These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8671#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 824 fasta sequence [ACCATGAATGGTTATGTTGACTAACAATAGTAAACAGTAATAATATTATTAAATATATTAGTTATTATCACTTTCATTTATGATTTCAGTGGGGACCTTCTATGTTCCTTTATTTATTTAATCTTTCGTTTCTTTTTATAGTATTTTATTAATTTTGATTCTTATGAAATGTGGAATGTAGGCTGTAATTATGCTGCATATTGCTTCTTTTTTTGTTCTGTTAAAATATATACATTCGCATATCTGATTTATGATAC-TTTATTACAAAGACCTCCTCCCCCCCCC-AAAAAAAACAACCACATAAAACTGAAACCAATTTATCTGTAACTACACTCCAGTCGCCTTTTATTTCGTATTTCTGTGTATATGTGCTTTGTTCAGACATATCCATTAACTAAAGATAGACAATGTATTGTCAATCTATGCAAACCTATCTTGTATTATTCAAAATTGTGTTTATACCGTCATCTAGTGTCTA-CTGAGAATTATAATAATGTACTGTTTATCCTCAGGGGTTTGAGTTGTTTTTTCGGTTTAAGAACAGTATAATTCTCTCATTTTTACGTTGAAATAATTTCCACTGTTAGCTTATTTATGCATAATTTATTTTTATTACTGATGACTTATGAAAGCGTAGTCTTTAACAGATGACGACAACAAACTTTTCTTACAACTTTATTCTAATACACAAGAACGTTTAACTTTATTAAACAATATACTATTGATACTACTGTGGTATGGGCTACTGATGTCGACAGA-TATAAGTAC-TATGTA-GCACCAATCGAAAGTGAAACACAGAAGGTTAAGGAGATTAA-TGAGAACAG] [+] EMBL CD159789 [ACCATGAATGGTTATGTTGACTAACAATAGTAAACAGTAATAATATTATTAAATATGTTAGTTATTATCACTTTCATTTATGATTTCAGTGGGGACCTTCTATGTTCCTTTATTTATTTAATCTTTCGTTTCTTTTTATAGTATTTTATTAATTTTGATTCTTATGAAATGTGGAATGTAGGCTGTAATTATGCTGCATATTGCTTCTTTTTTTGTTCTGTTAGAATATATACATTCGCATATCTGATTTATGATACGTTTATTACAAAGACCTCCTCCCCCCCCC AAAAAAAACAACCACATAAAACTGAAACCAATTTATCTGTAACTACACTCCAGTCGCCTTTTATTTCGTATTTCTGTGTATATGTGCTTNGTTCAGACATATTCATT ] [+] EMBL CD159780 [ACCATGAATGGTTATGTTGACTAACAATAGTAAACAGTAATAATATTATTAAATATATTAGTTATTATCACTTTCATTTATGATTTCAGTGGGGACCTTCTATGTTCCTTTATTTATTTAATCTTTCGTTTCTTTTTATAGTATTTTATTAATTTTGATTCTTATGAAATGTGGAATGTAGGCTGTCATTATGCTGCATATTGCTTCTTTTGTTGTTCTGTTAAAATATATACATTCGCATATCTGATTTATGATAC TTTATTACAAAGACCTCCTCCGCC ] [+] EMBL CD159801 [ACCATGAATGGTTATGTTGACTAACAATAGTAAACAGTAATAATATTATTAAATATATTAGTTATTATCACTTTCATTTATGATTTCAGTGGGGACCTTCTATGTTCCTTTATTTATTTAATCTTTCGTTTCTTTTTATAGTATTTTATTAATTTTGATTCTTATGAAATGTGGAATGTAGGCTGTAATTATGCTGCATATTGCTTCTTTTTTTGTTCTGTTAAAATATATACATTCGCATATCTGATTTATGATAC TTTATTACAAAGACCTCCTCCCCCCCCCAAAAAAAAACAACCACATAAAACTGAAACCAATTTATCTGTAACTACACTCCAGTCGCCTTTCGTTTGGTATTTCTGTGTATATGTGCTTTGTTCAGACATATC ] [+] EMBL CD134093 [ AAAAACAACCACATAAAACTGAAACCAATTTATCTGTAACTACACTCCAGTCGCCTTTTATTTTGTATTTCTGTTTATATGTGCTTTGTTCAGACATATCCATTAACTAAAGATAGACAATGTATTGTCAATCTATGCAAACCTATCTTGTATTATTCAAAATTGTGTTTATACCGTCATCTAGTGTCTA CTGAAAATTATAATAATGTACTG ] [-] EMBL CD159768 [ ATCTTGTATTATTCAAAATTGTGTTTATACCGTCATCTAGTGTCTA CTGAGAATTATAATAATGTACTGTTTATCCTCAGGGGTTTGAGTTGTTTTTTCGGTTTAAGAACAGTATAATTCTCTCATTTTTACGTTGAAATAATTTCCACTGTTAGCTTATTTATGCATAATTTATTTTTATTACTGATGACTTATGAAAGCGTAGTCTTTAACAGATGACGACAACAAACTTTTCTTACAACTTTATTCTAATACACAAGAACGTTTAACTTTATTAAACAATATACTATTGATACTACTGTGGTATGGGCTACTGATGTCGACAGA TATAAGTAC TATGTA GCACCAATCGAAAGTGAAACACAGAAGGTTAAGGAGATTAACTGAGAACA ] [-] EMBL CD159767 [ TAGTGTCTACCTGAGAATTATAATAATGTACTGTTTATCCTCAGGGGTTTGAGTTGTTTTTTCGCTTTAAGAACAGTATAATTCTCTCATTTTTACGTTGAAATAATTTCCACTGTTAGCTTATTTATGCATAATTTATTTTTATTACTGATGACTTATGAAAGCGTAGTCTTTAACAGATGACGACAACAAACTTTTCTTACAACTTTATTCTAATACACAAGAACGTTTAACTTTATTAAACAATATACTATTGATACTACTGTGGTATGGGCTACTGATGTCGACAGA TATAAGTAC TATGTA GCACCAATCGAAAGTGAAACACAGAAGGTTAAGGAGATTAA TGAGCACA ] [-] EMBL CD159756 [ ATACTATTGATACTACTGTGGTATGGGCTACTGATGTCGACAGACTATAAGTACATATGTACGCACCAATCGAAAGTGAAACACAGAAGGTTAAGGAGATTAA TGAGAACAG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||