cluster # 8496

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Schistosoma mansoni
cluster # 8496 cluster # 8496 Sequences # 7 consensus # 3

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consensus_8496#0 length = 856 sequences # 4

consensus_8496#1 length = 602 sequences # 2
consensus_8496#2 length = 344 sequences # 1

consensusID : consensus_8496#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 856
fasta sequence

                              [GGNTGATGGAATTAATAACGACAACATTATTGATAATCATAGTCATGCGAGAGAAGCTGAAAGAAATGAAGTTTCAAATTTAACAAGAAATAGAAAAATATCTAGTAGTAATATTATAATAACAAACGACTATGATCATAATATTTTGAACGATAATAATAGTGGCGATATTAACAATAATAATAATCATGCTATACAACTTGATCATCTTACAGTCGCTTATGTCTCTGGATTAGGGTATGGTTTGATGAGTTGTATTATACAATCGTTACGTATACTTATTGATTCCTATGGCCCTGGAATAACTATATATTCAACATGGAATCCGAGAACATTCTTTTTGTTTTCGTCGTGTCAGTGTATGTGTATATCAATGCTTCAAGTGTTTTGGTCTCTTATTCTGTTTTCTGCGTTTGTACAACGTGCATATGGTCAAATTATCCTTGTATACTTTATGCATTTTGGATTAGCTGGCATGTCGTTAATCAATACCTATTCATCACCTTGCTCAGAAATTGTATGTGCAATATACATGATTTGTCTCATAGGAATGATCATATTCGCCTATTGTCGATTTCATTCACAATTAATCACTAATCCTAAAAAAAATAGTGCTGTCAATTTTATTAATCAACAGTAATGGAGATTTTTTATACAAGCACCAAACTTCTTTTTGTAGTTTAAAATCCAGTATCCGGTACAA-TAAAAAC-GGAGATCTACCTTTTTTTTAAAGAAAAT-ATGGTAACATGAAGAA-TTT-TATTTTGTGCATCTCTTTTTGT-ACC--ATAT-TATAT-TATATATGAGTTATGTAACACTGGTTAT-ACTGT-AACATTA-TAATATCAAGT-ATAAAGTAAACTTT]

