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Schistosoma mansoni
cluster # 8633 cluster # 8633       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8633#0 length = 1481 sequences # 7  

consensusID : consensus_8633#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1481
fasta sequence
                              [TGTTTGTCGTTTTTCGAAATAGTACATTCGTCTTATCACATCAGAGATAACTCTCTCGTTCCTCCATACTCAAGTCCTCACTGGGTACCTTATGGATCAACGGTTATTGAGCCTCAGTTTGTACGCCTAACTTCCGATATAAAAAGTAGTCAAGGAGGTATTTTCAATATAAAACCTTTATTTGCTCGTGATTGGGAGGTGGTTATTTTGTTCCATGTTCATAGTCCCAAAACTCTGGTTGGTGATGGATTTGCTTTCTGGTATACTCAACATCCTCCTTCAAGTGGGCCAGCATTCGGTAGTAGAGATAAGTTCCGTGGGTTAGCCGTTTTCTTTGATACTTACGCTAATCAAAATGGTGAGCATAGTCATGAGCATCCTTATGTCAGTGCAATGATTAACGATGGATCTAAAAGCTATG-ATCATGATAAGGATGGAACTCTAA-C-TGAACTATCTGGTTGTTCATCTAATTTTCGTAATAATGACTACTCAATGGCCACAATTCGTTACGCTAATAACCAGTTGAAGGTTTCTTTGAAATATCAAGGTGCTGCAGATCCTGTAGATTGTTTCACAGTTGA-CGGAGTACGTTTACCCACTGGTTATTTTATTGGAGTTTCAGCCGCCACTGGTGACCTTTCAGATAATCACGACATATACTCTATTCATACCTATGAACTGGATGTTGGTCGAAAAGACGATCCGTTCGCTGACTTTTCTAAAATTGAACCATCAGCTGATCAGGAGGCTGCACCAAGAGCTCGAGTTGATGATACTCCACCATCGAGATTCAGCCGCGTAATCACATTATTTTCTTGGTTATTCATATTTGGACTTATTAGTGGCGGTGGATATATGGGCTATAAATACTACAAGAAGCGTCAGAGGCAAATGAAGCGATTCTATTAGTTAACAAATTTCAACTGATTATCACCGATTCCTCTTTAATTCTTTAGGAGAACTAATGGAAAACAATCTATTTTCAATAAACGGGCAGTGTATATTTACGGGTATTAGAAACTGGAGTCGTGACTACATCCTTTGTTTTTTTGAATGTTTATCTACACATTTTTTACAGATGATTTTTGTACTTGTTTTTACTACTGCTGGTCAATTAAAAGTGTTAAATATTTTTATTAACCTTATCAGTATGATGTTAGTATTTTTGTTTACCATGTCGGCCCTGATATTAGTAGTAGTAGATAATAATTTGTTAAACGATACAACGAATTGCAATATTTATTTTTGTTCAGTCCTTCTGGATCCTTATTTTTTAGGCCAGACAAACTACCCTGAAACGTTTTTTGCTGTAAAACTTTTGGTTATTCATATTTTCTTTTGTCGATAATCGTTAAACGTGTAAGAATTCAGTGTACTTTTTTCATTTTGGATATTTTCTTTACAACTATCATAAGATTTTTAATTTTTTTTTTATGGCGGTAAGAAGTTTTACATGATTGTGAAAAATAAATGTATTCATT]

[+] EMBL CD080322             [TGTTTGTCGTTTTTCGAAATAGTACATTCGTCTTATCACATCAGAGATAACTCTCTCGTTCCTCCATACTCAAGTCCTCACTGGGTACCTTATGGATCAACGGTTATTGAGCCTCAGTTTGTACGCCTAACTTCCGATATAAAAAGTAGTCAAGGAGGTATTTTCAATATAAAACCTTTATTTGCTCGTGATTGGGAGGTGGTTATTTTGTTCCATGTTCATAGTCCCAAAACTCTGGTTGGTGATGGATTTGCTTTCTGGTATACTCAACATCCTCCTTCAAGTGGGCCAGCATTCGGTAGTAGAGATAAGTTCCGTGGGTTAGCCGTTTTCTTTGATACTTACGCTAATCAAAATGGTGAGCATAGTCATGAGCATCCTTATGTCAGTGCAATGATTAACGATGGATCTAAAAGCTATG ATCATGATAAGGATGGAACTCTAA C TGAACTATCTGGTTGTTCATCTAATTTTCGTAATAATGACTACTCAATGGCCACAATTCGTTACGCTAATAACCAGTTGAAGGTTTCTTTGAAATATCAAGGTGCTGCAGATCCTGTAGATTGTTTCACAGTTGA CGGAGTACGTTTACCCACTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI976159             [                       ACATTCGTCTTATCACATCAGAGATAACTCTCTCGTTCCTCCATACTCAAGTCCTCACTGGGTACCTTATGGATCAACGGTTATTGAGCCTCAGTTTGTACGCCTAACTTCCGATATAAAAAGTAGTCAAGGAGGTATTTTCAATATAAAACCTTTATTTGCTCGTGATTGGGAGGTGGTTATTTTGTTCCATGTTCATAGTCCCAAAACTCTGGTTGGTGATGGATTTGCTTTCTGGTATACTCAACATCCTCCTTCAAGTGGGCCAGCATTCGGTAGTAGAGATAAGTTCCGTGGGTTAGCCGTTTTCTTTGATACTTACGCTAATCAAAATGGTGAGCATAGTCATGAGCATCCTTATGTCAGTGCAATGATTAACGATGGATCTAAAAGCTATG ATCATGATAAGGATGGAACTCTAA C TGAACTATCTGGTTGTTCATCTAATTTTCGTAATAATGACTACTCAATGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD114112             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cgagtGGTAGTAGAGATAAGTTCCGTGGGTTAGCCGTTTTCTTTGATACTTACGCTAATCAAAATGGTGAGCATAGTCATGAGCATCCTTATGTCAGGGCAATGATTAACGATGGATCTAAAAGCTATGTATCATGATAAGGATGGAACTCTAA C TGAACTATCTGGTTGTCCATCTAATTTTCGTAATAATGACTACTCAATGGCCACAATTCGTTACGCTAATAACCAGTTGAAGGTTTCTTTGAAATATCAAGGTGCTGCAGATCCTGTAGATTGTTTCACAGTTGA CGGAGTACGTTTACCCACTGGTTATTTTATTGGAGTTTCAGCCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD190449             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTCATGAGCATCCTTATGTCAGTGCAATGATTAACGATGGATCTAAAAGCTATG ATCATGATAAGGATGGAACTCTAA C TGAACTATCTGGTTGTTCATCTAATTTTCGTAATAATGACTACTCAATGGCCACAATTCGTTACGCTAATAACCAGTTGAAGGTTTCTTTGAAATATCAAGGTGCTGCAGATCCTGTAGATTGTTTCACAGTTGA CGGAGTACGTTTACCCACTGGTTATTTTATTGGAGTTTCAGCCGCCACTGGTGACCTTTCAGATAATCACGACATATACTCTATTCATACCTATGAACTGGATGTTGGTCGAAAAGACGATCCGTTCGCTGACTTTTCTAAAATTGAACCATCAGCTGATCAGGAGGCTGCACCAAGAGCTCGAGTTGATGATACTCCACCATCGAGATTCAGCCGCGTAATCACATTATTTTCTTGGTTATTCATATTTGGACTTATTAGTGGCGGTGGATATATGGGCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD060459             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCTAATCGTGAACTATCTGGTTGTTCATCTAATTTTCGTAATAATGACTACTCAATGGCCACAATTCGTTACGCTAATAACCAGTTGAAGGTTTCTTTGAAATATCAAGGTGCTGCAGATCCTGTAGATAGTTTCACAGTTGA CGGAGTACGTTTACCCACTGGTTATTTTATTGGAGTTTCAGCCGCCACTGGTGACCTTTCAGATAATCACGACATATACTCTATTCATACCTATGAACTGGATGTTGGTCGAAAAGACGATCCGTTCGCTGACTCTTCTAAAATTGAACCATCAGCTGATCAGGAGGCTGTACCAAGAGCTCGAGTTGATGATACTCCACCATCGAGATTCAGCCGCGTAATCACATTATTTTCTTGGTTATTCATATTTGGACTTATTAGTGGCGGTGGATATGTGGGCTATAAATACTACAAGAAGCGTCAGAGGCAAATGAAGCGATTCTATTAGTTAACAAATTTCAACTGATTATCACCGATTCGTCTTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD063763             