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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8558#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1219 fasta sequence
[NCGCGGNACATTGTTTTTTTTATCTTTTTTTTACATAAATTACACTAATTATGTGTGAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGTATGTACGTTAAACAAAAAGATAAAAACCCGTGTACAACAATATTCATCTACACCTGCCACAGATCTGGAACGAAAAAACAAGGAATATGAGAAATGCAAACAGCCAAGATATATGGAATAGGTAAGTATAGATATATATAAAAGACATACACATATATACTAATACAACAGGAAAATATAAGAATGAAATACATCGATGTACTACAACATACATGTATGTATATCGATGATGAGAAGGAAAAAAAATAGTCACTTCATTGGAATCAAAGGGATTAAGTCTTCTGTTTTTTTTGTTTGGATTATATAAAAAATTAAGCTGAAAAATAGTCTAGGGTAATCGCTTTCTATTTGTGATACAACACACACACACACACACGAGATTTTTTTAATGAACGAGGGGGGGGCGGAAGGGAATTGTTCACCTTTTGTTATTGTAACCCAAACATGGTATTCAATTTCAACACATACATACATGCTAACTGAACTCTATCTAATTAGATGAACTGCATTATTCTACCACAGTTCATCTTTTTTTTTAAAAAACCTCATGTTTACTGAAATGTTTTTCTTGTAAAAATAAATTTGTTTGTTTCATAAGTGTGTGTGTGTATGTGCAATGAATGATTAATTCAATGAAGGCTATCTTTATCTTCCTACTAATGAAGTCCCTTTAAAAAAAAAGAAAAACTCGATGGGATAACGAGAATGATGAAAAAATAAGATCAAAAATTTTTGTCAAAAAAGATAGTAGAGTTTAGGGATGAGAAAAATAGCAACAATAGATCTCCCTATTCCTTCTTACATAGTAATACAAACGAGGTTGATAGGGGTAGAGTGTGTGTTTGGGGGGGGGGTAAGGACTAAAAGCATGTCAAAATAAAAAATAGAGCATCGTATGTGCAATCAATCATACACTAGAACAGTCTACCACAATGCAATAGGGTATTAAAAAATAATTTCGCCCTCGTGCCGAATTTTTGG]
[+] EMBL CD073967 [NCGCGGNACATTGTTTTTTTTATCTTTTTTTTACATAAATTACACTAATTATGTGTTAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGTATGTACGTTAAACAAAAAGATAAAAACCCGTGTACAACAATATTCATCTACACCTGCCACAGATCTGGAACGAAAAAACAAGGAATATGAGAAATGCAAACAGCCAAGATATATGGAATAGGTAAGTATAGATATATATAAAAGACATACACATATATACTAATACAACAGGAAAATATAAGAATGAAATACATCGATGTACTACAACATACATGTATGTATATCGATGATGAGAAGGAAAAAAAATAGTCACTTCATTGGAATCAAAGGGATTAAGTCTTCTGTTTTTTTTGTTTGGATTATATAAAAAATTAAGCTGAAAAATAGTCTAGGGTAATCGCTTTCTATTTGTGATACAACACACACACACACACACGAGATTTTTTTAATGAACGAGGGGGGGGCGGAAGGGAATTGTTCACCTTTTGTTATTGTAACCCAAACATGGTATTCAATTTCAACACATACATACATGCTAACTGAACTCT ]
[+] EMBL CD075577 [ ACACTAATTATGTGTGAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATG ]
[+] EMBL CD074234 [ ACACTAATTATGTGTTAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATG ]
[-] EMBL CD080314 [ CACTAATTATGTGTGAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGT ]
[-] EMBL CD081864 [ CACTAATTATGTGTGAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTTTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGT ]
[+] EMBL AI067849 [ TGTGTGAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGTATGTACGTTAAACAAAAAGATAAAAACCCGTGTACAACAATATTCATCTACACCTGCCACAGATCTGGAACGAAAAAACAAGGAATATGAGAAATGCAAACAGCCAAGATATATGGAATAGGTAAGTATAGATATATATAAAAGACATACACATATATACTAATACAACAGGAAAATATAAGAATGAAATACATCGATGTACTACAACATACATGTATGTATATCGATGATGAGAAGG ]
[-] EMBL CD079709 [ TTNTGTNTGGATTATATAAAAAATTAAGCTGAAAAATAGTCTAGGGTAATCGCTTTCTATTTGTGATACAACACACACACACACACACGAGATTTTTTTAATGAACGAGGGGGGGGCGGAAGGGAATTGTTCACCTTTTGTTATTGTAACCCAAACATGGTATTCAATTTCAACACATACATACATGCTAACTGAACTCTATCTAATTAGATGAACTGCATTATTCTACCACAGTTCATCTTTTTTTTTAAAAAACCTCATGTTTACTGAAATGTTTTTCTTGTAAAAATAAATTTGTTTGTTTCATAAGTGTGTGTGTGTATGTGCAATGAATGATTAATTCAATGAAGGCTATCTTTATCTTCCTACTAATGAAGTCCCTTTAAAAAAAAAGAAAAACTCGATGGGATAACGAGAATGATGAAAAAATAAGATCAAAAATTTTTGTCAAAAAAGATAGTAGAGTTTAGGGATGAGAAAAATAGCAACAATAGATCTCCCTATTCCTTCTTACATAGTAATACAAACGAGGTTGATAGGGGTAGAGTGTGTGTTTGGGGGGGGGGTAAGGACTAAAAGCATGTCAAAATAAAAAATAGAGCATCGTATGTGCAATCAATCATACACTAGAACAGTCTACCACAATGCAATAGGGTATTAAAAAATAATTTCGCCCTCGTGCCGAATTTTTGG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||