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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8481#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 974 fasta sequence
[AATCGTCTATCAT-TCGTTCAAATCCTGTTGTTACTTAGATTGCCCCCTATTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTACATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCATACATGAAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGATGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAAAAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGTAGAT-AAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTTCTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAAGGTACGTTGCCTAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTAAACTATAGATACTTGGATATCTAACAATGATCAGGTGACAGTAAATGTGAGGTTAAATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATAAGTAAATCAGCCGAAACCTTTAGTAGGTGACAATATTTTTAGTTAAAATATGGCATAAAAATATGTGCGTAATGGAATCTTAAGTCTTTTTAGATATCTACGAAGCCAAGAACTTGAATTTAAGACACAGTTTCCTGTAATTTAATATGATGGGAATTTTTTAGCGATTAAATTGATTTTAGCTAATCAAAATTAATGGGGAAATATTGCTACTCAGACATTCGGAATTGATAATCGTAAGTGATCAGGTGTCCAGTTATTAAGAAATATCTTAGAGTCAATAACACGATTATCGCCACAAAAATCAATTTGTCTGTATCTACCTTACTGCTTGTTATATTGTAATCTTGAGTTATTCCTTGATAGAATTCATGGTACGTAGTTTCAAAATTTGAATTCGGCATTGAATTACATTG-CATCTCAGAGTACAACATCGCC]
[+] EMBL CD113837 [AATCGTCTATCATGTC TTCAAATCCTGTTGTTACTTAGATTGCCCCCTATTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTACATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCATACATGAAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGATGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAAAAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGTAGAT AAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTTCTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAACGTACGTTGCCTAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTncac ]
[+] EMBL CD113894 [ gCTATCAG TCGTTCAAATCCTG TGTTACTTAGA TGCCCCCTATTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTACATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCATACATGAAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGATGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAAAAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGTAGAT AAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTTCTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAAGGTACGTTGCCTAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTAAACTATAGATACTTGGATATCTAACAATGATCAGGTGACAGTA ]
[+] EMBL CD113890 [ TATCAT TCGTTCAAATCCTGTTGTTACTTAGATTG TCCCTATTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTACATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCATACATGAAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGATGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAATAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGTAGAT AAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTTCTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAAGGTACGTTGCCTAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTAAACTATAGATACTTGGATATCTAACAATGATCAAGTGACAGTAAATGTGAGGTTACATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATA ]
[+] EMBL CD113720 [ tcCAT GTGTTGAAATCCTGTTG TACTTAGATTGCTCCCTATTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTATTTCAATCTTTTACTGGTAAGCATTCCACTCCCCATTCCTGCTACATACTACTTATATCTGTCCACATAAGTAGCAAGCATTACACAAGTACATATTGCACGCATACATGGAATATAAAGATCTAACCAACCTATCTATCTTATAGTATACAGATAAACATAGATGGGTTCGTGTATTTGGAACGAGTGGAAAAACAGTTATTCCAAAACTACGTTAGAGTAGTAGATAAAAACTAATCTCCATCGACCGCTCATATTCATTTAAAGGACACAGTTTCCTTATTTCTCGAGCACCACGCCAAAGAATGGGTCGGATTTTTCTCGGGTAAGTCAAGGTACGTTGCCTAATGTAGTTAGTAATACTCCATAAAATGTAAACTATAGATACTTGGATATCTAACAATGATCAGGT ]
[-] EMBL CD113792 [ ATAGATACTGGGATATCTAACAATGATCAGGTGACAGTAAATGTGAGGTTAAATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATAAGTAAATCAGCCGAAACCTTTAGTAGGTGACAATATTTTTAGTTAAAATATGGCATAAAAATATGTGCGTAATGGAATCTTAAGTCTTTTTAGATATCTACGAAGCCAAGAACTTGTATTTAAGACACAGTTTCCTGTAATTTAATATGATGGGAATTTTTTAGCGATTAAATTGATTTTAGCTAATCAAAATTAATGGGGAAATATTGCTACTCAGACATTCGGAATTGATAATCGTAAGTGATCAGGTGTCCAGTTATTAAGAAATATCTTAGAGTCAATAACACGATTATCGCCACAAAAATCAATTTGTCTGTATCTACCTTACTGCTTGTTATATTGTAATCTTGAGTTATTCCTTGATAGAATTCATGGTACGTAGTTTCAAAATTTGAATTCGGCATTGAATTACATTG CATCTCAGAGTACAACATCGCC]
[-] EMBL CD113784 [ AGGTGACAGTAAATGTGAGGTTAAATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATAAGTAAATCAGCCGAAACCTTTAGTAGGTGACAATATTTTTAGTTAAAATATGGCATAAAAATATGTGCGTAATGGAATCTTAAGTCTTTTTAGATATCTACGAAGCCAAGAACTTGAATTTAATACACAGTTTCCTGTAATTTAATATGATGGGAATTTTTTAGCGATTAAATTGATTTTAGCTAATCAAAATTAATGGGGAAATATTGCTACTCAGACATTCGGAATTGATAATCGTAAGTGATCAGGTGTACAGTTATTAAGAAATATCTTAGA ]
[-] EMBL CD113702 [ GACAGTAAATGTGAGTTTAAATTCGTGGTGATCGAATGTAATTCTAATAAGTAAATCAGCCGAAACCTTTAGTAGGTGACAATATTTTTAGTTAAAATATGGCATAAAAATATGTGCGTAATGGAATCTTAAGTCTTTTTAGATATCTACGAAGCCAAGAACTTGAATTTAAAACACAGTTTCCTGTAATTTAATATGATGGGAATTTTTTAGCGATTAAATTGATTTTAGCTAATCAAAATTAATGGGGAAATATTGCTACTCAGACATTCGGAATTGATAATCGTAAGTGATCAGGTGTCCAGTTATTAAGAAATATCTTAGAGTCAATAACACGATTATCGCCACAAAAATCAATTTGTCTGTATCTACCTTACTGCTTGTTATATTGTAATCTTGAGTTATTCCTTGATAGAATTCATGGTACGTAGTTTCAAAATTTGAATTCGGCATTGAATTACATTGCCATCCTAGAGTACcaa ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||