These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8667#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1248 fasta sequence [TTAAACCNCAAAGAAAAAAGACTAGTTATTCACAGTCAAGCGATGGAGACGCCCAGAAAACTCATGGTAGTAGTGGTGAGGATCTAACTACTCAAGAAGTTGATCCTAACACCCATAGCTGGCATCGTATGAACCGTAACGCCTGGAATGCACAATCGGGTAGTTCTTCACACCACCCTCATCAAAGATATCCAAGTGGACCAACTGGGGACGTCGATCCTTCAACTCTCGTTTCCCAAGCAAATGGTCCCTTGCGTCCCACTAATGAAACAAAAAGAGGAGGGCATGGTGACTGGTCCCGAGGATGTGCTGGTTGGCGTCAACGTTCTTACAGTGGCAGTGAGCAATCTGATATCTTCTATTATAATCACTCTAATCACCGAGGTCGTGGTAATGGGCACCCATCCAATGAAGTTGACGGAAATACGGGACGGGGACGTGGTCGAGGGCGTGGTTCCGGACGTCAAGGCTTAACACATCGAGAACCTGTTGGTGGTGGTCAGTCACAAACTTCAGGCGGTAATGCTTGTCGACCTGCCAGTTGCTTAGTTGATACTCCTGGAGGGCAATTAAATCAACAAACCAAAAATGGGAGGATTTACTCCAAATCATTTTGTAGTGATCCACCGCCTGGTTTCGATCTACCAATTCATGAGAAACCTTCTAATGAGTCATCATTTGA-CAAAACCTGTCAAAAAGAAGATGTTTTCATAGATAATATTGATTCAGTACCTATTCATCATTGCCAACCTGTGAATGATGATTCTTCAAAGAGTTCTACACAAATAAATTCTAAACAATCTATTATACATCCTTGTCATTGGTATTATATCGATTTGTTTACATGTACTCAAGGTCCATTTACAAATCAACAAATGAGTACATGGCTTGCTAGTGGTTATTTACCAT--TATCATTAAAAATACG--TCGTGA-TTGTGATGAATGTTTTCTTAGTTTAGCTGACCATATGAATTTAGCTGGACGCATTCCATTTTGGACTGGCTATAATCAACCACCTATTACAAATGTAAATCTATCAACACTTTCTGGATTAAACTATAATAGTAATAATAATAATGGTAATCAGGTATTAATTCATTCAACTATTATCAACAACCAAACACCCTCCTCCTCAACTCCACCAGGTATTACAAACCGTAAAACAGACTGTGAAATTTCACTTCCACAATCCACATTAACAACATTTGATGAAAATACAATTCAGCTTCAAAACAAAGGTGACGTTAATG] [-] EMBL CD092886 [TTAAACCNCAAAGAAAAAAGACTAGTTATTCACAGTCAAGCGATGGAGACGCCCAGAAAACTCATGGTAGTAGTGGTGAGGATCTAACTACTCAAGAAGTTGATCCTAACACCCATAGCTGGCATCGTATGAACCGTAACGCCTGGAATGCACAATCGGGTAGTTCTTCACACCACCCTCATCAAAGATATCCAAGTGGACCAACTGGGGACGTCGATCCTTCAACTCTCGTTTCCCAAGCAAATGGTCCCTTGCGTCCCACTAATGAAACAAAAAGAGGAGGGCATGGTGACTGGTCCCGAGGATGTGCTGGTTGGCGTCAACGTTCTTACAGTGGCAGTGAGCAATCTGATATCTTCTATTATAATCACTCTAATCACCGAGGTCGTGGTAATGGGCACCCATCCAATGAAGTTGACGGAAATACGGGACGGGGACGTGGTCGAGGGCGTGGTTCCGGACGTCAAGGCTTAACACATCGAGAACCTGTTGGTGGTGGTCAGTCACAAACTTCAGGCGGTAATGCTTGTCGACCTGCCAGTTGCTTAG ] [+] EMBL AI976642 [ AGAACCTGTTGGTGGTGGTCAGTCACAAACTTCAGGCGGTAATGCTTGTCGACCTGCCAGTTGCTTAGTTGATACTCCTGGAGGGCAATTAAATCAACAAACCAAAAATGGGAGGATTTACTCCAAATCATTTTGTAGTGATCCACCGCCTGGTTTCGATCTACCAATTCATGAGAAACCTTCTAATGAGTCATCATTTGACCAAAACCTGTCAAAAAGAAGATGTTTTCATAGATAATATTGATTCAGTACCTATTCATCATTGCCAACCTGTGAATGATGATTCTTCAAAGAGTTCTACACAAATAAATTCTAAACAATCTATTATACATCCTTGTCATTGGTATTATATCGATTTGTTTACATGTACTCAAGGTCCATTTACAAATCAACAAATGAGTACATGGCTTGCTAGTGGTTATTTACCAT