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Schistosoma mansoni
cluster # 8626 cluster # 8626       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8626#0 length = 1204 sequences # 7  

consensusID : consensus_8626#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1204
fasta sequence
                              [GATTTGGACTATGTTAACCAACGAAATGAGTTCATTGTTCGTGCTGATAAAGATCCGTTACTTCAAGAAATAAGGAATAAACTAGACAATTTGGAGGAAAGAATTCGAGATGAATTTAGACGTTGTGCAAAAATACTGAACTTGGAACAGAATAAATCTATCAAGTTGGAAAGCAATGAGTTACATGGATATTTTATGCGTGTCACACTCAAGGATGAAAAATGTTTAAGAGGACTGAAAACATTTGAAATTTTGGACACACAAAAAGGTGGTGTACGTTTTCGTAATAAACAAATGACTTCATTAACTGAAACTTATGCCGAAGTGAAACAAGAATATAATGGATTACAAGAAGTGGTTGTGCATCAAGTTGTCTGTGCCGCAGCTACTTATCTGGAGCCTATTAATCAATTGAATGAAACCACTGCGTTCTTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGTGTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAAGCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACATCTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTTGGTCCGGCTGATTATCAATCCTCGTGATGTATCTACATTTCTAGCAGAAATGCTTGAAACTTCATCTGTTTTACGATCGGTCACACGAAATTCACTTGTCATTATCGATGAATTAGGACGTGGCACATCAACATATGATGGATTTGGACTAGCATGGGCGGTTGCCTCATTTTTAGCTAGTCCTGAAGTTGGTTGTTTCGGTTTATTTGCCACACATTTTCATGAATTAACCAGTTTAGCATATTATATGCCCAAACGTGTAGCTAATCTACGAGTTTTATGCAATGTATCAAACGACAAGGAAATCGTTGAAAATAAAGAATCTGAAACAAAAGTTACTATGTTATATAAAGTTGAGGCTGGCGTATGCAGTCGTAGTTATGGTCTAGACGTTGCTCGTCTTGCAGGGCTACCGATAGAAGTAATTAAACAAGCT]

[-] EMBL CD091279             [GATTTGGACTATGTTAACCAACGAAATGAGTTCATTGTTCGTGCTGATAAAGATCCGTTACTTCAAGAAATAAGGAATAAACTAGACAATTTGGAGGAAAGAATTCGAGATGAATTTAGACGTTGTGCAAAAATACTGAACTTGGAACAGAATAAATCTATCAAGTTGGAAAGCAATGAGTTACATGGATATTTTATGCGTGTCACACTCAAGGATGAAAAATGTTTAAGAGGACTGAAAACATTTGAAATTTTGGACACACAAAAAGGTGGTGTACGTTTTCGTAATAAACAAATGACTTCATTAACTGAAACTTATGCCGAAGTGAAACAAGAATATAATGGATTACAAGAAGTGGTTGTGCATCAAGTTGTCTGTGCCGCAGCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD060227             [                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAAACAAATGACTTCATTAACTGAAACTTATGCCGAAGTGAAACAAGAATATAATGGATTACAAGAAGTGGTTGTGCATCAAGTTGTCTGTGCCGCAGCTACTTATCTGGAGCCTATTAATCAATTGAATGAAACCACTGCGTTCTTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGTGTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAAGCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACATCTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTTGGTCCGGCTGATTATCAATCCTCGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD060226             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTAACTGAAACTTATGCCGAAGTGAAACAAGAATATAATGGATTACAAGAAGTGGTTGTGCATCAAGTTGTCTGTGCCGCAGCTACTTATCTGGAGCCTATTAATCAATTGAATGAAACCACTGCGTTCTTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGTGTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAAGCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACATCTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTTGGTCCGGCTGATGATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD182318             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGTGTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAAGCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACATCTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTCCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD136496             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGTGTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAAGCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACATCTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD060225             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTT GTCCGG TGATga                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD190340             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTTGGTGCGGCTGATTATCAAT GTCGTGGTGTATCTACATTTCTAGCAGAAATGCTTGAAACTTCATCTGTTTTACGATCGGTCACACGAAATTCACTTGTCATTATCGATGAATTAGGACGTGGCACATCAACATATGATGGATTTGGACTAGCATGGGCGGTTGCCTCATTTTTAGCTAGTCCTGAAGTTGGTTGTTTCGGTTTATTTGCCACACATTTTCATGAATTAACCAGTTTAGCATATTATATGCCCAAACGTGTAGCTAATCTACGAGTTTTATGCAATGTATCAAACGACAAGGAAATCGTTGAAAATAAAGAATCTGAAACAAAAGTTACTATGTTATATAAAGTTGAGGCTGGCGTATGCAGTCGTAGTTATGGTCTAGACGTTGCTCGTCTTGCAGGGCTACCGATAGAAGTAATTAAACAAGCT]


>consensus_8626#0 GATTTGGACTATGTTAACCAACGAAATGAGTTCATTGTTCGTGCTGATAAAGATCCGTTA CTTCAAGAAATAAGGAATAAACTAGACAATTTGGAGGAAAGAATTCGAGATGAATTTAGA CGTTGTGCAAAAATACTGAACTTGGAACAGAATAAATCTATCAAGTTGGAAAGCAATGAG TTACATGGATATTTTATGCGTGTCACACTCAAGGATGAAAAATGTTTAAGAGGACTGAAA ACATTTGAAATTTTGGACACACAAAAAGGTGGTGTACGTTTTCGTAATAAACAAATGACT TCATTAACTGAAACTTATGCCGAAGTGAAACAAGAATATAATGGATTACAAGAAGTGGTT GTGCATCAAGTTGTCTGTGCCGCAGCTACTTATCTGGAGCCTATTAATCAATTGAATGAA ACCACTGCGTTCTTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGT GTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAA GCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACAT CTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCA ACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCG TGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTTGGTCCGGCTGAT TATCAATCCTCGTGATGTATCTACATTTCTAGCAGAAATGCTTGAAACTTCATCTGTTTT ACGATCGGTCACACGAAATTCACTTGTCATTATCGATGAATTAGGACGTGGCACATCAAC ATATGATGGATTTGGACTAGCATGGGCGGTTGCCTCATTTTTAGCTAGTCCTGAAGTTGG TTGTTTCGGTTTATTTGCCACACATTTTCATGAATTAACCAGTTTAGCATATTATATGCC CAAACGTGTAGCTAATCTACGAGTTTTATGCAATGTATCAAACGACAAGGAAATCGTTGA AAATAAAGAATCTGAAACAAAAGTTACTATGTTATATAAAGTTGAGGCTGGCGTATGCAG TCGTAGTTATGGTCTAGACGTTGCTCGTCTTGCAGGGCTACCGATAGAAGTAATTAAACA AGCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)