| These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs : 
 consensusID : consensus_8555#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1651 fasta sequence 
                              [TTATCTACTCCATATTCAACGAAATTAGTTGTTTACATTACTACAAAATTAGCAAAAAAACTTTTAATGTTTGCTGACGTAATATGCATGTTGAAAAAATTAAGGTACAGAAGACAATAAAAAATGAAATGATTATCACAGACAATTGGACAACAGATAAGATGTGCACTTAATTTGAACAACAATAATAATTAGTATTATTGTTAGTATTTATTGTAATAGTCCGTAAAGGATGTTACTTCTTGAATTTCCATATAAACGACGGGTTGGTTCCACAGAATTTGATGACTTAGCAATACCGACACTTTTTGTTATTGAACAAACTTCTTGCAAAAACGTCCTTGAGTTATGAACACATGTACCGCCCAAAACAATATCAACACCCAGTGTGGAACAATTGATTTTATGCAAACTAGAAACTTCCTCATAAGTAACACCACCAATGAAAAATATAATAATTTCTTTTGGACGTTGACCACTAGGTACAGTTTTCCAACAAGTACCAGTAGCTAAGCTTGGAAATGAAGCATCAGGCAACTGACCTTTAATTAATTTGTTCAAAATTTCAACTAACAATGGTTCATGTTGTGTATAGACATTATTAACACCTTTTAATTCTTGAACTAAACGTTTTTTTAATGAAGCCATTGCTTTCGTCGCTGTCTGACTATCAACAAGTGACGTTG-TCGTTGTGTTGACACGTCCAGTCTTCATGACATGAAATAAATCAAAACCATCCGGAACAGAGATCGGCCAAG-ATATTCTAATAAATTGTCAATAGTTCGAATATCATCATCTGTTGCGCCACGTGCAACAAGTGATTGAATTAATCCACCTAATTCTTGTTTTTGCTTGCTGTAACGTAAAGCATAAAGAAGAACTAGTCTTAAAGCATCTGAGAGAAGAATCCTTGGGTCACTTATTAAACTTTTAATACGTGATATGATTGAAGAATGATTATCACGACATACCAGTTCTTGTTCTACTTCACTTATTTCTAGCAAAGCATGTTCTTTAACAATCCTAGACAATTCTGACATCAATGTTACATGTGTATCAACAGTACCGGATGTTTTACGAAAAGCAGGAAAATTTTCTAAAAATCGTTTTAAATCACCAATTGATTCTAAATTTTTGGTATCCACAGATTTAGAAGCTTTTTGGAAGTTCTCTACAAGTTGTTTAATTGACTGGCCAATATCACCAAAATTGGAAAATTGATTAGTTCGATAGAATTCATCAAATTCACGACTTAAAATAATCTCTTTTAATTCCGACTTGACCATTTGGCGCTCTAGATAAACTAACACGGTTTTGTGTAATACCAATTAACTCATGAACCATAGCTTCATATGTCCATTGTGATAGTAACGGTGTAACTGTGTCTTGTCTTCTATCTAATATAAGCAGGACAGGAACAGGTTCTGATTGCTTAAAGTCAAATATTACAGTTTCTCTTGATATAAATGACCGTATCGACTCAGCTAGTTGACGTGCAACCTCTGAAGCATTCTGGTAGCGTATAATTGGACATTTTTTTAAAGCTAATAATACGGATGTTAGGCCATCGGTTGATCGATTCAACACACCAGTTTTCAAATCTCTACTTTCATTTAGACTAATCGGTATGTCCAGCTCAAATAAAAATGGT]
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[+] EMBL CD073982             [                                                                                 ATATGCATGTTGAAAAAATTAAGGTACAGAAGACAATAAAAAATGAAATGATTATCACAGACAATTGGACAACAGATAAGATGTGCACTTAATTTGAACAACAATAATAATTAGTATTATTGTTAGTATTTATTGTAATAGTCCGTAAAGGATGTTACTTCTTGAATTTCCATATAAACGACGGGTTGGTTCCACAGAATTTGATGAATTAGCAATACCGACACTTTTTGTTATTGAACAAACTTCTTGCAAAAACGTCCTTGAGTTATGAACACATGTACCGCCCAAAACAATATCAACACCCAGTGTGGAACAATTGATTTTATGCAAACTAGAAACTTCCTCATAAGTAACACCACCAATGAAAAATATAATAATTTCTTTTGGACGTTGACCACTAGGTACAGTTTTCCAACAAGTACCAGTAGCTAAGCTTGGAAATGAAGCATCAGGCAACTGACCTTTAATTAATTTGTTCAAAATTTCAACTAACAATGGTTCATGTTGTGTATAGACATTATTAACACCTTTTAATTCTTGAACTAAACGTTTTTTTAATGAAGCCATTGCTTTCGTCGCTGTCTGACTATCAACAAGTGACGTTG TCGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD080361             