TATCATTAAAAATACG TCGTGA TTGTGATGAATGTTTTCTTAGTTTAGCTGACCATATGAATTTAGCTGGACGCATTCCATTTTGGACTGGCTATAATCAACCACCTATTACAAATGTAAATCTATCAACACTTTCTGGATTAAACTATAATAGTAATAATTATAATGGTAATCAGGTATTAATTCATTTCACTATTATCAACAACCAAACA ] [+] EMBL CD148472 [ CAACAAACCAAAAATGGGAGGATTTACTCCAAATCATTTTGTAGTGATCCACCGCCTGGTTTCGATCTACCAATTCATGAGAAACCTTCTAATGAGTCATCATTTGA CAAAACCTGTCAAAAAGAAGATGTTTTCATAGATAATATTGATTCAGTACCTATTCATCATTGCCAACCTGTGAATGATGATTCTTCAAAGAGTTCTACACAAATAAATTCTAAACAATCTATTATACATCCTTGNCATTGGTATTATACCGATTTGTTTACATGTACTCAAGGTCCATTTACAAATCAACAAATGA ] [-] EMBL CD096785 [ AGAAACCTTCTAATGAGTCATCATTTGA CAAAACCTGTCAAAAAGAAGATGTTTTCATAGATAATATTGATTCAGTACCTATTCATCATTGCCAACCTGTGAATGATGATTCTTCAAAGAGTTCTACACAAATAAATTCTAAACAATCTATTATACATCCTTGTCATTGGTATTATATCGATTTGTTTACATGTACTCAAGGTCCATTTACAAATCAACAAATGAGTACATGGCTTGCTAGTGGTTATTTACCAT TATCATTAAAAATACG TCGTGA TTGTGATGAATGTTTTCTTAGTTTAGCTGACCATATGAATTTAGCTGGACGCATTCCATTTTGGACTGGCTATAATCAACCACCTATTACAAATGTAAATCTATCAACACTTTCTGGATTAAACTATAATAGTAATAATAATAATGGTAATCAGGTATTAATTCATTCAACTATTATCAACAACCAAACACCCTCCTCCTCAACTCCACCAGGTATTACAAACCGTAAAACAGACTGTGAAATTTCACTTCCACAATCCACATTAACAACATTTGATGAAAATACAATTCAGCTTCAAAACAAAGGTGACGTTAATG] [-] EMBL CD132826 [ GTCATCATTTGA CAAAACCTGTCAAAAAGAAGATGTTNTCATAGATAATATTGATTCAGTACCTATTCATCATTGCCAACCTGTGAATGATGATTCTTCAAAGAGTTCTACACAAATAAATTCTAAACAATCTATTATACATCCTTGTCATTGGTATTATATCGATTTGTTTACATGTACTCAAGGTCCATTTACAAATCAACAAATGAGTACATGGCTCGCTAGTGGTTATTTACCAT TATCATTAAAAATACG TCGTGA TTGTGATGAATGTTTTCTTAGTTTAGCTGACCATATGAATTTAGCTGGACGCATTCCATTTTGGACTGGCTATAATCAACCACCTATTACAAATGCAAATCTATCAACACTTTCTGGATTAAACTATAATAGTAATAATAATAATGGTAATCAGGTATTAATTCATTCAACTATTATCAACAACCAAACACCCTCCTCC ] [-] EMBL CD178338 [ ATTGGTATTATATCGATTTGTTTACATGTACTCAAGGTCCATTTACAAATCAACAAATGAGTACATGGCTTGCTAGTGGTTATTTACCAT TATCATTAAAAATACG TCGTGA TTGTGATGAATGTTTTCTTAGTTTAGCTGACCATATGAATTTAGCTGGACGCATTCCATTTTGGACTGGCTATAATCAACCACCTATTACAAATGTAAATCTATCAACACTTTCTGGATTAAACTATAATAGTAATAATAATAATGGTAATCAGGTATTAATTCATTCAACTATTATCAACA ] [-] EMBL CD096906 [ ttnngnCTAGTGGTTATTTACCATNNTATCATTAAAAATACGTTTCGTGANTTGTGATGAATGTTTTCTTAGTTTAGCTGACCATATGAATTTAGCTGGACGCATTCCATTTTGGACTGGCTATAATCAACCACCTATTACAAATGTAAATCTATCAACACTTTCTGGATTAAACTATAATAGTAATAATAATAATGGTAATCAGGTATTAATTCATTCAACTATTATCAACAACCAAACACCCTCCTCCTCAACTCCACCAGGTATTACAAACCGTAAAACAGACTGTGAAATTTCACTTCCACAATCCACATTAACAACATTTGATGAAAATACAATTCAGCTTCAAAACAAAGGTGACGTTAATG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||