Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8482 cluster # 8482       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8482#0 length = 744 sequences # 7  
consensusID : consensus_8482#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 744
fasta sequence 
                              [AAACCACTTCAAATACTACAAATCAAAATAGTCCTAGAAAGTTAACTAATGAAAAACCTTCCAGTCTATATTATTGGCCACATAGACCATGGATAAATGATCATAGAATTATTGATAATGTAGTATTAAGATCATGGGATTCAATAAGTCAAATTTATTTACAATTATGGCCACCTCATGATAAAGTTATTACAACATGCCCAAATCTAGTCAAGTTAACATTGTTATCTAATACACGTTTATCAGATAAAGCTATTTTTATAGAATCAGTAATAAGAGGTAAACATCAGAAAATTGTAATA-CCAGCGGATAGTATAGACAATGATAATGACTATTGTATTGATCGAGATGATGAATTAGGTCATTATAAATGTTTAAATTGGAATTCAACAGAGATTGAATGTTTACCTGGTTGGAATGGTGAGAATTGTTTAATTCCTGTTTGTTCTTTAGAATGTAGT-AAAAAAGGTGGATTTTGTTCAAAACCTAATCAATGTCAATGTAAAACAGGTTGGACAGGAATAACATGTGATCAATGTGTTAAACGTGAAAATTGTTTACATGGTAAATGTTTACTTGGTAATGATTGTATATGTGAACCTGGATGGGCTGGATATTTATGTGATAGTAAAAAAGTGATTTATGAAAAAATTGAAGATGATTCTGAAACAAATAGTACAGATAGTGTGACCGAAGAAATCAATAATGAAGATTCAGAGAAACATTCCACAATGAACTCGCCAT]

[+] EMBL CD124028             [AAACCACTTCAAATACTACAAATCAAAATAGTCCTAGAAAGTTAACTAATGAAAAACCTTCCAGTCTATATTATTGGCCACATAGACCATGGATAAATGATCATAGAATTATTGATAATGTAGTATTAAGATCATGGGATTCAATAAGTCAAATTTATTTACAATTATGGCCACCTCATGATAAAGTTATTACAACATGCCCAAATCTAGTCAAGTTAACATTGTTATCTAATACACGTTTATCAGATAAAGCTATTTTTATAGAATCAGTAATAAGAGGTAAACATCAGAAAATTGTAATA CCAGCGGATAGTATAGACAATGATAATGACTATTGTATTGATCGAGATGATGAATTAGGTCATTATAAATGTTTAAATTGGAATTCAACAGAGATTGAATGTTTACCTGGTTGGAATGGTGAGAATTGTTTAATTCCTGTTTGTTCTTTAGAATGTAGT AAAAAAGGTGGATTTTGTTCAAAACCTAATCAATGTCAATGTAAAACAGGTTGGACAGGAATAACATGTGATCAGTGTGTTAAACGTGAAAATTGTTTACATGGTAAATGTTTACTTGGTAATGATTGTAT                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD119708             [                                                                                                                        gccttcaatGATCATGGGATTCAATAAGTCAAATTTATTTACAATTATGGCCACCTCATGATAAAGTTATTACAACATGCCCAAATCTAGTCAAGTTAACATTGTTATCTAATACACGTTTATCAGATAAAGCTATTTTTATAGAATCAGTAATAAGAGGTAAACATCAGAAAATTGTAATA CCAGCGGATAGTATAGACAATGATAATGACTATTGTATTGATCGAGATGATGAATTAGGTCATTATAAACGTTTAAATTGGAATTCAACAGAGATTGAATGTTTACCTGGTTGGAATGGTGAGAATTGTTTAATTCCTGTTTGTTCTTTAGAATGTAGT AAAAAAGGTGGATTTTGTTCAAAACCTAATCAATGTCAATGTAAAACAGGTTGGACAGGAATAACATGTGATCAATGTGTTAAACGTGAAAATTGTTTACATGGAAAATGTTTACTTGGTAAT                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD119648             [                                                                                                                                  ATCATGGGATTCAATAAATCAGATTTATTTACAATTATGGCCACCTCATGATAAAGTTATTACAACATGCCCAAATCTAGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD179580             [                                                                                                                                                                                                                              