[+] EMBL CD082335             [GGNTGATGGAATTAATAACGACAACATTATTGATAATCATAGTCATGCGAGAGAAGCTGAAAGAAATGAAGTTTCAAATTTAACAAGAAATAGAAAAATATCTAGTAGTAATATTATAATAACAAACGACTATGATCATAATATTTTGAACGATAATAATAGTGGCGATATTAACAATAATAATAATCATGCTATACAACTTGATCATCTTACAGTCGCTTATGTCTCTGGATTAGGGTATGGTTTGATGAGTTGTATTATACAATCGTTACGTATACTTATTGATTCCTATGGCCCTGGAATAACTATATATTCAACATGGAATCCGAGAACATTCTTTTTGTTTTCGTCGTGTCAGTGTATGTGTATATCAATGCTTCAAGTGTTTTGGTCTCTTATTCTGTTTTCTGCGTTTGTACAACGTGCATATGGTCAAATTATCCTTGTATACTTTATGCATTTTGGATTAGCTGGCATGTCGTTAATCAATACCTATTCATCACCTTGCTCAGAAATTGTATGTGCAATATACATGATTTGTCTCATAGGAATGATCATATTCGCCTATTGTCGATTTCATTCACAATTAATCACTAATCCTAAAAAAAATAGTGCTGTCAATTNTATTAATCAACAGNTATGGAGATTTTTTATACAAGCACCAAACTTCTTTTTGTAGTTTAAAATCCAGTATCCGGTACAA TAANAACGGGAGATCTA CTTTTTTTTAAAGAANAT ATGGT ACATGAAGAA TTT TATTTTGTGCATCTCTTTTTGT ACC  ATAT TATAT TATATATGANGTATGT ACACTGGNTAT ACTGT AACATTA  NATATCNAGT ATAAAGTAA     ]
[+] EMBL CD079849             [                                                                                                            TAATATTATAATAACAAACGACTATGATCATAATATTTTGAACGATAATAATACTGGCGATATTAACAATAATAATAATCATGCTATACAACTTGATCATCTTACAGTCGCTTATGTCTCTGGATTATGGTATGGATTGATGAGTTGTATTATACAATCGTTACGTATACTTATTGATTCCTATGGCCCTGGAATAACTATATATTCAACATGGAATCCGAGAACATTCTTTTTGTTTTCGTCGTGTCAGTGTATGTGTATATCAATGCTTCAAGTGTTTTGGTCTCTTATTCTGTTTTCTGCGTTTGTACAACGTGCATATGGTCAAATTATCCTTGTATACTTTATGCATTTTGGATTAGCTGGCATGTCGTTAATCAATACCTATTCATCACCTTGCTCAGAAATTGTATGTGCAATATACATGATTTGTCTCATAGGAATGATCATATTCGCCTATTGTCGATTTCATTCACAATTAATCACTAATCCTAAAAAAAATAGTGCTGTCAATTTTATTAATCAACAGTAATGGAGATTTTTTATACAAGCACCAAACTTCTTTNTGTAGTTTAAAATCCAGTATCCGGTACAA TTAAAAC GGAGATCTACCTTNATTTTAAAGAAAAT ATGGTCACATGAAGAA TTTNTA TTTGTGCATCTCTTTTTGT ACCATATAT TATA  TATATATGAGTTATGTAACACT GTTAT ACTGT AACATTA TTATATC AGT AATAAGTAA     ]
[-] EMBL CD075933             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGGCCCTGGAATAACTATATATTCAACATGGAATCCGAGAACATTCTTTTTGTTTTCGTCGTGTCAGTGTATGTGTATATCAATGCTTCAAGTGTTTTGGTCTCTTATTCTGTTTTCTGCGTTTGTACAACGTGCATATGGTCAAATTATCCTTGTATACTTTATGCATTTTGGATTAGCTGGCATGTCGTTAATCAATACCTATTCATCACCTTGCTCAGAAATTGTATGTGCAATATACATGATTTGTCTCATAGGAATGATCATATTCGCCTATTGTCGATTTCATTCACAATTAATCACTAATCCTAAAAAAAATAGTGCTGTCAATTTTATTAATCAACAGTAATGGAGATTTTTTATACAAGCACCAAACTTCTTTTTGTAGTTTAAAATCCAGTATCCGGTACAATTAAAAAC GGAGATCTACCTTTTTTTTAAAGAAAATAATGGTAACATGAAGAATTTT TATTTTGTGCATCTCTTTTTGTAACC  ATATATATATATATATATGAGTTATGTAACACTGTTTATAACTGTGAACATTATTAATATCAAGTAATAAAGTAAACTT ]
[-] EMBL CD076291             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cgGCGTTTGTACAACGTGCATATGGTCAAATTATCCTTGTATACTTTATGCATTTTGGATTAGCTGGCATGTCGTTAATCAATACCTATTCATCACCTTGCTCAGAAATTGTATGTGCAATATACATGATTTGTCTCATAGGAATGATCATATTCGCCTATTGTCGATTTCATTCACAATTAATCACTAATCCTAAAAAAAATAGTGCTGTCAATTTTATTAATCACCAGTAATGGAGATTTTTTATACAAGCACCAAACTTCTTTTTGTAGTTTAAAATCCAGTATCCGGTACAATTAAAAAC GGAGATCTACCTTTTTTTTAAAGAAAATAATGGTAACATGAAGAATTTT TATTTTGTGCATCTCTTTTTGTAACC  ATATATATATATATATATGAGTTATGTAACACTGTTTATAACTGTAAACATTATTAATATCAAGTAATAAAGTAAACTTT]




