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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8581#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 649 fasta sequence
[TTAACTTTCATGATGTTTCTGACAAAACTTCTAATGAACACTGATTGGATAAAATGCTTCTTAACGTCAATTGAAGCTAGACTACCATGGAAAACTGTCTAGTGCTTTTAGGTTTTCTATGATGGTCTAGCTTCAATTGATTCATGATTTCAACTATATAAAATTACTACAAAATCTCCACAAAACCCCCTTCTGATAATAATTTCAATAGTTGAATTCATGAGTTAATTAAAGTTAGAGTACCGAAGAAAACTTGAAATCATTGAACAGCTGTTTTGTCCTAATATGGGACTCCTCAATAGTGCACAGCCATGACTACTACAATCTTCACAAAAGCACTTTGCTGATAATAAACTTAAATAGATTGAGTGTTTGACACACAATAGCACTACAATATAAAAATCTAAATGTGACTGAAGGACAGTTTCTTGGTGTTTGATGAATAAACGGTTACATGAATAAACGTTACTGTACATTGATAACAAAATAATCAATAATATGGATTTAAATAATGCGCCTTAAAGTCAATAATAGCAACTAAATAAAACTTTG-AATGATAACTAGAATGAAAG-AAGAGATACCG-AAGAACATATACCAGATATTGTAATAGTTTTGAGTAAAACTTAGTTAGACATTAACACC-GTTGGAT]
[+] EMBL CD088655 [TTAACTTTCATGATGTTTCTGACAAAACTTCTAATGAACACTGATTGGATAAAATGCTTCTTAACGTCAATTGAAGCTAGACTACCATGGAAAACTGTCTAGTGCTTTTAGGTTTTCTATGATGGTCTAGCTTCAATTGATTCATGATTTCAACTATATAAAATTACTACAAAATCTCCACAAAACCCCCTTCTGATAATAATTTCAATAGTTGAATTCATGAGTTAATTAAAGTTAGAGTACCGAAGAAAACTTGAAATCATTGAACAGCTGTTTTGTCCTAATATGGGACTCCTCAATAGTGCACAGCCATGACTACTACAATCTTCACAAAAGCACTTTGCTGATAATAAACTTAAATAGATTGAGTGTTTGACACACAATAGCACTACAATATAAAAATCTAAATGTGACTGAAGGACAGTTTCTTGGTGTTTGATGAATAAACGGTTACATGAATAAACGTTACTGTACATTGATAACAAAATAAGCCATAATATGGATTTAAATAATGCGCCTTANAGTCAATAATAGCAACTAAATAAAACTTTG AATGATAACTAGAATGAAAG AAGAGATANCG AAGAACATATACCAGATATTGTAATAGTTNTGAGTAAAACTTAGTTAGACATTAACACCNGTTGG ]
[+] EMBL CD088666 [TTAACTTTCATGATGTTTCTGACAAAACTTCTAATGAACACTGATTGGATAAAATGCTTCTTAACGTCAATTGAAGCTAGACTACCATGGAAAACTGTCTAGTGCTTTTAGGTTTTCTATGATGGTCTAGCTTCAATTGATTCATGATTTCAACTATATAAAATTACTACAAAATCTCCACAAAACCCCCTTCTGATAATAATTTCAATAGTTGAATTCATGAGTTAATTAAAGTTAGAGTACCGAAGAAAACTTGAAATCATTGAACAGCTGTTTTGTCCTAATATGGGACTCCTCAATAGTGCACAGCCATGACTACTACAATCTTCACAAAAGCACTTTGCTGATAATAAACTTAAATAGATTGAGTGTTTGACACACAATAGCACTACAATATAAAAATCTAAATGTGACTGAAGGACAGTTTCTTGGTGTTTGATGAATAAACGGTTACATGAATAAACGTTACTGTACATTGATAACAAAATAATCAATAATATGGATTTAAATAATGCGCCTTANAGTCAATAATAGCAACTAAATAAAACTTTG AATGANTACTAGAATGAAAG AAGAGATACCG AAGAACATATACCAGATATTGTAATAGTTTTGAGTAAAACTTAGTTAGACATTANCACC GTTngg ]