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGTTGTGTATAGACATTATTAACACCTTTTAATTCTTGAACTAAACGTTTTTTTAATGAAGCCATTGCTTTCGTCGCTGTCTGACTATCAACAAGTGACGTTG TCGTTGTGTTGACACGTCCAGTCTTCATGACATGAAATAAATCAAAACCATCCGGAACAGAGATCGGCCAAGAATATTCTAATAAATTGTCAATAGTTCGAATATCATCATCTGTTGCGCCACGTGCAACAAGTGATTGAATTAATCCACCTAATTCTTGTTTTTGCTTGCTGTAACGTAAAGCATAAAGAAGAACTAGTCTTAAAGCATCTGAGAGAAGAATCCTTGGGTCACTTATTAAACTTTTAATACGTGATATGATTGAAGAATGATTATCACGACATACCAGTTCTTGTTCTACTTCACTTATTTCTAGCAAAGCATGTTCTTTAACAATCCTAGACAATTCTGACATCAATGTTACATGTGTATCAACAGTACCGGATGTTTTACGAAAAGCAGGAAAATTTTCTAAAAATCGTTTTAAATCACCAATTGATTCTAAATTTTTGGTATCCACAGATTTAGAAGCTTTTTGGAAGTTCTCTACAAGTTGTTTAATTGACTGGCCAATATCACCAAAATTGGAAAATTGATTAGTTCGATAGAATTCATCAAATTCACGACTTAAAATAATCTCTTTTAATTCCGACTTGACCATTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD079724             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATACCAGTTCTTGTTCTACTTCACTTATTTCTAGCAAAGCATGTTCTTTAACAATCCTAGACAATTCTGACATCAATGTTACATGTGTATCAACAGTACCGGATGTTTTACGAAAAGCAGGAAAATTTTCTAAAAATCGTTTTAAATCACCAATTGATTCTAAATTTTTGGTATCCACAGATTTAGAAGCTTTTTGGAAGTTCTCTACAAGTTGTTTAATTGACTGGCCAATATCACCAAAATTGGAAAATTGATTAGTTCGATAGAATTCATCAAATTCACGACTTAAAATAATCTCTTTTAATTCCGACTTGA CATTTGGCGCTCTAGATAAACTAACACGGTTTTGTGTAATACCAATTAACTCATGAACCATAGCTTCATATGTCCATTGTGATAGTAACGGTGTAACTGTGTCTTGTCTTCTATCTAATATAAGCAGGACAGGAACAGGTTCTGATTGCTTAAAGTCAAATATTACAGTTTCTCTTGATATAAATGACCGTATCGACTCAGCTAGTTGACGTGCAACCTCTGAAGCATTCTGGTAGCGTATAATTGGACATTTTTTTAAAGCTAATAATACGGATGTTAGGCCATCGGTTGATCGATTCAACACACCAGTTTTCAAATCTCTACTTTCATTTAGACTAATCGGTATGTCCAGCTCAAATAAAAATGGT]
consensusID : consensus_8555#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 1164 fasta sequence 
                              [GATTCTGAATCACGATTGTGTACATCTCAATAGCAAAAACACTATGTGCTGCGTATAGCATGTGAAAATTAGGTCAGAGGCAATAAAAATNAATGATATCCAGCATTTGGCACAGATAGATGTGCACTTATTTGACAACNAATAATATTAGTATATGTAGGGTATTTATGTAATAGTCNGTAAAGGATGTACTTTCNTGANTTTCCATATAACGACNGGGTTGGTTCCACAGAATTTGATGACTTAGCAATACNGACACTTNNTGTATTTGAACAAACTTCTTGCAAAAACGTCCTTGAGTTATGAACACATGTACCGCCCANAACNAATATCAACACCCAAGTGTGGAACAATTGATNTTATGCAAACTAGAAACTTCCTCATAAGTAACACCACCAATGAAAAATATAATAATTTCTTTTGGACGTTGACCACTAGGTACAGTTTCCAACAAGTACCAGTAGCTAAGCTTGGAAATGAAGCATCAGGCAACTGACCTTTAATTAATTTGTTCAAAATTTCAACTAACAATGGTTCATGTTGTGTATAGACATTATTAACACCTTTTAATTCTTGAACTAAACGTTTTTTTAATGAAGCCATTGCTTTCGTCGCTGTCTGACTATCAACAAGTGACGTTGTCGTTGTGTTGACACGTCCAGTCTTCATGACATGAAATAAATCAAAACCATCCGGAACAGAGATCGGCCAAGAATATTCTAATAAATTGTCAATAGTTCGAATATCATCATCTGTTGCGCCACGTGCAACAAGTGATTGAATTAATCCACCTAATTCTTGTTTTTGCTTGCTGTAACGTAAAGCATAAAGAAGAACTAGTCTTAAAGCATCTGAGAGAAGAATCCTTGGGTCACTTATTAAACTTTTAATACGTGATATGATTGAAGAATGATTATCACGACATACCAGTTCTTGTTCTACTTCACTTATTTCTAGCAAAGCATGTTCTTTAACAATCCTAGACAATTCTGACATCAATGTTACATGTGTATCAACAGTACCGGATGTTTTACGAAAAGCAGGAAAATTTTCTAAAAATCGTTTTAAATCACCAATTGATTCTAAATTTTTGGTATCCACAGATTTAGAAGCTTTTTGGAAGTTCTCTACAAGTTGTTTAATGACTCTGGTGCCGAATAAGGC]