>consensus_8496#0
GGNTGATGGAATTAATAACGACAACATTATTGATAATCATAGTCATGCGAGAGAAGCTGA
AAGAAATGAAGTTTCAAATTTAACAAGAAATAGAAAAATATCTAGTAGTAATATTATAAT
AACAAACGACTATGATCATAATATTTTGAACGATAATAATAGTGGCGATATTAACAATAA
TAATAATCATGCTATACAACTTGATCATCTTACAGTCGCTTATGTCTCTGGATTAGGGTA
TGGTTTGATGAGTTGTATTATACAATCGTTACGTATACTTATTGATTCCTATGGCCCTGG
AATAACTATATATTCAACATGGAATCCGAGAACATTCTTTTTGTTTTCGTCGTGTCAGTG
TATGTGTATATCAATGCTTCAAGTGTTTTGGTCTCTTATTCTGTTTTCTGCGTTTGTACA
ACGTGCATATGGTCAAATTATCCTTGTATACTTTATGCATTTTGGATTAGCTGGCATGTC
GTTAATCAATACCTATTCATCACCTTGCTCAGAAATTGTATGTGCAATATACATGATTTG
TCTCATAGGAATGATCATATTCGCCTATTGTCGATTTCATTCACAATTAATCACTAATCC
TAAAAAAAATAGTGCTGTCAATTTTATTAATCAACAGTAATGGAGATTTTTTATACAAGC
ACCAAACTTCTTTTTGTAGTTTAAAATCCAGTATCCGGTACAATAAAAACGGAGATCTAC
CTTTTTTTTAAAGAAAATATGGTAACATGAAGAATTTTATTTTGTGCATCTCTTTTTGTA
CCATATTATATTATATATGAGTTATGTAACACTGGTTATACTGTAACATTATAATATCAA
GTATAAAGTAAACTTT

consensusID : consensus_8496#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 602
fasta sequence

                              [TCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGGCCTGAAAGAAATGAAGTTTCAAATTTAACAAGAAATAGAAAAATATCTAGTAGTAATATTATAATAACAAACGACTATGATCATAATATTTTGAACGATAATAATAGTGGCGATATTAACAATAATAATAATCATGCTATACAACTTGATCATCTTACAGTCGCTTATGTCTCTGGATTAGGGTATGGTTTGATGAGTTGTATTATACAATCGTTACGTATACTTATTGATTCCTATGGCCCTGGAATAACTATATATTCAACATGGAATCCGAGAACATTCTTTTTGTTTTCGTCGTGTCAGTGTATGTGTATATCAATGCTTCAAGTGTTTTGGTCTCTTATTCTGTTTTCTGCGTTTGTACAACGTGCATATGGTCAAATTATCCTTGTATACTTTATGCATTTTGGATTAGCTGGCATGTCGTTAATCAATACCTATTCATCACCTTGCTCAGAAATTGTATGTGCAATATACATGATTTGTCTCATAGGAATGATCATATTCGCCTATTGTCGATTTCATTCACAATTAATCACTAATCCTAAAAAAAATAGTGCTGTCAATTNTATTAATC]

[+] EMBL CD082701             [TCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGGCCTGAAAGAAATGAAGTTTCAAATTTAACAAGAAATAGAAAAATATCTAGTAGTAATATTATAATAACAAACGACTATGATCATAATATTTTGAACGATAATAATAGTGGCGATATTAACAATAATAATAATCATGCTATACAACTTGATCATCTTACAGTCGCTTATGTCTCTGGATTAGGGTATGGTTTGATGAGTTGTATTATACAATCGTTACGTATACTTATTGATTCCTATGGCCCTGGAATAACTATATATTCAACATGGAATCCGAGAACATTCTTTTTGTTTTCGTCGTGTCAGTGTATGTGTATATCAATGCTTCAAGTGTTTTGGTCTCTTATTCTGTTTTCTGCGTTTGTACAACGTGCATATGGTCAAATTATCCTTGTATACTTTATGCATTTTGGATTAGCTGGCATGTCGTTAATCAATACCTATTCATCACCTTGCTCAGAAATTGTATGTGCAATATACATGATTTGTCTCATAGGAATGATCATATTCGCCTATTGTCGATTTCATTCACAATTAATCACTAATCCTAAAAAAAATAGTGCTGTCAATTNTATTAATC]
[-] EMBL CD115773             [                                                                                                                                                                                                                                                                  CTATGGCCCTGGAATAACTATATATTCAACATGGAATCCGAGAACATTCTTTTTGTNTTCGTCGTGTCAGTGTATGTGTATATCAATGCTTCAAGTGTTTTGGTCTCTTATTCTGTTTTCTG                                                                                                                                                                                                                              ]