[+] EMBL CD088615 [TTAACTTTCATGATGTTTCTGACAAAACTTCTAATGAACACTGATTGGATAAAATGCTTCTTAACGTCAATTGAAGCTAGACTACCATGGAAAACTGTCTAGTGCTTTTAGGTTTTCTATGATGGTCTAGCTTCAATTGATTCATGATTTCAACTATATAAAATTACTACAAAATCTCCACAAAACCCCCTTCTGATAATAATTTCAATAGTTGAATTCATGAGTTAATTAAAGTTAGAGTACCGAAGAAAACTTGAAATCATTGAACAGCTGTTTTGTCCTAATATGGGACTCCTCAATAGTGCACAGCCATGACTACTACAATCTTCACAAAAGCACTTTGCTGATAATAAACTTAAATAGATTGAGTGTTTGACACACAATAGCACTACAATATAAAAATCTAAATGTGACTGAAGGACAGTTTCTTGGTGTTTGATGAATACACGGTTACATGAATAAACGTTACTGTACATTGATAACAAAATAATCAATAATATGGATTTAAATAATGCGCCTTACAGTCAATAATAGCAACTAAATAAAACTTTG AATGATAACTAGAATGACAG AAGAGATACCGCAAG ACATATACAAGATATTGTATTAGCTCTGAGTACAACTTAGTTAGACATTACCACC GTTGaa ]
[+] EMBL CD088673 [TTAACTTTCATGATGTTTCTGACAAAACTTCTAATGAACACTGATTGGATAAAATGCTTCTTAACGTCAATTGAAGCTAGACTACCATGGAAAACTGTCTAGTGCTTTTAGGTTTTCTATGATGGTCTAGCTTCAATTGATTCATGACTTCAACTATATAAAATTACTACAAAATCTCCACAAAACCCCCTTCTGATAATAATTTCAATAGTTGAATTCATGAGTTAATTAAAGTTAGAGTACCGAAGAAAACTTGAAATCATTGAACAGCTGTTTTGTCCTAATATGGGACTCCTCAATAGTGCACAGCCATGACTACTATAATCTTCACAAAAGCACTTTGCTGATAATAAACTTAAATAGATTGAGTGTTTGACACACAATAGCACTACAATATAAAAATCTAAATGTGACTGAAGGACAGTTTCTTGGTGTTTGATGAATAAACGGTTACATGAATAAACGTTACTGTACATTGATAACANAATAATCAATAATATGGATTTAAATAATGCGCCTTAAAGTCAATAATAGCAACTAAATANAACTTTG GATGATAACTAGAATGAAAGAAAGAGATA CG AAGAACATATACCAGATATTGGTATAGTTNTGAGTAAAAC TAGTTAGACATTANCACC GNTGGA ]
[+] EMBL CD088667 [TTAACTTTCATGATGTTTCTGACAAAACTTCTAATGAACACTGATTGGATAAAATGCTTCTTAACGTCAATTGAAGCTAGACTACCATGGAAAACTGTCTAGTGCTTTTAGGTTTTCTATGATGGTCCAGCTTCAATTGATTCATGATTTCAACTATATAAAATTACTACAAAATCTCCACAAAACCCCCTTCTGATAATAATTTCAATAGTTGAATTCATGAGTTAATTAAAGTCAGAGTACCGAAGAAAACTTGAAATCATTGAACAGCTGTTTTGTCCTAATATGGGACTCCTCAATAGTGCACAGCCATGACTACTACAATCTTCACAAAAGCACTTTGCTGATAATAAACTTAAATAGATTGAGTGTTTGACACACAATAGCACTACAATATAAAAATCTAAATGTGACTGAAGGACAGTTTCTTGGTGTTTGATGAATAAACGGTTACATGAATAAACGTTACTGTACATTGATAACAAAATAATCAATAATATGGATTTAAATAATGCGCCTTAAAGTCAATAATAGCAACTAAATAAAACTTTGAAATGAT ]
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[-] EMBL CD088688 [ AACTTTCATGATGTTTCTGACAAANCTTCTAATGANCACTGATTGGATAAAATGCTTCTTAACGTCAATTGAAGCTAGACTACCATGGAAAACTGTCTAGTGCTTNTAGGTTTTCTATGATGGTCTAGCTTCAATTGATTCATGATTTCAACTATATAAAATTACTACAAAATCTCCACAAAACCCCCTTCTGATAATAATTTCAATAGTTGAATTCATGAGTTAATTAAAGTTAGAGTACCGAAGAAAACTTGAAATCATTGAACAGCTGTTTTGTCCTAATATGGGACTCCTCAATAGTGCACAGCCATGACTGCTACAATCTTCACAAAAGCACTTTGCTGATAATAAACTTAAATAGATTGAGTGTTTGACACACAATAGCACTACAATATAAAAATCTAAATGTGACTGAAGGACAGTTTCTTGGTGTTTGATGAATAAACGGTTACATGAATAAACGTTACTGTACATTGATAACAAAATAATCAATAATATGGATTTAAATAATGCGCCTTAAAGTCAATAATAGCAACTAAATAAAACTTTG AATGATAACTAGAATGAAAG AAGAGATAACG AAGAACATATACAAGATATTGTAATAGTTTTGAGTAAAACTTAGTTAGACATTAACACC GTTGGAT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||