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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8553#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1066 fasta sequence
[CCATATTCGGCACGAGGATTTTTTTACTGTGCCTATCGCTCGATATTTGGATGGGGCGTTAGTGTTGACACAAGTTCCCGCACTTTTGTTTAGCAAAATAACTAGTTACTTTGTGCCTACTAGTTTCTAAGAATTGTTTTCAACCTCTTTTTGAATATCATCAGTTTAAATTCGTATCGTAATTCATTCAGTTCTCTTCACAAACTTTCCATTTCTCAAATGAATCGTCCAAACTGGTTTTATACACTATATTTAACTGTTATTCAATTTATCATCTATGGAGTTTGTGAAGAGTTATCTGTTAGTCCTATCGCTCAAGCACTACGTGTTCATGAATCTGGAATTTTTGAATGTTCTTTCGAAAACTCATCCTATAATTCGGATTTAAGGTGGATATTGTTTGACGGGACAGTTCTATTAAATGGTAACACATCAGAAGATGGTCGATTTATTAATGAAGATGGTATCCTAAGAATGACTAATCTTACTATACCTGATTCTGGTGAATATAACTGTGAAAATCTTGAAATCAATACCACTGTTACTGCTCATCTTAAAGTGTATATTATGCCATCTTATTTGTTGGAAGGATCCATTGTTCTTGCTATCAATGGTATTCTCTTCATTCTATTCATTTATTCAATGATAAAAACATATCGAGAACAAAATATCAAAGATAGTATGCATGCTTTCTAATGGTTTATTATTTACTTGATGGGAAAGATTTCTCTCTCTGATCCTGTTTTTTACATCATCAACTTCAGTTCCTTATCCATTAGTTTTCTTTTGCGTGAATTCACTGAATAATATGATTACATGTGTTATACTATGCTTTATAATTT-A-ACATACAGTTCAATACACTCACTTGTGTTTGGTATTCATCTCTTAGATATGTTGTAAACTATATCTTTGCAAG-AAATAGCGATTCATAGA-TTTTTTGCAGTTATGAAACTCATTGTTTTGTTTTCTGCATTCTGAGATCACCTTAC-TTTTTACTCTTTTT-ACAAGGCAAATCTGTGAATATG-TGTTG-TAATGATG-TTTATTTTGATAGTT---AAATTC-TACTAAC]
[+] EMBL CD081629 [CCATATTCGGCACGAGGATTTTTTTACTGTGCCTATCGCTCGATATTTGGATGGGGCGTTAGTGTTGACACAAGTTCCCGCACTTTTGTTTAGCAAAATAACTAGTTACTTTGTGCCTACTAGTTTCTAAGAATTGTTTTCAACCTCTTTTTGAATATCATCAGTTTAAATTCGTATCGTAATTCATTCAGTTCTCTTCACAAACTTTCCATTTCTCAAATGAATCGTCCAAACTGGTTTTATACACTATATTTAACTGTTATTCAATTTATCATCTATGGAGTTTGTGAAGAGTTATCTGTTAGTCCTATCGCTCAAGCACTACGTGTTCATGAATCTGGAATTTTTGAATGTTCTTTCGAAAACTCATCCTATAATTCGGATTTAAGGTGGATATTGTTTGACGGGACAGTTCTATTAAATGGTAACACATCAGAAGATGGTCGATTTATTAATGAAGATGGTATCCTAAGAATGACTAATCTTACTATACCTGATTCTGGTGAATATAACTGTGAAAATCTTGAAATCAATACCACTGTTACTGCTCATCTTAAAGTGTATATTATGCCATCTTATTTGTTGGAAGGATCCATTGTTCTTGCTATCAATGGTATTCTCTTCATTCTATTCATTTATTCAATGATAAAAACATATCGAGAACAAAATATCAAAGATAGTATGCATGCTTTCTAATGGTTTATTATTTACTTGATGGGAAAGATTTCTCTCTCTGATCCTGTTTTTTACATCATCAACTTCAGTTCCTTATCCATTAGTTTTCTTTTGCGTGAATTCACTGAATAATATGATTACATGTGTTATACTATGCTTTATAATTT A ACATACAGTTCATTACACTCACTTGTGTTTGGTATTCATCTCTTAGATATGTTG AAACTATATCTTTGCAAG AAATAGCGATTCATAGA TTTTTTGCAGTTATGAAACTCATTGTTTTGTTTTCTGCATTCTGAGATCACCTTAC TTTTTACTCTTTTT ACCAGGCCAATCTGNGATAATG TGNTG TAATGATG TTTATTCTGATAGTT AAATTC TACT ]