>consensus_8496#1
TCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGGCCTGAAAGAAATGAAGTTTCAAATTTAACAAGAAA
TAGAAAAATATCTAGTAGTAATATTATAATAACAAACGACTATGATCATAATATTTTGAA
CGATAATAATAGTGGCGATATTAACAATAATAATAATCATGCTATACAACTTGATCATCT
TACAGTCGCTTATGTCTCTGGATTAGGGTATGGTTTGATGAGTTGTATTATACAATCGTT
ACGTATACTTATTGATTCCTATGGCCCTGGAATAACTATATATTCAACATGGAATCCGAG
AACATTCTTTTTGTTTTCGTCGTGTCAGTGTATGTGTATATCAATGCTTCAAGTGTTTTG
GTCTCTTATTCTGTTTTCTGCGTTTGTACAACGTGCATATGGTCAAATTATCCTTGTATA
CTTTATGCATTTTGGATTAGCTGGCATGTCGTTAATCAATACCTATTCATCACCTTGCTC
AGAAATTGTATGTGCAATATACATGATTTGTCTCATAGGAATGATCATATTCGCCTATTG
TCGATTTCATTCACAATTAATCACTAATCCTAAAAAAAATAGTGCTGTCAATTNTATTAA
TC

consensusID : consensus_8496#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 344
fasta sequence

                              [ATTAATCCCCTTGCTCAGAAATTGAATGTGCAAAAAACATGATTTGTCTCATAGGAATGATCATATTCGCCTATTGTGGATTTCATTCACAATTAATCGGTATTCTTAAAAAAAAAAGTGCTGTCAATTTTATTAATCACCAGTAATGGAGATTTTTTATACAAGCACCAAACTTCTTTTTGTAGTTTAAAATCCAGTATCCGGTTCAATTAAAACCGGAGATATCCCTTTTTTTTAAACGAAAATAATGGTAACATGAAGAATTTTTATTTTGTGCATCTCTTTTGGTACCCATATATATATAAAAATAATGAGTTAAGAAACAATAGTTTAAAACTAGATAA]

[-] EMBL CD075946             [ATTAATCCCCTTGCTCAGAAATTGAATGTGCAAAAAACATGATTTGTCTCATAGGAATGATCATATTCGCCTATTGTGGATTTCATTCACAATTAATCGGTATTCTTAAAAAAAAAAGTGCTGTCAATTTTATTAATCACCAGTAATGGAGATTTTTTATACAAGCACCAAACTTCTTTTTGTAGTTTAAAATCCAGTATCCGGTTCAATTAAAACCGGAGATATCCCTTTTTTTTAAACGAAAATAATGGTAACATGAAGAATTTTTATTTTGTGCATCTCTTTTGGTACCCATATATATATAAAAATAATGAGTTAAGAAACAATAGTTTAAAACTAGATAA]




>consensus_8496#2
ATTAATCCCCTTGCTCAGAAATTGAATGTGCAAAAAACATGATTTGTCTCATAGGAATGA
TCATATTCGCCTATTGTGGATTTCATTCACAATTAATCGGTATTCTTAAAAAAAAAAGTG
CTGTCAATTTTATTAATCACCAGTAATGGAGATTTTTTATACAAGCACCAAACTTCTTTT
TGTAGTTTAAAATCCAGTATCCGGTTCAATTAAAACCGGAGATATCCCTTTTTTTTAAAC
GAAAATAATGGTAACATGAAGAATTTTTATTTTGTGCATCTCTTTTGGTACCCATATATA
TATAAAAATAATGAGTTAAGAAACAATAGTTTAAAACTAGATAA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8496#0      GGNTGATGGAATTAATAACGACAACATTATTGATAATCATAGTCATGCGAGAGAAGCTGA 60
consensus_8496#1      -----------------------------TCGA-GGCCANAATTCGGCACGAGGGCCTGA 30
consensus_8496#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8496#0      AAGAAATGAAGTTTCAAATTTAACAAGAAATAGAAAAATATCTAGTAGTAATATTATAAT 120
consensus_8496#1      AAGAAATGAAGTTTCAAATTTAACAAGAAATAGAAAAATATCTAGTAGTAATATTATAAT 90
consensus_8496#2      --------------------------------ATTAATCCCCTTGCTCAGAAATTGAATG 28
                                                         **    ** *     * ***  *  

consensus_8496#0      AACAAACGACTATGATCATAATATTTTGAACGATAATAATAGTGGCGATATTAACAATAA 180
consensus_8496#1      AACAAACGACTATGATCATAATATTTTGAACGATAATAATAGTGGCGATATTAACAATAA 150
consensus_8496#2      TGCAAAAAAC-ATGATTTGTCTCATAGGAATGATCATATTCGCC-TATTGTGGATTTCAT 86
                        ****  ** *****     *  *  *** *** *** * *      * *  *    * 

