These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8656#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1248 fasta sequence [CGTGATTTGGATACTATGAATTTTATAGAATTCTGGGGTTATGGAGGAGGAAGTGTCACTAATGTAGTAAGCACTCAATCAGATGAAGCCCAGCTACTTGAAGCCGCCACTCGATTCAAAAATCTGAGTTCGTTGTGCTTAGAGCTACGGGATGATGAACGTTTCTTAAATGCAAAACAAAGAGTTACAGTCGCCTGCCAACACTTGGATACAGCTTTACTTGACAGCATTTAGAGCAAACTTTCTTGCGGGCAATGTCGAGACAATGAAGAGCATAGCAGATGTCCTTCTTCTTTCCAAAAACTACTCTCAATGTGCTGAGATCTTGGTCGAAGAAACAGTAAAGACGATAAATCCCAACAAGATTAGTTTTAAAGATATTACAAAGTG-TTGGTTACGAGTGAAAAGCTAATAATGACCTTATTCTTAAGACCAGATTCAGTCCTGATGCAGCTAATGCATAGTCTTTTCACAACAAAATTAAAAGTATACTTGAGTAATCATATGAAGGAAGAGTTGAATGCACAGGCATTTTTAACTAATTTGTACAATGAATATCGAAACGTGGAAAAGTTAGTTGTTGAGCTATCTAATGAGTTGACTTTAATTACGGATCCAATGCAACTGTCCAAATTATTTCGGGAATTATTTGCTCCATATTTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTTGAACATTATTATCAAAGTCAAAGGCATCAAAAACGTGCACTAAATGTTTCTGGCTTGGCTGAACTTCGTCGAGACCTCCAAGCTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAATGACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGAC-AATGGCAAATTCATATTTAATTGTTTGTATCACTATCTAATTGTTGAACACGTGGATTATGGTGTTACTATANGTTTGCACGGTTTGAATATAGCCGATCCTCGAAGTAGCAATCCAAACCTAGTCTTCTTCTCAATAATTCATGAAGCCACATCCATTTTTCACTTTTTTGAGAAAACAATTGATGAATCCATTTTACCAATGATTATTACGAACCCATCATATGCAAGTGAAATCTCTGTCAAACGTAACGAATTGAAACAAGATTTGGAAGGTAAATTCTGNNNGCGGTCAGGA] [+] EMBL CD060921 [CGTGATTTGGATACTATGAATTTTATAGAATTCTGGGGTTATGGAGGAGGAAGTGTCACTAATGTAGTAAGCACTCAATCAGATGAAGCCCAGCTACTTGAAGCCGCCACTCGATTCAAAAATCTGAGTTCGTTGTGCTTAGAGCTACGGGATGATGAACGTTTCTTAAATGCAAAACAAAGAGTTACAGTCGCCTGCCAACACTTGGATACAGCTTTACTTGACAGCATTTAGAGCAAACTTTCTTGCGGGCAATGTCGAGACAATGAAGAGCATAGCAGATGTCCTTCTTCTTTCCAAAAACTACTCTCAATGTGCTGAGATCTTGGTCGAAGAAACAGTAAAGACGATAAATCCCAACAAGATTAGTTTTAAAGATATTACAAAGTG TTGGTTACGAGTGAAAAGCTAATAATGAC ] [+] EMBL CD190472 [ ATTTAGAGCAAACTTTCTTGCGGGCAATGTTGAGACAATGAAGAGCATAGCTGATGTACTTCTTCTTTCCAAAAACTACTCTCAATGTGCTGAGATCTTGGTCGAAGAAACAGTAAAGACGATAAATCCCAACAAGATTAGTTTTAAAGATATTACAAAGTGTTTGGTTTCGAGTGAAAAGCTAATAATGACCTTATTCTTAAGACCAGATTCAGTCCTGATGCAGCTAATGCATAGTCTTTTCACAACAAAATTAAAAGTATACTTGAGTAATCATATGAAGGAAGAGTTGAATGCACAGGCATTTTTAACTAATTTGTACAATGAATATCGAAACGTGGAAAAGTTAGTTGTTGAGCTATCTAATGAGTTGACTTTAATTACGGATCCAATGCAACTGTCCAAATTATTTCGGGAATTATTTGCTCCATATTTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTTGAACATTATTATCAAAGTCANAGGCATCAAAAACGTG ] [+] EMBL CD063178 [ ATTACGGATCCAATGCAACTGTCCAAATTATTTCGGGAATTATTTGCTCCATATTTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTTGAACATTATTATCAAAGTCAAAGGCATCAAAAACGTGCACTAAATGTTTCTGGCTTGGCTGAACTTCGTCGAGACCTCCAAGCTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAATGACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCg ] [+] EMBL CD139873 [ GGGAATTATTTGCTCCATATTTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTTGAACATTATTATCAAAGTCAAAGGCATCAAAAACGTGCACTAAATGTTTCTGGCTTGGCTGAACTTCGTCGAGACCTCCAAGTTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAATGACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGACAAATGGC AATTCATATTTAATTGTTTGTATCACT ] [+] EMBL CD139924 [ GGGAATTATTTGCTCCATATTTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTTGAACATTATTATCAAAGTCAAAGGCATCAAAAACGTGCACTAAATGTTTCTGGCTTGGCTGAACTTCGTCGAGACCTCCAAGCTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAATGACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGAC NATGGCAAATTCATATTTAAn ] [+] EMBL CD078822 [ GTTTCTGGCTTGGCTGAACTTCGTCGAGACCTCCAAGCTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAAGGACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGAC AATGGCAAATTCATATTTAATTGTTTGTATCACTATCTAATTGTTGAACACGTGGATTATGGTGTTACTATANGTTTGCACGGTTTGAATATAGCCGATCCTCGAAGTAGCAATCCAAACCTAGTCTTCTTCTCAATAATTCATGAAGCCACATCCATTTTTCACTTTTTTGAGAAAACAATTGATGAATCCATTTTACCAATGATTATTACGAACCCATCATATGCAAGTGAAATCTCTGTCAAACGTAACGAATTGAAACAAGATTTGGAAGGTAAATTCTGNNNGCGGTCAGGA] [-] EMBL CD139962 [ AGTCGCTGTTAATATTATGNAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGAC AATGGCAAATTCATATTTAATTGTTTGTATCACTATCTAATTGTTGAACACGTGGATTATGGTGTTACTATAGGTTTGCACGGTTTGAATATAGCCGATCCTCGAAGTAGCAATCCAAACCTAGTCTTCTTCTCAATAATTCATGAAGCCACATCCATTTTTCACTTTTTTGAGAAAACAATTGATGAATCCATTTTACCAATGATTATTACGAACCCATCATATGCAAGTGAGATCTCTGTCAAAC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||