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Schistosoma mansoni
cluster # 8481 cluster # 8481       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8481#0 length = 974 sequences # 7  

consensusID : consensus_8481#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 974
fasta sequence
                              [AATCGTCTATCAT-TCGTTCAAATCCTGTTGTTACTTAGATTGCCCCCTATTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTACATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCATACATGAAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGATGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAAAAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGTAGAT-AAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTTCTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAAGGTACGTTGCCTAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTAAACTATAGATACTTGGATATCTAACAATGATCAGGTGACAGTAAATGTGAGGTTAAATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATAAGTAAATCAGCCGAAACCTTTAGTAGGTGACAATATTTTTAGTTAAAATATGGCATAAAAATATGTGCGTAATGGAATCTTAAGTCTTTTTAGATATCTACGAAGCCAAGAACTTGAATTTAAGACACAGTTTCCTGTAATTTAATATGATGGGAATTTTTTAGCGATTAAATTGATTTTAGCTAATCAAAATTAATGGGGAAATATTGCTACTCAGACATTCGGAATTGATAATCGTAAGTGATCAGGTGTCCAGTTATTAAGAAATATCTTAGAGTCAATAACACGATTATCGCCACAAAAATCAATTTGTCTGTATCTACCTTACTGCTTGTTATATTGTAATCTTGAGTTATTCCTTGATAGAATTCATGGTACGTAGTTTCAAAATTTGAATTCGGCATTGAATTACATTG-CATCTCAGAGTACAACATCGCC]

[+] EMBL CD113837             [AATCGTCTATCATGTC TTCAAATCCTGTTGTTACTTAGATTGCCCCCTATTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTACATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCATACATGAAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGATGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAAAAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGTAGAT AAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTTCTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAACGTACGTTGCCTAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTncac                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD113894             [     gCTATCAG TCGTTCAAATCCTG TGTTACTTAGA TGCCCCCTATTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTACATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCATACATGAAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGATGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAAAAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGTAGAT AAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTTCTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAAGGTACGTTGCCTAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTAAACTATAGATACTTGGATATCTAACAATGATCAGGTGACAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD113890             [       TATCAT TCGTTCAAATCCTGTTGTTACTTAGATTG TCCCTATTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTACATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCATACATGAAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGATGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAATAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGTAGAT AAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTTCTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAAGGTACGTTGCCTAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTAAACTATAGATACTTGGATATCTAACAATGATCAAGTGACAGTAAATGTGAGGTTACATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD113720             [        tcCAT GTGTTGAAATCCTGTTG TACTTAGATTGCTCCCTATTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTACATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCATACATGGAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGATGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAAAAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGTAGATAAAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTTCTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAAGGTACGTTGCCTAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTAAACTATAGATACTTGGATATCTAACAATGATCAGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD113792             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATAGATACTGGGATATCTAACAATGATCAGGTGACAGTAAATGTGAGGTTAAATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATAAGTAAATCAGCCGAAACCTTTAGTAGGTGACAATATTTTTAGTTAAAATATGGCATAAAAATATGTGCGTAATGGAATCTTAAGTCTTTTTAGATATCTACGAAGCCAAGAACTTGTATTTAAGACACAGTTTCCTGTAATTTAATATGATGGGAATTTTTTAGCGATTAAATTGATTTTAGCTAATCAAAATTAATGGGGAAATATTGCTACTCAGACATTCGGAATTGATAATCGTAAGTGATCAGGTGTCCAGTTATTAAGAAATATCTTAGAGTCAATAACACGATTATCGCCACAAAAATCAATTTGTCTGTATCTACCTTACTGCTTGTTATATTGTAATCTTGAGTTATTCCTTGATAGAATTCATGGTACGTAGTTTCAAAATTTGAATTCGGCATTGAATTACATTG CATCTCAGAGTACAACATCGCC]
[-] EMBL CD113784             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGGTGACAGTAAATGTGAGGTTAAATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATAAGTAAATCAGCCGAAACCTTTAGTAGGTGACAATATTTTTAGTTAAAATATGGCATAAAAATATGTGCGTAATGGAATCTTAAGTCTTTTTAGATATCTACGAAGCCAAGAACTTGAATTTAATACACAGTTTCCTGTAATTTAATATGATGGGAATTTTTTAGCGATTAAATTGATTTTAGCTAATCAAAATTAATGGGGAAATATTGCTACTCAGACATTCGGAATTGATAATCGTAAGTGATCAGGTGTACAGTTATTAAGAAATATCTTAGA                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD113702             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GACAGTAAATGTGAGTTTAAATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATAAGTAAATCAGCCGAAACCTTTAGTAGGTGACAATATTTTTAGTTAAAATATGGCATAAAAATATGTGCGTAATGGAATCTTAAGTCTTTTTAGATATCTACGAAGCCAAGAACTTGAATTTAAAACACAGTTTCCTGTAATTTAATATGATGGGAATTTTTTAGCGATTAAATTGATTTTAGCTAATCAAAATTAATGGGGAAATATTGCTACTCAGACATTCGGAATTGATAATCGTAAGTGATCAGGTGTCCAGTTATTAAGAAATATCTTAGAGTCAATAACACGATTATCGCCACAAAAATCAATTTGTCTGTATCTACCTTACTGCTTGTTATATTGTAATCTTGAGTTATTCCTTGATAGAATTCATGGTACGTAGTTTCAAAATTTGAATTCGGCATTGAATTACATTGCCATCCTAGAGTACcaa      ]


>consensus_8481#0 AATCGTCTATCATTCGTTCAAATCCTGTTGTTACTTAGATTGCCCCCTATTTTCCTTCTT CTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTA CATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCA TACATGAAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGA TGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAAAAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGT AGATAAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTT CTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAAGGTACGTTGCC TAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTAAACTATAGATACTTGGATATCTAACAATG ATCAGGTGACAGTAAATGTGAGGTTAAATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATAAGTA AATCAGCCGAAACCTTTAGTAGGTGACAATATTTTTAGTTAAAATATGGCATAAAAATAT GTGCGTAATGGAATCTTAAGTCTTTTTAGATATCTACGAAGCCAAGAACTTGAATTTAAG ACACAGTTTCCTGTAATTTAATATGATGGGAATTTTTTAGCGATTAAATTGATTTTAGCT AATCAAAATTAATGGGGAAATATTGCTACTCAGACATTCGGAATTGATAATCGTAAGTGA TCAGGTGTCCAGTTATTAAGAAATATCTTAGAGTCAATAACACGATTATCGCCACAAAAA TCAATTTGTCTGTATCTACCTTACTGCTTGTTATATTGTAATCTTGAGTTATTCCTTGAT AGAATTCATGGTACGTAGTTTCAAAATTTGAATTCGGCATTGAATTACATTGCATCTCAG AGTACAACATCGCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)