These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8491#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1096 fasta sequence [CTTTGTTGCATGGGGAATTAGCACGGAATCCATGGGTATTATAGATGAAGGTCTACCAGAAATTGTTGATGAATTGGATTATCAATACAGAACTGCAAACTGGCTTATTAAAACCAGAGAGCCATTTTGCCTTGGAGATGATGTAAGAGGACAACTTTTATCTCTCTTACGCAAACAAAGTGAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATCTATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCAATAATTCCAACCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGGCAGTTAG-TTGGATGGGGAGAATCCAGTAACTGGGCAGTTCCTGTTACAAATGCAGATAGTATATTTGTCTCTTTGTCTTACAGGTTAGCTCCAAAAGAAAAACTGGAAGCGATGTCACAAAGTCTATGTCTCGGTATGCAAAAAGTTATGACTCTTACGCATAAAATGTTTGGTAACTTAGATGATACGAAGCTCCGTATAACCCTATTTGGACATTCTGCCGGTGCACACTTAGTTCTGGAAATGATATATTGGGCTCATATGGACCTCGAATCAAATAATAATTGGCTATGCTGTTTGCGAAACCTTGTTTTAATGTCGGGAGTTTATGATCTACGTCCAATTATCCATACTTACGTAAATAAAGCAATAAAGTTTAAAACGATTGAGGAGGCTTTGTCTGTCAGTCCAATCCGACACTTCATGCAAGATGGTCTAAATCTACTGCTCAGCAAATCACTTCATTGGATTGTTGCTTGGGCAGAGTACGAATCGCCAGCTATGAAGGGCCAATTTAAATCACTAGCGGACTTGTTAAGTAAAGCATCAAACAGAAGTGGCCAAGGTTCACCTTTGCAATTTACCTATGAAACGTTTTATATGTCAAATGAAGATCATTTTACTTCACTCCTCGGTTTGCATGATGGTCCAAATCACAGTGCTATCCTCAAAAAAATCATAGATCTCATTAACCTCAAGCCTATTTAGTCGGGTCGCCCAATATAAAATCATAGAATAAAACGGTGA] [+] EMBL CD083118 [CTTTGTTGCAT GGGAATTAGCACGGAATCCATGGGTATTATAGATGAAGGTCTACCAGAAATTGTTGATGAATTGGATTATCAATACAGAACTGCAAACTGGCTTATTAAAACCAGAGAGCCATTTTGCCTTGGAGATGATGTAAGAGGACAACTTTTATCTCTCTTACGCAAACAAAGTGAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATCTATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCAATAATTCCAACCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGGCAGTTAG TTGGATGGGGAGAATCCAGTAACTGGGCAGTTCCTGTTACAAATGCAGATAGTATATTTGTCTCTTTGTCTTACAGGTTAGCTCCAAAAGAAAAACTGGAAGCGATGTCACAAAGTCTATGTCTCGGTATGCAAAAAGTTATGACTCTTACGCATAAAATGTTTGGTAACTTAGATGATACGAAGCTCCGTATAACCCTATTTGGACATTCTGCCGGTGCACACTTAGTTCTGGAA ] [+] EMBL CD081930 [ gGTTGCATGGGGAATTAGCACGGAATCCATGGGTATTATAGATGAAGGTCTACCAGAAATTGTTGATGAATTGGATTATCAATACAGAACTGCAAACTGGCTTATTAAAACCAGAGAGCCATTTTGCCTTGGAGATGATGTAAGAGGACAACTTTTATCTCTCTTACGCAAACAAAGTGAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATCTATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCAATAATTCCAACCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGGCAGTTAG