These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8644#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 544 fasta sequence [TCAGTCCATTTCGAAGGAATTCATCATAACCATCTTCACAGTCTACTACTCCATCACAAAACTTGTCTCTTCTAAACATTGTTGTGAACCACATGGTCGAAAACCTGGAGCACAAACTTCTTGAACGTATAGTTTTGCATAACCTTTGCTATAACCGTCTGTACACATGTAAGATATATTATGATCGAATCGA-CCAACATCTTTAACGATTAACAAAGCTCTACCACCATTCGTTCCTATTACCTCTTCTTTACCAGAA-CGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAGAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTG-TTCCAGG-ACGTG-CTTTAACC-TC-TTCAGG-AGTTAC-AGT-CAAATC-TCTTATTTTAACAATTAA-TTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAACCTTCATGATATTTTTGTACATTCATAATACTTAAAAATGATGTGGATGGTGTTGTATCAGGATTATCAATTTTAACATCATTATGTAAA] [+] EMBL CD126735 [TCAGTCCATTTCGAAGGAATTCATCATAACCATCTTCACAGTCTACTACTCCATCACAAAACTTGTCTCTTCTAAACATTGTTGTGAACCACATGGTCGAAAACCTGGAGCACAAACTTCTTGAACGTATAGTTTTGCATAACCTTTGCTATAACCGTCTGTACACATGTAAGATATATTATGATCGAATCGA CCAACATCTTTAACGATTAACAAAGCTCCACCACCATTCGTTCCTATTACCTCTTCTTTACCAGAA CGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAGAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTG TTCCAGG ACGTG CTTTAACC TC TTCAGG AGTTAC AGT CAAATC TCTTATTTTAACAATTAA TTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAACCTTCATGATATTTTTGTACATTCATAATACTTAAAAACGATGTGAATGG ] [-] EMBL CD067215 [ ctTTGTCTCTTTTAAACATTGTTGTGAACCACATGGTCGAAAACCTGGGGCACAAACTTCTTGAACGTATAGTTTTGCATAACCTTTGCTATAACCGTCTGTACACATGTAAGATATATTATGATCGAATCGA CCAACATCTTTAACGATTAACAAAGCTCTACCACCATTCGTTCCTATTACCTCTTCTTTACCAGAA CGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAGAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTG TTCCAGG ACGTG CTTTAACC TC TTCAGG AGTTAC AGT CAAATC TCTTATTTTAACAATTAA TTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAACCTTCATGATATTTTTGTACATTCATAATACTTAAAAATGATGTGGATGGTGTTGTATCAGGATTATCAATTTTAACATCATTATGTAAA] [-] EMBL CD067221 [ AGTTTTGCATAACCTTTGCTATAACCGTCTGTACACATGTAAGATATATTATGATCGAAACGA CCAACATCTTTAACGATTAACAAAGCTCTACCACCATTCGTTCCTATTACCTCTTCTTTACCAGAA CGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAAAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTG TTCCAGG ACGTG CTTTAACC TC TTCAGG AGTTAC AGT CAAATC TCTTATTTTAACAATTAA TTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAACCTTCATGATATTTTTGTACATTCATAATACTTAAAAATGATGTGGATGGTGTTGTATCAGGATTATCAATTTTAACATCATTATGTAAA] [+] EMBL CD126730 [ TGATCGAATCGATCCAACATCTTTAACGATTAACAGAGCTCTACCACCATTCGTTCCTATTACCTCTTCTTTACCAGAA CGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAGAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTG TTCCAGG ACGTG CTTTAACC TC TTCAGG AGTTAC AGT CAAATC TCTTATTTTAACAATTAA TTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAACCTTCACGATATTTTTGTACATTCATAATACTTAAAAATGATGTGAATGG ] [-] EMBL CD066993 [ CAAAGCTCTACCACCATTCGTTCGTATTACCTCTTCTTTACCAGAA CGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAGAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTG TTCCAGG ACGTG CTTTAACC TC TTCAGG AGTTAC AGT CAAATC TCTTATTTTAACAATTAA TTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAACCTTCATGATATTTTTGTACATTCATAATACTTAAAAATGATGTGGATGGTGTTGTATCAGGATTATCAATTTTAACATCATTATGTAAA] [+] EMBL CD166824 [ ACCTCTTCTTTACCAGAAGCGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAGAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTG TTCCAGG ACGTG CTTTAACC TC TTCAGG AGTTAC AGT CAAATC TCTTATTTTAACAATTAA TTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAAC ] [-] EMBL CD067412 [ AA CGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAGAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTGTTTCCAGGAACGTGCCTTTAACCTTCTTTCAGGAAGTTACAAGTNCAAATCTTCTTATTTTAACAATTAATTTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAACCTTCATGATATTTTTGTACATTCATAATACTTAAAAATGATGTGGATGGTGTTGTATCAGGATTATCAATTTTAACATCATTATGTAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||