These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8626#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1204 fasta sequence [GATTTGGACTATGTTAACCAACGAAATGAGTTCATTGTTCGTGCTGATAAAGATCCGTTACTTCAAGAAATAAGGAATAAACTAGACAATTTGGAGGAAAGAATTCGAGATGAATTTAGACGTTGTGCAAAAATACTGAACTTGGAACAGAATAAATCTATCAAGTTGGAAAGCAATGAGTTACATGGATATTTTATGCGTGTCACACTCAAGGATGAAAAATGTTTAAGAGGACTGAAAACATTTGAAATTTTGGACACACAAAAAGGTGGTGTACGTTTTCGTAATAAACAAATGACTTCATTAACTGAAACTTATGCCGAAGTGAAACAAGAATATAATGGATTACAAGAAGTGGTTGTGCATCAAGTTGTCTGTGCCGCAGCTACTTATCTGGAGCCTATTAATCAATTGAATGAAACCACTGCGTTCTTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGTGTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAAGCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACATCTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTTGGTCCGGCTGATTATCAATCCTCGTGATGTATCTACATTTCTAGCAGAAATGCTTGAAACTTCATCTGTTTTACGATCGGTCACACGAAATTCACTTGTCATTATCGATGAATTAGGACGTGGCACATCAACATATGATGGATTTGGACTAGCATGGGCGGTTGCCTCATTTTTAGCTAGTCCTGAAGTTGGTTGTTTCGGTTTATTTGCCACACATTTTCATGAATTAACCAGTTTAGCATATTATATGCCCAAACGTGTAGCTAATCTACGAGTTTTATGCAATGTATCAAACGACAAGGAAATCGTTGAAAATAAAGAATCTGAAACAAAAGTTACTATGTTATATAAAGTTGAGGCTGGCGTATGCAGTCGTAGTTATGGTCTAGACGTTGCTCGTCTTGCAGGGCTACCGATAGAAGTAATTAAACAAGCT] [-] EMBL CD091279 [GATTTGGACTATGTTAACCAACGAAATGAGTTCATTGTTCGTGCTGATAAAGATCCGTTACTTCAAGAAATAAGGAATAAACTAGACAATTTGGAGGAAAGAATTCGAGATGAATTTAGACGTTGTGCAAAAATACTGAACTTGGAACAGAATAAATCTATCAAGTTGGAAAGCAATGAGTTACATGGATATTTTATGCGTGTCACACTCAAGGATGAAAAATGTTTAAGAGGACTGAAAACATTTGAAATTTTGGACACACAAAAAGGTGGTGTACGTTTTCGTAATAAACAAATGACTTCATTAACTGAAACTTATGCCGAAGTGAAACAAGAATATAATGGATTACAAGAAGTGGTTGTGCATCAAGTTGTCTGTGCCGCAGCTA ] [-] EMBL CD060227 [ TAAACAAATGACTTCATTAACTGAAACTTATGCCGAAGTGAAACAAGAATATAATGGATTACAAGAAGTGGTTGTGCATCAAGTTGTCTGTGCCGCAGCTACTTATCTGGAGCCTATTAATCAATTGAATGAAACCACTGCGTTCTTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGTGTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAAGCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACATCTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTTGGTCCGGCTGATTATCAATCCTCGTGA ] [-] EMBL CD060226 [ TTAACTGAAACTTATGCCGAAGTGAAACAAGAATATAATGGATTACAAGAAGTGGTTGTGCATCAAGTTGTCTGTGCCGCAGCTACTTATCTGGAGCCTATTAATCAATTGAATGAAACCACTGCGTTCTTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGTGTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAAGCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACATCTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTTGGTCCGGCTGATGATC ] [-] EMBL CD182318 [ CTTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGTGTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAAGCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACATCTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTCCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGG ] [-] EMBL CD136496 [ TTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGTGTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAAGCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACATCTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTG ] [-] EMBL CD060225 [ AACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTT GTCCGG TGATga ] [+] EMBL CD190340 [ ACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTTGGTGCGGCTGATTATCAAT GTCGTGGTGTATCTACATTTCTAGCAGAAATGCTTGAAACTTCATCTGTTTTACGATCGGTCACACGAAATTCACTTGTCATTATCGATGAATTAGGACGTGGCACATCAACATATGATGGATTTGGACTAGCATGGGCGGTTGCCTCATTTTTAGCTAGTCCTGAAGTTGGTTGTTTCGGTTTATTTGCCACACATTTTCATGAATTAACCAGTTTAGCATATTATATGCCCAAACGTGTAGCTAATCTACGAGTTTTATGCAATGTATCAAACGACAAGGAAATCGTTGAAAATAAAGAATCTGAAACAAAAGTTACTATGTTATATAAAGTTGAGGCTGGCGTATGCAGTCGTAGTTATGGTCTAGACGTTGCTCGTCTTGCAGGGCTACCGATAGAAGTAATTAAACAAGCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||