These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8678#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 886 fasta sequence [TTTTGCCTTCTTTTCCTTATTTTCCTATTGAATAGTCCCCACAAACCTAGTGTGTAAAATTGTGTATTTCTGGTGTTTCATGGATGGTTTTATGAAAGAAAGCCTATTAAAATGGATTTCATTAATAACTGAGAGGAATGTTAGCCTCATAGACGGCGAAGTCCTCAACAATCTAATAGACCTTTC--GTGCTTTTCCATCAGTTACTACCTCAGAATGTTACAAGGAGCGAATTAGTTCGTTTTTGGATGCAATTTTTCATCCTGGAGTTTCTAATTTATTTGACGTTGAAGGGGTGATTTCTGGGAAAGCTGACGATGTGGAATTGTTTGGGTTATGCCTAACCGTTTTATTGGGATGTCTTCAATGTCCCTCCAAACAGTCATTCATGGATCCTGCTCTGGATTTGAGTTTGGATATGCAAACTGCTATATTCCATTTAATTCAAGTGCCTATGACCCAGTTATCGCTCCATCATGAGTTCACTCGGGATCTGGTCACAAGCAGAATTCTCGATTCATCACAGTGTATCCACAATGATAACTTGCCATTTCGTCATCAAACCATTACTTGTAAAGTAGAAGAAGAAATCTCAGAACCATCATCTAAGCCACCATCTTCAACAGGCATGTGTAACGGACAGAAAGTAGTTTGTACTGACAATAGAAATTTTGGTCTTTCATTGAACACATTCGGATTTGAATTCACTCGCCCTA--ATTCAC-CTACAGGATATGCTAATGGACATACAAACAAACTAAAAAATGGTCTTGATCACAGACCTAATAATCTTTCTTTGTGTAACACTCCTGATCGAAGTCTGTGCATTGCATCCAGATTGAATTTAACCGATAATTTGGAACATAATGCGAATCATACTCATCATGCACC] [+] EMBL AI395112 [TTTTGCCTTCTTTTCCTTATTTTCCTATTGAATAGTCCCCACAAACCTAGTGTGTAAAATTGTGTATTTCTGGTGTTTCATGGATGGTTTTATGAAAGAAAGCCTATTAAAATGGATTTCATTAATAACTGAGAGGAATGTTAGCCTCATAGACGGCGAAGTCCTCAACAATCTAATAGACCTTTCAGGTGCTTTTCCATCAGTTACTACCTCAGAATGTTACAAGGAGCGAATTAGTTCGTTTTTGGATGCAATTTTTCATCCTGGAGTTTCTAATTTATTTGACGTTGAAGGGGTGATTTCTGGGAAAGCTGACGATGTGGGATTGTTTGGGTTATGCCTAACCGTTTTATTGGGATGTCCTCAATGTCCCTCCAAACAGTCAGTCATGGATCCTGC ] [+] EMBL AI395076 [TTTTGCCTTCTTTTCCTTATTTTCCTATTGAATAGTCCCCACAAACCTAGTGTGTAAAATTGTGTATTTCTGGTGTTTCATGGATGGTTTTATGAAAGAAAGCCTATTAAAATGGATTTCATTAATAACTGAGAGGAATGTTAGCCTCATAGACGGCGAAGTCCTCAACAATCTAATAGACCTTTCAGGTGCTTTTCCATCAGTTACTACCTCAGAATGTTACAAGGAGCGAATTAGTTCGTTTTTGGATGCAATTTTTCATCCTGGAGTTTCTAATTTATTTGACGTTGAAGGGGTGATTTCTGGGAAAGCTGACGATGTGG ATTGTTTGGGTTATGCCTAACCGTTTTATTGGGATGTCTTCAATGTCCCTCCAAACAG CATTCAATGATCCTGCTCTG ] [-] EMBL CD068195 [ acATCTAATAGACCTTTC GTGCTTTTCCATCAGTTACTACCTCAGAATGTTACAAGGAGCGAATTAGTTCGTTTTTGGATGCAATTTTTCATCCTGGAGTTTCTAATTTATTTGACGTTGAAGGGGTGATTTCTGGGAAAGCTGACGATGTGGAATTGTTTGGGTTATGCCTAACCGTTTTATTGGGATGTCTTCAATGTCCCTCCAAACAGTCATTCATGGATCCTGCTCTGGATTTGAGTTTGGATATGCAAACTGCTATATTCCATTTAATTCAAGTGCCTATGACCCAGTTATCGCTCCATCATGAGTTCACTCGGGATCTGGTCACAAGCAGAATTCTCGATTCATCACAGTGTATCCACA ] [-] EMBL CD168930 [ AAAGCTGACGATGTGGAATTGTTTGGGTTATGCCTAACCGTTTTATTGGGATGTCTTCAATGTCCCTCCAAACAGTCATTCATGGATCCTGCTCTGGATTTGAGTTTGGATATGCAAACTGCTATATTCCATTTAATTCAAGTGCCTATGACCCAGTTATCGCTCCATCATGAGTTCACTCGGGATCTGGTCACAAGCAGAATTCTCGATTCATCACAGTGTATCCACAATGATAACTTGCCATTTCGTCATCAAACCATTACTTGTAAAGTAGAAGAAGAAATCTCAGAACCATCATCTAAGCCACCATCTTCAACAGGCATGTGTAACGGACAGAAAGTAGTTTGTACTGACAATAGAAATTTTGGTCTTTCATTGAACACATTCGGATTTGAATTCACTCGCCCAACCCATCACACTACTGGggg ] [+] EMBL CD149663 [ ATGTGGAATTGTTTGGGTTATGCCTAACCGTTTTATTGGGATGTCTTCAATGTCCCTCCAAACAGTCATTCATGGATCCTGCTCTGGATTTGAGTTTGGATATGCAAACTGCTATATTCCATTTAATTCAAGTGCCTATGACCCAGTTATCGCTCCATCATGAGTTCACTCGGGATCTGGTCACAAGCAGAATTCTCGATTCATCACAGTGTATCCACAATGATAACTTGCCATTTCGTCATCAAACCATTACTTGTAAAGTAGAAGAAGAAATCTCAGAACCATCATCTAAGCCACCATCTTCAACAGGCATGTGTAACGGACAGAAAGTAGTTTGTACTGACAATAGAAATTTTGGTCTTTCATTGAACACATTCGGATTTG ATTCACTCGCCCTA ATTCAC CTACAGAATATG ] [+] EMBL CD117192 [ CCGTTTTATTGGGATGTCTTCAATGTCCCTCCAAACAGTCATTCATGGATCCTGCTCTGGATTTGAGTTTGGATATGCAAACTGCTATATTCCATTTAATTCAAGTGCCTATGACCCAGTTATCGCTCCATCATGAGTTCACTCGGGATCTGGTCACAAGCAGAATTCTCGATTCATCACAGTGTATCCACAATGATAACTTGCCATTTCGTCATCAAACCATTACTTGTAAAGTAGAAGAAGAAATCTCAGAACCATCATCTAAGCCACCATCTTCAACAGGCATGTGTAACGGACAGAAAGTAGTTTGTACTGACAATAGAAATTTTGGTCTTTCATTGAACACATTCGGATTTGAATTCACTCGCCCTA ATTCAC CTACAGGATATGCTAATGGACATACAAACAAACTAAAAAATGGTCTTGATCACAGACCTAATAATCTTTCTTTGTGTAACACTCCTGATCGAAGTCTGTGCATTGCATCCAGATTGAATT ] [-] EMBL CD121692 [ TTAATTCAAGTGCCTATGACCCAGTTATCGCTCCATCATGAGTTCACTCGGGATCTGGTCACAAGCAGAATTCTCGATTCATCACAGTGTATCCACAATGATAACTTGCCATTTCGTCATCAAACCATTACTTGTAAAGTAGAAGAAGAAATCTCAGAACCATCATCTAAGCCACCATCTTCAACAGGCATGTGTAACGGACAGAAAGTAGTTTGTACTGACAATAGAAATTTTGGTCTTTCATTGAACACATTCGGATTTGAATTCACTCGCCCTA ATTCAC CTACAGAATATGCTAATGGACATACAAACAAACTAAAAAATGGTCTTGATCACAGACCTAATAATCTTTCTTTGTGTAACACTCCTGATCGAAGTCTGTGCATTGCATCCAGATTGAATTTAACCGATAATTTGGAACATAATGCGAATCATACTCATCATGCACC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||