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Schistosoma mansoni
cluster # 8519 cluster # 8519       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8519#0 length = 858 sequences # 7  
consensusID : consensus_8519#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 858
fasta sequence 
                              [TCGACAGCATCAGAGTTCGTTACCGAGAAGGGTATTTCCACGGGAATGTGGCCGCAACTGGCTATCTTGATGCTCTTAACAGGTCTATCTCTTGAATCCGTCGTTTCACTTTCAATCTGTCTAACAATGTTCATTCCTTCTACAACTTTTCCGAAAACAACATGCTTTCCATCTAACCACGAGGTCTTCACGGTCGTAATAAAGAATTGGCTTCCATTTGTATCAGGACCAGACACAAGATAGCTTTTTCTGCTGGTTTACAGATGAATCCTCAGTGTTCGGCGACGAGCTGGGTGAAGTAATAAAGGACGACATTTGGCCTAATCCACTGCAATATTACCTCTCACCAGATTTAGACGAAGAAAATGAAAACGATGAAGAGGATGAAGATGACGATGATGATCAGGATCTCGACGAGGATGAAACTGGTGTAGCGGATGTTTAAAGATCATTGCAATATATCATTTCCATTTAAACTTCAATCTTTGTTTCCCAAACGTGTATGTCTTCGCATGGAACAATATTGATACATTTGATTTGT-TGTACAATGGCAAAAACAGACTGTTTCCACTTGTATATCGCGCCCCGGTTTTATGTTCCACTCTTGAATACGCCTTTGTGTCATTTTGCATTTAATTGTAGCTATCGTCATACCGAGGCATATTCATGTGTCATGTGTTGGCTTTAACTTGACTGTTTTTATCCAGGGATCAGCGTTTTTGCCGTTGTTTCTGTTCCAGCCGCTATGCGTCTTAAGATTTTTGTATCAACACTTTTCGAGACGTGAGGTCATATCTCAAACTTTGTTTCTAATAAACAGTTATGAAGGATAGTTCTTATTCTAAAACTCGAAATCAT]

[+] EMBL CD137174             [TCGACAGCATCAGAGTTCGTTACCGAGAAGGGTATTTCCACGGGAATGTGGCCGCAACTGGCTATCTTGATGCTCTTAACAGGTCTATCTCTTGAATCCGTCGTTTCACTTTCAATCTGTCTAACAATGTTCATTCCTTCTACAACTTTTCCGAAAACAACATGCTTTCCATCTAACCACGAGGTCTTCACGGTCGTAATAAAGAATTGGCTTCCATTTGTATCAGGACCAGACACAAGATAGCTTTTTCTGCTGGTTTACAGATGAATCCTCAGTGTTCGGCGACGAGCTGGGTGAAGTAATAAAGGACGACATTTGGCCTAATCCACTGCAATATTACCTCTCACCAGATTTAGACGAAGAAAATGANAACGATGAAGAGGATGAAGATGACGATGATGATCAGGATCTCGACGAGGATGAAACTGGTGTAGCGGATGTTTAAAGATCATTGCAATATATCATTTCCATTTAAACTTCAATCTTTGTTTCCCAAACGTGTATGTCTTCGCATGGAACAATATTGATACATTTGATTTGT TGTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD136999             [                                                                                                                                                                                                                     aCATTTG    AGGACCAGACACAAGATAGCTTTTTCTGCTGGTTTACAGATGAATCCTCAGTGTTCGGCGACGAGCTGGGTGAAGTAATAAAGGACGACATTTGGCCTAATCCACTGCAATATTACCTCTCACCAGATTTAGACGAAGAAAATGAAAACGATGAAGAGGATGAAGATGACGATGATGATCAGGATCTCGACGAGGATGAAACTGGTGTAGCGGATGTTTAAAGATCATTGCAATATATCATTTCCATTTAAACTTCAATCTTTGTTTCCCAAACGTGTATGTCTTCGCATGGAACAATATTGATACATTTGATTTGT TGTACAATGGCAAAAACAGACTGTTTCCACTTGTATATCGCGCCCCGGTTGTATGTTCCACTCTTGAATACGCCTTTGTGTCATTTTGCATTTAATTGTAGCTATCGTCATACCGAGGCATATTCATGTGTCATGTGTTGGCTTTAACTTGACTGTTTTTATCCAGGGATCAGCGTTTTTGCCGTTGTTTCTGTTCCAGCCGCTATGCGTCTTAAGATTTTTGTATCAACACTTTTCGAGACGTGNAGTCATATCTCAAACTTTGTTTC                                                ]
[-] EMBL CD161496             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATTACCTCTCACCAGATTTAGACGAAGAAAATGAAAACGATGAAGAGGATGAAGATGACGATGATGATCAGGATCTCGACGAGGATGAAACTGGTGTAGCGGATGTTTAAAGATCATTGCAATATATCATTTCCATTTAAACTTCAATCTTTGTTTCCCAAACGTGTATGTCTTCGCATGGAACAATATTGATACATTTGATTTGT TGTACAATGGCAAAAACAGACTGTTTCCACTTGTATATCGCGCCCCGGTTTTATGTTCCACTCTTGAATACGCCTTTGTGTCATTTTGCATTTAATTGTAGCTATCGTCATACCGAGGCATATTCATGTGTCATGTGTTGGCTTTAACTTGACTGTTTTTATCCAGGGATCAGCGTTTTTGCCGTTGTTTCTGTTCCAGCCGCTATGCGTCTTAAGATTTTTGTATCAACACTTTTCGAGACGTGAGGTCATATCTCAAACTTTGTTTCTAAT                                            ]
