These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8587#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1089 fasta sequence [TTTTATTAACGAAAAAGGCTAAAGGAAAATAATTAGACTCAACTAAATAATATTTGGTTTCCGTGCTGTAATTTG-TTGTTTGTTTAAATGTG-TCTATATTGAATTCAGATTAAAAGTTGAAGACAGAAAAATAAAAATAGTATGTGTAGGGAGTTAGGG-TTTCAGAATATTTCTACTCTATTCGAACGAAAAATAGTGGATGATGAAGCAGTGCATCTGGAAAA-CCGAAAGAAAACATGAAATAAACATTCACAAAGAGTTTAATACAGTTGGTGCATGAGTAACTAATTCATACTAGTTGAAAGAAAGGCAGTGGTAGTAGTAGTAGTACCATTAAATTATGTGTATAGTTTGTG-TGTGTGTGATCAACGAAAATGCAAAATTAATTGATTAGAAGAAAAGAGCTGGAAAATCAACATAGCATATAACTCTATTCTAGTGATTTTCCTTATTTCTTGTCATTTTCTAATCTAGTCTCTTTTGTGTACTTGTTTGTTGTTTTACTGTTCAATTCTTTCTATTTCCACTAAAGCAGATAAGAAGGAACACAAGAAGAAACGGGATAAGTTACAAGATGGTAAGTTTAACTGATTCAAAAATTAAGCAATAAAGAAGGGTTGAGGAGGAAGAATAAAAAGATTGAGTGGATGAAAAGTAAAGCTATTGTATGATAGTATTATTTTGAGGATTTAGTTAATATGTAAGAATATCTTTTTAAAAGG-AAAAAAACGTGGTAAGGTACACAACTGCACATTATCATACATCAAAACATTAGATTTGTCAATTGAGCTAATATATTCAACAGATGTAAACTAAGTGAAGAGAATGAGTAGTAATGGTTGATTGTATTACTTAGTGATTCTAAAACAGTTTTCGTTTTGATAAAATCATATGAAATCTCTTTAGTATAAAAATGAGGATAAAATAACATTTTAATGATCATGAATTTCTTCAAGTGAATCATCCCCTTCAGTATCATGACCACTATCATCATCTTCAACTCCAAAGATGTTTTCGATTCGTTTTAATATAGATAAAACGATAGACCTCGTTTTCGTCATAGGTTTGCCATCGTTCTCTCCATCGTCG] [+] EMBL AI740426 [TTTTATTAACGAAAAAGGCTAAAGGAAAATAATTAGACTCAACTAAATAATATTTGGTTTCCGTGCTGTAATTTGTTTGTTTGTTTAAATGTG TCTATATTGAATTCAGATTAAAAGTTGAAGACAGAAAAATAAAAATAGTATGTGTAGGGAGTTAGGGTTTTCAGAATATTTCTACTCTATTCGAACGAAAAATAGTGGATGATGAAGCAGTGCATCTGGAAAAGCCGAAAGAAAACATGAAATAAACATTCACAAAGAGTTTAATACAGTTGGTGCATGAGTAACTAATTCATACTAGTTGAAAGAAAGGCAGTGGTAGTAGTAGTAGTACCATTAAATTATGTGTAAAGTTTGGGATGTGTGTGATCAACGAAAATGCAAAAT ] [-] EMBL BE431230 [ aaTTG TTGGTTGTTTAAAAGGGTTCTATAATGAATTCAGATTAAAAGGTGAAGACAGAAAAATAAAAATAGTATGTGTAGGGAGTGAGGG TTTCAGAATATTTCTACTCTATACGAACGAAAAATAGTGGATGATGAAGAAGTGAAACTGGAAAA CCGAAAGAAAACATGAAATAAACATTCACAAAGAGTTTAATACAGTTGGTGAATGAATAACTAATTCATACTAGTTGAAAGAAAGGCAGTGGTAGTAGTAGTAGTACCATTAAATTATGTGTATAGTTTGTG