cluster # 858

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Schistosoma mansoni
cluster # 858 cluster # 858 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_858#0 length = 1063 sequences # 2

consensusID : consensus_858#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1063
fasta sequence

                              [CGGAGCCATTAATTCGGCACGCAGGCTGGAAAACGTGAAGACTTTTACCATACTTTATCCGCTTGTACGAATCGGGCATTGTTTTGGAAATGAATCAAAATTAGAAGATTGTGTTACATTCACTGATCCAAACGGAGTACCTTGTTCAAATAAGAGTTTGGGAATAGTAGTAAATTGTTCAACAGTTTTAGCTGATTTAGAACCAGATGTCAAAGCATTGGAGTCTTCAGCTTACAGTAGTATGATTCCTCTATTTCAAGCACAGTGTGCTTTAGAAGAAAATTGCTTTCCTCCGAGTGTTTATAATTTGATTAACAGAAATCGACATTTAGCATTGATGCATATGCGTCGTTTACTGCGTTTTTCTTCAATTATACACAATGTTGGAACTGATGTCTTTCGTCCACATGAACCGCCTGAACGATGGGTATGGCATGCATGCCATATGCATTATCATAGTATGAAAGTATTCTCCTATTATAAAGTCATCAATGCAAAACAACAGCTTATGGCTGTTGGTCACAAAGCTAGTTTTTGTTTAGAAGATAATGCTTGTAAAAATGGATATAAAAAACATTTTGTTTGTTCAACTACATTAGTAACACGTGGGGATCAAGGTATTAGTCCTGGATGCCAAGATAATTATTTCCACGATTATGATTGTCAATGGTTAGATATTACCGATCTAATTCCAGGTGAATATACATTTCAATTGATTNTAAATCCAGATTTCTTAGTACCTGAAATTACATACGAGAACAATGCCATAGAATGTCGTCTATCTATAGGACATACAAATCATCATTATGCTGCATTATCAAAGTGTCGTTTAGTACATCCGTATGATTTGTGAAAATTCGTAACTGCACACGGTCACATACATAAACATATCAGTTGTACTTTGAAAAAACATCTAGTACCTATGTTATACTTATATAAATTAGATACATTTATTATCATGTAATCACATCATANCATTATTTTATATGCNAAACATTGGATGATACATTATTGGTTGTATCATAAACATTNATATTTTCAGTAGACATTNAATAAAATTATA]