[-] EMBL CD081803             [GATTCTGAATCACGATTGTGTACATCTCAATAGCAAAAACACTATGTGCTGCGTATAGCATGTGAAAATTAGGTCAGAGGCAATAAAAATNAATGATATCCAGCATTTGGCACAGATAGATGTGCACTTATTTGACAACNAATAATATTAGTATATGTAGGGTATTTATGTAATAGTCNGTAAAGGATGTACTTTCNTGANTTTCCATATAACGACNGGGTTGGTTCCACAGAATTTGATGACTTAGCAATACNGACACTTNNTGTATTTGAACAAACTTCTTGCAAAAACGTCCTTGAGTTATGAACACATGTACCGCCCANAACNAATATCAACACCCAAGTGTGGAACAATTGATNTTATGCAAACTAGAAACTTCCTCATAAGTAACACCACCAATGAAAAATATAATAATTTCTTTTGGACGTTGACCACTAGGTACAGTTTCCAACAAGTACCAGTAGCTAAGCTTGGAAATGAAGCATCAGGCAACTGACCTTTAATTAATTTGTTCAAAATTTCAACTAACAATGGTTCATGTTGTGTATAGACATTATTAACACCTTTTAATTCTTGAACTAAACGTTTTTTTAATGAAGCCATTGCTTTCGTCGCTGTCTGACTATCAACAAGTGACGTTGTCGTTGTGTTGACACGTCCAGTCTTCATGACATGAAATAAATCAAAACCATCCGGAACAGAGATCGGCCAAGAATATTCTAATAAATTGTCAATAGTTCGAATATCATCATCTGTTGCGCCACGTGCAACAAGTGATTGAATTAATCCACCTAATTCTTGTTTTTGCTTGCTGTAACGTAAAGCATAAAGAAGAACTAGTCTTAAAGCATCTGAGAGAAGAATCCTTGGGTCACTTATTAAACTTTTAATACGTGATATGATTGAAGAATGATTATCACGACATACCAGTTCTTGTTCTACTTCACTTATTTCTAGCAAAGCATGTTCTTTAACAATCCTAGACAATTCTGACATCAATGTTACATGTGTATCAACAGTACCGGATGTTTTACGAAAAGCAGGAAAATTTTCTAAAAATCGTTTTAAATCACCAATTGATTCTAAATTTTTGGTATCCACAGATTTAGAAGCTTTTTGGAAGTTCTCTACAAGTTGTTTAATGACTCTGGTGCCGAATAAGGC]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_8555#0      TTATCTACTCCATATTCAACGAAATTAGTTGTTTACATTACTACAAAATTAGCAAAAAAA 60
consensus_8555#1      ----------GATTCTGAATCA---CGATTGTGTACATCTCAA------TAGCAAAAACA 41
                                 **  * **  *      **** *****  * *      ********* *
consensus_8555#0      CTTTTAATGTTTGCTGACGTAATATGCATGTTGAAAAAATTAAGGTACAGAAGACAATAA 120
consensus_8555#1      CT------ATGTGCTG-CGTA-TA-GCATGT---GAAAATTAGGTCA---GAGGCAATAA 86
                      **       * ***** **** ** ******    ******* *  *    ** ******
consensus_8555#0      AAAATGAAATGATTATCACAGACAATTGGACAACAGATAAGATGTGCACTTAATTTGAAC 180
consensus_8555#1      AAAT--NAATGATATCCA---GCATTTGGC--ACAGATA-GATGTGCACTTA-TTTGACA 137
                      ***    ******   **    ** ****   ******* ************ *****  
consensus_8555#0      AACAATAATAATTAGTATTATTGTTAGTATTTATTGTAATAGTCCGTAAAGGATGTTACT 240
consensus_8555#1      ACNAATAATA-TTAGTAT-ATGTAGGGTATTTAT-GTAATAGTCNGTAAAGGATGTACTT 194
                      *  ******* ******* **     ******** ********* ***********   *
consensus_8555#0      TCTTGAATTTCCATATAAACGACGGGTTGGTTCCACAGAATTTGATGACTTAGCAATACC 300
consensus_8555#1      TCNTGANTTTCCATATAACGACNGGGTTGGTTCCACAGAATTTGATGACTTAGCAATACN 254