[+] EMBL CD136721             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATGAAGAGGATGAAGATGACGATGATGATCAGGATCTCGACGAGGATGAAACTGGTGTAGCGGATGTTTAAAGATCATTGCAATATATCATTTCCATTTAAACTTCAATCTTTGTTTCCCAAACGTGTATGTCTTCGCATGGAACAATATTGATACATTTGATTTGT TGTACAATGGCAAAAACAGACTGTTTCCACTTGTATATCGCGCCCCGGTTTTATGTTCCACTCTTGAATACGCCTTTGTGTCATTTTGCATTTAATTGTAGCTATCGTCATACCGAGGCATATTCATGTGTCATGTGTTGGCTTTAACTTGACTGTTTTTATCCAGGGATCAGCGTTTTTGCCGTTGTTTCTGTTCCAGCCGCTATGCGTCTTAAGATTTTTGTATCAACACTTTTCGAGACGTGAGGTCATATCTCAAACTNTGTTTCT                                               ]
[-] EMBL CD136682             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCAAACGTGTATGTCTTCGCATGGAACAATATTGATACATTTGATTTGT TGTACAATGGCAAAAACAGACTGTTTCCACTTGTATATCGCGCCCCGGTTTTATGTTCCACTCTTGAATACGCCTTTGTGTCATTTTGCATTTAATTGTAGCTATCGTCATACCGAGGCATATTCATGTGTCATGTGTTGGCTTTAACTTGACTGTTTTTATCCAGGGATCAGCGTTTTTGCCGTTGTTTCTGTTCCAGCCGCTATGCGTCTTAAGATTTTTGTATCAACACTTTTCGAGACGTGAGGTCATATCTCAAACTTTGTTTCTAATAAACAGTTATGAAGGc                            ]
[-] EMBL CD165239             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agCAATATGNATACA TTGA TTGTNNGTACAATGGCAAAAACAGACTGTTTCCACTTGTATATCGCGCCCCGGTTTTATGTTCCACTCTTGAATACGCCTTTGTGTCATTTTGCATTTAATTGTAGCTATCGTCATACCGAGGCATATTCATGTGTCATGTGTTGGCTTTAACTTGACTGTTTTTATCCAGGGATCAGCGTTTTTGCCGTTATTTCTGTTCCAGCCGCTATGCGTCTTAAGATTTTTGTATCAACACTTTTCGAGACGTGAGGTCATATCTCAAACTTTGTTTCTAATAAACAGTTATGAAGGATAGTTCTTATTCTAAAACTCGAAATCAT]
[-] EMBL CD165153             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GCCCCGGTTNTATGTCNCACTCTTGAATACGCCTTTGTGTCATTTTGCATTTAATTGTAGCTATCGTCATACCGAGGCATATTCATGTGTCATGTGTTGGCTTTAACTTGACTGTTTTTATCCAGGGATCAGCGTTTTTGCCGTTGTTTCTGTTCCAGCCGCTATGCGTCTTAAGATTTTTGTATCAACACTTTTCGAGACGTGAGGTCATATCTCAAACTTTGTTTCTAATAAACAGTTATGAAGGATAGTTCTTACTCTAAAACTCGAAATCAT]




>consensus_8519#0
TCGACAGCATCAGAGTTCGTTACCGAGAAGGGTATTTCCACGGGAATGTGGCCGCAACTG
GCTATCTTGATGCTCTTAACAGGTCTATCTCTTGAATCCGTCGTTTCACTTTCAATCTGT
CTAACAATGTTCATTCCTTCTACAACTTTTCCGAAAACAACATGCTTTCCATCTAACCAC
GAGGTCTTCACGGTCGTAATAAAGAATTGGCTTCCATTTGTATCAGGACCAGACACAAGA
TAGCTTTTTCTGCTGGTTTACAGATGAATCCTCAGTGTTCGGCGACGAGCTGGGTGAAGT
AATAAAGGACGACATTTGGCCTAATCCACTGCAATATTACCTCTCACCAGATTTAGACGA
AGAAAATGAAAACGATGAAGAGGATGAAGATGACGATGATGATCAGGATCTCGACGAGGA
TGAAACTGGTGTAGCGGATGTTTAAAGATCATTGCAATATATCATTTCCATTTAAACTTC
AATCTTTGTTTCCCAAACGTGTATGTCTTCGCATGGAACAATATTGATACATTTGATTTG
TTGTACAATGGCAAAAACAGACTGTTTCCACTTGTATATCGCGCCCCGGTTTTATGTTCC
ACTCTTGAATACGCCTTTGTGTCATTTTGCATTTAATTGTAGCTATCGTCATACCGAGGC
ATATTCATGTGTCATGTGTTGGCTTTAACTTGACTGTTTTTATCCAGGGATCAGCGTTTT
TGCCGTTGTTTCTGTTCCAGCCGCTATGCGTCTTAAGATTTTTGTATCAACACTTTTCGA
GACGTGAGGTCATATCTCAAACTTTGTTTCTAATAAACAGTTATGAAGGATAGTTCTTAT
TCTAAAACTCGAAATCAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)