[+] EMBL CD081637             [CGGAGCCATTAATTCGGCACGCAGGCTGGAAAACGTGAAGACTTTTACCATACTTTATCCGCTTGTACGAATCGGGCATTGTTTTGGAAATGAATCAAAATTAGAAGATTGTGTTACATTCACTGATCCAAACGGAGTACCTTGTTCAAATAAGAGTTTGGGAATAGTAGTAAATTGTTCAACAGTTTTAGCTGATTTAGAACCAGATGTCAAAGCATTGGAGTCTTCAGCTTACAGTAGTATGATTCCTCTATTTCAAGCACAGTGTGCTTTAGAAGAAAATTGCTTTCCTCCGAGTGTTTATAATTTGATTAACAGAAATCGACATTTAGCATTGATGCATATGCGTCGTTTACTGCGTTTTTCTTCAATTATACACAATGTTGGAACTGATGTCTTTCGTCCACATGAACCGCCTGAACGATGGGTATGGCATGCATGCCATATGCATTATCATAGTATGAAAGTATTCTCCTATTATAAAGTCATCAATGCAAAACAACAGCTTATGGCTGTTGGTCACAAAGCTAGTTTTTGTTTAGAAGATAATGCTTGTAAAAATGGATATAAAAAACATTTTGTTTGTTCAACTACATTAGTAACACGTGGGGATCAAGGTATTAGTCCTGGATGCCAAGATAATTATTTCCACGATTATGATTGTCAATGGTTAGATATTACCGATCTAATTCCAGGTGAATATACATTTCAATTGATTNTAAATCCAGATTTCTTAGTACCTGAAATTACATACGAGAACAATGCCATAGAATGTCGTCTATCTATAGGACATACAAATCATCATTATGCTGCATTATCAAAGTGTCGTTTAGTACATCCGTATGATTTGTGAAAATTCGTAACTGCACACGGTCACATACATAAACATATCAGTTGTACTTTGAAAAAACATCTAGTACCTATGTTATACTTATATAAATTAGATACATTTATTATCATGTAATCACATCATANCATTATTTTATATGCNAAACATTGGATGATACATTATTGGTTGTATCATAAACATTNATATTTTCAGTAGACATTNAATAAAATTATA]
[-] EMBL CD075459             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAAAAATGGATATAAAAAACATTTTGTTTGTTCAACTACATTAGTAACACGTGGGGATCAAGGTATTAGTCCTGGATGCCAAAATAATTATTTCCCCGATTATGATTGTCAATGGTTAGATATTACCGATTTAATTCCAGGTGAATATACATTTCAATTGATTTTAAATCCAGATTTTTTAGTCCCTGAAATTACATACGAGACCAATGCCATAAAATGTCGTTTATTTATAGGACATACAAATCATCATTATGCTGCATTATCAAAGTGTCGTTTAGTACATCCGTATGATTTGTGAAAATTGGTAACTGCACCCGGTCACATACATAAACATATCAGTTGTACTTTGAAAAAACATTTAGTACCTATGTAATACTTATATAAATTAGATACATTTATTATCATGTAATCCCATCATAACATTATTTTATATGCAAAACATTGGATGATACATTATTGGTTGTATCATAAACATTTATATTTTCAGTAGACAATTAATAAAATTATA]




>consensus_858#0
CGGAGCCATTAATTCGGCACGCAGGCTGGAAAACGTGAAGACTTTTACCATACTTTATCC
GCTTGTACGAATCGGGCATTGTTTTGGAAATGAATCAAAATTAGAAGATTGTGTTACATT
CACTGATCCAAACGGAGTACCTTGTTCAAATAAGAGTTTGGGAATAGTAGTAAATTGTTC
AACAGTTTTAGCTGATTTAGAACCAGATGTCAAAGCATTGGAGTCTTCAGCTTACAGTAG
TATGATTCCTCTATTTCAAGCACAGTGTGCTTTAGAAGAAAATTGCTTTCCTCCGAGTGT
TTATAATTTGATTAACAGAAATCGACATTTAGCATTGATGCATATGCGTCGTTTACTGCG
TTTTTCTTCAATTATACACAATGTTGGAACTGATGTCTTTCGTCCACATGAACCGCCTGA
ACGATGGGTATGGCATGCATGCCATATGCATTATCATAGTATGAAAGTATTCTCCTATTA
TAAAGTCATCAATGCAAAACAACAGCTTATGGCTGTTGGTCACAAAGCTAGTTTTTGTTT
AGAAGATAATGCTTGTAAAAATGGATATAAAAAACATTTTGTTTGTTCAACTACATTAGT
AACACGTGGGGATCAAGGTATTAGTCCTGGATGCCAAGATAATTATTTCCACGATTATGA
TTGTCAATGGTTAGATATTACCGATCTAATTCCAGGTGAATATACATTTCAATTGATTNT
AAATCCAGATTTCTTAGTACCTGAAATTACATACGAGAACAATGCCATAGAATGTCGTCT
ATCTATAGGACATACAAATCATCATTATGCTGCATTATCAAAGTGTCGTTTAGTACATCC
GTATGATTTGTGAAAATTCGTAACTGCACACGGTCACATACATAAACATATCAGTTGTAC
TTTGAAAAAACATCTAGTACCTATGTTATACTTATATAAATTAGATACATTTATTATCAT
GTAATCACATCATANCATTATTTTATATGCNAAACATTGGATGATACATTATTGGTTGTA
TCATAAACATTNATATTTTCAGTAGACATTNAATAAAATTATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case