                      ** *** ***********     ************************************ 
consensus_8555#0      GACACTTTTTGTTATTGAACAAACTTCTTGCAAAAACGTCCTTGAGTTATGAACACATGT 360
consensus_8555#1      GACACTTNNTGTATTTGAACAAACTTCTTGCAAAAACGTCCTTGAGTTATGAACACATGT 314
                      *******  ***  **********************************************
consensus_8555#0      ACCGCCCAAAACAA-TATCAACACCCA-GTGTGGAACAATTGATTTTATGCAAACTAGAA 418
consensus_8555#1      ACCGCCCANAACNAATATCAACACCCAAGTGTGGAACAATTGATNTTATGCAAACTAGAA 374
                      ******** *** * ************ **************** ***************
consensus_8555#0      ACTTCCTCATAAGTAACACCACCAATGAAAAATATAATAATTTCTTTTGGACGTTGACCA 478
consensus_8555#1      ACTTCCTCATAAGTAACACCACCAATGAAAAATATAATAATTTCTTTTGGACGTTGACCA 434
                      ************************************************************
consensus_8555#0      CTAGGTACAGTTTTCCAACAAGTACCAGTAGCTAAGCTTGGAAATGAAGCATCAGGCAAC 538
consensus_8555#1      CTAGGTACAGTTT-CCAACAAGTACCAGTAGCTAAGCTTGGAAATGAAGCATCAGGCAAC 493
                      ************* **********************************************
consensus_8555#0      TGACCTTTAATTAATTTGTTCAAAATTTCAACTAACAATGGTTCATGTTGTGTATAGACA 598
consensus_8555#1      TGACCTTTAATTAATTTGTTCAAAATTTCAACTAACAATGGTTCATGTTGTGTATAGACA 553
                      ************************************************************
consensus_8555#0      TTATTAACACCTTTTAATTCTTGAACTAAACGTTTTTTTAATGAAGCCATTGCTTTCGTC 658
consensus_8555#1      TTATTAACACCTTTTAATTCTTGAACTAAACGTTTTTTTAATGAAGCCATTGCTTTCGTC 613
                      ************************************************************
consensus_8555#0      GCTGTCTGACTATCAACAAGTGACGTTGTCGTTGTGTTGACACGTCCAGTCTTCATGACA 718
consensus_8555#1      GCTGTCTGACTATCAACAAGTGACGTTGTCGTTGTGTTGACACGTCCAGTCTTCATGACA 673
                      ************************************************************
consensus_8555#0      TGAAATAAATCAAAACCATCCGGAACAGAGATCGGCCAAGA-TATTCTAATAAATTGTCA 777
consensus_8555#1      TGAAATAAATCAAAACCATCCGGAACAGAGATCGGCCAAGAATATTCTAATAAATTGTCA 733
                      ***************************************** ******************
consensus_8555#0      ATAGTTCGAATATCATCATCTGTTGCGCCACGTGCAACAAGTGATTGAATTAATCCACCT 837
consensus_8555#1      ATAGTTCGAATATCATCATCTGTTGCGCCACGTGCAACAAGTGATTGAATTAATCCACCT 793
                      ************************************************************
consensus_8555#0      AATTCTTGTTTTTGCTTGCTGTAACGTAAAGCATAAAGAAGAACTAGTCTTAAAGCATCT 897
consensus_8555#1      AATTCTTGTTTTTGCTTGCTGTAACGTAAAGCATAAAGAAGAACTAGTCTTAAAGCATCT 853
                      ************************************************************
consensus_8555#0      GAGAGAAGAATCCTTGGGTCACTTATTAAACTTTTAATACGTGATATGATTGAAGAATGA 957
