These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8556#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1381 fasta sequence [GGCCAAGATTCGGCCGAGGAGAACAGCTGCTATATGTGTTTACCCATATCAAGTTAAAACATGTGCAGAAACTTTTAAGAAATTAAAATTACCAAATTTTAACATTGCTTCTGTTGCTACTGGTTTTCCTACTGGACAGTATCCCCTAGAAACTCGGCTATTGGAAATTAAATCAGCTATAAATGATGGAGCGAATGAAATTGATGTGGTAATAAATAGAACATTAGCTTTACAAGGCGATTGGGAAGGAGTTTATAATGAAGTATGTGCAATGCGTAAAGCTTGTGGTGATCAAACACACTTAAAGACTATTCTTGCCACTGGTGAATTAAGCAGTTATGATAATGTTTATAAGGCTTCAATGGTTTGTATGTTAGCTGGAGCAGATTTTATTAAAACTTCTACTGGCAAAGAAACAGTCAATGCAACACTCCCAGTTTCATTGGTTATGGCTAGAGCTATTCAAGATTTCAAAGAAGTATATGGCATCAAGATTGGCTTTAAACCTGCCGGTGGTCTTCGTACAGCTAAAGATGCTATCGACTATCTTCAATTAATCGATAATGTTCTCGGCTCTGATTGGACAAATCCAGATTATTTACGATTTGGAGCTAGTTCACTATTAGCCAATGTTGAAACTCGACTATACAGTCTATGCCATAATGGTTTAATGCCATTACCTGGTGAATTAGACTTCTTCTAATTTTTGGTTACTTTTTTCCCCTGTTTTCTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTCCTCTTTTTTCTT-AAAAAAAG-TCGTTTCTATTAA-TTTTTTTTTATACTGATGAACCAAAC-GTTATTTATATTTTGTACACATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTTTTTTTTTAACAAAAAAAAGAAAGAAATGACAAGGGGTTTCTATTTACGCTTATTCTCATTTGTTCCTTGTCGGTTTTCACGGAGTCCCTCCGACATCTATTCTTAGGTTTGTATGTATCACACATCGAAATAAATTAC----ATATATATATATATATATATACTTGCGGAGAAAGGTCAGAGGACGAAACAAAAGTGAAAAAAAATTAGGAAAGTAAACAAAACGATAGAACACAGTAATGGATGAATAGAAAAACAAAACAAAAAGAGAAATAAATC-C-ATAATATTTGTAAACATATTCCATAAACAAAAAATCAATAAATTTTATTACACATTATGATAATTGTATACCTTTTATTTTCTATATATTGCCTCAAAATCCTGTTTATATAGTAAATATTATTGTAAACAATCAATAATAATGA] [+] EMBL CD079522 [GGCCAAGATTCGGCCGAGGAGAACAGCTGCTATATGTGTTTACCCATATCAAGTTAAAACATGTGCAGAAACTTTTAAGAAATTAAAATTACCAAATTTTAACATTGCTTCTGTTGCTACTGGTTTTCCTACTGGACAGTATCCCCTAGAAACTCGGCTATTGGAAATTAAATCAGCTATAAATGATGGAGCGAATGAAATTGATGTGGTAATAAATAGAACATTAGCTTTACAAGGCGATTGGGAAGGAGTTTATAATGAAGTATGTGCAATGCGTAAAGCTTGTGGTGATCAAACACACTTAAAGACTATTCTTGCCACTGGTGAATTAAGCAGTTATGATAATGTTTATAAGGCTTCAATGGTTTGTATGTTAGCTGGAGCAGATTTTATTAAAACTTCTACTGGCAAAGAAACAGTCAATGCAACACTCCCAGTTTCATTGGTTATGGCTAGAGCTATTCAAGATTTCAAAGAAGTATATGGCATCAAGATTGGCTTTAAACCTGCCGGTGGTCTTCGTACAGCTAAAGATGCTATCGACTATCTTCAATTAATCGATAATGTTCTCGGCTCTGATTGGACAAATCCAGATTATTTACGATTTGGAGCTAGTTCACTATTAGCCAATGTTGAAACTCGACTATACAGTCTATGCCATAATGGTTTAATGCCATTACCTGGTGAATTAGACTTCTTCTAATTTTTGGT ] [+] EMBL CD078995 [ AAGATTGGCTTTAAACCTGCCGGTGGTCTTCGTACAGCTAAAGATGCTATCGACTATCTTCAATTAATCGATAATGTTCTCGGCTCTGATTGGACAAATCCAGATTATTTACGATTTGGAGCTAGTTCACTATTAGCCAATGTTGAAACTCGACTATACAGTCTATGCCATAATGGTTTAATGCCATTACCTGGTGAATTAGACTTCTTCTAATTTTTGGTTACTTTTTTCCCCTGTTTTCTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTCCTCTTTTTTCTT