These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8684#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 867 fasta sequence [GTGTGAATGGTAATCTAGTTAAGTAAGTTCGACCAGGAGGGGGAGTTAATTCACGATCATCGTCTATGTGAGAACGAACGGGAATTGGATAAGGTACATGAGGCCGACCAGAGGCATCGCACACGTTATTCAGATTCCAAGGAAGATGGTTCA-CCACCGTTGAATATGCATCATTCTCTCCGATTCTTTAGGTTTTGGTGGGAGATAAATAGTGCACTGATCGTTAGTATCCAATGCGATGTTAGCTGTTGTTGTAATGGGGGGAATAGTACAATTTGCTGACAGTGCAGAAGCATCACGTTTACATCCAGTTGCAATTGGACCAAGTGGTTCTGTGAAAACTGGTAGATCTATATCCTGGTTTCCATTTGAACGTGAATGACGAGGCATAGTGACGATTACAGGTGTAATGATATTTGAACAGTGATCTCCAGAGCTCAATTGATGACGACTTTGATTGTCAACACTTCGACCAGTTGGAAATAATGTAAAATTAGAATGGGTCAGTGACTGTTTGGGACTCAGTGCTCTTCTGATCGGCACAGACAATCCAAAAGCTTGTGCAAAATGTTGGGTTTGAGCAGATTGAGTAGAAGAGGATGGACAATAATCACCAGTGACTGCAAACCATTGTAAAGCAGGATTTTGAACCAGCATTACTATTGACAACTAGCGAAAGTTGAGGGCCCCATGACAGGAACATGGAAACAACCAACGCTGTTGAGAGAAATAATGTCCAGCATGAACAGTTCAGTAATCAACTGAGGTAGTCCTCATTTTAAAAATTGATGAGATTATGTCTTCTCGATCACAATGTAGTTAATACTTGCAAAAAGCAAAGCTTTAATCCAGAACACAGGGTCGAAC] [+] EMBL CD115346 [GTGTGAATGGTAATCTAGTTAAGTAAGTTCGACCAGGAGGGGGAGTTAATTCACGATCATCGTCTATGTGAGAACGAACGGGAATTGGATAAGGTACATGAGGCCGACCAGAGGCATCGCACACGTTATTCAGATTCCAAGGAAGATGGTTCA CCACCGTTGAATATGCATCATTCTCTCCGATTCTTTAGGTTTTGGTGGGAGATAAATAGTGCACTGATCGTTAGTATCCAATGCGATGTTAGCTGTTGTTGTAATGGGGGGAATAGTACAATTTGCTGACAGTGCAGAAGCATCACGTTTACATCCAGTTGCAATTGGACCAAGTGGTTCTGTGAAAACTGGTAGATCTATATCCTGGTTTCCATTTGAACGTGAATGACGAGGCATAGTGACGATTACAGGTGTAATGATATTTGAACAGTGATCTCCAGAGCTCAATTGATGACGACTTTGATTGTCAACACTTCGACCAGTTGGAAATAATGTAAAATTAGAATGGGTC ] [-] EMBL CD189088 [ TTCGACCAGGAGGGGGAGTTAATTCACGATCATCGTCTATGTGAGAACGAACGGGAATTGGATAAGGTACATGAGGCCGACCAGAGGCATCGCACACGTTATTCAGATTCCAAGGAAGATGGTTCACCCACCGTTGAATATGCATCATTCTCTCCGATCCTTTAGGTTTTGGTGGGAGATAAATAGTGCACTGATCGTTAGTATCCAATGCGATGTTAGCTGTTGTTGTAATGGGGGGAATAGTACAATTTGCTGACAGTGCAGAAGCATCACGTTTACATCCAGTTGCAATTGGACCAAGTGGTTCTGTGAAAACTGGTAGATCTATATCCTGGTTTCCATTTGAACGTGAATGACGAGGCATAGTGACGATTACA ] [+] EMBL CD061439 [ CGTTTACATCCAGTTGCAATTGGACCAAGTGGTTCTGTGAAAACTGGTAGATCTATATCCTGGTTTCCATTTGAACGTGAATGACGAGGCATAGTGACGATTACAGGTGTAATGATATTTGAACAGTGATCTCCAGAGCTCAATTGGTGACGACTTTGATTGTCAACACTTCGACCAGTTGGAAATAATGTAAAATTAGAATGGGTCAGTGACTGTTTGGGACTCAGTGCTCTTCTGATCGGCACAGACAATCCAAAAGCTTGTGCAAAATGTTGGGTTTGAGCAGATTGAG ] [+] EMBL CD190147 [ GAACGTGAATGACGAGGCATAGTGACGATTACAGGTGTAATGATATTTGAACAGTGATCTCCAGAGCTCAATTGATGACGACTTTGATTGTCAACACTTCGACCAGTTGGAAATAATGTAAAATTAGAATGGGTCAGTGACTGTTTGGGACTCAGTGCTCTTCTGATCGGCACAGACAATCCAAAAGCTTGTGCAAAATGTTGGGTTTGAGCAGATTGAGTAGAAGAGGATGGACAATAATCACCAGTGACTGCAAACCATTGTAAAGCAGGATTTTGAACCAGCATTACTATTGACAACTAGCGAAA ] [+] EMBL CD190202 [ GAACGTGAATGACGAGGCATAGTGACGATTACAGGTGTAATGATATTTGAACAGTGATCTCCAGAGCTCAATTGATGACGACTTTGATTGTCAACACTTCGACCAGTTGGAAATAATGTAAAATTAGAATGGGTCAGTGACTGTTTGGGACTCAGTGCTCTTCTGATCGGCACAGACAATCCAAAAGCTTGTGCAAAATGTTGGGTTTGAGCAGATTGAGTAGAAGAGGATGGACAATAATCACCAGTGACTGCAAACCATTGTAAAGCAGGATTTTGAACCAGCATTACTATTGACAACTAGCGAAA ] [+] EMBL CD189269 [ GAACGTGAATGACGAGGCATAGTGACGATTACAGGTGTAATGATATTTGAACAGTGATCTCCAGAGCTCAATTGATGACGACTTTGATTGTCAACACTTCGACCAGTTGGAAATAATGTAAAATTAGAATGGGTCAGTGACTGTTTGGGACTCAGTGCTCTTCTGATCGGCACAGACAATCCAAAAGCTTGTGCAAAATGTTGGGTTTGAGCAGATTGAGTAGAAGAGGATGGACAATAATCACCAGTGACTGCAAACCATTGTAAAGCAGGATTTTGAACCAGCATTACTATTGACAACTAGCGAAAGTTGAGGGCCCCATGACAGGAACATGGAAACAACCAACGCTGTTGAGAGAAATAATGTCCAGCATGAACAGTTCAGTAATCAACTGAGGTAGTCCTCATTTTAAAAATTGATGAGATTATGTCTTCTCGATCACAATGTAGTTAATACTTGCAAAAAGCA ] [-] EMBL CD115144 [ TAGAAGAGGATGGACAATAATCACCAGTGACTGCAAACCATTGTAAAGCAGGGTTTTGAACCAGCATTACTATTGACAACTAGCGAAAGTTGAGGGCCCCATGACAGGAACATGGAAACAACCAACGCTGTTGAGAGAAATAATGTCCAGCATGAACAGTTCAGT ATCAACTGAGGTAGTCCTCATTTTAAAAATTGATGAGATTATGTCTTCTCGATCACAATGTAGTTAATACTTGCAAAAAGCAAAGCTTTAATCCAGAACACAGGGTCGAAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||