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Schistosoma mansoni
cluster # 8656 cluster # 8656       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8656#0 length = 1248 sequences # 7  

consensusID : consensus_8656#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1248
fasta sequence
                              [CGTGATTTGGATACTATGAATTTTATAGAATTCTGGGGTTATGGAGGAGGAAGTGTCACTAATGTAGTAAGCACTCAATCAGATGAAGCCCAGCTACTTGAAGCCGCCACTCGATTCAAAAATCTGAGTTCGTTGTGCTTAGAGCTACGGGATGATGAACGTTTCTTAAATGCAAAACAAAGAGTTACAGTCGCCTGCCAACACTTGGATACAGCTTTACTTGACAGCATTTAGAGCAAACTTTCTTGCGGGCAATGTCGAGACAATGAAGAGCATAGCAGATGTCCTTCTTCTTTCCAAAAACTACTCTCAATGTGCTGAGATCTTGGTCGAAGAAACAGTAAAGACGATAAATCCCAACAAGATTAGTTTTAAAGATATTACAAAGTG-TTGGTTACGAGTGAAAAGCTAATAATGACCTTATTCTTAAGACCAGATTCAGTCCTGATGCAGCTAATGCATAGTCTTTTCACAACAAAATTAAAAGTATACTTGAGTAATCATATGAAGGAAGAGTTGAATGCACAGGCATTTTTAACTAATTTGTACAATGAATATCGAAACGTGGAAAAGTTAGTTGTTGAGCTATCTAATGAGTTGACTTTAATTACGGATCCAATGCAACTGTCCAAATTATTTCGGGAATTATTTGCTCCATATTTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTTGAACATTATTATCAAAGTCAAAGGCATCAAAAACGTGCACTAAATGTTTCTGGCTTGGCTGAACTTCGTCGAGACCTCCAAGCTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAATGACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGAC-AATGGCAAATTCATATTTAATTGTTTGTATCACTATCTAATTGTTGAACACGTGGATTATGGTGTTACTATANGTTTGCACGGTTTGAATATAGCCGATCCTCGAAGTAGCAATCCAAACCTAGTCTTCTTCTCAATAATTCATGAAGCCACATCCATTTTTCACTTTTTTGAGAAAACAATTGATGAATCCATTTTACCAATGATTATTACGAACCCATCATATGCAAGTGAAATCTCTGTCAAACGTAACGAATTGAAACAAGATTTGGAAGGTAAATTCTGNNNGCGGTCAGGA]

[+] EMBL CD060921             [CGTGATTTGGATACTATGAATTTTATAGAATTCTGGGGTTATGGAGGAGGAAGTGTCACTAATGTAGTAAGCACTCAATCAGATGAAGCCCAGCTACTTGAAGCCGCCACTCGATTCAAAAATCTGAGTTCGTTGTGCTTAGAGCTACGGGATGATGAACGTTTCTTAAATGCAAAACAAAGAGTTACAGTCGCCTGCCAACACTTGGATACAGCTTTACTTGACAGCATTTAGAGCAAACTTTCTTGCGGGCAATGTCGAGACAATGAAGAGCATAGCAGATGTCCTTCTTCTTTCCAAAAACTACTCTCAATGTGCTGAGATCTTGGTCGAAGAAACAGTAAAGACGATAAATCCCAACAAGATTAGTTTTAAAGATATTACAAAGTG TTGGTTACGAGTGAAAAGCTAATAATGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD190472             [                                                                                                                                                                                                                                    ATTTAGAGCAAACTTTCTTGCGGGCAATGTTGAGACAATGAAGAGCATAGCTGATGTACTTCTTCTTTCCAAAAACTACTCTCAATGTGCTGAGATCTTGGTCGAAGAAACAGTAAAGACGATAAATCCCAACAAGATTAGTTTTAAAGATATTACAAAGTGTTTGGTTTCGAGTGAAAAGCTAATAATGACCTTATTCTTAAGACCAGATTCAGTCCTGATGCAGCTAATGCATAGTCTTTTCACAACAAAATTAAAAGTATACTTGAGTAATCATATGAAGGAAGAGTTGAATGCACAGGCATTTTTAACTAATTTGTACAATGAATATCGAAACGTGGAAAAGTTAGTTGTTGAGCTATCTAATGAGTTGACTTTAATTACGGATCCAATGCAACTGTCCAAATTATTTCGGGAATTATTTGCTCCATATTTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTTGAACATTATTATCAAAGTCANAGGCATCAAAAACGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD063178             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTACGGATCCAATGCAACTGTCCAAATTATTTCGGGAATTATTTGCTCCATATTTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTTGAACATTATTATCAAAGTCAAAGGCATCAAAAACGTGCACTAAATGTTTCTGGCTTGGCTGAACTTCGTCGAGACCTCCAAGCTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAATGACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCg                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD139873             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGGAATTATTTGCTCCATATTTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTTGAACATTATTATCAAAGTCAAAGGCATCAAAAACGTGCACTAAATGTTTCTGGCTTGGCTGAACTTCGTCGAGACCTCCAAGTTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAATGACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGACAAATGGC AATTCATATTTAATTGTTTGTATCACT                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD139924             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGGAATTATTTGCTCCATATTTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTTGAACATTATTATCAAAGTCAAAGGCATCAAAAACGTGCACTAAATGTTTCTGGCTTGGCTGAACTTCGTCGAGACCTCCAAGCTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAATGACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGAC NATGGCAAATTCATATTTAAn                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD078822             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTTTCTGGCTTGGCTGAACTTCGTCGAGACCTCCAAGCTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAAGGACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGAC AATGGCAAATTCATATTTAATTGTTTGTATCACTATCTAATTGTTGAACACGTGGATTATGGTGTTACTATANGTTTGCACGGTTTGAATATAGCCGATCCTCGAAGTAGCAATCCAAACCTAGTCTTCTTCTCAATAATTCATGAAGCCACATCCATTTTTCACTTTTTTGAGAAAACAATTGATGAATCCATTTTACCAATGATTATTACGAACCCATCATATGCAAGTGAAATCTCTGTCAAACGTAACGAATTGAAACAAGATTTGGAAGGTAAATTCTGNNNGCGGTCAGGA]
[-] EMBL CD139962             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTCGCTGTTAATATTATGNAAGATATTCGGCGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGAC AATGGCAAATTCATATTTAATTGTTTGTATCACTATCTAATTGTTGAACACGTGGATTATGGTGTTACTATAGGTTTGCACGGTTTGAATATAGCCGATCCTCGAAGTAGCAATCCAAACCTAGTCTTCTTCTCAATAATTCATGAAGCCACATCCATTTTTCACTTTTTTGAGAAAACAATTGATGAATCCATTTTACCAATGATTATTACGAACCCATCATATGCAAGTGAGATCTCTGTCAAAC                                                  ]


