Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 848 cluster # 848       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_848#0 length = 1004 sequences # 2  

consensusID : consensus_848#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1004
fasta sequence
                              [CGAGNCCATNAATTCGGCACGCGGTTTATCATCATCATCATCATCATCATCATCTATATCAAATGATCTATTTATTATTGGAGCTGGTCAAATGAGAACTGGTACAACTAGTTTAAAATTTGCTCTACAATTATTATATAATCAATCATGTTATCATATGTATGATATAATCTATCATTATCAAGAATCTCATATTCAAAAATGGATAAATCTATTTAATATGAATAAGAAATTTATTAATATTGAAAAAATTCATTGGAATGATATTTTTAATGAGTGCAGATTTGCTGTTGATTATCCAACATGTGTATTTTATAAAGAATTAATGAAGATTTATCCAAATGCCAAGGTAATTTTAACAGTTCGTGATGCCGATTCATGGGTTTCAAGTTGTCGAGCAACAACTGCTTCCGATATGGTTATGACTAAACATACCACATTTACTGAGAATATTATTTACCGATTACGTGGACTTAAAAGTTTACCAATATTACATGATAACATGTACACTAAGGCGTTTGGTCCAAATTATGATCAAATGACAGATGATGAATTAAGAGATGCCTTTATTAAATGGAACCAAGAGATTATTGATTATGTTCCAAAAGATCGTTTATTAATATTTGATCCCAAAGATGGATGGACCCCGCTATGTGAATTTTTAAATATCCCTATTCCTGNAAATGTTCCCTTTCCTCATCTAAATAAACGAGTAGATTTAAGAAATAGATTACTAAAATATCGATTTTTAGCACAATTTTTAAATTTTTCATTAATGATTTCATTNTTATGGTTTGTTCATTATATCATTACATCTTAATCTATGGGCTACAGAGTGAAAACCATCTGTCTACTTATTTTTAATTAAGTAGCTTCGTAAAACGTAGTCATTTTTAAATTTACATATGTGAAAGTCGTAATTC-ATTTACCTA-TATTTTGTAAAC-AACTCAATGTTCAT-CAGTAAAAGACCTCTTTACCAC-TTCACCTAT-AATATATCTAACTTT]

[+] EMBL CD081613             [CGAGNCCATNAATTCGGCACGCGGTTTATCATCATCATCATCATCATCATCATCTATATCAAATGATCTATTTATTATTGGAGCTGGTCAAATGAGAACTGGTACAACTAGTTTAAAATTTGCTCTACAATTATTATATAATCAATCATGTTATCATATGTATGATATAATCTATCATTATCAAGAATCTCATATTCAAAAATGGATAAATCTATTTAATATGAATAAGAAATTTATTAATATTGAAAAAATTCATTGGAATGATATTTTTAATGAGTGCAGATTTGCTGTTGATTATCCAACATGTGTATTTTATAAAGAATTAATGAAGATTTATCCAAATGCCAAGGTAATTTTAACAGTTCGTGATGCCGATTCATGGGTTTCAAGTTGTCGAGCAACAACTGCTTCCGATATGGTTATGACTAAACATACCACATTTACTGAGAATATTATTTACCGATTACGTGGACTTAAAAGTTTACCAATATTACATGATAACATGTACACTAAGGCGTTTGGTCCAAATTATGATCAAATGACAGATGATGAATTAAGAGATGCCTTTATTAAATGGAACCAAGAGATTATTGATTATGTTCCAAAAGATCGTTTATTAATATTTGATCCCAAAGATGGATGGACCCCGCTATGTGAATTTTTAAATATCCCTATTCCTGNAAATGTTCCCTTTCCTCATCTAAATAAACGAGTAGATTTAAGAAATAGATTACTAAAATATCGATTTTTAGCACAATTTTTAAATTTTTCATTAATGATTTCATTNTTATGGTTTGTTCATTATATCATTACATCTTAATCTATGGGCTACAGAGTGAAAACCATCTGTCTACTTATTTTTAATTAAGTAGCTTCGTAAAACGTAGTCATTTTTAAATTTACATATGTGAAAGTCGTAATTC ATTTACCTA TATTTTGTAAAC AACTCAATGTTCAT CAGTAAAAGACCTCTTTACCAC TTCACCTAT AATATATCTAAC   ]
[-] EMBL CD075436             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTTTCAAGTTGTCGAGCAACAACTGCTTCCGATATGGTTATGACTAAACATACCACATTTACTGAGAATATTATTTACCGATTACGTGGACTTAAAAGTTTACCAATATTACATGATAACATGTACACTAAGGCGTTTGGTCCAAATTATGATCAAATGACAGATGATGAATTAAGAGATGCCTTTATTAAATGGAACCAAGAGATTATTGATTATGTTCCAAAAGATCGTTTATTAATATTTGATCCCAAAGATGGATGGACCCCGCTATGTGAATTTTTAAATATCCCTATTCCTGAAAATGTTCCCTTTCCTCATCTAAATAAACGAGTAGATTTAAGAAATAGATTACTAAAATATCGATTTTTAGCACAATTTTTAAATTTTTCATTAATGATTTCATTTTTATGGTTTGTTCATTATATCATTACATCTTAATCTATGGGCTACAGAGTGAAAACAATCTGTCTACTTATTTTTAATTAAGTAGCTTCGTAAAACGTAGTCATTTTTAAATTTACATATGTGAAAGTCGTAATTCAATTTACTTATTATTTTGTAAACAAACTCAATGTTCATCCAGTAAAAGACCTCTTTAACACTTTCACTAATAAATATATCTAACTTT]


>consensus_848#0 CGAGNCCATNAATTCGGCACGCGGTTTATCATCATCATCATCATCATCATCATCTATATC AAATGATCTATTTATTATTGGAGCTGGTCAAATGAGAACTGGTACAACTAGTTTAAAATT TGCTCTACAATTATTATATAATCAATCATGTTATCATATGTATGATATAATCTATCATTA TCAAGAATCTCATATTCAAAAATGGATAAATCTATTTAATATGAATAAGAAATTTATTAA TATTGAAAAAATTCATTGGAATGATATTTTTAATGAGTGCAGATTTGCTGTTGATTATCC AACATGTGTATTTTATAAAGAATTAATGAAGATTTATCCAAATGCCAAGGTAATTTTAAC AGTTCGTGATGCCGATTCATGGGTTTCAAGTTGTCGAGCAACAACTGCTTCCGATATGGT TATGACTAAACATACCACATTTACTGAGAATATTATTTACCGATTACGTGGACTTAAAAG TTTACCAATATTACATGATAACATGTACACTAAGGCGTTTGGTCCAAATTATGATCAAAT GACAGATGATGAATTAAGAGATGCCTTTATTAAATGGAACCAAGAGATTATTGATTATGT TCCAAAAGATCGTTTATTAATATTTGATCCCAAAGATGGATGGACCCCGCTATGTGAATT TTTAAATATCCCTATTCCTGNAAATGTTCCCTTTCCTCATCTAAATAAACGAGTAGATTT AAGAAATAGATTACTAAAATATCGATTTTTAGCACAATTTTTAAATTTTTCATTAATGAT TTCATTNTTATGGTTTGTTCATTATATCATTACATCTTAATCTATGGGCTACAGAGTGAA AACCATCTGTCTACTTATTTTTAATTAAGTAGCTTCGTAAAACGTAGTCATTTTTAAATT TACATATGTGAAAGTCGTAATTCATTTACCTATATTTTGTAAACAACTCAATGTTCATCA GTAAAAGACCTCTTTACCACTTCACCTATAATATATCTAACTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)