TGTGTGTGATCAACGAAAATGCAAAATTAATTGATTAGAAGAAAAGAGCTGGAAAATCAACATAGCATATAACTCAGTTCTAGTGATTTT ] [+] EMBL CD136853 [ AGAAAGGCAGTG GTAGTAGTAGTACCATTAAATTATGTGTATAGTTTGTG TGTGTGTGATCAACGAAAATGCAAAATTAATTGATTAGAAGAAAAGAGCTGGAAAATCAACATAGCATATAACTCTATTCTAGTGATTTTCCTTATTTCTTGTCATTTTCTAATCTAGTCTCTTTTGTGTACTTGTTTGTTGTTTTACTGTTCAATTCTTTCTATTTCCACTAAAGCAGATAAGAAGGAACACAAGAAGAAACGGGATAAGTTACAAGATGGTAAGTTTAACTGATTCAAAAATTAAGCAATAAAGAAGGGTTGAGGAGGAAGAATAAAAAGATTGAGTGGATGAAAAGTAAAGCTATTGTATGATAGTATTATTTTGAGGATTTAGTTAATATGTAA ] [-] EMBL CD134359 [ GCAGTGGTAGTAGTAGTAGTACCATTAAATTATGTGTATAGTTTGTG TGTGTGTGATCAACGAAAATGCAAAATTAATTGATTAGAAGAAAAGAGCTGGAAAATCAACATAGCATATAACTCTATTCTAGTGATTTTCCTTATTTCTTGTCATTTTCTAATCTAGTCTCTTTTGTGTACTTGTTTGTTGTTTTACTGTTCAATTCTTTCTATTTCCACTAAAGCAGATAAGAAGGAACACAAGAAGAAACGGGATAAGTTACAAGATGGTAAGTTTAACTGATTCAAAAATTAAGCAATAAAGAA ] [+] EMBL CD139852 [ TAAGAAGGAACACAAGAAGAAACGGGATAAGTTACAAGATGGTAAGTTTAACTGATTCAAAAATTAAGCAATAAAGAAGGGTTGAGGAGGAAGAATAAAAAGATTGAGTGGATGAAAAGTAAAGCTATTGTATGATAGTATTATTTTGAGGATTTAGTTAATATGTAAGAATATCTTTTTAAAAGGAAAAAAAACGTGGTAAGGTACACAACTGCACATTATC ] [+] EMBL CD113185 [ AAAGATTGAGTGGATGAAAAGTAAAGCTATTGTATGATAGTATTATTTTGAGGATTTAGTTAATATGTAAGAATATCTTTTTAAAAGG AAAAAAACGAGGTAAGGTACACAACTGCACATTATCATACATCAAAACATTAGATTTGTCAATTGAGCTAATATATTCAACAGATGTAAACTAAGTGAAGAGAATGAGTAGTAATGGTTGATTGTATTACTTAGTGATTCTAAAACAGTTTTCGTTTTGATAAAATCATATGAAATCTCTTTAGTATAAAAATGAGGATAAAATAACATTTTAATGATCATGAATTTCTTCAAGTGAATCATCCCCTTCAGTATCATGACCACTATCATCATCTTCAACTCCAAAGATGTTTTCGATTCGTTTTAATATAGATAAAACGATAGACCTCGTTTTCGTCATAGGTTTG ] [-] EMBL CD088490 [ ATGTAAGAATATCTTTTTAAAAGG AAAAAAACGTGGTAAGGTACACAACTGCACATTATCATACATCAAAACATTAGATTTGTCAATTGAGCTAATATATTCAACAGATGTAAACTAAGTGAAGAGAATGAGTAGTAATGGTTGATTGTATTACTTAGTGATTCTAAAATAGTTTTCGTTTTGATAAAATCATATGAAATCTCTTTAGTATAAAAATGAGGATAAAATAACATTTTAATGATCATGAATTTCTTCAAGTGAATCATCCTCTTCAGTATCATGACCACTATCATCATCTTCAACTCCAAAGATGTTTTCGATTCGTTTTAATATAGATAAAACGATAGACCTCGTTTTCGTCATAGGTTTGCCATCGTTCTCTCCATCGTCG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||