consensus_8496#0      TAATAATCATGCTATACAACTTGATCATCTTACAGTCGCTTATGTCTCTGGATTAGGGTA 240
consensus_8496#1      TAATAATCATGCTATACAACTTGATCATCTTACAGTCGCTTATGTCTCTGGATTAGGGTA 210
consensus_8496#2      TCACAATTAATCGGTATT-CTTAAAAAAAAAAGTGCTGTCAATTTTATTAATCACCAGTA 145
                      * * *** *  *  **   *** *  *    *  *  *   ** *   *        ***

consensus_8496#0      TGGTTTGATGAGTTGTATTATACAATCGTTACGTATACTTATTGATTCCTATGGCCCTGG 300
consensus_8496#1      TGGTTTGATGAGTTGTATTATACAATCGTTACGTATACTTATTGATTCCTATGGCCCTGG 270
consensus_8496#2      ATG------GAGATTTTTTATACAAGCACCAAACTT-CTTTTTGTAGTTTAAAATCC--- 195
                        *      *** * * ******** *   *    * *** ***     **    **   

consensus_8496#0      AATAACTATATATTCAACATGGAATCCGAGAACATTCTTTTTGTTTTCGTCGTGTCAGTG 360
consensus_8496#1      AATAACTATATATTCAACATGGAATCCGAGAACATTCTTTTTGTTTTCGTCGTGTCAGTG 330
consensus_8496#2      AGTATCCG---GTTCAA--TTAAAACCGGAGATATCCCTTTTTTTTAAACGAAAATAATG 250
                      * ** *      *****  *  ** ***   * ** * **** ***          * **

consensus_8496#0      TATGTGTATATCAATGCTTCAAGTGTTTTGGTCTCTTATTCTGTTTTCTGCGTTTGTACA 420
consensus_8496#1      TATGTGTATATCAATGCTTCAAGTGTTTTGGTCTCTTATTCTGTTTTCTGCGTTTGTACA 390
consensus_8496#2      ---GTA-ACATGAAGAATTTT--TATTTTGTGCATCTCTTTTGGTACCCATATATATATA 304
                         **  * ** **   **    * *****  *   * ** ** *  *    * * ** *

consensus_8496#0      ACGTGCATATGGTCA--AATTATCCTTGTATACTTTATGCATTTTGGATTAGCTGGCATG 478
consensus_8496#1      ACGTGCATATGGTCA--AATTATCCTTGTATACTTTATGCATTTTGGATTAGCTGGCATG 448
consensus_8496#2      AAAATAATGAGTTAAGAAACAATAGTTTAAAACTAGATAA-------------------- 344
                      *     **  * * *  **  **  **  * ***  **                      

consensus_8496#0      TCGTTAATCAATACCTATTCATCACCTTGCTCAGAAATTGTATGTGCAATATACATGATT 538
consensus_8496#1      TCGTTAATCAATACCTATTCATCACCTTGCTCAGAAATTGTATGTGCAATATACATGATT 508
consensus_8496#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8496#0      TGTCTCATAGGAATGATCATATTCGCCTATTGTCGATTTCATTCACAATTAATCACTAAT 598
consensus_8496#1      TGTCTCATAGGAATGATCATATTCGCCTATTGTCGATTTCATTCACAATTAATCACTAAT 568
consensus_8496#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8496#0      CCTAAAAAAAATAGTGCTGTCAATTTTATTAATCAACAGTAATGGAGATTTTTTATACAA 658
consensus_8496#1      CCTAAAAAAAATAGTGCTGTCAATTNTATTAATC-------------------------- 602
consensus_8496#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8496#0      GCACCAAACTTCTTTTTGTAGTTTAAAATCCAGTATCCGGTACAATAAAAACGGAGATCT 718
consensus_8496#1      ------------------------------------------------------------
consensus_8496#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8496#0      ACCTTTTTTTTAAAGAAAATATGGTAACATGAAGAATTTTATTTTGTGCATCTCTTTTTG 778
consensus_8496#1      ------------------------------------------------------------
consensus_8496#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8496#0      TACCATATTATATTATATATGAGTTATGTAACACTGGTTATACTGTAACATTATAATATC 838
consensus_8496#1      ------------------------------------------------------------
consensus_8496#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8496#0      AAGTATAAAGTAAACTTT 856
consensus_8496#1      ------------------
consensus_8496#2      ------------------