These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8481#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 974 fasta sequence [AATCGTCTATCAT-TCGTTCAAATCCTGTTGTTACTTAGATTGCCCCCTATTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTACATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCATACATGAAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGATGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAAAAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGTAGAT-AAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTTCTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAAGGTACGTTGCCTAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTAAACTATAGATACTTGGATATCTAACAATGATCAGGTGACAGTAAATGTGAGGTTAAATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATAAGTAAATCAGCCGAAACCTTTAGTAGGTGACAATATTTTTAGTTAAAATATGGCATAAAAATATGTGCGTAATGGAATCTTAAGTCTTTTTAGATATCTACGAAGCCAAGAACTTGAATTTAAGACACAGTTTCCTGTAATTTAATATGATGGGAATTTTTTAGCGATTAAATTGATTTTAGCTAATCAAAATTAATGGGGAAATATTGCTACTCAGACATTCGGAATTGATAATCGTAAGTGATCAGGTGTCCAGTTATTAAGAAATATCTTAGAGTCAATAACACGATTATCGCCACAAAAATCAATTTGTCTGTATCTACCTTACTGCTTGTTATATTGTAATCTTGAGTTATTCCTTGATAGAATTCATGGTACGTAGTTTCAAAATTTGAATTCGGCATTGAATTACATTG-CATCTCAGAGTACAACATCGCC] [+] EMBL CD113837 [AATCGTCTATCATGTC TTCAAATCCTGTTGTTACTTAGATTGCCCCCTATTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTACATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCATACATGAAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGATGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAAAAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGTAGAT AAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTTCTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAACGTACGTTGCCTAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTncac ] [+] EMBL CD113894 [ gCTATCAG TCGTTCAAATCCTG TGTTACTTAGA TGCCCCCTATTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTACATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCATACATGAAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGATGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAAAAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGTAGAT AAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTTCTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAAGGTACGTTGCCTAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTAAACTATAGATACTTGGATATCTAACAATGATCAGGTGACAGTA ] [+] EMBL CD113890 [ TATCAT TCGTTCAAATCCTGTTGTTACTTAGATTG TCCCTATTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTACATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCATACATGAAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGATGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAATAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGTAGAT AAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTTCTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAAGGTACGTTGCCTAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTAAACTATAGATACTTGGATATCTAACAATGATCAAGTGACAGTAAATGTGAGGTTACATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATA ] [+] EMBL CD113720 [ tcCAT GTGTTGAAATCCTGTTG TACTTAGATTGCTCCCTATTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTACATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCATACATGGAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGATGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAAAAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGTAGATAAAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTTCTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAAGGTACGTTGCCTAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTAAACTATAGATACTTGGATATCTAACAATGATCAGGT ] [-] EMBL CD113792 [ ATAGATACTGGGATATCTAACAATGATCAGGTGACAGTAAATGTGAGGTTAAATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATAAGTAAATCAGCCGAAACCTTTAGTAGGTGACAATATTTTTAGTTAAAATATGGCATAAAAATATGTGCGTAATGGAATCTTAAGTCTTTTTAGATATCTACGAAGCCAAGAACTTGTATTTAAGACACAGTTTCCTGTAATTTAATATGATGGGAATTTTTTAGCGATTAAATTGATTTTAGCTAATCAAAATTAATGGGGAAATATTGCTACTCAGACATTCGGAATTGATAATCGTAAGTGATCAGGTGTCCAGTTATTAAGAAATATCTTAGAGTCAATAACACGATTATCGCCACAAAAATCAATTTGTCTGTATCTACCTTACTGCTTGTTATATTGTAATCTTGAGTTATTCCTTGATAGAATTCATGGTACGTAGTTTCAAAATTTGAATTCGGCATTGAATTACATTG CATCTCAGAGTACAACATCGCC] [-] EMBL CD113784 [ AGGTGACAGTAAATGTGAGGTTAAATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATAAGTAAATCAGCCGAAACCTTTAGTAGGTGACAATATTTTTAGTTAAAATATGGCATAAAAATATGTGCGTAATGGAATCTTAAGTCTTTTTAGATATCTACGAAGCCAAGAACTTGAATTTAATACACAGTTTCCTGTAATTTAATATGATGGGAATTTTTTAGCGATTAAATTGATTTTAGCTAATCAAAATTAATGGGGAAATATTGCTACTCAGACATTCGGAATTGATAATCGTAAGTGATCAGGTGTACAGTTATTAAGAAATATCTTAGA ] [-] EMBL CD113702 [ GACAGTAAATGTGAGTTTAAATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATAAGTAAATCAGCCGAAACCTTTAGTAGGTGACAATATTTTTAGTTAAAATATGGCATAAAAATATGTGCGTAATGGAATCTTAAGTCTTTTTAGATATCTACGAAGCCAAGAACTTGAATTTAAAACACAGTTTCCTGTAATTTAATATGATGGGAATTTTTTAGCGATTAAATTGATTTTAGCTAATCAAAATTAATGGGGAAATATTGCTACTCAGACATTCGGAATTGATAATCGTAAGTGATCAGGTGTCCAGTTATTAAGAAATATCTTAGAGTCAATAACACGATTATCGCCACAAAAATCAATTTGTCTGTATCTACCTTACTGCTTGTTATATTGTAATCTTGAGTTATTCCTTGATAGAATTCATGGTACGTAGTTTCAAAATTTGAATTCGGCATTGAATTACATTGCCATCCTAGAGTACcaa ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||