These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8639#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 870 fasta sequence [CATTGAGCTGACACCCACAACATGCACCAGGAAAAATGAAATTGTTTTCTCCAAAAGTGGAAA-AACTGGTGAAGGGGACCTTAGAAACCAGAAGTAATATTC-CCTAGG-TAATGATCAAAAAAGACCTATTTCAGGT-GAACAACTCACTTAGTTGAAGTAATAGTCAATAAGATCAA-GGGAATACATTGATAA-GTATAAAGAGACCTTTATTTG-AATACTACTGTTATGTATAGCAATAAAAGCAGTAGTAATGGTAGTAGGGATGGAGGCATATTGTCAGTTTACAAGTATAGAGATTGTAT-TTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTTTATGCTGCCTATCCCCCCTCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAACATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTTGTTTACCATTAATAATACTTTTTCTATCATTTTGAATATTATTGAAATTCGGATGTAAACTAGGTGCACTTAAGACAAATGGGATTTTTCTTTGAACTGATAATGATTTCTGATTATCACTATTACCATTAACATTATTGTTATCATCATCATCACTATTATTATGAACATGATTATCAGTCACCATGACTGACAGAATAAAATGTTGATTTGAAATGGTGTTAATTTCATTATTCGATGAATTGGAAATTNTACATTGACTNTNTAATTNTTCATTATGCTCTTCA-TTTTTATCGGTCGTGNTGTTGTGATTGTTGTTGATGATGGTGGNAGGNACATA-GTAGTAACTTGTACAGGAACAGGTACANAACTTGTCGACGGTACTCCTGT] [-] EMBL CD091647 [CATTGAGCTGACACCCACAACATGCACCAGGAAAAATGAAATTGTTTTCTCCAAAAGTGGAAA AACTGGTGAAGGGGACCTTAGAAACCAGAAGTAATATTC CCTAGGTTAATGATCAAAAAAGACCTATTTCAGGTGGACCAATTCACTTGGTTTAAGTAATAGTCATTAAGATCAAGGGGAATACATTGATAA GTATAAAGAGACCTTAATTTG AATACTACTGTTATGTATAGCAATAAAAGCAGTAGTAATGGTAGTAGGGATGGAGGCATATTGTCAGTTTACAAGTATAGAGATTGTAT TTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTTTATGCTGCCTATCCCCCCTCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAACATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTTGTTTACCATTAATAATACTTTTTCTATCATTTTGAATATTATTGAAATTCAGATGTAAACTAGGTGCACTTAAGACAAATGGGATTTTTCTTTGAACTGATAATGATTTCTGATTATCACTATTACCATTAACATTATTGTTATCATCATCATCACTATTATTATGAACATGATTATCAGTCACCATGACTGACAGAATAAAAT ] [+] EMBL CD201828 [ TTATTTTGACGATAAATGGAAATAACTGTAGAAGGGAAACTAAAAAAACAGAAGTAATAATCGCCTAGG TAATGATCAAAAGAGAACTATTTCAGGT GAACAACTCACTTAGTTGAAGTAATAGTCAATAAGATCAA GGGAATACATTGATAA GTATAAAGAGACCTTTATTTG AATACTACTGTTATGTATAGCAATAAAAGCAGTAGTAATGGTAGTAGGGATGGAGGCATATTGTCAGTTTACAAGTATAGAGATTGTAT TTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTTTATGCTGCCTATCCCCCCTCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAATATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTTGTTTACCATTAATAATACTTTTTCT ] [-] EMBL CD066881 [ AACAACTCACTTAGTTGAAGTAATAGTCAATAAGATCAA GGGAATACATTGATAA GTATAAAGAGACCTTTATTTG AATACTACTGTTATGTATAGCAATAAAAGCAGTAGTAATGGTAGTAGGGATGGAGGCATATTGTCAGTTTACAAGTATAGAGATTGTAT TTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTTTATGCTGCCTATCCCCCCTCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAACATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTTGTTTACCATTAATAATACTTTTTCTATCATTTTGAATATTATTGAAATTCGGATGTAAACTAGGTGCACTTAAGACAAATGGGATTTTTCTTTGAACT ] [-] EMBL CD091662 [ TTGAAGTAATAGTCAATAAGATCAA GGGAATACATTGATAA GTATAAAGAGACCTTTATTTG AATACTACTGTTATGTATAGCAATAAAAGCAGTAGTAATGGTAGTAGGGATGGAGGCATATTGTCAGTTTACAAGTATAGAGATTGTAT TTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTTTATGCTGCCTATCCCCCCTCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAACATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTTGTTTACCATTAATAATACTTTTTCTATCATTTTGAATATTATTGAAATTCAGATGTAAACTAGGTGCACTTAAGACAAATGGGATTTTTCTTTGAACTGATAATGATTTCTGATTATCACTATTACCATTAACATTATTGTTATCATCATCATCACTATTATTATGAACATGATTATCAGTCACCATGACTGACAGAATAAAATGTT ] [+] EMBL CD153231 [ TCAATAAGATCAA GGGAATACATTGACAA GTATAAAGAGACCTTTATTTG AATACTACTGTTATGTATAGCAATAAAAGCAGTAGTAATGGTAGTAGGGATGGAGGCATATTGTCAGTTTACAAGTATAGAGATTGTAT TTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTTTATGCTGCCTATCCCCCCTCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAACATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTTGTTTACCATTAATAATACTTTTTCTATCATTTTGAATATTATTGAAATTCGGATGTAAACTAGGTGCACTTAAGACAAATGGGATTTTTCTTTGAACTGATAATGATTTCTGATTATCACTATTACCATTAACATTATTGTTATCATCATCATCATTATTATTATGAACATGATTATCAGTCACCATGACTGACAGAATANAATGTTGATTTGAAATGGTGTTAATTTCATTATTCGATGAATTGGAAATTNTACATTGACTNTNTAATTNTTCATTATGCTCTTCA TTTTTATCGGTCGTGNTGTTGTGATTGTTGTTGATGATGGTGGNAGGNACATA GTAGTAACTTGTACAGGAACAGGTACANAACTTGTCGACGGTACTCCTGT] [-] EMBL CD153222 [ CATTAGGATC A GGGGAT CA TGATAAGGTATAAAGAGGCCTTTAATTGAAATACTACTGGTATGTATAGCAATAAAAGCAGTAGTAATGGTAGTAGGAATGGAGGCATATGNTCAGTTTACAAGTATAGAGA TGTATNTTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTNTATGCTGCCTATCCCGCCTCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAACATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTTGTTTACCATTAATAATACTTTTTCTATCATTTTGAATATTATTGAAATTCGGATGTAAACTAGGTGCACTTAAGACAAATGGGATTTTTCTTTGAACTGATAATGATTTCTGATTATCACTATTACCATTAACATTATTGTTATCATCATCATCATTATTATTATGAACATGATTATCAGTCACCATGACTGACAGAATAAAATGTTGATTTGAAATGGTGTTAATTTCATTATTCGATGAATTGGAAATTTTACATTGACTTTTTAATTTTTCATTATGCTCTTCATTTTTTATCGGTCGTGTTGTTGTGATTGTTGTTGATGATGGTGG AGGGACATAGGTAGTAACTTGTACAGGAACAGGTACAAAACTTGTCGACGGTACTCCTG ] consensusID : consensus_8639#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! 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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||