AAAAAAAG TCGTTTCTATTAA TTTTTTTTTATACTGATGAACCAAAC GTTATTTATATTTTGTACACATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTT ] [-] EMBL CD073446 [ AGATTGGCTTTAAACCTGCCGGTGGTCTTCGTACAGCTAAAGATGCTATCGACTATCTTCAATTAATCGATAATGTTCTCGGCTCTGATTGGACAAATCCAGATTATTTACGATTTGGAGCTAGTTCACTATTAGCCAATGTTGAAACTCGACTATACAGTCTATGCCATAATGGTTTAATGCCATTACCTGGTGAATTAGACTTCTTCTAATTTTTGGTTACTTTTTTCCCCTGTTTTCTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTCCTCTTTTTTCTT AAAAAAAG TCGTTTCTATTAA TTTTTTTTTATACTGATGAACCAAAC GTTATTTATATTTTGTACACATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTTT ] [-] EMBL CD073788 [ TTCCCCTGTTTTCTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTCCTCTTTTTTCTTAAAAAAAAG TCGTTTCTATTAA TTTTTTTTTATACTGATGAACCAAAC GTTATTTATATTTTGTACACATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAG TTTTTTTTTAACAAAAAAAAGAAAGAAATGACAAGGGGTTTCTATTTACGCTTATTCTCATTTGTTCCTTGTCGGTTTTCACGGAGTCCCTCCGACATCTATTCTTAGGTTTGTATGTATCACACATCGAAATAAATTAC ATATATATATATATATATATACTTGCGGAGAAAGGTCAGAGGACGAAACAAAAGTGAAAAAAAATTAGGAAAGTAAACAAAACGATAGAACACAGTAATGGATGAATAGAAAAACAAAACAAAAAGAGAAATAAATC C ATAATATTTGTAAACATATTCCATAAACAAAAAATCAATAAATTTTACTACACATTATGATAATTGTATACCTTTTATTTTCTATATATTGCCTCAAAATCCTGTTTATATAGTAAATATTATTGTAAACAATCAATAATAATGA] [-] EMBL BF936502 [ CTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTTCTCTTTTTTCTTAAAAAAAAGTTCGTCTCTATTAATTTTTTTTTTATACTGATGAACCAAACGGTTATTTATATTTTGTACACATTTTG TTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTTTTTTTTTAACAAAAAAAAGAAAGAAATGACAAGGGGTTTCTATTTACGCTTATTCTCATTTGTTCCTTGTCGGTTTTCACGGAGTCCCTCCGACATCTATTCTTAGGTTTGTATGTATCACACATCGAAATAAATTACATATATATATATATATATATATATACTTGCGGAGAAAGGTCAGAGGACGAAACGAAAGTGAAAAAAAATTAGGAAAGTAAACAAAACGATAGAACACAGTAATGGATGAATAGAAAAACAAAACAAAAAGAGAAATAAATC C ATAATATTTGTAAACATATTCCATAAACAAAAAATCAATAAATTTTATTACACATTATGATAATTGTATACCTTTTATTTTCTATATATTGCCTCAAAATCCTGTTTATATAATAAATATTATTGTAAACATTCActcgtgc ] [+] EMBL AI559033 [ CATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTTTTTTTTTAACAAAAAAAAGAAAGAAATGACAAGGGGTTTCTATTTACGCTTATTCTCATTTGTTCCTTGTCGGTTTTCACGGAGTCCCTCC ] [-] EMBL AA801607 [ AATCGCGATAATATTTGTAAACATATTCGATAAACAAAGAATCAATAAATTTTATTACACATTATGATAATTGTATACCTTTTATTTTCTATATATTGCCTCAAAATCC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||