These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_848#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 1004 fasta sequence [CGAGNCCATNAATTCGGCACGCGGTTTATCATCATCATCATCATCATCATCATCTATATCAAATGATCTATTTATTATTGGAGCTGGTCAAATGAGAACTGGTACAACTAGTTTAAAATTTGCTCTACAATTATTATATAATCAATCATGTTATCATATGTATGATATAATCTATCATTATCAAGAATCTCATATTCAAAAATGGATAAATCTATTTAATATGAATAAGAAATTTATTAATATTGAAAAAATTCATTGGAATGATATTTTTAATGAGTGCAGATTTGCTGTTGATTATCCAACATGTGTATTTTATAAAGAATTAATGAAGATTTATCCAAATGCCAAGGTAATTTTAACAGTTCGTGATGCCGATTCATGGGTTTCAAGTTGTCGAGCAACAACTGCTTCCGATATGGTTATGACTAAACATACCACATTTACTGAGAATATTATTTACCGATTACGTGGACTTAAAAGTTTACCAATATTACATGATAACATGTACACTAAGGCGTTTGGTCCAAATTATGATCAAATGACAGATGATGAATTAAGAGATGCCTTTATTAAATGGAACCAAGAGATTATTGATTATGTTCCAAAAGATCGTTTATTAATATTTGATCCCAAAGATGGATGGACCCCGCTATGTGAATTTTTAAATATCCCTATTCCTGNAAATGTTCCCTTTCCTCATCTAAATAAACGAGTAGATTTAAGAAATAGATTACTAAAATATCGATTTTTAGCACAATTTTTAAATTTTTCATTAATGATTTCATTNTTATGGTTTGTTCATTATATCATTACATCTTAATCTATGGGCTACAGAGTGAAAACCATCTGTCTACTTATTTTTAATTAAGTAGCTTCGTAAAACGTAGTCATTTTTAAATTTACATATGTGAAAGTCGTAATTC-ATTTACCTA-TATTTTGTAAAC-AACTCAATGTTCAT-CAGTAAAAGACCTCTTTACCAC-TTCACCTAT-AATATATCTAACTTT] [+] EMBL CD081613 [CGAGNCCATNAATTCGGCACGCGGTTTATCATCATCATCATCATCATCATCATCTATATCAAATGATCTATTTATTATTGGAGCTGGTCAAATGAGAACTGGTACAACTAGTTTAAAATTTGCTCTACAATTATTATATAATCAATCATGTTATCATATGTATGATATAATCTATCATTATCAAGAATCTCATATTCAAAAATGGATAAATCTATTTAATATGAATAAGAAATTTATTAATATTGAAAAAATTCATTGGAATGATATTTTTAATGAGTGCAGATTTGCTGTTGATTATCCAACATGTGTATTTTATAAAGAATTAATGAAGATTTATCCAAATGCCAAGGTAATTTTAACAGTTCGTGATGCCGATTCATGGGTTTCAAGTTGTCGAGCAACAACTGCTTCCGATATGGTTATGACTAAACATACCACATTTACTGAGAATATTATTTACCGATTACGTGGACTTAAAAGTTTACCAATATTACATGATAACATGTACACTAAGGCGTTTGGTCCAAATTATGATCAAATGACAGATGATGAATTAAGAGATGCCTTTATTAAATGGAACCAAGAGATTATTGATTATGTTCCAAAAGATCGTTTATTAATATTTGATCCCAAAGATGGATGGACCCCGCTATGTGAATTTTTAAATATCCCTATTCCTGNAAATGTTCCCTTTCCTCATCTAAATAAACGAGTAGATTTAAGAAATAGATTACTAAAATATCGATTTTTAGCACAATTTTTAAATTTTTCATTAATGATTTCATTNTTATGGTTTGTTCATTATATCATTACATCTTAATCTATGGGCTACAGAGTGAAAACCATCTGTCTACTTATTTTTAATTAAGTAGCTTCGTAAAACGTAGTCATTTTTAAATTTACATATGTGAAAGTCGTAATTC ATTTACCTA TATTTTGTAAAC AACTCAATGTTCAT CAGTAAAAGACCTCTTTACCAC TTCACCTAT AATATATCTAAC ] [-] EMBL CD075436 [ GGTTTCAAGTTGTCGAGCAACAACTGCTTCCGATATGGTTATGACTAAACATACCACATTTACTGAGAATATTATTTACCGATTACGTGGACTTAAAAGTTTACCAATATTACATGATAACATGTACACTAAGGCGTTTGGTCCAAATTATGATCAAATGACAGATGATGAATTAAGAGATGCCTTTATTAAATGGAACCAAGAGATTATTGATTATGTTCCAAAAGATCGTTTATTAATATTTGATCCCAAAGATGGATGGACCCCGCTATGTGAATTTTTAAATATCCCTATTCCTGAAAATGTTCCCTTTCCTCATCTAAATAAACGAGTAGATTTAAGAAATAGATTACTAAAATATCGATTTTTAGCACAATTTTTAAATTTTTCATTAATGATTTCATTTTTATGGTTTGTTCATTATATCATTACATCTTAATCTATGGGCTACAGAGTGAAAACAATCTGTCTACTTATTTTTAATTAAGTAGCTTCGTAAAACGTAGTCATTTTTAAATTTACATATGTGAAAGTCGTAATTCAATTTACTTATTATTTTGTAAACAAACTCAATGTTCATCCAGTAAAAGACCTCTTTAACACTTTCACTAATAAATATATCTAACTTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||