These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8612#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 680 fasta sequence [GCGGGAACATGTGATTTGATACCATGATGGATGTATTGGGTTTCAAAGTAGTGAAATCCACCTTATGATTAAACTTCTTCGTTTTGTTCTGTGGCTATCACCGTCGTCCACAGATCAAATATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACAT-GTCTT-CGAAG-CTGGTACC-TGGAAAGAACAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATTGGATGTCTTAAAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCCTGAAATAATTGCTACTTACGTTTCATATGAAAAGCGAATTCGTCAAGTGTGTATATTTTCTTTATCAAATGGAATTCTATCTTCCGGGGTTTCAGTAGAAGAACTAAATGATCAATCAGTTGATATGATGCTGACTACGA] [+] EMBL CD123977 [GCGGGAACATGTGATTTGATACCATGATGGATGTATTGGGTTTCAAGGTAGTGAAATCCACCTTATGATTAAACTTCTTCGTTTTGTTCTGTGGCTATCACCGTCGTCCACAGATCAAATATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACAT GTCTT CGAAG CTGGTACC TGGAAAGAACAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGGGTGCTATGTGGTATTCTGTGCCGGAGGTTTACAA ] [+] EMBL CD124002 [GCGGGAACATGTGACCTGATACCATGATGGATGCATTGGGATTCAAAGTAGTGAAACTCACCTCATGATTAAACTTCTTCACTTAGGTCTGAGGCTATCACCGTCGTTCACGGATCAAATATTTGCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACATAGTCTTCCCAAGCCTGGAACCTTGGAAAGAGCAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTATCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTGTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGTAAAGGATATACTAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGTACTGCTTACATAATGGCTATTGAATGTC ] [+] EMBL CD123995 [GCGGGAACATGTGATTTGATACCATGATGGATGTATTGGGTTTCAAAGTAGTGAAATCCACCTCATGATTAAACTTCTTCGTTTTGTTCTGTGGCTATCACCGTCGTCCACAGATCAAATATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACAT GTCTT CGAAG CTGGTACC TGGAAAGAACAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATTGGATGTC ] [+] EMBL CD153964 [ GGGTTTCAAAGTAGTGAAATCCACCTTATGATTAAACTTCTTCGTTTTGTTCTGTGGCTATCACCGTCGTCCACAGATCAAATATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACAT GTCTT CGAAG CTGGTACC TGGAAAGAACAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATTGGATGTCTTANAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCCTGAAATAATTGCTACTTACGTTTCATATGAAAAGCGAATTCGTCAAGTGTGTATATTTTCTTTAT ] [+] EMBL CD165559 [ TATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACAT GTCTT CGAAG CTGGTACC TGGAAAGAACAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATCGGATGTCTTAAAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCCTGAACTAATTGCTACTTACGTTTCATATGACAAGCGAATTCGTCAAGTG ] [+] EMBL CD094116 [ GTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATTGGATGTCTTAAAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCCTGAAATAATTGCTACTTACGTTTCATATGAAAAGCGAATTCGTCAAGTGTGTATATTTTCTTTATCAAATGGAATTCTATCTTCCGGGGTTTCAGTAGAAGAACTAAATGATCAATCAGTTGATATGATGCTGACTACGA] [-] EMBL CD195519 [ TTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATTGGATGTCTTAAAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCCTGAAATAATTGCTACTTACGTTTCATATGAAAAGCGAATTCGTCAAGTGTGTATATTTTCTTTATCAAATGGAATTCTATCTTCCGGGGTTTCAGTAGAAGAACTAAATGATCAATCAGT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||