TGTTATCTAATACACGTTTATCAGATAAAGCTATTTTTATAGAATCAGTAATAAGAGGTAAACATCAGAAAATTGTAATAGCCAGCGGATAGTATAGACAATGATAATGACTATTGTATTGATCGAGATGATGAATTAGGTCATTATAAATGTTTAAATTGGAATTCAACAGAGATTGAATGTTTACCTGGTTGGAATGGTGAGAATTGTTTAATTCCTGTTTGTTCTTCAGAATGTAGT AAAAAAGGTGGATTTTGTTCAAAACCTAATCAATGTCAATGTAAAACAGGTTGGACAGGAATAACATGTGATCAATGTGTTAAACGTGAAAATTGTTTACATGGTAAATGTTTACTTGGTAATGATTGTATATGTGAACCTGGATGGGCTGGATATTTATGTGATAGTAAAAAAGTGATTTATGAAAAAATTGAAGATGATTCTGAAACAAATAGTACAGATAGTGTGACCGAAGAAATCAATAATGAAGATTCAGAGAAACATTCCACAATGAACTCGCCAT]
[-] EMBL CD146728             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GACAATGATAATGACTATTGTATTGATCGAGATGATGAATTAGGTCATTATAAATGTTTAAATTGGAATTCAACAGAGATTGAATGTTTACCTGGTTGGAATGGTGAGAATTGTTTAATTCCTGTTTGTTCTTTAGAATGTAGTAAAAAAAGATGGATTTTGTTCAAAACCTAATCAATGTCAATGTAAAACAGGTTGGACAGGAATAACATGTGATCAATGTGTTAAACGTGAAAATTGTTTACATGGTAAATGTTTACTTGGTAATGATTGTATATGTGAA                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD096509             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACTATTGTATTGATCGAGATGATGAATTAGGTCATTATAAATGTTTAAATTGGAATTCAACAGAGATTGAATGTTTACCTGGTTGGAATGGTGAGAATTGTTTAATTCCTGTTTGTTCTTTAGAATGTAGT AAAAAAGGTGGATTTTGTTCAAAACCTAATCAATGTCAATGTAAAACAGGTTGGACAGGAATAACATGTGATCAATGTGTTAAACGTGAAAATTGTTTACATGGTAAATGTTTACTTGGTAATGATTGTATATGTGAACCTGGATGGGCTGGATATTTATGTGATAGTAAAAAAGTGATTTATGAAAAAATTGAAGATGATTCTGAAACAAATA                                                                     ]
[-] EMBL CD096581             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTATTGTATTGATCGAGATGATGAATTAGGTCATTATAAGTGTTTAAATTGGAATTCAACAGAGATTGAATGTTTACCTGGTTGGAATGGTGAGAATTGTTTAATTCCTGTTTGTTCTTTAGAATGTAGT AAAAAAGGTGGATTTTGTTCAAAACCTAATCAATGTCAATGTAAAACAGGTTGGACAGGAATAACATGTGATCAATGTGTTAAACGTGAAAATTGTTTACATGGTAAATGTTTACTTGGTAATGATTGTATATGTGAACCTGGATGGGCTGGATATTTATGTGA                                                                                                                       ]




>consensus_8482#0
AAACCACTTCAAATACTACAAATCAAAATAGTCCTAGAAAGTTAACTAATGAAAAACCTT
CCAGTCTATATTATTGGCCACATAGACCATGGATAAATGATCATAGAATTATTGATAATG
TAGTATTAAGATCATGGGATTCAATAAGTCAAATTTATTTACAATTATGGCCACCTCATG
ATAAAGTTATTACAACATGCCCAAATCTAGTCAAGTTAACATTGTTATCTAATACACGTT
TATCAGATAAAGCTATTTTTATAGAATCAGTAATAAGAGGTAAACATCAGAAAATTGTAA
TACCAGCGGATAGTATAGACAATGATAATGACTATTGTATTGATCGAGATGATGAATTAG
GTCATTATAAATGTTTAAATTGGAATTCAACAGAGATTGAATGTTTACCTGGTTGGAATG
GTGAGAATTGTTTAATTCCTGTTTGTTCTTTAGAATGTAGTAAAAAAGGTGGATTTTGTT
CAAAACCTAATCAATGTCAATGTAAAACAGGTTGGACAGGAATAACATGTGATCAATGTG
TTAAACGTGAAAATTGTTTACATGGTAAATGTTTACTTGGTAATGATTGTATATGTGAAC
CTGGATGGGCTGGATATTTATGTGATAGTAAAAAAGTGATTTATGAAAAAATTGAAGATG
ATTCTGAAACAAATAGTACAGATAGTGTGACCGAAGAAATCAATAATGAAGATTCAGAGA
AACATTCCACAATGAACTCGCCAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)