These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8676#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1175 fasta sequence [AGGAAGTGCTGCTCGTTTTGAAACATGTGCACGTGGTCAACCAGCACCAACTGTACGTTGGCTTAAAGATGGTAAACCATTATTAACTGATGGAATACGTTTATGTGTATCACAAACATCAACTGAAAGATCTGGTACTAATACATCTAGTCATACACTTTTAGTTAAAGATGCTATACCACGTGATAGTGGAACATATACATGTATTGCAACAAGTTCATCAGGTACTGCTATCACTGAAGCAGCATTACATGTTCGTGGTTTATTTGGTCGTGGAGGTCATACTGGCTCAGATGCAATTAATAGTGGTGGTATTCGACATCGTCATCCTGAATTTACTCGTCGTTTACGTAATCAACAAGTTGATTTTGGTAGTACTATACGATTAGCTGCATCAGTATTAGCTCAACCATCAGCTACAGTGGTATGGCAAAAAGATGGTATAGAAATTTTAACTGAACCATCGGATGATCCAAGAATTACTGCTAAAAATCATAGCGGTCATTTAGAATTACGTATTGAAAATGTATGTAAAGATGATTTAGGTCAATATACAGTAATTGCATATAATTCTGCTGGTGAAGCTCGTTGTTCATGCATTTTACAAGGTACAACAAAAATGGAAATACAAGTACCTAAATTCACTAAAGAACTTCGTGATTATACAATACTAGAAGGTACTAATTTATGTTTAGAAACCATAGCAATTGGTGAACCAATACCTGAATTTAAATGGGAAAAAGATGGTTTTGAAATTCTTCCTGATGAATATGGTCCACCACGTATTACACCTGGTAC-AATGGCAGTAGTTTAGCTTATTTACGCATTCACAATGTCCGTAGTTCAGATGCAGGTTTGTATCGTTGCATATCATATAATAGATTTGGTCGTGAAAGAACAACTTGTATTGTTCATGTGGAATCAATCAAACAAAAAGGTGTACATCGATCAGATATGATGAATGGATCATTTACTTCGAAAAAAGACACAGATTCTTCTTTAGCAATGTTATCTGAGAATGGTATTAAAGCATCACCGAGGAATCATTCAGATTCACCTAAATTAACTGGATATATTAATGTATTACGTCCATTGCCTAAGACTGTTGAAGTTGAAGAAGGCAGTCCTATTGAACTAACATGTCGTGTTGATACANNATTACATTACATTCCTAC] [+] EMBL BF936404 [AGGAAGTGCTGCTCGTTTTGAAACATGTGCACGTGGTCAACCAGCACCAACTGTACGTTGGCTTAAAGATGGTAAACCATTATTAACTGATGGAATACGTTTATGTGTATCACAAACATCAACTGAAAGATCTGGTACTAATACATCTAGTCATACACTTTTAGTTAAAGATGCTATACCACGTGATAGTGGAACATATACATGTATTGCAACAAGTTCATCAGGTACTGCTATCACTGAAGCAGCATTACATGTTCGTGGTTTATTTGGTCGTGGAGGTCATACTGGCTCAGATGCAATTAATAGTGGTGGTATTCGACATCGTCATCCTGAATTTACTCGTCGTTTACGTAATCAACAAGTTGATTTTGGTAGTACTATACGATTAGCTGCATCAGTATTAGCTCAACCATCAGCTACAGTGGTATGGCAAAAAGATGGTATAGAAATTTTAACTGAACCATCGGATGATCCAAGAATTACTGCTAAAAATCATAGCGGTCATTTAGAATTACGTATTGAAAATGTATGTAAAGATGATTTAGGTCAATATACAGTAATTGCATATAATTCTGCTGGTGAAACTCGTTGTTCATGCATTTTACAAGGTACAACAAAAATGGAAATACAAGTACCTAAATTCACTAAAAAACTTCGTGATTATACAATACTAAAAGGTACTA ] [+] EMBL AW016978 [AGGAAGTGCTGCTCGTTTTGAAACATGTGCACGTGGTCAACCAGCACCAACTGTACGTTGGCTTAAAGATGGTAAACCATTATTAACTGATGGAATACGTTTATGTGTATCACAAACATCAACTGAAAGATCTGGTACTAATACATCTAGTCATACACTTTTAGTTAAAGATGCTATACCACGTGATAGTGGAACATATACATGTATTGCAACAAGTTCATCAGGTACTGCTATCACTGAAGCAGCATTACATGTTCGTGGTTTATTTGGTCGTGGAGGTCATACTGGCTCAGATGCAATTAATAGTGGTGGTATTCGACATCGTCATCCTGAATTTACTCGTCGTTTACGTAATCAACAAGTTGATTTTGGTAGTACTATACGATTAGCTGCATCAGTATTAGCTCAACCATCAGCTACAGTGGTATGGCAAAAAGATGGTATAGAAATTTTAACTGAACCATCGGATGATCCAAG