[+] EMBL CD080168 [ TTTTACTGTGCCTATCGCTCGATATTTGGATGGGGCGTTAGTGTTGACACAAGTTCCCGCACTTTTGTTTAGCAAAATAACTAGTTACTTTGTGCCTACTAGTTTCTAAGAATTGTTTTCAACCTCTTTTTGAATATCATCAGTTTAAATTCGTATCGTAATTCATTCAGTTCTCTTCACAAACTTTCCATTTCTCAAATGAATCGTCCAAACTGGTTTTATACACTATATTTAACTGTTATTCAATTTATCATCTATGGAGTTTGTGAAGAGTTATCTGTTAGTCCTATCGCTCAAGCACTACGTGTTCATGAATCTGGAATTTTTGAATGTTCTTTCGAAAACTCATCCTATAATTCGGATTTAAGGTGGATATTGTTTGACGGGACAGTTCTATTAAATGGTAACACATCAGAAGATGGTCGATTTATTAATGAAGATGGTATCCTAAGAATGACTAATCTTACTATACCTGATTCTGGTGAATATAACTGTGAAAATCTTGAAATCAATACCACTGTTACTGCTCATCTTAAAGTGTATATTATGCCATCTTATTTGTTGGAAGGATCCATTGTTCTTGCTATCAATGGTATTCTCTTCATTCTATTCATTTATTCAATGATAAAAACATATCGAGAACCAAATATCANAGATAGTATGCATGCTTTCTAATGGTTTATTATTTACTTG ]
[-] EMBL CD140967 [ GAATCGTCCAAACT GTTTTATACACTATATTTAACTGTTATTCAATTTATCATCTATGGAGTTTGTGAAGAGTTATCTGTTAGTCCTAT ]
[+] EMBL CD078975 [ GAATCTGGAATTTTTGAATGTTCTTTCGAAAACTCATCCTATAATTCGGATTTAAGGTGGATATTGTTTGACGGGACAGTTCTATTAAATGGTAACACATCAGAAGATGGTCGATTTATTAATGAAGATGGTATCCTAAGAATGACTAATCTTACTATACCTGATTCTGGTGAATATAACTGTGAAAATCTTGAAATCAATACCACTGTTACTGCTCATCTTAAAGTGTATATTATGCCATCTTATTTGTTGGAAGGATCCATTGTTCTTGCTATCAATGGTATTCTCTTCATTCTATTCATTTATTCAATGATAAAAACATATCGAGAACAAAATATCAAAGATAGTATGCATGCTTTCTAATGGTTTATTATTTACTTGATGGGAAAGATTTCTCTCTCTGATCCTGTTTTTTACATCATCAACTTCAGTTCCTTATCCATTAGTTTTCTTTTGCGTGAATTCACTGAATAATATGATTACATGTGTTATACTATGCTTTATAATTT ANACATACAGTTCAATACACTCACTTGTGTTTGGTATTCATCTCTTAGATATGTTGTANACTATATCTT ]
[+] EMBL AW018284 [ TATCCTAAGAATGACTAATCTTACTATACCTGATTCTGGTGAATATAACTGTGAAAATCTTGAAATCAATACCACTGTTACTGCTCATCTTAAAGTGTATATTATGCCATCTTATTTGTTGGAAGGATCCATTGTTCTTGCTATCAATGGTATTCTCTTCATTCTATTCATTTATTCAATGAT AAAACATTTCGGGAACAAATTTTC AAGGTATGATGCATGCTTTCAAAGGGTT ]
[-] EMBL CD075452 [ TAACTGTGAAAATCTTGAAATCAATACCACTGTTACTGCTCATCTTAAAGTGTATATTATGCCATCTTATTTGTTGGAAGGATCCATTGTTCTTGCTATCAATGGTATTCTCTTCATTCTATTCATTTATTCAATGATAAAAACATATCGAGAACAAAATATCAAAGATAGTATGCATGCTTTCTAATGGTTTATTATTTACTTGATGGGAAAGATTTCTCTCTCTGATCCTGTTTTTTACATCATCAACTTCAGTTCCTTATCCATTAGTTTTCTTTTGCGTGAATTCACTGAATAATATGATTACATGTGTTATACTATGCTTTATAATTTAA ACATACAGTTCAATACACTCACTTGTGTTTGGTATTCATCTCTTAGATATGTTGTAAACTATATCTTTGCAAGAAAATAGCGATTCATAGATTTTTTTGCAGTTATGAAACTCATTGTTTTGTTTTCTGCATTCTGAGATCACCTTACTTTTTTACTCTTTTTAACAAGGCAAATCTGTGAATATGTTGTTGTTAATGATGTTTTATTTTGATAGTTTTAAAATTCATACTAAC]
[-] EMBL CD073427 [ CTGTGAAAATCTTGAAATCAATACCACTGTTACTGCTCATCTTAAAGTGTATATTATGCCATCTTATTTGTTGGAAGGATCCATTGTTCTTGCTATCAATGGTATTCTCTTCATTCTATTCATTTATTCAATGATAAAAACATATCGAGAACAAAATATCAAAGATAGTATGCATGCTTTCTAATGGTTTATTATTTACTTGATGGGAAAGATTTCTCTCTCTGATCCTGTTTTTTACATCATCAACTTCAGTTCCTTATCCATTAGTTTTCTTTTGCGTGAATTCACTGAATAATATGATTACATGTGTTATACTATGCTTTATAATTTAA ACATACAGTTCAATACACTCACTTGTGTTTGGTATTCATCTCTTAGATATGTTGTAAACTATATCTTTGCAAGAAAATAGCGATTCATAGATTTTTTTGCAGTTATGAAACTCATTGTTTTGTTTTCTGCATTCTGAGATCACCTTACTTTTTTACTCTTTTTAACAAGGCAAATCTGTGAATATGTTGTTGTTAATGATGTTTTATTTTGATAGTTTTAAAATTCATACTAAC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||