>consensus_8656#0 CGTGATTTGGATACTATGAATTTTATAGAATTCTGGGGTTATGGAGGAGGAAGTGTCACT AATGTAGTAAGCACTCAATCAGATGAAGCCCAGCTACTTGAAGCCGCCACTCGATTCAAA AATCTGAGTTCGTTGTGCTTAGAGCTACGGGATGATGAACGTTTCTTAAATGCAAAACAA AGAGTTACAGTCGCCTGCCAACACTTGGATACAGCTTTACTTGACAGCATTTAGAGCAAA CTTTCTTGCGGGCAATGTCGAGACAATGAAGAGCATAGCAGATGTCCTTCTTCTTTCCAA AAACTACTCTCAATGTGCTGAGATCTTGGTCGAAGAAACAGTAAAGACGATAAATCCCAA CAAGATTAGTTTTAAAGATATTACAAAGTGTTGGTTACGAGTGAAAAGCTAATAATGACC TTATTCTTAAGACCAGATTCAGTCCTGATGCAGCTAATGCATAGTCTTTTCACAACAAAA TTAAAAGTATACTTGAGTAATCATATGAAGGAAGAGTTGAATGCACAGGCATTTTTAACT AATTTGTACAATGAATATCGAAACGTGGAAAAGTTAGTTGTTGAGCTATCTAATGAGTTG ACTTTAATTACGGATCCAATGCAACTGTCCAAATTATTTCGGGAATTATTTGCTCCATAT TTAGTTGATTATATGAAACGAGAATCTGACTGGTTAACTGAACGCTTAACAGGTCATCTT GAACATTATTATCAAAGTCAAAGGCATCAAAAACGTGCACTAAATGTTTCTGGCTTGGCT GAACTTCGTCGAGACCTCCAAGCTAAGTTTCATATCACTGGTGGTGATCGATCACAAAAT GACTACGATATATCTTTGTTATCCGAAGAAGTCGCTGTTAATATTATTGAAGATATTCGG CGTGCTGCCAAACGATGCTTGCTCTTATCCCAACCTACTGCTATTCCAGACAATGGCAAA TTCATATTTAATTGTTTGTATCACTATCTAATTGTTGAACACGTGGATTATGGTGTTACT ATANGTTTGCACGGTTTGAATATAGCCGATCCTCGAAGTAGCAATCCAAACCTAGTCTTC TTCTCAATAATTCATGAAGCCACATCCATTTTTCACTTTTTTGAGAAAACAATTGATGAA TCCATTTTACCAATGATTATTACGAACCCATCATATGCAAGTGAAATCTCTGTCAAACGT AACGAATTGAAACAAGATTTGGAAGGTAAATTCTGNNNGCGGTCAGGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)