TTGGATGGGGAGAATCCAGTAACTGGGCAGTTCCTGTTACAAATGCAGATAGTATATTTGTCTCTTTGTCTTACAGGTTAGCTCCAAAAGAAAAACTGGAAGCGATGTCACAAAGTCTATGTCTCGGTATGCAAAAAGTTATGACTCTTACGCATAAAATGTTTGGTAACTTAGATGATACGAAGCTCCGTATAACCCTATTTGGACATTCTGCCGGTGCACACTTAGTTCTGGAAATGATATATTGGGCTCATATGGACCTCGAATCANATAATAATTGGCTATGCTGNTTG ] [+] EMBL CD196309 [ atGGGAATTAGCACGGAATCCATGGGTATTATAGATGAAGGTCTACCAGAAATTGTTGATGAATTGGATTATCAATACAGAACTGCAAACTGGCTTATTAAAACCAGAGAGCCATTTTGCCTCGGAGATGATGTAAGAGGACAACTTTTATCTCTCTTACGCAAACAAAGTGAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATCTATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCGATAATGCC ANCGATATTGNTGTCTATATTCATGGAGGCTATTGGCAGNTAGNNTGGAT GGGAG ATCCAGTAACTGGGCAGNTCCTGTTACAANTGCAGATAGNATATTTGTCTCTTTGNCNTACAGGGTAGCTCC AAAGGAAAACTGGA ] [+] EMBL CD182266 [ GAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATCTATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCAATAATTCCAGCCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGACA ] [-] EMBL CD190496 [ ATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCAATAATTCCAACCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGGCAGTTAG TTGGATGGGGAGAATCCAGTAACTGGGCAGTTCCTGTTACAAATGCAGATAGTATATTTGTCTCTTTGTCTTACAGGTTAGCTCCAAAAGAAAAACTGGAAGCGATGTCACAAAGTCTATGTCTCGGTATGCAAAAAGTTATGACTCTTACGCATAAAATGTTTGGTAACTTAGATGATACGAAGCTCCGTATAACCCTATTTGGACATTCTGCCGGTGCACACTTAGTTCTGGAAATGATATATTGGGCTCATATGGACCCCGAATCAAATAATAATTGGCTATGCTGTTTGCGAAACCTTGTTTTAATGTCGGGAGTTTATGATCTACGTCCAATTATCCATACTTACGTAAATAAAGCAATAAAGTTTA ] [-] EMBL CD076692 [ CTGGAAATGATATATTGGGCTCATATGGACCTCGAATCAAATAATAATTGGCTATGCTGTTTGCGAAACCTTGTTTTAATGTCGGGAGTTTATGATCTACGTCCAATTATCCATACTTACGTAAATAAAGCAATAAAGTTTAAAACGATTGAGGAGGCTTTGTCTGTCAGTCCAATCCGACACTTCATGCAAGATGGTCTAAATCTACTGCTCAGCAAATCACTTCATTGGATTGTTGCTTGGGCAGAGTACGAATCGCCAGCTATGAAGGGCCAATTTAAATCACTAGCGGACTTGTTAAGTAAAGCATCAAACAGAAGTGGCCAAGGTTCACCTTTGCAATTTACCTATGAAACGTTTTATATGTCAAATGAAGATCATTTTACTTCACTCCTCGGTTTGCATGATGGTCCAAATCACAGTGCTATCCTCAAAAAAATCATAGATCTCATTAACCTCAAGCCTATTTAGTCGGGTCGCCCAATATAAAATCATAGAATAAAACGGTGA] [+] EMBL CD140887 [ GAATCAAATAATAATTGGCTAAGCTGTTTGCGAAACCTTGTTTTAATGTCGGGAGTTTATGATCTACGTCCAATTATCCATACTTACGTAAATAAAGCAATAAAGTTTAAAACGATTGAGGAGGCTTTGTCTGTCAGTCCAATCCGACACTTCATGCAAGATGGTCTAAATCTACTGCTCAGCAAATCACTTCATTGGATTGTTGCTTGGGCAGAGTACGAATCGCCAGCTATGAAGGGACAATCTAAATCACTAGCGGACTTGTTAAGTAAAGCATCAAACAGAAGTGGACAAGGTTCACCTTTGCAATTTACCTATGAAACGTTTTATATGTCAAATGAAGATCATTTTACTTCACTCCTC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||