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Schistosoma mansoni
cluster # 8585 cluster # 8585       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8585#0 length = 903 sequences # 7  

consensusID : consensus_8585#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 903
fasta sequence
                              [TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTATGATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACACAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCAGAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAGATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGGAACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGA-AATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGTTTTAAGCATGTTATAATTACGCGACAAGCTTTTTAGACTGGTATGCTCATTCATATGTACTAACATTAGTATGCAGAGAAAATCAGGTAGCTTTCTTTAGAGGATTGCTAACGATATCCATTAGTGATCCCTTGAATAGTTGGATGAAGGGAGTTTTGTCTTCCTATACGGTCGATTCGTAATACAAGTTTGCGCATTTTACGGTCTGTGGGATAATGTGTTGGCCAGACAGCTTTGGATGATCTTAGAAATCGGAATTAACAGCTAAATATCTTGACACATTAGCAGAAATATCAAGCACTCGTGTTTAC]

[+] EMBL CD085099             [TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTATGATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACACAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCAGAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAGATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGGAACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTANATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGA AATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD085203             [TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTATGATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACACAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCAGAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAGATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGGAACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATACCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGGTAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGNGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGANNATGC ATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD085054             [TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTATGATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACACAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCAGAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAGATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGGAACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGGGTAGCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD085140             [TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTATGATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACACAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCAGAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAGATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGGAACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD085204             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAGTTCGAATGCCAAATCTGCTGTGCATANAACGTTANCAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGA AATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGTTTTAAGCATGTTATAATTACGCGACAAGCTTTTTAGACTGGTATGCTCATTCATATGTACTAACATTAGTATGCAGAGAAAATCAGGTAGCTTTCTTTAGAGGATTGCTAACGATATCCATTAGTGATCCCTTGAATAGTTGGATGAAGGGAGTTTTGTCTTCCTATACGGTCGATTCGTAATACAAGTTTGCGCATTTTACGGTCTGTGGGATAATGTGTTGGCCAGACAGCTTTGGATGATCTTAGAAATCGGAATTAACAGCTAAATATCTTGACACATTAGCAGAAATATCAAGCACTCGTGTTTAC]
[-] EMBL CD085206             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGA AATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGTTTTAAGCATGTTATAATTACGCGACAAGCTTTTTAGACTGGTATGCTCATTCATATGTACTAACATTAGTATGCAGAGAAAATCAGGTAGCTTTCTTTAGAGGATTGCTAACGATATCCATTAGTGATCCCTTGAATAGTTGGATGAAGGGAGTTTTGTCTTCCTATACGGTCGATTCGTAATACAAGTTTGCGCATTTTACGGTCTGTGGGATAATGTGTTGGCCAGACAGCTTTGGATGATCTTAGAAATCGGAATTAACAGCTAAATATCTTGACACATTAGCAGAAATATCAAGCACTCGTGTTTAC]
[-] EMBL CD085108             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATANAACGTNTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGATAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGA AATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGTTTTAAGCATGTTATAATTACGCGACAAGCTTTTTAGACTGGTATGCTCATTCATATGTACTAACATTAGTATGCAGAGAAAATCAGGTAGCTTTCTTTAGAGGATTGCTAACGATATCCATTAGTGATCCCTTGAATAGTTGGATGAAGGGAGTTTTGTCTTCCTATACGGTCGATTCGTAATACAAGTTTGCGCATTTTACGGTCTGTGGGATAATGTGTTGGCCAGACAGCTTTGGATGATCTTAGAAATCGGAATTAACAGCTAAATATCTTGACACATTAGCAGAAATATCAAGCACTCGTGTTTAC]


>consensus_8585#0 TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTAT GATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACA CAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCA GAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAG ATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGG AACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACG TTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATG ATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAA TCCCTATTTAAATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACT GAAATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGTTTTAAGCA TGTTATAATTACGCGACAAGCTTTTTAGACTGGTATGCTCATTCATATGTACTAACATTA GTATGCAGAGAAAATCAGGTAGCTTTCTTTAGAGGATTGCTAACGATATCCATTAGTGAT CCCTTGAATAGTTGGATGAAGGGAGTTTTGTCTTCCTATACGGTCGATTCGTAATACAAG TTTGCGCATTTTACGGTCTGTGGGATAATGTGTTGGCCAGACAGCTTTGGATGATCTTAG AAATCGGAATTAACAGCTAAATATCTTGACACATTAGCAGAAATATCAAGCACTCGTGTT TAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)