These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8526#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 367 fasta sequence [GTAGAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGATGATTCGGATGATGACGATGATGATGATGATGGTGATGAAGATGATGATGATT-GTGAAGATTATGATGA] [+] EMBL CD155377 [GTAAAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGGTGATTCGGACTATGACGATG ] [+] EMBL CD120340 [ AGAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGATGATTCGGATGATGACGATGATGATGATGATGGTGATGAAGATGATGATGATT GTGAAGATTATGATGA] [+] EMBL CD120458 [ AGAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCAGATGATGATTCGGATGATGACGATGATGATGATGATGGTGATGAAGATGATGATGGTTCGTGAga ] [+] EMBL CD120170 [ AGAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGATGATTNCGATGATGACGATGATGATGATGATGGTGATGAAGATGATGATGATT GTGAAGA ] [+] EMBL CD120046 [ AGAAACAAAATCCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCCCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGATGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGNGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGATGATTCGGATGATGACGATGATGATGATGATGGNGACGAAGATGATGATGATT GTGAAGA ] [-] EMBL CD123365 [ CGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACCGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGA ] [+] EMBL CD161545 [ CATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATGATGAT GATGATAATG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||