These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8558#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1219 fasta sequence [NCGCGGNACATTGTTTTTTTTATCTTTTTTTTACATAAATTACACTAATTATGTGTGAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGTATGTACGTTAAACAAAAAGATAAAAACCCGTGTACAACAATATTCATCTACACCTGCCACAGATCTGGAACGAAAAAACAAGGAATATGAGAAATGCAAACAGCCAAGATATATGGAATAGGTAAGTATAGATATATATAAAAGACATACACATATATACTAATACAACAGGAAAATATAAGAATGAAATACATCGATGTACTACAACATACATGTATGTATATCGATGATGAGAAGGAAAAAAAATAGTCACTTCATTGGAATCAAAGGGATTAAGTCTTCTGTTTTTTTTGTTTGGATTATATAAAAAATTAAGCTGAAAAATAGTCTAGGGTAATCGCTTTCTATTTGTGATACAACACACACACACACACACGAGATTTTTTTAATGAACGAGGGGGGGGCGGAAGGGAATTGTTCACCTTTTGTTATTGTAACCCAAACATGGTATTCAATTTCAACACATACATACATGCTAACTGAACTCTATCTAATTAGATGAACTGCATTATTCTACCACAGTTCATCTTTTTTTTTAAAAAACCTCATGTTTACTGAAATGTTTTTCTTGTAAAAATAAATTTGTTTGTTTCATAAGTGTGTGTGTGTATGTGCAATGAATGATTAATTCAATGAAGGCTATCTTTATCTTCCTACTAATGAAGTCCCTTTAAAAAAAAAGAAAAACTCGATGGGATAACGAGAATGATGAAAAAATAAGATCAAAAATTTTTGTCAAAAAAGATAGTAGAGTTTAGGGATGAGAAAAATAGCAACAATAGATCTCCCTATTCCTTCTTACATAGTAATACAAACGAGGTTGATAGGGGTAGAGTGTGTGTTTGGGGGGGGGGTAAGGACTAAAAGCATGTCAAAATAAAAAATAGAGCATCGTATGTGCAATCAATCATACACTAGAACAGTCTACCACAATGCAATAGGGTATTAAAAAATAATTTCGCCCTCGTGCCGAATTTTTGG] [+] EMBL CD073967 [NCGCGGNACATTGTTTTTTTTATCTTTTTTTTACATAAATTACACTAATTATGTGTTAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGTATGTACGTTAAACAAAAAGATAAAAACCCGTGTACAACAATATTCATCTACACCTGCCACAGATCTGGAACGAAAAAACAAGGAATATGAGAAATGCAAACAGCCAAGATATATGGAATAGGTAAGTATAGATATATATAAAAGACATACACATATATACTAATACAACAGGAAAATATAAGAATGAAATACATCGATGTACTACAACATACATGTATGTATATCGATGATGAGAAGGAAAAAAAATAGTCACTTCATTGGAATCAAAGGGATTAAGTCTTCTGTTTTTTTTGTTTGGATTATATAAAAAATTAAGCTGAAAAATAGTCTAGGGTAATCGCTTTCTATTTGTGATACAACACACACACACACACACGAGATTTTTTTAATGAACGAGGGGGGGGCGGAAGGGAATTGTTCACCTTTTGTTATTGTAACCCAAACATGGTATTCAATTTCAACACATACATACATGCTAACTGAACTCT ] [+] EMBL CD075577 [ ACACTAATTATGTGTGAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATG ] [+] EMBL CD074234 [ ACACTAATTATGTGTTAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATG ] [-] EMBL CD080314 [ CACTAATTATGTGTGAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGT ] [-] EMBL CD081864 [ CACTAATTATGTGTGAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTTTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGT ] [+] EMBL AI067849 [ TGTGTGAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGTATGTACGTTAAACAAAAAGATAAAAACCCGTGTACAACAATATTCATCTACACCTGCCACAGATCTGGAACGAAAAAACAAGGAATATGAGAAATGCAAACAGCCAAGATATATGGAATAGGTAAGTATAGATATATATAAAAGACATACACATATATACTAATACAACAGGAAAATATAAGAATGAAATACATCGATGTACTACAACATACATGTATGTATATCGATGATGAGAAGG ] [-] EMBL CD079709 [ TTNTGTNTGGATTATATAAAAAATTAAGCTGAAAAATAGTCTAGGGTAATCGCTTTCTATTTGTGATACAACACACACACACACACACGAGATTTTTTTAATGAACGAGGGGGGGGCGGAAGGGAATTGTTCACCTTTTGTTATTGTAACCCAAACATGGTATTCAATTTCAACACATACATACATGCTAACTGAACTCTATCTAATTAGATGAACTGCATTATTCTACCACAGTTCATCTTTTTTTTTAAAAAACCTCATGTTTACTGAAATGTTTTTCTTGTAAAAATAAATTTGTTTGTTTCATAAGTGTGTGTGTGTATGTGCAATGAATGATTAATTCAATGAAGGCTATCTTTATCTTCCTACTAATGAAGTCCCTTTAAAAAAAAAGAAAAACTCGATGGGATAACGAGAATGATGAAAAAATAAGATCAAAAATTTTTGTCAAAAAAGATAGTAGAGTTTAGGGATGAGAAAAATAGCAACAATAGATCTCCCTATTCCTTCTTACATAGTAATACAAACGAGGTTGATAGGGGTAGAGTGTGTGTTTGGGGGGGGGGTAAGGACTAAAAGCATGTCAAAATAAAAAATAGAGCATCGTATGTGCAATCAATCATACACTAGAACAGTCTACCACAATGCAATAGGGTATTAAAAAATAATTTCGCCCTCGTGCCGAATTTTTGG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||