consensus_8555#1      GAGAGAAGAATCCTTGGGTCACTTATTAAACTTTTAATACGTGATATGATTGAAGAATGA 913
                      ************************************************************
consensus_8555#0      TTATCACGACATACCAGTTCTTGTTCTACTTCACTTATTTCTAGCAAAGCATGTTCTTTA 1017
consensus_8555#1      TTATCACGACATACCAGTTCTTGTTCTACTTCACTTATTTCTAGCAAAGCATGTTCTTTA 973
                      ************************************************************
consensus_8555#0      ACAATCCTAGACAATTCTGACATCAATGTTACATGTGTATCAACAGTACCGGATGTTTTA 1077
consensus_8555#1      ACAATCCTAGACAATTCTGACATCAATGTTACATGTGTATCAACAGTACCGGATGTTTTA 1033
                      ************************************************************
consensus_8555#0      CGAAAAGCAGGAAAATTTTCTAAAAATCGTTTTAAATCACCAATTGATTCTAAATTTTTG 1137
consensus_8555#1      CGAAAAGCAGGAAAATTTTCTAAAAATCGTTTTAAATCACCAATTGATTCTAAATTTTTG 1093
                      ************************************************************
consensus_8555#0      GTATCCACAGATTTAGAAGCTTTTTGGAAGTTCTCTACAAGTTGTTTAATTGACTGGCCA 1197
consensus_8555#1      GTATCCACAGATTTAGAAGCTTTTTGGAAGTTCTCTACAAGTTGTTTAAT-GACT--CTG 1150
                      ************************************************** ****  *  
consensus_8555#0      ATATCACCAAAATTGGAAAATTGATTAGTTCGATAGAATTCATCAAATTCACGACTTAAA 1257
consensus_8555#1      GTGCCGAATAAGGC---------------------------------------------- 1164
                       *  *    **                                                 
consensus_8555#0      ATAATCTCTTTTAATTCCGACTTGACCATTTGGCGCTCTAGATAAACTAACACGGTTTTG 1317
consensus_8555#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  
consensus_8555#0      TGTAATACCAATTAACTCATGAACCATAGCTTCATATGTCCATTGTGATAGTAACGGTGT 1377
consensus_8555#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  
consensus_8555#0      AACTGTGTCTTGTCTTCTATCTAATATAAGCAGGACAGGAACAGGTTCTGATTGCTTAAA 1437
consensus_8555#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  
consensus_8555#0      GTCAAATATTACAGTTTCTCTTGATATAAATGACCGTATCGACTCAGCTAGTTGACGTGC 1497
consensus_8555#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  
consensus_8555#0      AACCTCTGAAGCATTCTGGTAGCGTATAATTGGACATTTTTTTAAAGCTAATAATACGGA 1557
consensus_8555#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  
consensus_8555#0      TGTTAGGCCATCGGTTGATCGATTCAACACACCAGTTTTCAAATCTCTACTTTCATTTAG 1617
consensus_8555#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  
consensus_8555#0      ACTAATCGGTATGTCCAGCTCAAATAAAAATGGT 1651
consensus_8555#1      ----------------------------------
                                                        
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||