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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8656#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1248 fasta sequence
[CGTGATTTGGATACTATGAATTTTATAGAATTCTGGGGTTATGGAGGAGGAAGTGTCACTAATGTAGTAAGCACTCAATCAGATGAAGCCCAGCTACTTGAAGCCGCCACTCGATTCAAAAATCTGAGTTCGTTGTGCTTAGAGCTACGGGATGATGAACGTTTCTTAAATGCAAAACAAAGAGTTACAGTCGCCTGCCAACACTTGGATACAGCTTTACTTGACAGCATTTAGAGCAAACTTTCTTGCGGGCAATGTCGAGACAATGAAGAGCATAGCAGATGTCCTTCTTCTTTCCAAAAACTACTCTCAATGTGCTGAGATCTTGGTCGAAGAAACAGTAAAGACGATAAATCCCAACAAGATTAGTTTTAAAGATATTACAAAGTG-TTGGTTACGAGTGAAAAGCTAATAATGACCTTATTCTTAAGACCAGATTCAGTCCTGATGCAGCTAATGCATAGTCTTTTCACAACAAAATTAAAAGTATACTTGAGTAATCATATGAAGGAAGAGTTGAATGCACAGGCATTTTTAACTAATTTGTACAATGAATATCGAAACGTGGAAAAGTTAGTTGTTGAGCTATCTAATGAGTTGACTTTAATTACGGATCCAATGCAACTGTCCAAATTATTTCGGGAATTATTTGCTCCATATTTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTTGAACATTATTATCAAAGTCAAAGGCATCAAAAACGTGCACTAAATGTTTCTGGCTTGGCTGAACTTCGTCGAGACCTCCAAGCTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAATGACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGAC-AATGGCAAATTCATATTTAATTGTTTGTATCACTATCTAATTGTTGAACACGTGGATTATGGTGTTACTATANGTTTGCACGGTTTGAATATAGCCGATCCTCGAAGTAGCAATCCAAACCTAGTCTTCTTCTCAATAATTCATGAAGCCACATCCATTTTTCACTTTTTTGAGAAAACAATTGATGAATCCATTTTACCAATGATTATTACGAACCCATCATATGCAAGTGAAATCTCTGTCAAACGTAACGAATTGAAACAAGATTTGGAAGGTAAATTCTGNNNGCGGTCAGGA]
[+] EMBL CD060921 [CGTGATTTGGATACTATGAATTTTATAGAATTCTGGGGTTATGGAGGAGGAAGTGTCACTAATGTAGTAAGCACTCAATCAGATGAAGCCCAGCTACTTGAAGCCGCCACTCGATTCAAAAATCTGAGTTCGTTGTGCTTAGAGCTACGGGATGATGAACGTTTCTTAAATGCAAAACAAAGAGTTACAGTCGCCTGCCAACACTTGGATACAGCTTTACTTGACAGCATTTAGAGCAAACTTTCTTGCGGGCAATGTCGAGACAATGAAGAGCATAGCAGATGTCCTTCTTCTTTCCAAAAACTACTCTCAATGTGCTGAGATCTTGGTCGAAGAAACAGTAAAGACGATAAATCCCAACAAGATTAGTTTTAAAGATATTACAAAGTG TTGGTTACGAGTGAAAAGCTAATAATGAC ]
[+] EMBL CD190472 [ ATTTAGAGCAAACTTTCTTGCGGGCAATGTTGAGACAATGAAGAGCATAGCTGATGTACTTCTTCTTTCCAAAAACTACTCTCAATGTGCTGAGATCTTGGTCGAAGAAACAGTAAAGACGATAAATCCCAACAAGATTAGTTTTAAAGATATTACAAAGTGTTTGGTTTCGAGTGAAAAGCTAATAATGACCTTATTCTTAAGACCAGATTCAGTCCTGATGCAGCTAATGCATAGTCTTTTCACAACAAAATTAAAAGTATACTTGAGTAATCATATGAAGGAAGAGTTGAATGCACAGGCATTTTTAACTAATTTGTACAATGAATATCGAAACGTGGAAAAGTTAGTTGTTGAGCTATCTAATGAGTTGACTTTAATTACGGATCCAATGCAACTGTCCAAATTATTTCGGGAATTATTTGCTCCATATTTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTTGAACATTATTATCAAAGTCANAGGCATCAAAAACGTG ]
[+] EMBL CD063178 [ ATTACGGATCCAATGCAACTGTCCAAATTATTTCGGGAATTATTTGCTCCATATTTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTTGAACATTATTATCAAAGTCAAAGGCATCAAAAACGTGCACTAAATGTTTCTGGCTTGGCTGAACTTCGTCGAGACCTCCAAGCTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAATGACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCg ]
[+] EMBL CD139873 [ GGGAATTATTTGCTCCATATTTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTTGAACATTATTATCAAAGTCAAAGGCATCAAAAACGTGCACTAAATGTTTCTGGCTTGGCTGAACTTCGTCGAGACCTCCAAGTTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAATGACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGACAAATGGC AATTCATATTTAATTGTTTGTATCACT ]
[+] EMBL CD139924 [ GGGAATTATTTGCTCCATATTTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTTGAACATTATTATCAAAGTCAAAGGCATCAAAAACGTGCACTAAATGTTTCTGGCTTGGCTGAACTTCGTCGAGACCTCCAAGCTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAATGACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGAC NATGGCAAATTCATATTTAAn ]
[+] EMBL CD078822 [ GTTTCTGGCTTGGCTGAACTTCGTCGAGACCTCCAAGCTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAAGGACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGAC AATGGCAAATTCATATTTAATTGTTTGTATCACTATCTAATTGTTGAACACGTGGATTATGGTGTTACTATANGTTTGCACGGTTTGAATATAGCCGATCCTCGAAGTAGCAATCCAAACCTAGTCTTCTTCTCAATAATTCATGAAGCCACATCCATTTTTCACTTTTTTGAGAAAACAATTGATGAATCCATTTTACCAATGATTATTACGAACCCATCATATGCAAGTGAAATCTCTGTCAAACGTAACGAATTGAAACAAGATTTGGAAGGTAAATTCTGNNNGCGGTCAGGA]
[-] EMBL CD139962 [ AGTCGCTGTTAATATTATGNAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGAC AATGGCAAATTCATATTTAATTGTTTGTATCACTATCTAATTGTTGAACACGTGGATTATGGTGTTACTATAGGTTTGCACGGTTTGAATATAGCCGATCCTCGAAGTAGCAATCCAAACCTAGTCTTCTTCTCAATAATTCATGAAGCCACATCCATTTTTCACTTTTTTGAGAAAACAATTGATGAATCCATTTTACCAATGATTATTACGAACCCATCATATGCAAGTGAGATCTCTGTCAAAC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||