These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8482#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 744 fasta sequence [AAACCACTTCAAATACTACAAATCAAAATAGTCCTAGAAAGTTAACTAATGAAAAACCTTCCAGTCTATATTATTGGCCACATAGACCATGGATAAATGATCATAGAATTATTGATAATGTAGTATTAAGATCATGGGATTCAATAAGTCAAATTTATTTACAATTATGGCCACCTCATGATAAAGTTATTACAACATGCCCAAATCTAGTCAAGTTAACATTGTTATCTAATACACGTTTATCAGATAAAGCTATTTTTATAGAATCAGTAATAAGAGGTAAACATCAGAAAATTGTAATA-CCAGCGGATAGTATAGACAATGATAATGACTATTGTATTGATCGAGATGATGAATTAGGTCATTATAAATGTTTAAATTGGAATTCAACAGAGATTGAATGTTTACCTGGTTGGAATGGTGAGAATTGTTTAATTCCTGTTTGTTCTTTAGAATGTAGT-AAAAAAGGTGGATTTTGTTCAAAACCTAATCAATGTCAATGTAAAACAGGTTGGACAGGAATAACATGTGATCAATGTGTTAAACGTGAAAATTGTTTACATGGTAAATGTTTACTTGGTAATGATTGTATATGTGAACCTGGATGGGCTGGATATTTATGTGATAGTAAAAAAGTGATTTATGAAAAAATTGAAGATGATTCTGAAACAAATAGTACAGATAGTGTGACCGAAGAAATCAATAATGAAGATTCAGAGAAACATTCCACAATGAACTCGCCAT] [+] EMBL CD124028 [AAACCACTTCAAATACTACAAATCAAAATAGTCCTAGAAAGTTAACTAATGAAAAACCTTCCAGTCTATATTATTGGCCACATAGACCATGGATAAATGATCATAGAATTATTGATAATGTAGTATTAAGATCATGGGATTCAATAAGTCAAATTTATTTACAATTATGGCCACCTCATGATAAAGTTATTACAACATGCCCAAATCTAGTCAAGTTAACATTGTTATCTAATACACGTTTATCAGATAAAGCTATTTTTATAGAATCAGTAATAAGAGGTAAACATCAGAAAATTGTAATA CCAGCGGATAGTATAGACAATGATAATGACTATTGTATTGATCGAGATGATGAATTAGGTCATTATAAATGTTTAAATTGGAATTCAACAGAGATTGAATGTTTACCTGGTTGGAATGGTGAGAATTGTTTAATTCCTGTTTGTTCTTTAGAATGTAGT AAAAAAGGTGGATTTTGTTCAAAACCTAATCAATGTCAATGTAAAACAGGTTGGACAGGAATAACATGTGATCAGTGTGTTAAACGTGAAAATTGTTTACATGGTAAATGTTTACTTGGTAATGATTGTAT ] [+] EMBL CD119708 [ gccttcaatGATCATGGGATTCAATAAGTCAAATTTATTTACAATTATGGCCACCTCATGATAAAGTTATTACAACATGCCCAAATCTAGTCAAGTTAACATTGTTATCTAATACACGTTTATCAGATAAAGCTATTTTTATAGAATCAGTAATAAGAGGTAAACATCAGAAAATTGTAATA CCAGCGGATAGTATAGACAATGATAATGACTATTGTATTGATCGAGATGATGAATTAGGTCATTATAAACGTTTAAATTGGAATTCAACAGAGATTGAATGTTTACCTGGTTGGAATGGTGAGAATTGTTTAATTCCTGTTTGTTCTTTAGAATGTAGT AAAAAAGGTGGATTTTGTTCAAAACCTAATCAATGTCAATGTAAAACAGGTTGGACAGGAATAACATGTGATCAATGTGTTAAACGTGAAAATTGTTTACATGGAAAATGTTTACTTGGTAAT ] [+] EMBL CD119648 [ ATCATGGGATTCAATAAATCAGATTTATTTACAATTATGGCCACCTCATGATAAAGTTATTACAACATGCCCAAATCTAGACA ] [+] EMBL CD179580 [ TGTTATCTAATACACGTTTATCAGATAAAGCTATTTTTATAGAATCAGTAATAAGAGGTAAACATCAGAAAATTGTAATAGCCAGCGGATAGTATAGACAATGATAATGACTATTGTATTGATCGAGATGATGAATTAGGTCATTATAAATGTTTAAATTGGAATTCAACAGAGATTGAATGTTTACCTGGTTGGAATGGTGAGAATTGTTTAATTCCTGTTTGTTCTTCAGAATGTAGT AAAAAAGGTGGATTTTGTTCAAAACCTAATCAATGTCAATGTAAAACAGGTTGGACAGGAATAACATGTGATCAATGTGTTAAACGTGAAAATTGTTTACATGGTAAATGTTTACTTGGTAATGATTGTATATGTGAACCTGGATGGGCTGGATATTTATGTGATAGTAAAAAAGTGATTTATGAAAAAATTGAAGATGATTCTGAAACAAATAGTACAGATAGTGTGACCGAAGAAATCAATAATGAAGATTCAGAGAAACATTCCACAATGAACTCGCCAT] [-] EMBL CD146728 [ GACAATGATAATGACTATTGTATTGATCGAGATGATGAATTAGGTCATTATAAATGTTTAAATTGGAATTCAACAGAGATTGAATGTTTACCTGGTTGGAATGGTGAGAATTGTTTAATTCCTGTTTGTTCTTTAGAATGTAGTAAAAAAAGATGGATTTTGTTCAAAACCTAATCAATGTCAATGTAAAACAGGTTGGACAGGAATAACATGTGATCAATGTGTTAAACGTGAAAATTGTTTACATGGTAAATGTTTACTTGGTAATGATTGTATATGTGAA ] [+] EMBL CD096509 [ ACTATTGTATTGATCGAGATGATGAATTAGGTCATTATAAATGTTTAAATTGGAATTCAACAGAGATTGAATGTTTACCTGGTTGGAATGGTGAGAATTGTTTAATTCCTGTTTGTTCTTTAGAATGTAGT AAAAAAGGTGGATTTTGTTCAAAACCTAATCAATGTCAATGTAAAACAGGTTGGACAGGAATAACATGTGATCAATGTGTTAAACGTGAAAATTGTTTACATGGTAAATGTTTACTTGGTAATGATTGTATATGTGAACCTGGATGGGCTGGATATTTATGTGATAGTAAAAAAGTGATTTATGAAAAAATTGAAGATGATTCTGAAACAAATA ] [-] EMBL CD096581 [ CTATTGTATTGATCGAGATGATGAATTAGGTCATTATAAGTGTTTAAATTGGAATTCAACAGAGATTGAATGTTTACCTGGTTGGAATGGTGAGAATTGTTTAATTCCTGTTTGTTCTTTAGAATGTAGT AAAAAAGGTGGATTTTGTTCAAAACCTAATCAATGTCAATGTAAAACAGGTTGGACAGGAATAACATGTGATCAATGTGTTAAACGTGAAAATTGTTTACATGGTAAATGTTTACTTGGTAATGATTGTATATGTGAACCTGGATGGGCTGGATATTTATGTGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||