ATTACTGCT AAAATCATA CGG C TTTAGAA ] [+] EMBL CD135288 [ GTGGTCAACCAGCACCAACTGTACGTTGGCTTAAAGATGGTAGACCATTATTAACTGATGGAATACGTTTATGTGTATCACAAACATCAACTGAAAGATCTGGTACTAATACATCTAGTCATACACTTTTAGTTAAAGATGCTATACCACGTGATAGTGGAACATATACATGTATTGCAACAAGTTCATCAGGTACTGCTATCACTGAAG ] [+] EMBL CD197623 [ GATGCAATTAATAGTGGTGGTATTCGACATCGTCATCCTGAATTTACTCGTCGTTTACGTAATCAACAAGTTGATTTTGGTAGTACTATACGATTAGCTGCATCAGTATTAGCTCAACCATCAGCTACAGTGGTATGGCAAAAAGATGGTATAGAAATTTTAACTGAACCATCGGATGATCCAAGAATTACTGCTAAAAATCATAGCGGTCATTTAGAATTACGTATTGAAAATGTATGTAAAGATGATTTAGGTCAATATACAGTAATTGCATATAATTCTGCTGGTGAAGC ] [-] EMBL CD068176 [ TAGTGGTGGTATTCGACATCGTCATCCTGAATTTACTCGTCGTTTACGTAATCAACAAGTTGATTTTGGTAGTACTATACGATTAGCTGCATCAGTATTAGCTCAACCATCAGCTACAGTAGTATGGCAAAAAGATGGTATAGAAATTTTGACTGAACCATCGGATGATCCAAGAATTACTGCTAAAAATCATAGCGGTCATTTAGAATTACGTATTGAAAATGTATGTAAAGATGATTTAGGTCAATATACAGTAATTGCATATAATTCTGCTGGTGAAGCTCGTTGTTCATGCATTTTACAAGGTACAACAAAAATGGAAATACAAGTACCTAAATTCACTAAAGAACTTCGTGATTATACAATACTAGAAGGTACTAATTTATGTTTAGAAACCATAGCAATTGGTGAACCAATACCTGAATTTAAATGGGAAAAAGATGGTTTTGAAATTCTTCCTGATGAATATGGTCCACCACGTATTACACCTGGTAC AATGGCAGTA ] [+] EMBL AI975596 [ GGTGGTATTCGACATCGTCATCCTGAATTTACTCGTCGTTTACGTAATCAACAAGTTGATTTTGGTAGTACTATACGATTAGCTGCATCAGTATTAGCTCAACCATCAGCTACAGTGGTATGGCAAAAAGATGGTATAGAAATTTTAACTGAACCATCGGATGATCCAAGAATTACTGCTAAAAATCATAGCGGTCATTTAGAATTACGTATTGAAAATGTATGTAAAGATGATTTAGGTCAATATACAGTAATTGCATATAATTCTGCTGGTGAAGCTCGTTGTTCATGCATTTTACAAGGTACAACAAAAATGGAAATACAAGTACCTAAATTCACTAAAGAACTTCGTGATTATACAATACTAGAAGGTACTAATTTATGTTTAGAAACCATAGCAATTGGTGAACCAATACCTGAATTTAAATGGGAAAAAGATGGTTTTGAAATTCTTCCTGATGAATATGGTCCACCACGTATTACACCTG ] [+] EMBL AW016972 [ ATTATACAATACTAGAAGGTACTAATTTATGTTTAGAAACCATAGCAATTGGTGAACCAATACCTGAATTTAAATGGGAAAAAGATGGTTTTGAAATTCTTCCTGATGAATATGGTCCACCACGTATTACACCTGGTACAAATGGCAGTGGTTTAGCTTATTTACGCATTCACAATGTCCGTAGTTCAGATGCAGGTTTGTATCGTTGCATATCATATAATAGATTTGGTCGTGAAAGAACAACTTGTATTGTTCATGTGGAATCAATCAAACAAAAAGGTGTACATCGATCAGATATGATGAATGGATCATTTACTTCGAAAAAAGACACAGATTCTTCTTTAGCAATGTTATCTGAGAATGGTATTAAAGCATCACCGAGGAATCATTCAGATTCACCTAAATTAACTGGATATATTAATGTATTACGTCCATTGCCTAAGACTGTTGAAGTTGAAGAAGGCAGTCCTATTGAACTAACATGTCGTGTTGATACANNATTACATTACATTCCTAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||