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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8609#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 965 fasta sequence
[GGGTATTTCGATTTGCTACCTTACTCAGCAATGTTTAGAAATCAATATGACCACGATGTTTCCATATGGAGTCCACAAGGACGAATTCATCAAATCGAATATGCTATGGAAGCTGTAAAGCAGGGCTCAGCAGCAGTCGCCTTGAAGAATCATGACTACGCCATAATTGTTGCCTTAAAGAGAGCACCATCCGAGCTCTCTTCCTACCAAGAAAAGATCATTCAAATAGATGATCATGTAGGGGTGGCAATTTCGGGTTTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCAGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCAATTTCACGTCTGCTTTCTAAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTACTCAGAGATACGGTCGACGACCTTTCGGAGTTGGTATGCTAGTTACTGGTTGTGATGCCTTGGGACCACATGTTTACTACTTGTGTCCATCCTCAAACGCATACGATTGCAAATGCATAGCCATTGGTTCTCGCTCTCAGTCAGCTCGTACTTACTTGGAACGACATTTAAATGAATTTAAAGGTTCATCTTTGGACGATTTAATTTGTCATGGATTGAAAGCTTTAAACAGCACGTTGCCAAATGAAGTCAGTTTGAACATAAAAAATTGTTCACTTGCTATAGTTGGAAAAGACATGAAATTCACAATATTTGAAGATGATGATATTGATCCATATTTGAAGTTATTCGAAGCTACTCAAGTGGATGCACCAGCTGCAGCTATCCCCGATTCTGGTCCTACTCCTATGGAACAGGATCAGTCTGCGTTGTAGCCGGTTATCTATCTATATATATGTAATTGTTTATGTGGTGATGATCTAACGATTATTCTGAGTCCTAACTTGTTTATATTTTCGATTTGTAACGACAAGTTAATAAAGCTGAGTTATGAAATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CD131985 [GGGTATTTCGATTTGCTACCTTACTCAGCAATGTTTAGAAATCAATATGACCACGATGTTTCCATATGGAGTCCACAAGGACGAATTCATCAAATCGAATATGCTATGGAAGCTGTAAAGCAGGGCTCAGCAGCAGTCGCCTTGAAGAATCATGACTACGCCATAATTGTTGCCTTAAAGAGAGCACCATCCGAGCTCTCTTCCTACCAAGAAAAGATCATTCAAATAGATGATCATGTAGGGGTGGCAATTTCGGGTTTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCAGATGGGC ]
[+] EMBL CD166264 [ TTCATCAAATCGAATATGCTATGGAAGCTGTAAAGCAGGGCTCAGCAGCAGTCGCCTTGAAGAATCATGACTACGCCATAATTGTTGCCTTAAAGAGAGCACCATCCGAGCTCTCTTCCTACCAAGAAAAGATCATTCAAATAGATGATCATGTAGGGGTGGCAATTTCGGGTTTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCAGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCAATTTCACGTCTGCTTTCTAAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTA ]
[+] EMBL CD194670 [ GCTCAGCAGCAGTCGCCTTGAAGAATCATGACTACGCCATAATTGTTGCCTTAAAGAGAGCACCATCCGAGCTCTCTTCCTACCAAGAAAAGATCATTCAAATAGATGATCATGTAGGGGTGGCAATTTCGGGTTTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCAGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCAATTTCACGTCTGCTTTCTAAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTACTCAGAGATACGGTCGACGACCTCTCGGAGTTGGTATGCTAGTTACTGGTTGTGATGCCTTGGGACCACATGTATACTACTTGTGTCCATCCTTAAACGCATACGATTGCAAATGCATAGCCCTTGGGTCT ]
[+] EMBL CD201118 [ TTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCTGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCATTTTCACGTCTGCTTTCTAAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTACTCAGAGATACGGTCGACGACCTTTCGGAGTTGGTATGCTAGTTACTGGTTGTGATGCCTTAGGACCACATGTTTACTACTTGTGTCCATCCTCAAACGCATACGATTGCAAATGCATAGCCATTGGTTCTCGCTCTCAGTCAGCTCGTACTTACTTGGAACGACATTTAAATGAATTTAAAGGTTCATCTTTGGACGATTTAATTTGTCATGGATTGAAAGCTTTA ]
[+] EMBL CD129919 [ AGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCAGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCAATTTCACGTCTGCTTTCTAAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTACTCAGAGATACGGTCGACGACCTTTCGGAGTTGGTATGCTAGTTACTGGTTGTGATGCCTTGGGACCACATGTTTACTACTTGTGTCCATCCTCAAACGCATACGATTGCAAATGCATAGCCATTGGTTCTCGCTCTCAGTCAGCTCGTACTTACTTGGAACGACATTTAAATGAATTTAAAGGTTCATCTTTGGACGATTTAATTTGTCATGGATTGAAAGCTTTAAACAGCACGTTGCCAAATGAAGTCAGTTTGAACATAAAAAATTGTTCACTTGCTATAGTTGGAAAAGACATGAAATTCACAATATTTGAAGATGATGATATTGATCCATATTTGAAGTTATTCGAAGCTACTCAAGTGGATGC ]
[-] EMBL AI394967 [ cTAAAAAATTGTTCACTTGCTATAGTTGGAAAAGACATGAAATTCACAATATTTGAAGATGATGATATTGACCCATATTTGAAGTTATTCGAAGCTACTCAAGTGGATGCACCAGCTGCAGCTATCCCCGATTCTGGTCCTACTCCTATGGAACAGGATCAGTCTGCGTTGTAGCCGGTTATCTATCTATATATATGTAATTGTTTATGTGGTGATGATCTAACGATTATTCTGAGTCCTAACTTGTTTATATTTTCGATTTGTAACGACAAGTTAATAAAGCTGAGTTATGAAATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CD093819 [ TTCTGGTCCTACTCCTATGGAACAGGATCAGTCTGCGTTGTAGCCGGTTATCTATCTATATATATGTAATTGCTTATGTGGTGATGATCTAACGATT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||