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Schistosoma mansoni
cluster # 864 cluster # 864       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_864#0 length = 656 sequences # 2  

consensusID : consensus_864#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 656
fasta sequence
                              [AGCCATTAATTCGGCACGCAGGGCCATTATATCCGATCCATTTTCTGCATTATGGGCTAAAGAAAATTCACCACGTGCAACTCACACAAATTTTGTTTAACAAGGATGGTGGTTAAGGTAGCAGTGTGATACATATCTTTGTAAGGAACAGTATTGTAAGCCCAGGACAGAGTCGGCTGGAGATTTCTGGTGGGAGGCCTTTGCTACACGAGGGGTAACAAGCGTAAGAGATTATATAAATTATTGCAAGAAGCAATATTACATTTATTAAAACAATAGTCCATATCAAGTACATATTTATAAATCCATTAATTTTGTGCAAACTTATTCGACAGTGCTTAAACTTTTCTATTATTCAATCTGATATACCTTTATTAACATAGTTAATCACTTGATATGTGCTTAAAAATATTTATTTATGATTCTATTTTAGCTCTGCGTTTCACGGTATTTGTGTATTTCTATTGTCAATTGAATTTTGTCACCGATTTGAGAAGTCTATTCCCATCGATCAGACCAGATTTTGAAAAAAGATCCAATGATATACGAAAATAATAATGGCTACAAATAGATTAATGTTAGTTTGTAAGATAAACGGAAATTCAACAGTTAATGTCAATGGTTTGTATATTAAATCCTAATCTTTAAAAAATGGA]

[+] EMBL CD081639             [AGCCATTAATTCGGCACGCAGGGCCATTATATCCGATCCATTTTCTGCATTATGGGCTAAAGAAAATTCACCACGTGCAACTCACACAAATTTTGTTTAACAAGGATGGTGGTTAAGGTAGCAGTGTGATACATATCTTTGTAAGGAACAGTATTGTAAGCCCAGGACAGAGTCGGCTGGAGATTTCTGGTGGGAGGCCTTTGCTACACGAGGGGTAACAAGCGTAAGAGATTATATAAATTATTGCAAGAAGCAATATTACATTTATTAAAACAATAGTCCATATCAAGTACATATTTATAAATCCATTAATTTTGTGCAAACTTATTCGACAGTGCTTAAACTTTTCTATTATTCAATCTGATATACCTTTATTAACATAGTTAATCACTTGATATGTGCTTAAAAATATTTATTTATGATTCTATTTTAGCTCTGCGTTTCACGGTATTTGTGTATTTCTATTGTCAATTGAATTTTGTCACCGATTTGAGAAGTCTATTCCCATCGATCAGACCAGATTTTGAAAAAAGATCCAATGATATACGAAAATAATAATGGCTACAAATAGATTAATGTTAGTTTGTAAGATAAACGGAAATTCAACAGTTAATGTCAATGGTTTGTATATTAAATCCTAATCTTTAAAAAATGGA]
[-] EMBL CD075461             [                                                                                                        GATGGTGGTTAAGGTAGCAGTGTGATACATATCTTTGTAAGGACCAGTATTGTAAGCCCAGGACAGAGTCGGCTGGAGATTTTTGGTGGGAGGCCTTTGCTACACGAGGGGTACCAAGCGTAAGAGATTATATAAATTATTGCAAGAAGCAATATTCCATTTATTAAACCAATAGTCCATATCAAGTACATATTTATAAATCCATTAATTTTGTGCAAACTTATTCGCCAGTGCTTAAACTTTTCTATTATTCAATCTGATATCCCTTTATTAACATAGTTAATCACTTGATATGTGCTTAAAAATATTTATTTATGATTCTATTTTAGCTCTGCGTTTCCCGGTATTTGGGTATTTCTATTGTCAATTGAATTTTGTCCCCGATTTGAGAAGTCTATTCCCATCGATCAGACCAGATTTTGAAAAAAGATCCAATGATATACGAAAATAATAATGGCTACAAATAGATTAATGTTAGTTTGTAAGATAAACGGAAATTCACCAGTTAATGTCAATGGTTTGTATATTAAATCCTGATCTTTAAAAAATGGA]


>consensus_864#0 AGCCATTAATTCGGCACGCAGGGCCATTATATCCGATCCATTTTCTGCATTATGGGCTAA AGAAAATTCACCACGTGCAACTCACACAAATTTTGTTTAACAAGGATGGTGGTTAAGGTA GCAGTGTGATACATATCTTTGTAAGGAACAGTATTGTAAGCCCAGGACAGAGTCGGCTGG AGATTTCTGGTGGGAGGCCTTTGCTACACGAGGGGTAACAAGCGTAAGAGATTATATAAA TTATTGCAAGAAGCAATATTACATTTATTAAAACAATAGTCCATATCAAGTACATATTTA TAAATCCATTAATTTTGTGCAAACTTATTCGACAGTGCTTAAACTTTTCTATTATTCAAT CTGATATACCTTTATTAACATAGTTAATCACTTGATATGTGCTTAAAAATATTTATTTAT GATTCTATTTTAGCTCTGCGTTTCACGGTATTTGTGTATTTCTATTGTCAATTGAATTTT GTCACCGATTTGAGAAGTCTATTCCCATCGATCAGACCAGATTTTGAAAAAAGATCCAAT GATATACGAAAATAATAATGGCTACAAATAGATTAATGTTAGTTTGTAAGATAAACGGAA ATTCAACAGTTAATGTCAATGGTTTGTATATTAAATCCTAATCTTTAAAAAATGGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)