTGTTGTTTTAGGGACAGGTTTAAAAGAATGTATACTTAGCAGCCTAATGTCTATGGAAGGGAAGAAAGTCCTCCATATTGACAAAAACAGTTACTACGGTGGTGATATCACATCCGTAAATATCGACTCCCTGTTCCAGCACTTCAACGTTGAAACAGACATTTCTAAATACCATCGTGCTAAGGACTGGAATGTTGATCTGATCTCGAAGTTTCTAATGGCGAATGGAAAATTGGTTCAAATCCTTGTTCATACT-GGTGTGACGCGATACTTAGAGTTTAGGAGTGTAG-AAGGAAGTTATGTTTATCACTCAGGTTCTGTCTACAAAGTACCATGTAACGAAAGTGAAGCACTTAGTACAAAACTAATGGACCTTTTCGAGAAGCGTCGTTTCAGAAAGTTGTTGGTCTGGATGTTGAATATTGATGTAGATAACCCGTCAACATGGAACTATATTTATCCTCCACCAATGGATATCAAAAAGGATACTATTTCTCACGCCTTCAATAGTTTTAATATCAATAAAGAAACCCAAAATTTTATAGGGCATGCAAT]
[+] EMBL CD077825 [GTAACCCTTGTTAGTGGACGATACCACAGAAGCGTTCCCGCAAACAGCTGAGTTATGGATGATGAGTACGACGTTGTTGTTTTAGGGACAGGTTTAAAAGAATGTATACTTAGCAGCCTAATGTCTATGGAAGGGAAGAAAGTCCTCCATATTGACAAAAACAGTTACTACGGTGGTGATATCACATCCGTAAATATCGACTCCCTGTTCCAGCACTTCAACGTTGAAACAGACATTTCTAAATACCATCGTGCTAAGGACTGGAATGTTGATCTGATCTCGAAGTTTCTAATGGCGAATGGAANATTGGNTC ]
[+] EMBL CD178663 [ TTCCCGCAAACAGCTGAGTTATGGATGATGAGTACGACGTTGTTGTTTTAGGGACAGGTTTAAAAGAATGTATACTTAGCAGCCTAATGTCTATGGAAGGGAAGAAAGTCCTCCATATTGACAAAAACAGTTACTACGGTGGTGATATCACATCCGTAAATATCGACTCCCTGTTCCAGCACTTCAACGTTGAAACAGACATTTCTAAATACCATCGTGCTAAGGACCGGAATGTTGATCTGATCTCGAAGTTTCTAATGGCGAATGGAAAATTGGTTCAAATCCTTGTTCATACT GGTGTGACGCGATACTTAGAGTTTAGGAGTGTAG AAGGAAGTTATGTTTATCACTCAGGTTCTGTCTACAAAGTACCATGTAACGAAAGTGAAGCACTTAGTACAAAACTAATGGACCTTTTCGAGAAGCGTCGTTTCAGAAAGTTGTTGGTCTGGATGTTGAATATTGATGTAGATAACCCGTCAACATGGAA ]
[+] EMBL CD181260 [ TCCCGCAAACAGCTGAGTTATGGATGATGAGTACGACGTTGTTGTTTTAGGGACAGGTTTAAAAGAATGTATACTTAGCAGCCTAATGTCTATGGAAGGGAAGAAAGTCCTCCATATTGACAAAAACAGTTACTACGGTGGTGATATCACATCCGTAAATATCGACTCCCTGTTCCAGCACTTCAACGTTGAAACAGACATTTCTAAATACCATCGTGCTAAGGACTGNAATGTTGATCTGATCTCGAAGTTTCTAATGGCGAATGGAAAA TNGTTCANATCCTTNGTCATACTGGGTGTG CGCGATACTTAGAGTTNANGAGTGTAGAAAGGAAGTT ]
[-] EMBL CD131159 [ TCCCGCAAACAGCTGAGTTATGGATGATGAGTACGACGTTGTTGTTTTAGGGACAGGTTTAAAAGAATGTATACTTAGCAGCCTAATGTCTATGGAAGGGAAGAAAGTCCTCCATATTGACAAAAACAGTTACTACGGTGGTGATATCACATCCGTAAATATCGACTCCCTGTTCCAGCACTTCAACGTTGAGACAGACATTTCTAGATACCATCGTGCTAAGGACTGGAATGTTGATCTGATCTCGAAGTTTCTAATGGCGAATGGAAAATTGGTTCAAATCCTTGTTCATACT GGTGTGACGCGATACTTAGAGTTTAGGAGTGTAG AAGGAAGTTA ]
[+] EMBL CD178821 [ CCTCCATATTGACAAAAACAGTTACTACGGTGGTGATATCACATCCGTAAATATCGACTCCCTGTTCCAGCACTTCAACGTTGAAACAGACATTTCTAAATACCATCGTGCTAAGGACTGGAATGTTGATCTGATCTCGAAGTTTCTAATGGCGAATGGAAAATTGGTTCAAATCCTTGTTCATACT GGTGTGACGCGATACTTAGAGTTTAGGAGTGTAG AAGGAAGTTATGTTTATCACTCAGGTTCTGTCTACAAAGTACCATGTAACGAAAGTGAAGCACTTAGTACAAAACTAATGGACCTTTTCGAGAAGCGTCGTTTCAGAAAGTTGTTGGTCTGGATGTTGAATATTGATGTAGATAACCCGTCAACATGGAA ]
[-] EMBL CD147965 [ TTCCAGCACTTCAACGGTGAAACAGACATTTCTAAATACCATCGTGCTAAGGACTGGAATGTTGATCTGATCTCGAAGTTTCTAATGGCGAATGGAAAATTGGTTCAATTCCTTGTTCATACT GGTGTGACGCGATACTTAGAGTTTAGGAGTGTAG AAGGAAGTTATGTTTATCACTCAGGTTCTGTCTACAAAGTACCATGTAACGAAAGTGAAGCACTTAGTACAAAACTAATGGACCTTTTCGAGAAGCGTCGTTTCAGAAAGTTGTTGGTCTGGATGTTGAATATTGATGTAGATAACCCGTCAACATGGAACTATATTTATCCTCCACCAATGGATATCAAAAAGGATACTATTTCTCACGCCTTCAATAGTTTTAATATCAATAAAGAAACCCAAAATTTTATAGGGCATGCAAT]
[-] EMBL CD190776 [ TTTCTAAATACCATCGTGCTAAGGACTGGAATGTTGATCTGATCTCGAAGTTTCTAATGGCGAATGGAAAATTGGTTCAAATCCTTGTTCATACT GGTGTGACGCGATACTTAGAGTTTAGGAGTGTAG AAGGAAGTTATGTTTATCACTCAGGTTCTGTCTACAAAGTACCATGTAACGAAAGTGAAGCACTTAGTACAAAACTAATGGACCTTTTCGAGAAGCGTCGTTTCAGAAAGTTGTTGGTCTGGATGTTGAATATTGATGTAGATAACCCGTCAACATGGAACTATATTTATCCTCCACCAATGGATATCAAAAAGGATACTATTTCTCACGCCTTCAATAGTTTTA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||