These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8585#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 903 fasta sequence [TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTATGATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACACAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCAGAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAGATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGGAACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGA-AATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGTTTTAAGCATGTTATAATTACGCGACAAGCTTTTTAGACTGGTATGCTCATTCATATGTACTAACATTAGTATGCAGAGAAAATCAGGTAGCTTTCTTTAGAGGATTGCTAACGATATCCATTAGTGATCCCTTGAATAGTTGGATGAAGGGAGTTTTGTCTTCCTATACGGTCGATTCGTAATACAAGTTTGCGCATTTTACGGTCTGTGGGATAATGTGTTGGCCAGACAGCTTTGGATGATCTTAGAAATCGGAATTAACAGCTAAATATCTTGACACATTAGCAGAAATATCAAGCACTCGTGTTTAC] [+] EMBL CD085099 [TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTATGATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACACAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCAGAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAGATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGGAACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTANATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGA AATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGT ] [+] EMBL CD085203 [TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTATGATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACACAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCAGAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAGATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGGAACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATACCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGGTAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGNGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGANNATGC ATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTT ] [+] EMBL CD085054 [TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTATGATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACACAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCAGAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAGATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGGAACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGGGTAGCG ] [+] EMBL CD085140 [TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTATGATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACACAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCAGAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAGATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGGAACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGG ] [-] EMBL CD085204 [ TAGTTCGAATGCCAAATCTGCTGTGCATANAACGTTANCAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGA AATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGTTTTAAGCATGTTATAATTACGCGACAAGCTTTTTAGACTGGTATGCTCATTCATATGTACTAACATTAGTATGCAGAGAAAATCAGGTAGCTTTCTTTAGAGGATTGCTAACGATATCCATTAGTGATCCCTTGAATAGTTGGATGAAGGGAGTTTTGTCTTCCTATACGGTCGATTCGTAATACAAGTTTGCGCATTTTACGGTCTGTGGGATAATGTGTTGGCCAGACAGCTTTGGATGATCTTAGAAATCGGAATTAACAGCTAAATATCTTGACACATTAGCAGAAATATCAAGCACTCGTGTTTAC] [-] EMBL CD085206 [ TAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGA AATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGTTTTAAGCATGTTATAATTACGCGACAAGCTTTTTAGACTGGTATGCTCATTCATATGTACTAACATTAGTATGCAGAGAAAATCAGGTAGCTTTCTTTAGAGGATTGCTAACGATATCCATTAGTGATCCCTTGAATAGTTGGATGAAGGGAGTTTTGTCTTCCTATACGGTCGATTCGTAATACAAGTTTGCGCATTTTACGGTCTGTGGGATAATGTGTTGGCCAGACAGCTTTGGATGATCTTAGAAATCGGAATTAACAGCTAAATATCTTGACACATTAGCAGAAATATCAAGCACTCGTGTTTAC] [-] EMBL CD085108 [ TTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATANAACGTNTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGATAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGA AATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGTTTTAAGCATGTTATAATTACGCGACAAGCTTTTTAGACTGGTATGCTCATTCATATGTACTAACATTAGTATGCAGAGAAAATCAGGTAGCTTTCTTTAGAGGATTGCTAACGATATCCATTAGTGATCCCTTGAATAGTTGGATGAAGGGAGTTTTGTCTTCCTATACGGTCGATTCGTAATACAAGTTTGCGCATTTTACGGTCTGTGGGATAATGTGTTGGCCAGACAGCTTTGGATGATCTTAGAAATCGGAATTAACAGCTAAATATCTTGACACATTAGCAGAAATATCAAGCACTCGTGTTTAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||