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aagTGACCGGAGTACGTTTACCCACTGGTTATTTTATTGGAGTTTCAGCCGCCACTGGTGACCTTTCAGATAATCACGACATATACTCTATTCATACCTATGAACTGGATGTTGGTCGAAAAGACGATCCGTTCGCTGACTTTTCTAAAATTGAACCATCAGCTGATCAGGAGGCTGCACCAAGAGCTCGAGTTGATGATACTCCACCATCGAGATTCAGCCGCGTAATCACGTTATTTTCTTGGTTATTCATATTTGGACTTATTAGTGGCGGTGGATATATGGGCTATAAATACTACAGGAAGCGTCAGAGGCAAATGAAGCGATTCTATTAGTTAACAAATTTCAACTGATTATCACCGATTCCTCTTTAATTCTTTAGGAGAACTAATGGAAAACAATCTATTTTCAATAAACGGGCAGTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD074242             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAAATTTCAACTGATTATCACCGATTCCTCTTTAATTCTTTAGGAGAACTAATGGAAAACAATCTATTTTCAATAAACGGGCAGTGTATATTTACGGGTATTAGAAACTGGAGTCGTGACTACATCCTTTGTTTTTTTGAATGTTTATCTACACATTTTTTACAGATGATTTTTGTACTTGTTTTTACTACTGCTGGTCAATTAAAAGTGTTAAATATTTTTATTAACCTTATCAGTATGATGTTAGTATTTTTGTTTACCATGTCGGCCCTGATATTAGTAGTAGTAGATAATAATTTGTTAAACGATACAACGAATTGCAATATTTATTTTTGTTCAGTCCTTCTGGATCCTTATTTTTTAGGCCAGACAAACTACCCTGAAACGTTTTTTGCTGTAAAACTTTTGGTTATTCATATTTTCTTTTGTCGATAATCGTTAAACGTGTAAGAATTCAGTGTACTTTTTTCATTTTGGATATTTTCTTTACAACTATCATAAGATTTTTAATTTTTTTTTTATGGCGGTAAGAAGTTTTACATGATTGTGAAAAATAAATGTATTCATT]


>consensus_8633#0 TGTTTGTCGTTTTTCGAAATAGTACATTCGTCTTATCACATCAGAGATAACTCTCTCGTT CCTCCATACTCAAGTCCTCACTGGGTACCTTATGGATCAACGGTTATTGAGCCTCAGTTT GTACGCCTAACTTCCGATATAAAAAGTAGTCAAGGAGGTATTTTCAATATAAAACCTTTA TTTGCTCGTGATTGGGAGGTGGTTATTTTGTTCCATGTTCATAGTCCCAAAACTCTGGTT GGTGATGGATTTGCTTTCTGGTATACTCAACATCCTCCTTCAAGTGGGCCAGCATTCGGT AGTAGAGATAAGTTCCGTGGGTTAGCCGTTTTCTTTGATACTTACGCTAATCAAAATGGT GAGCATAGTCATGAGCATCCTTATGTCAGTGCAATGATTAACGATGGATCTAAAAGCTAT GATCATGATAAGGATGGAACTCTAACTGAACTATCTGGTTGTTCATCTAATTTTCGTAAT AATGACTACTCAATGGCCACAATTCGTTACGCTAATAACCAGTTGAAGGTTTCTTTGAAA TATCAAGGTGCTGCAGATCCTGTAGATTGTTTCACAGTTGACGGAGTACGTTTACCCACT GGTTATTTTATTGGAGTTTCAGCCGCCACTGGTGACCTTTCAGATAATCACGACATATAC TCTATTCATACCTATGAACTGGATGTTGGTCGAAAAGACGATCCGTTCGCTGACTTTTCT AAAATTGAACCATCAGCTGATCAGGAGGCTGCACCAAGAGCTCGAGTTGATGATACTCCA CCATCGAGATTCAGCCGCGTAATCACATTATTTTCTTGGTTATTCATATTTGGACTTATT AGTGGCGGTGGATATATGGGCTATAAATACTACAAGAAGCGTCAGAGGCAAATGAAGCGA TTCTATTAGTTAACAAATTTCAACTGATTATCACCGATTCCTCTTTAATTCTTTAGGAGA ACTAATGGAAAACAATCTATTTTCAATAAACGGGCAGTGTATATTTACGGGTATTAGAAA CTGGAGTCGTGACTACATCCTTTGTTTTTTTGAATGTTTATCTACACATTTTTTACAGAT GATTTTTGTACTTGTTTTTACTACTGCTGGTCAATTAAAAGTGTTAAATATTTTTATTAA CCTTATCAGTATGATGTTAGTATTTTTGTTTACCATGTCGGCCCTGATATTAGTAGTAGT AGATAATAATTTGTTAAACGATACAACGAATTGCAATATTTATTTTTGTTCAGTCCTTCT GGATCCTTATTTTTTAGGCCAGACAAACTACCCTGAAACGTTTTTTGCTGTAAAACTTTT GGTTATTCATATTTTCTTTTGTCGATAATCGTTAAACGTGTAAGAATTCAGTGTACTTTT TTCATTTTGGATATTTTCTTTACAACTATCATAAGATTTTTAATTTTTTTTTTATGGCGG TAAGAAGTTTTACATGATTGTGAAAAATAAATGTATTCATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)